PHASE/0

PHASE/0 adalah program untuk menghitung struktur elektronik yang berbasis DFT (density functional theory) dan skema pseudopotensial. Program ini dapat memperkirakan ciri fisik dari material yang tidak ditemukan dalam percobaan apapun dengan ketepatan tinggi.

Versi yang Tersedia

Versi	Dukungan MPI	Dukungan Hardware
2020.01	Pure MPI	CPU, multi-node

Menjalankan PHASE/0

User menjalankan PHASE/0 pada Job Composer EFIRO yang dapat dibuka melalui menu Jobs > Jobs Composer

Memilih Template PHASE/0

Klik New Jobs > From Template. Pilih template PHASE/0 yang dibutuhkan. isi Job Name sesuai keinginan user kemudian klik Create New Job.

Daftar Template PHASE/0
PHASE/0 2020.01 Template standar PHASE/0 versi 2020.01

Mempersiapkan File Input PHASE/0

User dapat melakukan upload, editing, dan rename file input melalui menu Edit Files. Fitur upload di halaman Edit Files mempunyai batasan ukuran upload 2GB per file. Gunakan aplikasi FTP apabila user hendak mengupload file tunggal diatas 2GB. Taruh file input pada direktori yang sama dengan file slurm-phase.sh.

Melengkapi Submit Script Template

• Melalui menu Open Editor, user perlu melengkapi Submit Script supaya program PHASE/0 dapat berjalan:
  • Parameter SBATCH.
• Panduan umum lengkap dalam mengisi Submit Script dan parameter SBATCH:

MPI pada PHASE/0

PHASE/0 menggunakan MPI (Message Passing Interface) sehingga memberi kebebasan user untuk:

MPI ALELEON Supercomputer
MPI Satu Node vs Multi Node User dapat menjalankan PHASE/0 hanya dengan 1 node (maksimal 128 core thread CPU) Atau menggunakan multi-node alias lebih dari 128 core thread CPU.

Menjalankan Job

Semua file untuk menjalankan program dan Submit Script sudah siap? Jalankan job dengan menekan tombol Submit. Perhatikan status jalannya job pada kolom Status. Status jalannya Job Status Arti Not Submitted Job belum pernah dijalankan Running Job berjalan Queue Job mengantri dan belum berjalan Completed Job selesai berjalan Failed Job berhenti di tengah berjalan. Bisa karena di Stop atau Delete oleh user. User dapat memantau perubahan kolom Status dengan me-refresh halaman Job. Apabila user ingin menghentikan job yang sedang berjalan, klik tombol Stop yang berada di sebelah tombol Submit.

Melihat hasil job yang selesai

Apabila job sudah selesai (status Completed), user dapat melihat hasil output job melalui bagian Folder Contents atau membuka halaman Edit Pages. Kolom Folder Contents memperlihatkan isi dari direktori ruang job tersebut.
Tips: Apabila job tidak berjalan dengan semestinya (contoh tidak ada output atau menghasilkan output error), lakukan troubleshooting dengan membaca output yang didefinisikan pada SBATCH error.

Submit ulang job

User dapat menjalankan ulang job pada ruang job yang sama (misalkan ketika ada error dan mau dijalankan ulang setelah koreksi file input) dengan mengklik kembali tombol Submit. Job akan mencetak output di folder yang sama.