Tutorial Menggunakan ALELEON Supercomputer: Perbedaan antara revisi

Dari ALELEON by EFISON
(→‎3A. Tutorial Menjalankan Software Komputasi: tes penulisan tabel dan menambah tabel cara menjalankan komputasi)
Baris 2: Baris 2:


User menggunakan ALELEON Supercomputer melalui EFIRO OnDemand atau disingkat '''EFIRO -''' konsol tampilan grafis (GUI) untuk mengakses ALELEON Supercomputer melalui web browser.  
User menggunakan ALELEON Supercomputer melalui EFIRO OnDemand atau disingkat '''EFIRO -''' konsol tampilan grafis (GUI) untuk mengakses ALELEON Supercomputer melalui web browser.  
{| class="wikitable"
!Quick checkpoint!
Tutorial ALELEON Supercomputer
|-
|[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Tutorial_Menggunakan_ALELEON_Supercomputer#2_-_Selamat_Datang_di_Dashboard_EFIRO '''Dashboard EFIRO''']
|-
|[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Tutorial_Menggunakan_ALELEON_Supercomputer#3_-_Job_Composer:_Menjalankan_Komputasi_.28Job_Submission.29 '''Menjalankan komputasi via Job Composer EFIRO''']
|}
=='''1. Koneksi VPN dan Login EFIRO'''==
=='''1. Koneksi VPN dan Login EFIRO'''==
* Sebelum mengakses ALELEON Supercomputer, user harus [[Koneksi VPN ALELEON Supercomputer|'''terhubung ke koneksi VPN EFISON''']] demi keamanan jaringan dan data user.
* Sebelum mengakses ALELEON Supercomputer, user harus [[Koneksi VPN ALELEON Supercomputer|'''terhubung ke koneksi VPN EFISON''']] demi keamanan jaringan dan data user.
Baris 19: Baris 10:
Setelah login, user masuk ke dalam dashboard EFIRO yang menjadi ''central hub'' untuk menggunakan ALELEON Supercomputer.   
Setelah login, user masuk ke dalam dashboard EFIRO yang menjadi ''central hub'' untuk menggunakan ALELEON Supercomputer.   


[[Berkas:Efiromenubarbig.png|al=|800x800px]]
[[Berkas:Efiromenubar2.png|al=|900x900px]]
{| class="wikitable"
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
!Dashboard EFIRO
!Isi dari Dashboard EFIRO
|-
|-
|
|
=== Jobs > '''Job Composer'''===
=== Jobs > '''Job Composer'''===
* Adalah tempat bagi user untuk membuat dan menjalankan komputasi (disebut sebagai '''<nowiki/>'job'''') di '''Compute Node ALELEON Supercomputer''' - bagian utama server untuk menjalankan komputasi berat.
* Halaman untuk membuat dan menjalankan komputasi di Compute Node ALELEON Supercomp'''<nowiki/>'''uter.
* Semua software komputasi ALELEON Supercomputer dijalankan melalui halaman ini. '''<nowiki/><nowiki/>'''
* Job Composer berisikan serangkaian template, formulir, dan script untuk menjalank'''<nowiki/>'''an software komputasi. '''<nowiki/><nowiki/>'''
[[Berkas:Efirojobcomposer3.png|al=|jmpl|Halaman Job Composer|kiri]]
[[Berkas:Efirojobcomposer3.png|al=|jmpl|Halaman Job Composer|kiri]]
|-
|-
Baris 36: Baris 27:
|
|
=== Clusters > '''Aleleon Shell Access'''===
=== Clusters > '''Aleleon Shell Access'''===
* Menampilkan terminal Linux (shell) ALELEON Supercomputer.
* Halaman terminal Linux (shell) ALELEON Supercomputer.
* Untuk kegiatan yang membutuhkan terminal seperti compiling, membuat environment, dll.
* Untuk kegiatan yang membutuhkan terminal seperti compiling, membuat environment, dll.
[[Berkas:Efiroshell.png|kiri|jmpl|200x200px|Terminal ALELEON Supercomputer]]
|-
|-
|
|
Baris 48: Baris 40:
|}
|}


== '''3A. Tutorial Menjalankan Software Komputasi''' ==
== '''3. Menjalankan Komputasi di ALELEON Supercomputer''' ==
Silahkan pilih berdasarkan software yang akan user jalankan.
Terdapat dua metode untuk menjalankan software komputasi di ALELEON Supercomputer:
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
!Metode Menjalankan Komputasi di ALELEON Supercomputer
|-
|
=== Job Composer ===
[[Berkas:Efirojobcomposermenu.png|nirbing|300x300px]][[Berkas:Efirojobcomposer3.png|nir|jmpl|Halaman Job Composer.]]---
 
* Bekerja dengan model '''''job submission'':''' software komputasi dijalankan oleh sistem berdasarkan serangkaian formulir dan script yang didefinisikan user.
* Job Composer menjalankan software komputasi pada '''Compute Node''' - bagian server utama dan terkencang untuk menjalankan komputasi user.
* Job Composer digunakan untuk menjalankan komputasi skala apapun dari kecil hingga besar.
* Langkah menggunakan Job Composer dirangkum pada semua tutorial penggunaan software komputasi ALELEON Supercomputer,
|-
|
=== Interactive Apps ===
[[Berkas:Inapps.png|nirbing]][[Berkas:Jupyterefiro.png|nir|jmpl|Contoh salah satu interactive apps di ALELEON Supercomputer yaitu Jupyter Notebook.]]---
 
* Aplikasi yang dapat dijalankan secara '''interaktif''' (langsung) oleh user.
* Semua software Interactive Apps berjalan pada '''Interactive Node''' - bagian server untuk menjalankan semua interactive apps
* Interactive Node mempunyai spesifikasi hardware terbatas sehingga lebih cocok digunakan untuk komputasi skala kecil atau pengujian jalannya software / script. Gunakan Job Composer untuk melakukan komputasi skala besar.
* Untuk saat ini, aplikasi pada Interactive Apps hanya dapat ditambahkan oleh admin EFISON. Kedepannya akan diimplementasikan model sandbox supaya user dapat menambah aplikasi interaktif sendiri.
|}
 
=='''Melakukan Komputasi via Job Composer'''==
 
* Software yang dijalankan via Job Composer akan menggunakan Compute Node ALELEON Supercomputer - bagian
* Silahkan pilih berdasarkan software yang akan user jalankan.
{| class="wikitable sortable mw-collapsible mw-collapsed"
{| class="wikitable sortable mw-collapsible mw-collapsed"
|+SOFTWARE SAINTIFIK
|+SOFTWARE SAINTIFIK

Revisi per 23 Februari 2022 09.06

User menggunakan ALELEON Supercomputer melalui EFIRO OnDemand atau disingkat EFIRO - konsol tampilan grafis (GUI) untuk mengakses ALELEON Supercomputer melalui web browser.

1. Koneksi VPN dan Login EFIRO

  • Setelah terhubung ke VPN, user mengakses EFIRO melalui alamat berikut, diikuti dengan memasukkan username dan password akun user.
http://efisonlt.ood

2. Dashboard EFIRO

Setelah login, user masuk ke dalam dashboard EFIRO yang menjadi central hub untuk menggunakan ALELEON Supercomputer.

Isi dari Dashboard EFIRO

Jobs > Job Composer

  • Halaman untuk membuat dan menjalankan komputasi di Compute Node ALELEON Supercomputer.
  • Job Composer berisikan serangkaian template, formulir, dan script untuk menjalankan software komputasi.
Halaman Job Composer

Jobs > Active Jobs

  • Menampilkan status dan antrian job komputasi semua user yang sedang berjalan.
Halaman Active Jobs

Clusters > Aleleon Shell Access

  • Halaman terminal Linux (shell) ALELEON Supercomputer.
  • Untuk kegiatan yang membutuhkan terminal seperti compiling, membuat environment, dll.
Terminal ALELEON Supercomputer

Files > Home Directory

  • Menampilkan isi direktori HOME user.
  • User dapat melakukan manajemen file seperti upload, download, copy, rename, delete, dll.
Halaman Home Directory dan menu manajemen file

3. Menjalankan Komputasi di ALELEON Supercomputer

Terdapat dua metode untuk menjalankan software komputasi di ALELEON Supercomputer:

Metode Menjalankan Komputasi di ALELEON Supercomputer

Job Composer

Efirojobcomposermenu.png
Halaman Job Composer.
---
  • Bekerja dengan model job submission: software komputasi dijalankan oleh sistem berdasarkan serangkaian formulir dan script yang didefinisikan user.
  • Job Composer menjalankan software komputasi pada Compute Node - bagian server utama dan terkencang untuk menjalankan komputasi user.
  • Job Composer digunakan untuk menjalankan komputasi skala apapun dari kecil hingga besar.
  • Langkah menggunakan Job Composer dirangkum pada semua tutorial penggunaan software komputasi ALELEON Supercomputer,

Interactive Apps

Inapps.png
Contoh salah satu interactive apps di ALELEON Supercomputer yaitu Jupyter Notebook.
---
  • Aplikasi yang dapat dijalankan secara interaktif (langsung) oleh user.
  • Semua software Interactive Apps berjalan pada Interactive Node - bagian server untuk menjalankan semua interactive apps
  • Interactive Node mempunyai spesifikasi hardware terbatas sehingga lebih cocok digunakan untuk komputasi skala kecil atau pengujian jalannya software / script. Gunakan Job Composer untuk melakukan komputasi skala besar.
  • Untuk saat ini, aplikasi pada Interactive Apps hanya dapat ditambahkan oleh admin EFISON. Kedepannya akan diimplementasikan model sandbox supaya user dapat menambah aplikasi interaktif sendiri.

Melakukan Komputasi via Job Composer

  • Software yang dijalankan via Job Composer akan menggunakan Compute Node ALELEON Supercomputer - bagian
  • Silahkan pilih berdasarkan software yang akan user jalankan.
SOFTWARE SAINTIFIK
Nama Software

R R.png

GROMACS GROMACS.png

NWChem Nwhem.png

Quantum ESPRESSO Quantum ogo ok.png

GAMESS GAMESS.png

NAMD NAMDsof.png

ORCA Orca logo.png

TensorFlow TF.png

PHASE/0 Phase-logo4.png

COMCOT


Diperoleh dari "https://wiki.efisonlt.com/index.php?title=Tutorial_Menggunakan_ALELEON_Supercomputer&oldid=646"