Komputasi Python dengan Conda Environment: Perbedaan antara revisi

Dari ALELEON by EFISON
(test)
Baris 1: Baris 1:
Halaman ini menjelaskan bagaimana menjalankan komputasi Python melalui Anaconda di ALELEON Supercomputer.
Halaman ini menjelaskan menjalankan komputasi Python dengan environment Anaconda di ALELEON Supercomputer.
 
[[Berkas:Pythonanaconda.png|500x500px]]


== '''Langkah Menjalankan Komputasi''' ==
== '''Langkah Menjalankan Komputasi''' ==
Baris 93: Baris 95:
User dapat memilih metode menjalankan komputasi sesuai keinginan:  
User dapat memilih metode menjalankan komputasi sesuai keinginan:  


=== Batch Job Terminal ===
=== Job Submission Terminal ===
'''Ketentuan:'''  
'''Ketentuan:'''  


# Menjalankan file Python siap jalan di terminal dengan scheduler SLURM.
# Menjalankan file Python di terminal dengan scheduler SLURM.
# File ipynb harus dikonversi ke file Python.
#* File ipynb harus dikonversi ke file Python.
# Berjalan di Compute Node.
# Berjalan di Compute Node.
[[Berkas:Sbatch Terminal.png|tepi|500x500px]]
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
! colspan="2" |Langkah Menjalankan Anaconda di Batch Job Terminal
! colspan="2" |Langkah Job Submission Terminal
[[Berkas:Sbatch Terminal.png|tepi|400x400px]]
|-
|-
|
|
Baris 113: Baris 115:
|}
|}


=== Batch Job Web EFIRO ===
=== Job Submission Web EFIRO ===
'''Ketentuan:'''
'''Ketentuan:'''


# Menjalankan file Python siap jalan di web EFIRO Job Composer dengan scheduler SLURM.
# Menjalankan file Python di web EFIRO Job Composer dengan scheduler SLURM.
# File ipynb harus dikonversi ke file Python.
#* File ipynb harus dikonversi ke file Python.
# Berjalan di Compute Node.
# Berjalan di Compute Node.
[[Berkas:Efirojobcomposer3.png|nirbing|500x500px]]
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
! colspan="2" |Langkah Menjalankan Anaconda di Batch Job Web EFIRO
! colspan="2" |Langkah Job Submission Web EFIRO
[[Berkas:Efirojobcomposer3.png|nirbing|400x400px]]
|-
|-
|
|
Baris 138: Baris 140:
# Menjalankan sesi interaktif Jupyter Lab atau Notebook.
# Menjalankan sesi interaktif Jupyter Lab atau Notebook.
# Berjalan di Interactive Node.
# Berjalan di Interactive Node.
[[Berkas:Efirojupyterlab.png|500x500px]]
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
! colspan="2" |Langkah Menjalankan Anaconda di Sesi Jupyter
! colspan="2" |Langkah Interactive Job Sesi Jupyter
[[Berkas:Efirojupyterlab.png|400x400px]]
|-
|-
|
|

Revisi per 4 April 2024 03.59

Halaman ini menjelaskan menjalankan komputasi Python dengan environment Anaconda di ALELEON Supercomputer.

Berkas:Pythonanaconda.png

Langkah Menjalankan Komputasi

Terdapat dua langkah utama:

  1. Membuat dan menyiapkan conda environment untuk komputasi user.
  2. Memilih metode menjalankan komputasi.

Membuat Conda Environment

Kegiatan ini dilakukan pada terminal:

  • Diakses melalui login SSH.
  • Bagi yang login ke web EFIRO, buka menu Clusters -> Aleleon Shell Access
Membuat Conda Environment
1 Pilih dan aktifkan modul Anaconda yang akan digunakan.

$ module load <nama-modul-anaconda>

Daftar nama modul Anaconda
Nama Modul Versi
Anaconda3/2023.07-2 Anaconda 3 2023.07-2
Anaconda3/2022.05 Anaconda 3 2022.05
Anaconda3/2021.05 Anaconda 3 2021.05
Anaconda3/2020.11 Anaconda 3 2020.11
2 Buat conda env di direktori HOME dan aktifkan dengan perintah: 
$ conda create --name <nama-conda-env> pip

Contoh dengan nama 'skripsi'
$ conda create --name skripsi pip
Mengaktifkan Conda Environment dan Instalasi Package
0 Aktifkan modul Anaconda yang digunakan untuk membuat conda env user.
1 Aktifkan conda env dengan perintah: 
$ source activate <nama-conda-env>

Contoh mengaktifkan conda env 'skripsi'
$ source activate skripsi
User dapat melihat daftar conda env yang dibuat sebelumnya dengan:

$ conda env list

2 Lakukan instalasi package Python yang dibutuhkan dengan pip
3 Untuk menonaktifkan conda env jalankan perintah:

$ conda deactivate

Manajemen Conda Environment
1 Deactivate conda env untuk melakukan manajemen dibawah ini.
2 Untuk mengubah nama conda env: 
$ conda rename -n <nama-saat-ini> <nama-baru>

Contoh mengubah nama env skripsi ke tesis
$ conda rename -n skripsi tesis
Untuk menghapus conda env:

$ conda remove -n <nama-conda-env> --all

Metode Menjalankan Komputasi

User dapat memilih metode menjalankan komputasi sesuai keinginan:

Job Submission Terminal

Ketentuan:

  1. Menjalankan file Python di terminal dengan scheduler SLURM.
    • File ipynb harus dikonversi ke file Python.
  2. Berjalan di Compute Node.
Langkah Job Submission Terminal

Sbatch Terminal.png

Job Submission Web EFIRO

Ketentuan:

  1. Menjalankan file Python di web EFIRO Job Composer dengan scheduler SLURM.
    • File ipynb harus dikonversi ke file Python.
  2. Berjalan di Compute Node.
Langkah Job Submission Web EFIRO

Efirojobcomposer3.png

Interactive Job Sesi Jupyter

Ketentuan:

  1. Menjalankan sesi interaktif Jupyter Lab atau Notebook.
  2. Berjalan di Interactive Node.
Langkah Interactive Job Sesi Jupyter

Efirojupyterlab.png

Diperoleh dari "https://wiki.efisonlt.com/index.php?title=Komputasi_Python_dengan_Conda_Environment&oldid=1398"