Anaconda Python
ALELEON Supercomputer menggunakan suite Anaconda untuk komputasi yang membutuhkan environment Python. Anaconda adalah suite katalog packages Python dan R untuk komputasi data science dan machine learning.
Versi yang Tersedia
Versi | Dukungan
MPI |
Dukungan
Hardware |
---|---|---|
Anaconda3 2020.11 | - | default: CPU dan GPU, single-node
*multi-node dengan coding dan library yang tepat |
Anaconda3 2021.05 | - |
Komputasi Python di Job Composer vs Interactive Apps
ALELEON Supercomputer dapat menjalankan komputasi Python via Job Composer dan Interactive Apps Jupyter Notebook.
Menjalankan komputasi Python di Job Composer VS Interactive Apps Jupyter Notebook |
---|
Melalui Job Composer:
|
Melalui interaktif Jupyter Notebook:
|
Saran admin:
|
Halaman ini untuk menjalankan komputasi Python via Interactive Apps Jupyter Notebook. Apabila ingin menjalankan komputasi Python via Job Composer, klik:
Python Anaconda menggunakan Job Composer |
Membuat Conda Environment dan Instalasi Jupyter
Untuk praktek yang baik dalam menjalankan komputasi Python di ALELEON Supercomputer, user harus membuat Conda Environment supaya dapat mengisolasi dan secara bebas mengatur instalasi package Python di dalamnya. Perlu diketahui kegiatan instalasi berikut tidak mengurangi Kredit Core Hour user.
1 | Buka terminal melalui dashboard EFIRO menu Clusters > Aleleon Shell Access. |
2 | Aktifkan modul Anaconda, tim admin EFISON menyarankan menggunakan Anaconda3 terbaru. Untuk versi lainnya lihat Daftar Software Python dan Anaconda ALELEON Supercomputer.
$ module load Anaconda3/2021.05 |
3 | Buat Conda Environment secara default di direktori HOME dengan format perintah:
$ conda create --name <nama-conda-environment> Contoh: $ conda create --name tensortest |
4 | Admin EFISON merekomendasikan user untuk mengaktifkan Conda Environment melalui perintah source activate:
$ source activate $HOME/.conda/envs/<nama-conda-environment> Contoh: $ source activate $HOME/.conda/envs/tensortest
(tensortest) [wololo@login ~]$ |
5 | Instal pip Anaconda kemudian instal Jupyter melalui pip:
(tensortest) $ conda install pip (tensortest) $ pip install jupyter Dengan demikian, user siap menjalankan TensorFlow pada Interactive Apps Jupyter Notebook dengan Conda Environment yang barusan dibuat. |
Instalasi Package Python pada Conda Environment
Membuat Sesi Jupyter Notebook untuk TensorFlow
Buka menu Interactive Apps > Jupyter Notebook.
Mengisi Formulir Sesi Jupyter Notebook
Terdapat dua skenario pengisian formulir untuk menjalankan komputasi Python yaitu dengan CPU atau plus akselerasi GPU.
Panduan Formulir Menjalankan Jupyter Notebook CPU |
---|
|
User dapat menghitung penggunaan kredit CPU Core Hour dengan rumus:
|
Panduan Formulir Menjalankan Jupyter Notebook GPU |
---|
|
User dapat menghitung penggunaan kredit CPU Core Hour dan GPU Hour dengan rumus:
|
Launch!
- Apabila formulir sudah terisi, klik tombol Launch untuk memulai sesi Jupyter Notebook. User akan diarahkan ke halaman My Interactive Sessions. Tunggu hingga sesi Jupyter Notebook user siap diakses.
- Jupyter Notebook siap diakses saat menunjukkan status Running (kolom berwarna hijau).
- Klik Connect to Jupyter.
Note:
|
- User dapat mengunjungi halaman My Interactive Sessions melalui menu di dasboard EFIRO.
Default Notebook di Jupyter Notebook
User dapat menjalankan komputasi Python melalui Notebook default yaitu Python 3 (ipykernel).
- User juga dapat melakukan instalasi package (via pip atau conda) di dalam Notebook Jupyter Notebook.
- Package akan terinstal di dalam Conda Environment user yang digunakan pada sesi Jupyter Notebook tersebut.