Daftar Software Komputasi dan Tutorial Penggunaan: Perbedaan antara revisi

Dari ALELEON by EFISON
(→‎Software Komputasi: menambah link TF)
(reformat dengan menambah penjelasan job composer dan interactive apps)
Baris 1: Baris 1:
Halaman ini merangkum semua daftar software komputasi pada ALELEON Supercomputer dan tutorial penggunaannya.  
Halaman ini merangkum semua daftar software komputasi pada ALELEON Supercomputer dan tutorial penggunaannya.  


== '''Software Komputasi''' ==
== '''Kredit Core Hour''' ==
Sebelum melakukan komputasi, user disarankan mengecek kuota [[Core Hour|'''Kredit Core Hour''']] karena dibutuhkan untuk menjalankan komputasi di ALELEON Supercomputer.
 
# Buka terminal melalui '''dashboard EFIRO Clusters > ALELEON Shell Access'''.  [[Berkas:Shellaccess.png|nirbing|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Shellaccess.png|al=|200x200px]]
# Jalankan perintah <code>sausage</code>[[Berkas:Sausage.png|nir|jmpl|'''Perintah sausage memperlihatkan sisa kredit CCH dan GH user'''|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Sausage.png]]
 
Kuota pada kredit Core Hour akan berkurang sesuai dengan resources CPU / GPU yang dialokasikan user saat menjalankan komputasi di ALELEON Supercomputer.
 
== '''Job Composer dan Interactive Apps''' ==
Terdapat dua metode untuk menjalankan  komputasi di ALELEON Supercomputer yaitu Job Composer dan Interactive Apps.
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
!Menjalankan Komputasi via Job Composer
|-
|[[Berkas:Efirojobcomposer2.png|nir|jmpl|'''Halaman Job Composer. Diakses melalui menu Jobs > Job Composer di dashboard EFIRO.'''|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Efirojobcomposer2.png]]
*Cara utama untuk menjalankan '''semua software komputasi''' di ALELEON Supercomputer.
*Job Composer menjalankan software pada '''[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Spesifikasi_ALELEON_Supercomputer#Spesifikasi_Hardware:_Compute_Node Compute Node]''' - bagian server komputasi ALELEON Supercomputer terkencang untuk menjalankan berbagai level komputasi dari kecil hingga besar.
*Job Composer bekerja dengan model '''''job submission'':''' software komputasi dijalankan oleh sistem berdasarkan serangkaian template, formulir, dan script yang didefinisikan user.
|}
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
!Menjalankan Komputasi via Interactive Apps
|-
|[[Berkas:Jupyterefiro.png|nir|jmpl|'''Contoh salah satu interactive apps: Jupyter Notebook, diakses melalui menu Interactive Apps di dashboard EFIRO.'''|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Jupyterefiro.png]]
*'''Interactive Apps''' adalah aplikasi yang dapat dijalankan secara '''interaktif''' (langsung) oleh user.
*Interactive Apps berjalan pada '''[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Spesifikasi_ALELEON_Supercomputer#Spesifikasi_Hardware:_Interactive_Node Interactive Node]''' - bagian server komputasi ALELEON Supercomputer untuk menjalankan semua Interactive Apps.
*Interactive Node mempunyai '''spesifikasi hardware terbatas''' sehingga lebih cocok digunakan untuk komputasi skala kecil atau pengujian jalannya software / script. Gunakan '''Job Composer''' untuk melakukan komputasi skala besar.
|}
 
=='''Software Komputasi dan Tutorial'''==
{| class="wikitable sortable mw-collapsible"
{| class="wikitable sortable mw-collapsible"
!Software
!Software
Baris 31: Baris 58:
|'''R'''
|'''R'''
|
|
* '''[[R menggunakan Job Composer|Job Composer]]'''
*'''[[R menggunakan Job Composer|Job Composer]]'''
* '''[[R menggunakan Jupyter Notebook|Interactive Apps Jupyter Notebook]]'''
*'''Interactive Apps:'''
** '''[[R menggunakan Jupyter Notebook|Jupyter Notebook]]'''
|-
|-
|'''TensorFlow'''
|'''Komputasi Python'''
|''(coming soon)''
Mencakup:


* '''[[TensorFlow menggunakan Job Composer|Job Composer]]'''
* TensorFlow
* '''[[TensorFlow menggunakan Jupyter Notebook|Interactive Apps Jupyter Notebook]]'''
* PyTorch
* Keras
* dll
|
*'''[[TensorFlow menggunakan Job Composer|Job Composer]]'''
*'''Interactive Apps:'''
** '''[[TensorFlow menggunakan Jupyter Notebook|Jupyter Notebook]]'''
|}
|}
__TANPADAFTARISI__
__TANPADAFTARISI__

Revisi per 24 Maret 2022 09.23

Halaman ini merangkum semua daftar software komputasi pada ALELEON Supercomputer dan tutorial penggunaannya.

Kredit Core Hour

Sebelum melakukan komputasi, user disarankan mengecek kuota Kredit Core Hour karena dibutuhkan untuk menjalankan komputasi di ALELEON Supercomputer.

  1. Buka terminal melalui dashboard EFIRO Clusters > ALELEON Shell Access.
  2. Jalankan perintah sausage
    Perintah sausage memperlihatkan sisa kredit CCH dan GH user

Kuota pada kredit Core Hour akan berkurang sesuai dengan resources CPU / GPU yang dialokasikan user saat menjalankan komputasi di ALELEON Supercomputer.

Job Composer dan Interactive Apps

Terdapat dua metode untuk menjalankan komputasi di ALELEON Supercomputer yaitu Job Composer dan Interactive Apps.

Menjalankan Komputasi via Job Composer
Halaman Job Composer. Diakses melalui menu Jobs > Job Composer di dashboard EFIRO.
  • Cara utama untuk menjalankan semua software komputasi di ALELEON Supercomputer.
  • Job Composer menjalankan software pada Compute Node - bagian server komputasi ALELEON Supercomputer terkencang untuk menjalankan berbagai level komputasi dari kecil hingga besar.
  • Job Composer bekerja dengan model job submission: software komputasi dijalankan oleh sistem berdasarkan serangkaian template, formulir, dan script yang didefinisikan user.
Menjalankan Komputasi via Interactive Apps
Contoh salah satu interactive apps: Jupyter Notebook, diakses melalui menu Interactive Apps di dashboard EFIRO.
  • Interactive Apps adalah aplikasi yang dapat dijalankan secara interaktif (langsung) oleh user.
  • Interactive Apps berjalan pada Interactive Node - bagian server komputasi ALELEON Supercomputer untuk menjalankan semua Interactive Apps.
  • Interactive Node mempunyai spesifikasi hardware terbatas sehingga lebih cocok digunakan untuk komputasi skala kecil atau pengujian jalannya software / script. Gunakan Job Composer untuk melakukan komputasi skala besar.

Software Komputasi dan Tutorial

Software

Komputasi

Dukungan

Penggunaan

COMCOT Job Composer
GAMESS Job Composer
GROMACS Job Composer
NAMD Job Composer
NWChem Job Composer
ORCA Job Composer
PHASE/0 Job Composer
R
Komputasi Python

Mencakup:

  • TensorFlow
  • PyTorch
  • Keras
  • dll


Interactive Apps

(coming soon)