Daftar Software Komputasi dan Tutorial Penggunaan: Perbedaan antara revisi

Dari ALELEON by EFISON
k (WilsonLisan memindahkan halaman Daftar Software Job Composer ke Daftar Software Komputasi dan Tutorial Penggunaan tanpa membuat pengalihan: Menyatukan job composer dan interactive apps)
(→‎Daftar Software Komputasi dan Tutorial: menambah nama EFIRO di sesi interactive)
(24 revisi perantara oleh pengguna yang sama tidak ditampilkan)
Baris 1: Baris 1:
Halaman ini merangkum daftar software yang dapat berjalan di Job Composer dan tutorial penggunaannya.
Halaman ini merangkum semua daftar software komputasi pada ALELEON Supercomputer dan tutorial penggunaannya.  
* Job Composer menjalankan software pada '''Compute Node''' - bagian server utama untuk menjalankan komputasi berat.
* Bekerja dengan model '''''job submission'':''' software komputasi dijalankan oleh sistem berdasarkan serangkaian template, formulir, dan script yang didefinisikan user.


{| class="wikitable sortable"
== '''Mengecek Kredit Core Hour bagi Akun Perseorangan''' ==
!Daftar Software dan tutorial penggunaan
User dengan akun perseorangan mempunyai kuota komputasi bernama [[Core Hour|'''Kredit Core Hour''']]. User disarankan untuk selalu mengecek sisa Kredit Core Hour sebelum melakukan komputasi dengan langkah berikut:  
|-
|
===R [[Berkas:R.png|nirbing|100x100px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:R.png]]===
{| class="wikitable"
{| class="wikitable"
|
|1
=== [[R menggunakan Jupyter Notebook|Interactive Apps: Jupyter Notebook]] ===
|Buka terminal (bagi pengguna EFIRO, buka menu '''<code>Clusters</code> > <code>Aleleon Shell Access</code>'''
|-
|-
|
|2
=== [[R menggunakan Job Composer|Job Composer]] ===
|Jalankan perintah 'sausage'.
$ '''sausage'''
|}
|}
=='''Daftar Software Komputasi dan Tutorial'''==
{| class="wikitable sortable mw-collapsible"
! rowspan="2" |Software Komputasi dan Tutorial
! colspan="2" |Dukungan Penggunaan
|-
!SLURM sbatch / Job Composer
!Sesi Interactive EFIRO
|-
|'''[[COMCOT]]'''
|V
|X
|-
|'''[[GAMESS]]'''
|V
|X
|-
|-
|
|'''[[GROMACS]]'''
=== MPI (Template Umum) '''''(coming soon)''''' ===
|V
 
|X
* Tutorial menjalankan program MPI secara umum di Job Composer.
* Mencakup Pure MPI dan Hybrid MPI.
|-
|-
|
|'''[[NAMD]]'''
=== Python (Template Umum) '''''(coming soon)''''' ===
|V
 
|X
* Tutorial menjalankan program Python secara umum di Job Composer.
|-
|-
|
|'''[[NWChem]]'''
=== Default Job ''(coming soon)'' ===
|V
 
|X
* Tutorial mengenal template default job pada Job Composer.
* Untuk menjalankan program apapun di Compute Node CPU.
|-
|-
|
|'''[[ORCA]]'''
==='''[[GROMACS]]''' ===
|V
|X
|-
|-
|
|'''[[PHASE/0]]'''
===[[NWChem]] ===
|V
|X
|-
|-
|
|'''[[Quantum ESPRESSO]]'''
===[[Quantum ESPRESSO]] ===
|V
|X
|-
|-
|
|'''R'''
===[[GAMESS]] ===
|Untuk program .R siap jalan.
'''''Tidak support file .ipynb.'''''
|Jupyter Lab
|-
|-
|
|'''Python<small><sup>''1''</sup></small>''' '''''via Anaconda'''''
===[[NAMD]] ===
|Untuk program '''.py''' siap jalan.
'''''Tidak support file .ipynb'''''.
|Jupyter Lab
|-
|-
|
|'''[[CP2K]]'''
===[[ORCA]] ===
|V
|X
|-
|-
|
|'''Blender'''
===TensorFlow (Job Composer) ''(coming soon)'' ===
|V
 
|ALELEON Desktop
* Tutorial Menjalankan TensorFlow di Job Composer.
* Untuk versi interaktif Jupyter Notebook lihat '''''(coming soon)'''''
|-
|-
|
|'''[[SPECFEM3D]]'''
===[[PHASE/0]] ===
|V
|X
|-
|-
|
|'''FLACS'''
===[[COMCOT]]===
|V
|ALELEON Desktop
|}
|}
__TANPADAFTARISI__
'''Note:'''
 
# Python mengacu interpreter dan library komputasi seperti TensorFlow, Scikit, PyTorch, Keras, Pandas, dll

Revisi per 24 November 2022 05.04

Halaman ini merangkum semua daftar software komputasi pada ALELEON Supercomputer dan tutorial penggunaannya.

Mengecek Kredit Core Hour bagi Akun Perseorangan

User dengan akun perseorangan mempunyai kuota komputasi bernama Kredit Core Hour. User disarankan untuk selalu mengecek sisa Kredit Core Hour sebelum melakukan komputasi dengan langkah berikut:

1 Buka terminal (bagi pengguna EFIRO, buka menu Clusters > Aleleon Shell Access
2 Jalankan perintah 'sausage'.
$ sausage

Daftar Software Komputasi dan Tutorial

Software Komputasi dan Tutorial Dukungan Penggunaan
SLURM sbatch / Job Composer Sesi Interactive EFIRO
COMCOT V X
GAMESS V X
GROMACS V X
NAMD V X
NWChem V X
ORCA V X
PHASE/0 V X
Quantum ESPRESSO V X
R Untuk program .R siap jalan.

Tidak support file .ipynb.

Jupyter Lab
Python1 via Anaconda Untuk program .py siap jalan.

Tidak support file .ipynb.

Jupyter Lab
CP2K V X
Blender V ALELEON Desktop
SPECFEM3D V X
FLACS V ALELEON Desktop

Note:

  1. Python mengacu interpreter dan library komputasi seperti TensorFlow, Scikit, PyTorch, Keras, Pandas, dll