GAMESS: Perbedaan antara revisi

Dari ALELEON by EFISON
(→‎Versi yang Tersedia: Tambah versi initial GAMESS)
(→‎Contoh SLURM Submission Script: Add submission script for single node and multi node)
Baris 15: Baris 15:
|}
|}


=='''SLURM Submission Script'''==
=='''Contoh SLURM Submission Script'''==
User harus menggunakan [[Scheduler SLURM Aleleon|Scheduler SLURM]] untuk menjalankan komputasi GAMESS di Compute Node. User dapat menjalankan GAMESS dengan satu node atau paralel (lebih dari satu node) untuk performa lebih.
 
===Satu Node===
Contoh menggunakan 64 core CPU dan RAM 128GB.
#!/bin/bash
#SBATCH --ntasks=64
#SBATCH --mem=128GB
#SBATCH --time=10:00:00
#SBATCH --output=result-%j.out
#SBATCH --error=result-%j.err
# MODULE
module load gamess
# RUN COMMAND
rungms <file_input> 00 64
 
===Banyak Node===
Contoh menggunakan 2 node, masing-masing 64 core CPU dan RAM 128GB.
#!/bin/bash
#SBATCH --nodes=2
#SBATCH --ntasks-per-node=64
#SBATCH --mem=128GB
#SBATCH --time=10:00:00
#SBATCH --output=result-%j.out
#SBATCH --error=result-%j.out
# MODULE
module load orca
# RUN COMMAND
# Total proses = ntasks per node X nodes
rungms <file_input> 00 128

Revisi per 5 April 2021 07.21

Software GAMESS

GAMESS (General Atomic and Molecular Electronic Structure System) adalah package ab-inito kimia kuantum untuk komputasi SCF Wavefunctions.

Versi yang Tersedia

Versi Nama Modul Dukungan Hardware Partisi
2020.2 gamess CPU, parallel multi-node epyc

Contoh SLURM Submission Script

User harus menggunakan Scheduler SLURM untuk menjalankan komputasi GAMESS di Compute Node. User dapat menjalankan GAMESS dengan satu node atau paralel (lebih dari satu node) untuk performa lebih.

Satu Node

Contoh menggunakan 64 core CPU dan RAM 128GB.

#!/bin/bash

#SBATCH --ntasks=64
#SBATCH --mem=128GB
#SBATCH --time=10:00:00
#SBATCH --output=result-%j.out
#SBATCH --error=result-%j.err

# MODULE
module load gamess

# RUN COMMAND
rungms <file_input> 00 64

Banyak Node

Contoh menggunakan 2 node, masing-masing 64 core CPU dan RAM 128GB.

#!/bin/bash

#SBATCH --nodes=2
#SBATCH --ntasks-per-node=64
#SBATCH --mem=128GB
#SBATCH --time=10:00:00
#SBATCH --output=result-%j.out
#SBATCH --error=result-%j.out

# MODULE
module load orca

# RUN COMMAND
# Total proses = ntasks per node X nodes
rungms <file_input> 00 128