GAMESS: Perbedaan antara revisi
Dari ALELEON by EFISON
LSlowmotion (bicara | kontrib) (→Versi yang Tersedia: Tambah versi initial GAMESS) |
LSlowmotion (bicara | kontrib) (→Contoh SLURM Submission Script: Add submission script for single node and multi node) |
||
Baris 15: | Baris 15: | ||
|} | |} | ||
=='''SLURM Submission Script'''== | =='''Contoh SLURM Submission Script'''== | ||
User harus menggunakan [[Scheduler SLURM Aleleon|Scheduler SLURM]] untuk menjalankan komputasi GAMESS di Compute Node. User dapat menjalankan GAMESS dengan satu node atau paralel (lebih dari satu node) untuk performa lebih. | |||
===Satu Node=== | |||
Contoh menggunakan 64 core CPU dan RAM 128GB. | |||
#!/bin/bash | |||
#SBATCH --ntasks=64 | |||
#SBATCH --mem=128GB | |||
#SBATCH --time=10:00:00 | |||
#SBATCH --output=result-%j.out | |||
#SBATCH --error=result-%j.err | |||
# MODULE | |||
module load gamess | |||
# RUN COMMAND | |||
rungms <file_input> 00 64 | |||
===Banyak Node=== | |||
Contoh menggunakan 2 node, masing-masing 64 core CPU dan RAM 128GB. | |||
#!/bin/bash | |||
#SBATCH --nodes=2 | |||
#SBATCH --ntasks-per-node=64 | |||
#SBATCH --mem=128GB | |||
#SBATCH --time=10:00:00 | |||
#SBATCH --output=result-%j.out | |||
#SBATCH --error=result-%j.out | |||
# MODULE | |||
module load orca | |||
# RUN COMMAND | |||
# Total proses = ntasks per node X nodes | |||
rungms <file_input> 00 128 |
Revisi per 5 April 2021 07.21
Software GAMESS
GAMESS (General Atomic and Molecular Electronic Structure System) adalah package ab-inito kimia kuantum untuk komputasi SCF Wavefunctions.
Versi yang Tersedia
Versi | Nama Modul | Dukungan Hardware | Partisi |
---|---|---|---|
2020.2 | gamess | CPU, parallel multi-node | epyc |
Contoh SLURM Submission Script
User harus menggunakan Scheduler SLURM untuk menjalankan komputasi GAMESS di Compute Node. User dapat menjalankan GAMESS dengan satu node atau paralel (lebih dari satu node) untuk performa lebih.
Satu Node
Contoh menggunakan 64 core CPU dan RAM 128GB.
#!/bin/bash #SBATCH --ntasks=64 #SBATCH --mem=128GB #SBATCH --time=10:00:00 #SBATCH --output=result-%j.out #SBATCH --error=result-%j.err # MODULE module load gamess # RUN COMMAND rungms <file_input> 00 64
Banyak Node
Contoh menggunakan 2 node, masing-masing 64 core CPU dan RAM 128GB.
#!/bin/bash #SBATCH --nodes=2 #SBATCH --ntasks-per-node=64 #SBATCH --mem=128GB #SBATCH --time=10:00:00 #SBATCH --output=result-%j.out #SBATCH --error=result-%j.out # MODULE module load orca # RUN COMMAND # Total proses = ntasks per node X nodes rungms <file_input> 00 128