GAMESS

Dari ALELEON by EFISON

Revisi sejak 15 September 2021 10.55 oleh WilsonLisan (bicara | kontrib) (major paraphrasing)

Software GAMESS

GAMESS (General Atomic and Molecular Electronic Structure System) adalah package ab-inito kimia kuantum untuk komputasi SCF Wavefunctions.

Versi yang Tersedia

Versi Nama Modul Dukungan MPI Dukungan Hardware Partisi
2020.2 gamess Pure MPI CPU, parallel multi-node epyc

Contoh SLURM Submission Script

User harus menggunakan manajemen SLURM untuk menjalankan komputasi GAMESS di Compute Node. User dapat menjalankan GAMESS dengan satu node atau paralel (lebih dari satu node) untuk performa lebih.

Satu Node CPU

Contoh berikut untuk menjalankan GAMESS pada satu node CPU.

#!/bin/bash

#SBATCH --ntasks=64              # Contoh menggunakan 64 core CPU
#SBATCH --mem=128GB              # Contoh menggunakan RAM 128GB
#SBATCH --time=10:00:00          # Contoh menetapkan walltime maks 10 jam
#SBATCH --output=result-%j.out   # Output terminal program
#SBATCH --error=result-%j.err    # Output verbose program

# Memuat modul GAMESS
module load gamess

# RUN COMMAND
rungms <file_input> 00 $SLURM_NTASKS

Multi Node CPU

Contoh berikut untuk menjalankan GAMESS pada lebih dari satu node CPU.

#!/bin/bash

#SBATCH --nodes=2                 # Contoh menggunakan 2 node ...
#SBATCH --ntasks-per-node=128     # dengan 128 core per node.
                                  # Maka dari itu total menggunakan 256 core CPU
#SBATCH --mem=240GB               # Contoh menggunakan RAM 240GB per node
#SBATCH --time=10:00:00           # Contoh menggunakan walltime maks 10 jam
#SBATCH --output=result-%j.out    # Output terminal program
#SBATCH --error=result-%j.err     # Output verbose program

# Memuat modul GAMESS
module load gamess

# RUN COMMAND
# $SLURM_NTASKS menangkap total proses MPI (nodes * ntasks-per-node)

rungms <file_input> 00 $SLURM_NTASKS