Katalog Software ALELEON Supercomputer

Dari ALELEON by EFISON

Revisi sejak 26 Maret 2021 10.46 oleh WilsonLisan (bicara | kontrib) (Initial writing)
(beda) ← Revisi sebelumnya | Revisi terkini (beda) | Revisi selanjutnya → (beda)

Halaman ini memuat daftar software esensial di HPC Aleleon Mk.II untuk user termasuk tautan tutorial untuk software komputasi. Pengguna dapat menggunakan semua katalog software di HPC Aleleon Mk.II dengan Module Environment.

Permohonan Instalasi Software

User dapat mengajukan permohonan ke admin EFISON apabila membutuhkan set software yang belum terinstal di HPC Aleleon Mk.II melalui email support@efisonlt.com. Tidak terdapat biaya untuk memohon instalasi software termasuk optimasinya. User juga dapat menginstal atau membangun software di direktori $HOME masing-masing dimana dapat dijalankan di Compute Node via scheduler SLURM.

Admin EFISON akan memastikan semua software untuk berjalan dengan efisien dan optimal di sistem HPC Aleleon Mk.II dengan pedoman:

  • Optimasi berdasarkan spesifikasi Compute Node (AMD EPYC untuk CPU node / NVIDIA Ampere untuk GPU node)
  • Opsi apabila software yang diminta user dapat berjalan di GPU
  • Software komputasi paralel akan diatur menggunakan protokol network Infiniband / UCX untuk performa skalabilitas yang lebih baik.

Daftar Software Komputasi

Tutorial mencakup dual hal: menjalankan software komputasi melalui SLURM dan parameter optimasi supaya software dapat berjalan dengan performa terbaik.

Software Versi

(default)

Versi

(lainnya)

Bidang Nama Module

(versi default)

Tutorial Dukungan Hardware
GROMACS 2021.1 - Kimia Komputasi gromacs [link] CPU, paralel multi-node
NWChem 7.0.2 - Kimia Komputasi nwchem [link] CPU, paralel multi-node
Quantum Espresso 6.7 - Kimia Komputasi qe [link] CPU, paralel multi-node
R 4.0.4 - Statistika R [link] CPU, paralel single-node

Daftar Compiler

Compiler Kategori Versi

(default)

Versi

(lainnya)

Nama Module

(versi default)

GCC (default OS) C/C++/Fortran 9.3.1 RHEL - (default OS)
GCC (custom) C/C++/Fortran 10.2.0 - GCC/10.2.0
OpenMPI MPI 4.1.0 - openmpi

Daftar Library Matematika

Daftar Software Python