NWChem
NWChem adalah software komputasi kimia untuk biomolekul, kimia kuantum, kimia klasik, Gaussian, nanostructures, solid-state, ground-state, excite-state, dan sebagainya.
Versi yang Tersedia
| Versi | Dukungan MPI | Dukungan Hardware |
|---|---|---|
| 7.0.2 | Pure MPI | CPU, multi-node |
User menjalankan NWChem pada Job Composer EFIRO yang dapat dibuka melalui menu Jobs > Jobs Composer
Memilih template NWChem
- Klik New Jobs > From Template.
- Pilih template NWChem yang dibutuhkan.
- isi Job Name sesuai keinginan user kemudian klik Create New Job.
---
| Nama Template | Penjelasan |
|---|---|
| NWChem 7.0.2 | Template standar NWChem versi 7.0.2 |
---
Mempersiapkan file input NWChem
- User dapat melakukan upload, editing, dan rename file input NWChem melalui menu Edit Files.
- Taruh input file pada direktori yang sama dengan file slurm-nwchem.sh.
---
Melengkapi Submit Script Template
- Melalui menu Open Editor, user perlu melengkapi Submit Script supaya program NWChem dapat berjalan:
- Parameter SBATCH.
- Nama file input NWChem.
- Panduan umum lengkap dalam mengisi Submit Script dan parameter SBATCH:
MPI pada NWChem
NWChem menggunakan MPI (Message Passing Interface) sehingga memberi kebebasan user untuk:
| MPI ALELEON Supercomputer |
|---|
|
---
Menjalankan Job
Semua file untuk menjalankan program dan Submit Script sudah siap? Jalankan job dengan menekan tombol Submit.
- Perhatikan status jalannya job pada kolom Status.
| Status | Arti |
|---|---|
| Not Submitted | Job belum pernah dijalankan. |
| Running | Job berjalan. |
| Queue | Job mengantri dan belum berjalan. |
| Completed | Job selesai berjalan. |
| Failed | Job berhenti di tengah jalan,
Bisa karena di Stop atau Delete oleh user. |
- User dapat memantau perubahan kolom Status dengan me-refresh halaman Job.
- Apabila user ingin menghentikan job yang sedang berjalan, klik tombol Stop yang berada di sebelah tombol Submit.
---
Melihat hasil job yang selesai
Apabila job sudah selesai (status Completed), user dapat melihat hasil output job melalui bagian Folder Contents atau membuka halaman Edit Pages.
---
Submit ulang job
User dapat menjalankan ulang ruang job yang sama (misalkan ketika ada koreksi file input atau Submit Script) dengan mengklik kembali tombol Submit.
