PHASE/0: Perbedaan antara revisi
WilsonLisan (bicara | kontrib) |
WilsonLisan (bicara | kontrib) (reformat) |
||
Baris 15: | Baris 15: | ||
== '''Menjalankan PHASE/0 di Job Composer''' == | == '''Menjalankan PHASE/0 di Job Composer''' == | ||
{| class="wikitable" | {| class="wikitable" | ||
|'''1''' | | rowspan="2" |'''1''' | ||
|Buka menu '''Jobs > Jobs Composer''' | |Buka menu '''Jobs > Jobs Composer''' | ||
[[Berkas:Efirojobcomposermenu.png|nirbing|300x300px|al=|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Efirojobcomposermenu.png]] | [[Berkas:Efirojobcomposermenu.png|nirbing|300x300px|al=|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Efirojobcomposermenu.png]] | ||
|- | |- | ||
|Pilih '''New Jobs > From Template''' | |Pilih '''New Jobs > From Template''' | ||
[[Berkas:Jcnewjobmarked.png|al=|nirbing|180x180px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Jcnewjobmarked.png]] | [[Berkas:Jcnewjobmarked.png|al=|nirbing|180x180px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Jcnewjobmarked.png]] | ||
|- | |- | ||
|''' | |'''2''' | ||
| | | | ||
==='''Memilih Template PHASE/0'''=== | ==='''Memilih Template PHASE/0'''=== | ||
Baris 38: | Baris 37: | ||
|}[[Berkas:Jcselecttemplate3.png|al=|nir|jmpl|Memilih template, mengisi Job Name, dan klik Create New Job|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Jcselecttemplate3.png]] | |}[[Berkas:Jcselecttemplate3.png|al=|nir|jmpl|Memilih template, mengisi Job Name, dan klik Create New Job|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Jcselecttemplate3.png]] | ||
|- | |- | ||
|''' | |'''3''' | ||
| | | | ||
==='''Mempersiapkan File untuk Menjalankan Job'''=== | ==='''Mempersiapkan File untuk Menjalankan Job'''=== | ||
Baris 45: | Baris 44: | ||
**Laman Edit Files juga dapat melakukan view / download / edit / rename / delete file. | **Laman Edit Files juga dapat melakukan view / download / edit / rename / delete file. | ||
*Fitur upload pada laman Edit Files '''mempunyai batasan ukuran upload 2GB per file'''. Gunakan [[Upload File dengan Aplikasi FTP|'''aplikasi FTP''']] apabila user hendak mengupload file tunggal diatas 2GB. | *Fitur upload pada laman Edit Files '''mempunyai batasan ukuran upload 2GB per file'''. Gunakan [[Upload File dengan Aplikasi FTP|'''aplikasi FTP''']] apabila user hendak mengupload file tunggal diatas 2GB. | ||
*Taruh file pada direktori yang sama dengan file '''slurm-...sh.''' | *Taruh file input pada direktori yang sama dengan file '''slurm-...sh.''' | ||
|- | |- | ||
|''' | | rowspan="3" |'''4''' | ||
| | | | ||
==='''Melengkapi Submit Script Template'''=== | ==='''Melengkapi Submit Script Template'''=== | ||
[[Berkas:Jceditor3.png|al=|nirbing|500x500px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Jceditor3.png]] | [[Berkas:Jceditor3.png|al=|nirbing|500x500px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Jceditor3.png]] | ||
Melalui menu '''Open Editor''', user perlu melengkapi Submit Script supaya job PHASE/0 dapat berjalan: | |||
*Parameter SBATCH Partisi epyc / Compute Node CPU. | |||
--- | --- | ||
==='''Panduan lengkap mengisi Submit Script:'''=== | |||
'''Jangan lupa Save setiap sekali mengubah script.''' | |||
[[Berkas:Save.png|nirbing|450x450px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Save.png]] | |||
|- | |||
| | |||
=== '''Panduan lengkap mengisi Submit Script:''' === | |||
[[Berkas:Wiki-14edit.jpg|al=SLURM Script ALELEON Supercomputer|1000x1000px |link=Submit Script ALELEON Supercomputer ]] | [[Berkas:Wiki-14edit.jpg|al=SLURM Script ALELEON Supercomputer|1000x1000px |link=Submit Script ALELEON Supercomputer ]] | ||
|- | |||
| | |||
==='''Fitur MPI pada PHASE/0'''=== | === '''Fitur MPI pada PHASE/0''' === | ||
PHASE/0 menggunakan MPI (Message Passing Interface) sehingga memberi kebebasan user untuk: | PHASE/0 menggunakan MPI (Message Passing Interface) sehingga memberi kebebasan user untuk: | ||
{| class="wikitable" | {| class="wikitable" | ||
Baris 72: | Baris 75: | ||
|} | |} | ||
|- | |- | ||
|''' | | rowspan="2" |'''5''' | ||
| | | | ||
==='''Menjalankan Job'''=== | ==='''Menjalankan Job'''=== | ||
Baris 80: | Baris 83: | ||
[[Berkas:Jcsubmit2.png|al=|nirbing|600x600px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Jcsubmit2.png]] | [[Berkas:Jcsubmit2.png|al=|nirbing|600x600px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Jcsubmit2.png]] | ||
|- | |||
|Penjelasan kolom '''Status,''' pantau dengan refresh halaman job''':''' | |||
Penjelasan kolom '''Status,''' pantau dengan refresh halaman job''':''' | |||
{| class="wikitable" | {| class="wikitable" | ||
!Status | !Status | ||
Baris 105: | Baris 106: | ||
|} | |} | ||
|- | |- | ||
|''' | | rowspan="2" |'''6''' | ||
| | |||
==='''Melihat hasil job yang selesai'''=== | |||
User dapat melihat hasil output job melalui bagian '''Folder Contents''' atau membuka halaman '''Edit Pages.'''[[Berkas:Jcfoldercontentsedit.png|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Jcfoldercontentsedit.png|al=|nir|jmpl|User dapat melihat semua file output yang keluar di kolom '''Folder Contents'''.]][[Berkas:Jcjoboption3.png|nir|jmpl|atau dengan membuka menu '''Edit Files'''. |pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Jcjoboption3.png]] | |||
|- | |||
| | | | ||
=== Submit Ulang Job === | === Submit Ulang Job === | ||
User dapat '''menjalankan ulang ruang job yang sama''' (misalkan ketika ada koreksi file input atau Submit Script) dengan '''mengklik kembali tombol Submit'''. | User dapat '''menjalankan ulang ruang job yang sama''' (misalkan ketika ada koreksi file input atau Submit Script) dengan '''mengklik kembali tombol Submit'''. | ||
|} | |} |
Revisi per 25 Maret 2022 06.35
PHASE/0 adalah program untuk menghitung struktur elektronik yang berbasis DFT (density functional theory) dan skema pseudopotensial. Program ini dapat memperkirakan ciri fisik dari material yang tidak ditemukan dalam percobaan apapun dengan ketepatan tinggi.
Versi yang Tersedia
Versi | Dukungan MPI | Dukungan Hardware |
---|---|---|
2020.01 | Pure MPI | CPU, multi-node |
Menjalankan PHASE/0 di Job Composer
1 | Buka menu Jobs > Jobs Composer | |||||||||||
Pilih New Jobs > From Template | ||||||||||||
2 |
Memilih Template PHASE/0Pilih template PHASE/0 yang dibutuhkan. Isi Job Name sesuai keinginan user kemudian klik Create New Job.
| |||||||||||
3 |
Mempersiapkan File untuk Menjalankan Job
| |||||||||||
4 |
Melengkapi Submit Script TemplateMelalui menu Open Editor, user perlu melengkapi Submit Script supaya job PHASE/0 dapat berjalan:
--- Jangan lupa Save setiap sekali mengubah script. | |||||||||||
Panduan lengkap mengisi Submit Script: | ||||||||||||
Fitur MPI pada PHASE/0PHASE/0 menggunakan MPI (Message Passing Interface) sehingga memberi kebebasan user untuk:
| ||||||||||||
5 |
Menjalankan JobApabila file untuk menjalankan program dan Submit Script sudah siap, jalankan job dengan menekan tombol Submit.
| |||||||||||
Penjelasan kolom Status, pantau dengan refresh halaman job:
| ||||||||||||
6 |
Melihat hasil job yang selesaiUser dapat melihat hasil output job melalui bagian Folder Contents atau membuka halaman Edit Pages. | |||||||||||
Submit Ulang JobUser dapat menjalankan ulang ruang job yang sama (misalkan ketika ada koreksi file input atau Submit Script) dengan mengklik kembali tombol Submit. |