R

Dari ALELEON by EFISON

Revisi sejak 30 Maret 2021 09.09 oleh WilsonLisan (bicara | kontrib) (initial writing)
(beda) ← Revisi sebelumnya | Revisi terkini (beda) | Revisi selanjutnya → (beda)

Halaman ini menjelaskan bagaimana cara menjalankan software R di HPC Aleleon Mk.II.

Software R

R adalah software untuk menjalankan komputasi statistik dan grafis. Software R didukung oleh The R Foundation for Statistical Computing.

Versi yang Tersedia

Versi Nama Modul Dukungan Hardware
4.0.4 "Lost Library Book" R CPU, parallel single-node (tidak mendukung multi-node)

User dapat melihat R packages yang terinstal dengan memuat modul R yang akan dipakai lalu menjalankan perintah installed.packages():

$ module load R
$ R
-> installed.packages()

User dapat menghubungi admin EFISON melalui email support@efisonlt.com apabila membutuhkan instalasi R versi spesifik dan R packages yang belum terinstal.

SLURM Submission Script

Berikut adalah contoh SLURM Submission Script untuk menjalankan R ((dengan 64 core dan RAM 128GB)):

#!/bin/bash

#SBATCH --ntasks=64
#SBATCH --mem=128GB
#SBATCH --time=10:00:00
#SBATCH --output=result-%j.out
#SBATCH --error=result-%j.err

# Load module R
module load R

# Menjalankan program R
Rscript myjob.R