Submit Script ALELEON Supercomputer: Perbedaan antara revisi

Revisi per 22 Maret 2021 08.33

SLURM adalah software scheduler untuk mengantarkan job komputasi user ke Compute Node. Bila tidak menggunakan SLURM maka job user akan berjalan di Login Node yang tidak layak untuk komputasi. Selain itu SLURM mencatat penggunaan Core Hour user.

Alur Penggunaan SLURM untuk Job Submission

Pada contoh berikut, user akan menjalankan komputasi HPCG ke Compute Node dengan nama program 'xhpcg-3.1':

[ale01@login hpcg-tutorial]$ ls
hasil  hpcg.dat  xhpcg-3.1

User harus membuat SLURM submission script yang berisikan alokasi resources (CPU, GPU, RAM, waktu, dkk) dan alur jalannya program. Langkah membuat SLURM submission script akan dijelaskan di bagian berikutnya. Pada contoh ini, user membuat SLURM submission script bernama 'slurm-hpcgnvidia'.

[ale01@login hpcg-tutorial]$ ls
hasil  hpcg.dat  slurm-hpcgnvidia  xhpcg-3.1

Jalankan SLURM submission script dengan perintah sbatch. Perhatikan bahwa SLURM menjalankan job user dengan nomor ID 231.

[ale01@login hpcg-tutorial]$ sbatch slurm-hpcgnvidia
Submitted batch job 231

User dapat melihat status jalannya job dengan perintah squeue. Perhatikan bahwa job ID 231 sedang berjalan.

[ale01@login hpcg-tutorial]$ squeue -l
Mon Mar 22 10:43:22 2021
             JOBID PARTITION     NAME     USER    STATE       TIME TIME_LIMI  NODES NODELIST(REASON)
               230      epyc  HPLBLIS    ale02  RUNNING       9:42  20:00:00      1 epyc01
               229      epyc  HPLBLIS    ale02  RUNNING      10:46  20:00:00      1 epyc02
               231 gpu_amper slurm-hp    ale01  RUNNING       2:00   1:00:00      1 gpu1

Job selesai bila sudah tidak terlihat di daftar squeue. User dapat mengatur konfigurasi file output di SLURM submission script seperti contoh dibawah ini (output result-231.err dan result-231.out).

[ale01@login hpcg-tutorial]$ ls
hasil                                       hpcg.dat                          result-231.err  slurm-hpcgnvidia
HPCG-Benchmark_3.1_2021-03-22_10-43-30.txt  hpcg_log_2021.03.22.10.41.25.txt  result-231.out  xhpcg-3.1

Perintah Esensial SLURM

Berikut adalah perintah esensial bagi user untuk menggunakan SLURM:

Perintah	Penjelasan
$ sbatch <slurm-submission-script>	Mengirim SLURM submission script untuk dijalankan di SLURM.
$ squeue	Melihat status dan antrian semua komputasi. Tambahan opsi: squeue -l : squeue dengan info lengkap squeue -u $USER : squeue untuk job user saja
$ scancel <job-ID>	Membatalkan job. Misalkan pada contoh diatas dengan job ID 231: $ scancel 231

SLURM Submission Script

SLURM submission script adalah bash-script yang bertujuan untuk menjalankan program komputasi melalui SLURM. Terdapat 4 komponen penting pada SLURM submission script:

DDD
DD
DD
D

@@ Baris 1: / Baris 1: @@
-SLURM adalah scheduler dengan tugas utama mengantarkan job komputasi yang dijalankan oleh user di Login Node ke Compute Node. Selain itu SLURM juga mengatur antrian job, menjaga supaya semua job yang berjalan di Compute Node tidak bentrok satu sama lain, serta mencatat penggunaan Core Hour user.
+SLURM adalah software scheduler untuk mengantarkan job komputasi user ke Compute Node. Bila tidak menggunakan SLURM maka job user akan berjalan di Login Node yang tidak layak untuk komputasi. Selain itu SLURM mencatat penggunaan Core Hour user.
 == Alur Penggunaan SLURM untuk Job Submission ==
-Pada contoh berikut, user akan menjalankan komputasi HPCG ke Compute Node dengan nama program ''''xhpcg-3.1'''<nowiki/>':
+Pada contoh berikut, user akan menjalankan komputasi HPCG ke Compute Node dengan nama program '''<nowiki/>''''xhpcg-3.1':
   [ale01@login hpcg-tutorial]$ ls
   hasil  hpcg.dat  '''xhpcg-3.1'''
-User harus membuat '''SLURM submission script''' yang berisikan alokasi resources (CPU, GPU, RAM, waktu, dkk) dan alur jalannya program xhpcg-3.1. Langkah membuat SLURM submission script akan dijelaskan di bagian berikutnya. Pada contoh ini, user membuat SLURM submission script bernama ''''slurm-hpcgnvidia'''<nowiki/>'.
+User harus membuat '''SLURM submission script''' yang berisikan alokasi resources (CPU, GPU, RAM, waktu, dkk) dan alur jalannya program. Langkah membuat SLURM submission script akan dijelaskan di bagian berikutnya. Pada contoh ini, user membuat SLURM submission script bernama ''''slurm-hpcgnvidia'''<nowiki/>'.
   [ale01@login hpcg-tutorial]$ ls
   hasil  hpcg.dat  '''slurm-hpcgnvidia'''  xhpcg-3.1
@@ Baris 18: / Baris 18: @@
       epyc  HPLBLIS    ale02  RUNNING      10:46  20:00:00      1 epyc02
 gpu_amper slurm-hp    ale01  RUNNING       2:00   1:00:00      1 gpu1
-Tunggu hingga job selesai. User dapat mengatur konfigurasi file output di SLURM submission script.
+Job selesai bila sudah tidak terlihat di daftar squeue. User dapat mengatur konfigurasi file output di SLURM submission script seperti contoh dibawah ini (output result-231.err dan result-231.out).
   [ale01@login hpcg-tutorial]$ ls
   hasil                                       hpcg.dat                          result-231.err  slurm-hpcgnvidia
   HPCG-Benchmark_3.1_2021-03-22_10-43-30.txt  hpcg_log_2021.03.22.10.41.25.txt  result-231.out  xhpcg-3.1
+== Perintah Esensial SLURM ==
+Berikut adalah perintah esensial bagi user untuk menggunakan SLURM:
+{| class="wikitable"
+!Perintah
+!Penjelasan
+|-
+|
+ $ sbatch <slurm-submission-script>
+|Mengirim SLURM submission script untuk dijalankan di SLURM.
+|-
+|
+ $ squeue
+|Melihat status dan antrian semua komputasi. Tambahan opsi:
+* squeue -l : squeue dengan info lengkap
+* squeue -u $USER : squeue untuk job user saja
+|-
+|
+ $ scancel <job-ID>
+|Membatalkan job. Misalkan pada contoh diatas dengan job ID 231:
+ $ scancel 231
+|}
+== SLURM Submission Script ==
+SLURM submission script adalah bash-script yang bertujuan untuk menjalankan program komputasi melalui SLURM. Terdapat 4 komponen penting pada SLURM submission script:
+[[Berkas:Contoh SLURM.png|kiri|nirbing|578x578px]]
+# DDD
+# DD
+# DD
+# D

Article tools

Perkakas pribadi

Navigasi

Perkakas

Submit Script ALELEON Supercomputer: Perbedaan antara revisi

Revisi per 22 Maret 2021 08.33

Alur Penggunaan SLURM untuk Job Submission

Perintah Esensial SLURM

SLURM Submission Script