Spesifikasi ALELEON Supercomputer: Perbedaan antara revisi

Dari ALELEON by EFISON
(Major writing spek hardware, software, dan EFIRO)
(edit kapasitas efektif mem)
 
(29 revisi perantara oleh pengguna yang sama tidak ditampilkan)
Baris 1: Baris 1:
ALELEON Supercomputer saat ini menggunakan '''HPC ALELEON Mk.II''' - superkomputer ''custom'' EFISON generasi kedua yang beroperasi pada bulan April 2021.
ALELEON Supercomputer saat ini menggunakan '''HPC ALELEON Mk.III''' - superkomputer ''custom'' EFISON generasi ketiga menyesuaikan arsitektur EFIRO.


== '''Spesifikasi Hardware''' ==
== '''''Spesifikasi Compute Node''''' ==
{{DISPLAYTITLE:Spesifikasi ALELEON Supercomputer}}
Compute Node menjalankan komputasi user via job submission SLURM (sbatch terminal atau Job Composer EFIRO).
__TOC__
{| class="wikitable"
{| class="wikitable"
|+Hardware - per April 2021
! colspan="2" |Spesifikasi Compute Node CPU
!Komponen
 
!Jumlah
=== Partisi epyc [[Berkas:GMB CPU icon.png|nirbing|80x80px]] ===
!Spesifikasi
|-
!Nama Partisi SLURM
|Nodes
|3
 
* epyc001 -> high memory
* epyc[002-003] -> normal
|-
|CPU per node
|1x AMD EPYC 7702P, 64 core / 128 thread, 2.0Ghz
|-
|RAM per node
|
* high memory -> 500GB efektif
* normal -> 240GB efektif
|-
|-
|Compute Node CPU
|Interkoneksi
|3 nodes
|Mellanox RoCE 100Gbps
|AMD EPYC 7702P 64 cores / 128 threads, 2.0Ghz. RAM 256GB
|-
'''Total 192 cores / 384 threads, RAM 768GB'''
! colspan="2" |Spesifikasi Compute Node GPU
|'''epyc''' (DEFAULT)
 
=== Partisi ampere[[Berkas:GMB GPU icon.png|nirbing|100x100px]] ===
|-
|-
|Compute Node GPU
|Nodes
|1 node
|1
|AMD Threadripper 3990X 64 cores / 128 threads, 2.9Ghz. RAM 128GB
2x NVIDIA RTX 3090 24GB GDDR6X
|'''gpu_ampere'''
|-
|-
|Storage HOME
|CPU
|1 sistem
|1x AMD Threadripper 3955WX, 16 core / 32 thread, 3.9Ghz
| colspan="2" |20TB, harddisk RAID-10, terpusat
|-
|-
|Storage SCRATCH
|RAM
|1 unit
|120GB efektif
| colspan="2" |1TB, SSD NVMe PCIe 4.0. Caching untuk read / write output software komputasi
|-
|-
|High-speed network
|GPU
| colspan="3" |100 GbE RDMA/RoCE, QSFP28 Mellanox
|2x NVIDIA RTX 3090 24GB NVLink
 
* ''Arsitektur NVIDIA Ampere''
* ''Tidak mendukung CUDA 11 kebawah.''
|-
|-
|Storage network
|Interkoneksi
| colspan="3" |10 GbE SFP+
|Mellanox RoCE 25Gbps
|}
|}


== '''Spesifikasi Sistem Operasi''' ==
== '''''Spesifikasi Interactive Node''''' ==
Interactive Node menjalankan sesi interaktif pada web service EFIRO seperti Jupyter dan ALELEON Virtual Desktop.
{| class="wikitable"
{| class="wikitable"
|+Sistem Operasi - per Januari 2022
! colspan="2" |Spesifikasi Interactive Node CPU
!Komponen
 
!Tipe
=== Partisi torti [[Berkas:GMB CPU icon.png|nirbing|80x80px]] ===
!Versi
!Spesifikasi
|-
|-
|Sistem Operasi
|Nodes
|Linux CentOS
|2
|7.9
|Kernel 5.4.100-1.el7.elrepo.x86_64
|-
|-
|Autentikasi Login
|CPU per node
| colspan="3" |OpenVPN, PAM
|AMD Threadripper 3990X, 32 v-core, 2.9Ghz
|-
|-
|Tampilan GUI
|RAM per node
|Custom - EFIRO OnDemand
|55GB efektif
|1.0
|Tampilan web browser untuk mengakses ALELEON Supercomputer
|-
|-
|GCC (default)
! colspan="2" |Spesifikasi Interactive Node GPU
|GNU RHEL
 
|10.2.0
=== Partisi tilla[[Berkas:GMB GPU icon.png|nirbing|100x100px]] ===
|C/C++/Fortran, optimasi arch untuk AMD EPYC
|-
|-
|Manajemen
|Nodes
|SLURM
|2
|20.11.5
|Dengan protokol PMIX, UCX, CUDA, auto load-balancing
|-
|-
|Module Environment
|CPU per node
|Lmod
|AMD Threadripper 3990X, 32 v-core, 2.9Ghz
|8.1.18
| -
|-
|-
|Modul instalasi user
|RAM per node
|Easybuild
|55GB efektif
|4.4.2
|Terintegrasi dengan Lmod
|-
|-
|Katalog lengkap software
|GPU per node
| colspan="3" |'''[[Katalog Software ALELEON Supercomputer]]'''
|1x NVIDIA RTX 3090 24GB
 
* ''Arsitektur NVIDIA Ampere''
* ''Tidak mendukung CUDA 11 kebawah.''
|}
|}


== '''EFIRO OnDemand''' ==
== '''''Spesifikasi Storage''''' ==
Mulai aktif pada awal tahun 2022, EFIRO OnDemand atau '''EFIRO''' untuk singkatnya adalah '''tampilan grafis (GUI) dari ALELEON Supercomputer yang dapat diakses melalui web browser'''. Melalui EFIRO, user dapat melakukan kegiatan esensial di superkomputer dari manajemen file (download / upload / editing) hingga job submission. EFIRO dirancang untuk memudahkan user dalam mengakses ALELEON Supercomputer khususnya untuk user awam yang pertama kali menggunakan superkomputer atau belum tanggap dengan sistem operasi Linux. EFIRO menyediakan tampilan secara grafis maupun terminal.
Sistem melakukan checkpoint snapshot storage per 24 jam.
 
* '''User dapat melayangkan permintaan ke email support untuk recovery data apabila tidak sengaja menghapus data.'''
 
{| class="wikitable"
! colspan="2" |Spesifikasi Stoarge Node
|-
|Jenis storage
|Block-storage, protokol NFS
|-
|HOME and workdir
|HDD SAS 83TiB efektif
|-
|SCRATCH caching
|SSD 1TB NVMe 4.0
|-
|Interkoneksi
|Mellanox RoCE 100Gbps
|}
{{DISPLAYTITLE:Spesifikasi ALELEON Supercomputer}}
__TOC__


[[Berkas:EFIRO Job Composer 1.png|nir|jmpl|1100x1100px|'''Tampilan EFIRO OnDemand untuk job submission di ALELEON Supercomputer''']]
== '''''Spesifikasi Software Sistem''''' ==
[[Berkas:EFIRO FTP.png|nir|jmpl|900x900px|'''Layaknya penyimpanan cloud, EFIRO dapat melayani fungsi manajemen data seperti upload, download, editing, rename, copy, move, dan masih banyak lagi.''']]


* '''Sistem Operasi'''
** Rocky Linux 8 (Red-hat based) dengan kernel 5.4.266-1.el8.elrepo.x86_64
* '''Autentikasi Login'''
** OpenVPN dan PAM
*'''Manajemen Job (job scheduler)'''
** SLURM 23.11.1-1 dengan protokol PMIX, UCX, CUDA, dan auto load-balancing menyesuaikan spesifikasi ALELEON Supercomputer.
*'''[[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Menggunakan_ALELEON_Supercomputer_via_EFIRO EFIRO Web Service]] untuk login web dengan tampilan grafis (GUI)'''
**Berbasiskan '''Open OnDemand 3.0''' dengan modifikasi oleh tim engineering EFISON menyesuaikan arsitektur dan fitur ALELEON Supercomputer
**''MIT License, maintained by Ohio Supercomputing Center (OSC), a member of the Ohio Technology Consortium, the technology and information division of the Ohio Department of High Education.''
* '''Manajemen modul software (Module Environment)'''
** Lmod 8.7.32
*'''Manajemen instalasi software (Package Manager)'''
**EasyBuild 4.9.4
**Spack (berbagai versi melalui modul - default Spack 0.21.1)
*'''Environment Python'''
**Basis Python 3, tidak mendukung Python 2
**Python 3 default OS versi 3.9.19
*'''Package Manager Python'''
**Anaconda (berbagai versi melalui modul)
**Mamba (berbagai versi melalui modul)
**Mendukung package manager pip dan conda. Ketentuan site-packages lihat '''[<nowiki/>[[Komputasi Python]]]'''
* '''Manajemen container'''
** Apptainer 1.3.3
*'''Manajemen compiling OS'''
**Automake, CMake, make (berbagai versi melalui modul)
* '''Profiler sistem'''
** CPU -> AMD μProf
* '''Library I/O sistem'''
** HDF5 1.14.1
** NetCDF 4.9.2
* '''Katalog lengkap modul software''' lihat laman:
[[Berkas:Banner Katalog 1 4 2.jpg|1000x1000px |link=Katalog Software ALELEON Supercomputer |alt=Katalog Software ALELEON Supercomputer ]]


User juga dapat mengakses ALELEON Supercomputer dengan cara klasik yaitu via software terminal dan login SSH.
__TANPADAFTARISI__
[[Berkas:Terminal.png|nir|jmpl|800x800px|'''Cara klasik mengakses ALELEON Supercomputer melalui software terminal dan login SSH.''']]

Revisi terkini sejak 6 Mei 2025 06.01

ALELEON Supercomputer saat ini menggunakan HPC ALELEON Mk.III - superkomputer custom EFISON generasi ketiga menyesuaikan arsitektur EFIRO.

Spesifikasi Compute Node

Compute Node menjalankan komputasi user via job submission SLURM (sbatch terminal atau Job Composer EFIRO).

Spesifikasi Compute Node CPU

Partisi epyc GMB CPU icon.png

Nodes 3
  • epyc001 -> high memory
  • epyc[002-003] -> normal
CPU per node 1x AMD EPYC 7702P, 64 core / 128 thread, 2.0Ghz
RAM per node
  • high memory -> 500GB efektif
  • normal -> 240GB efektif
Interkoneksi Mellanox RoCE 100Gbps
Spesifikasi Compute Node GPU

Partisi ampereGMB GPU icon.png

Nodes 1
CPU 1x AMD Threadripper 3955WX, 16 core / 32 thread, 3.9Ghz
RAM 120GB efektif
GPU 2x NVIDIA RTX 3090 24GB NVLink
  • Arsitektur NVIDIA Ampere
  • Tidak mendukung CUDA 11 kebawah.
Interkoneksi Mellanox RoCE 25Gbps

Spesifikasi Interactive Node

Interactive Node menjalankan sesi interaktif pada web service EFIRO seperti Jupyter dan ALELEON Virtual Desktop.

Spesifikasi Interactive Node CPU

Partisi torti GMB CPU icon.png

Nodes 2
CPU per node AMD Threadripper 3990X, 32 v-core, 2.9Ghz
RAM per node 55GB efektif
Spesifikasi Interactive Node GPU

Partisi tillaGMB GPU icon.png

Nodes 2
CPU per node AMD Threadripper 3990X, 32 v-core, 2.9Ghz
RAM per node 55GB efektif
GPU per node 1x NVIDIA RTX 3090 24GB
  • Arsitektur NVIDIA Ampere
  • Tidak mendukung CUDA 11 kebawah.

Spesifikasi Storage

Sistem melakukan checkpoint snapshot storage per 24 jam.

  • User dapat melayangkan permintaan ke email support untuk recovery data apabila tidak sengaja menghapus data.
Spesifikasi Stoarge Node
Jenis storage Block-storage, protokol NFS
HOME and workdir HDD SAS 83TiB efektif
SCRATCH caching SSD 1TB NVMe 4.0
Interkoneksi Mellanox RoCE 100Gbps

Spesifikasi Software Sistem

  • Sistem Operasi
    • Rocky Linux 8 (Red-hat based) dengan kernel 5.4.266-1.el8.elrepo.x86_64
  • Autentikasi Login
    • OpenVPN dan PAM
  • Manajemen Job (job scheduler)
    • SLURM 23.11.1-1 dengan protokol PMIX, UCX, CUDA, dan auto load-balancing menyesuaikan spesifikasi ALELEON Supercomputer.
  • [EFIRO Web Service] untuk login web dengan tampilan grafis (GUI)
    • Berbasiskan Open OnDemand 3.0 dengan modifikasi oleh tim engineering EFISON menyesuaikan arsitektur dan fitur ALELEON Supercomputer
    • MIT License, maintained by Ohio Supercomputing Center (OSC), a member of the Ohio Technology Consortium, the technology and information division of the Ohio Department of High Education.
  • Manajemen modul software (Module Environment)
    • Lmod 8.7.32
  • Manajemen instalasi software (Package Manager)
    • EasyBuild 4.9.4
    • Spack (berbagai versi melalui modul - default Spack 0.21.1)
  • Environment Python
    • Basis Python 3, tidak mendukung Python 2
    • Python 3 default OS versi 3.9.19
  • Package Manager Python
    • Anaconda (berbagai versi melalui modul)
    • Mamba (berbagai versi melalui modul)
    • Mendukung package manager pip dan conda. Ketentuan site-packages lihat [Komputasi Python]
  • Manajemen container
    • Apptainer 1.3.3
  • Manajemen compiling OS
    • Automake, CMake, make (berbagai versi melalui modul)
  • Profiler sistem
    • CPU -> AMD μProf
  • Library I/O sistem
    • HDF5 1.14.1
    • NetCDF 4.9.2
  • Katalog lengkap modul software lihat laman:

Katalog Software ALELEON Supercomputer