OpenMX: Perbedaan antara revisi

Dari ALELEON by EFISON
(overhaul wiki openmx 120124)
(→‎Batch Job: menambah karakter batch job)
 
(14 revisi perantara oleh pengguna yang sama tidak ditampilkan)
Baris 1: Baris 1:
[[Berkas:OpenMX Logo.png|nirbing|243x243px]]
[[Berkas:Logo OpenMX ALELEON tp.png|nirbing|325x325px]]


[https://www.openmx-square.org/ '''OpenMX'''] adalah software package untuk simulasi material skala nano berdasarkan DFT (Density Functional Theories), norm-conserving pseudopotensials, dan pseudo-atomic localized basis functinons. OpenMX merupakan software tidak berbayar dengan lisensi GNU GPLv3.
'''[[https://www.openmx-square.org/ OpenMX]]''' adalah software package untuk simulasi material skala nano berdasarkan DFT (Density Functional Theories), norm-conserving pseudopotensials, dan pseudo-atomic localized basis functinons. OpenMX merupakan software tidak berbayar dengan lisensi GNU GPLv3.


== '''Modul OpenMX''' ==
== '''''Modul OpenMX''''' ==
Berikut adalah detail versi OpenMX yang tersedia secara global di ALELEON Supercomputer:
Berikut adalah detail versi OpenMX yang tersedia secara global di ALELEON Supercomputer:
* Hubungi tim admin melalui email '''support@efisonlt.com''' untuk permintaan instalasi versi lain.
{| class="wikitable"
{| class="wikitable"
|+Modul OpenMX
|+Modul OpenMX
! rowspan="2" |Versi
! rowspan="3" |Versi
! rowspan="2" |Nama modul
! rowspan="3" |Nama modul
! rowspan="2" |Modul
! colspan="5" |Dukungan hardware
DEFAULT
|-
! colspan="4" |Dukungan hardware
! rowspan="2" |[[Berkas:GMB CPU icon.png|nirbing|50x50px]]
! rowspan="2" |[[Berkas:GMB GPU icon.png|nirbing|80x80px]]
! colspan="3" |Parallel run
|-
|-
!CPU
!OMP<sup>''1''</sup>
!GPU
!MPI<sup>''2''</sup>
!OMP
!Hybrid''<sup>3</sup>''
Threading
!MPI
multi-node
|-
|-
|3.9.9
|3.9.9
|openmx/3.9.9-GCC11.3-AOCL4.0
|'''<code>openmx/3.9.9-GCC11.3-AOCL4.0</code>'''
|V
!V
|V
!-
| -
! V
|V
!V
|V
!V
|}
|}
'''Note:'''
#'''OMP''' -> komputasi berjalan multi-core CPU melalui API OpenMP.
#'''MPI''' -> komputasi berjalan multi-core CPU dan multi-node melalui protokol MPI (Message Passing Interface).
# '''Hybrid''' -> komputasi berjalan multi-core CPU dan multi-node melalui kombinasi OpenMP dan MPI.


=== '''DATA.PATH pada File Input''' ===
== '''''DATA.PATH pada File Input''''' ==
User wajib mendefinisikan DATA.PATH berikut pada file input supaya OpenMX dapat berjalan. Daftar DATA.PATH per versi OpenMX lihat tabel di bawah.  
User wajib mendefinisikan '''<code>DATA.PATH</code>''' berikut pada file input supaya OpenMX dapat berjalan. Daftar '''<code>DATA.PATH</code>''' per versi OpenMX lihat tabel di bawah.  
  DATA.PATH        ''<data-path-OpenMX>''
  DATA.PATH        ''[data-path-OpenMX]''
{| class="wikitable"
{| class="wikitable"
|+Daftar DATA.PATH OpenMX
|+Daftar <code>DATA.PATH</code> OpenMX
!Versi
!Versi
!DATA.PATH
!<code>DATA.PATH</code>
|-
|-
|3.9.9
|3.9.9
|<code>/comp/openmx/3.9.9-GCC11.3-AOCL4.0/DFT_DATA19</code>
|<code>/comp/openmx/3.9.9-GCC11.3-AOCL4.0/DFT_DATA19</code>
|}
|}
=='''''Pilihan Menjalankan Komputasi'''''==
Berikut opsi menjalankan OpenMX, pilih sesuai kebutuhan:
{| class="wikitable"
!Jenis Komputasi
!Berjalan di
|-
|'''<big>[[https://wiki.efisonlt.com/wiki/ORCA#Batch_Job Batch Job]]</big>'''
*Menjalankan komputasi siap jalan melalui '''manajemen Slurm'''.
**''Job dijalankan oleh Slurm, user menunggu hingga selesai.''


== '''Pilihan MPI atau Threading OpenMP untuk Menjalankan OpenMX''' ==
* Koneksi user tidak mempengaruhi jalannya job, contoh:  
OpenMX dapat berjalan melalui metode paralelisasi MPI, threading OpenMP (OMP), atau Hybrid MPI/OMP. ALELEON Supercomputer menyerahkan keputusan kepada user untuk memilih metode paralelisasi tersebut melalui konfigurasi pada SLURM Submit Script (''lihat subbab Menjalankan OpenMX''):
** ''Job tidak akan berhenti ketika koneksi user terputus, atau''
*SBATCH ntasks mewakili jumlah task MPI sedangkan SBATCH cpus-per-task mewakili jumlah thread OMP.
** ''User keluar (log out) dari ALELEON.''
'''#SBATCH --ntasks''' ''-> mewakili jumlah task MPI''
* Job akan berhenti ketika:
'''#SBATCH --cpus-per-task''' ''-> mewakili jumlah thread OpenMP''
** ''Program komputasi selesai berjalan.''
*Apabila ingin Pure MPI maka isi jumlah SBATCH cpus-per-task dengan 1.
** ''Program menjumpai error sehingga selesai prematur.''  
''# Pure MPI''
|'''[<nowiki/>[[Spesifikasi ALELEON Supercomputer#Spesifikasi%20Compute%20Node|Compute node]]]:'''
'''#SBATCH --ntasks='''''<isi-sesuai-keinginan>''
*Partisi epyc [[Berkas:GMB CPU icon.png|nirbing|50x50px]]
'''#SBATCH --cpus-per-task=1'''
|}
*Apabila ingin Hybrid MPI/OMP maka isi kedua parameter tersebut. Perlu diingat bahwa total core CPU yang digunakan adalah ntasks * cpus-per-task. Contoh berikut menggunakan 2 proses MPI dan 4 thread OMP per MPI sehingga total menggunakan 8 core CPU:
=== Batch Job ===
''# Hybrid MPI/OMP, contoh dengan 2 proses MPI dan 4 thread OMP per MPI.''
Tersedia dua pilihan tampilan yaitu terminal dan web EFIRO melalui app Job Composer. Pilih sesuai keinginan.
'''#SBATCH --ntasks=2'''
 
'''#SBATCH --cpus-per-task=4'''
''<small><code>(klik expand / kembangkan)</code></small>''
*Apabila ingin Pure OMP maka isi jumlah ntasks dengan 1.
''# Pure OMP''
'''#SBATCH --ntasks=1'''
'''#SBATCH --cpus-per-task='''''<isi-sesuai-keinginan>''
=='''Menjalankan OpenMX'''==
User dapat menjalankan komputasi dengan pilihan cara melalui terminal atau website EFIRO ''(klik expand atau kembangkan)''.
===Opsi Menggunakan terminal (SLURM sbatch)===
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
! colspan="2" |Langkah Menjalankan OpenMX di Terminal
!- Langkah Batch Job di Terminal -
[[Berkas:Sbatch Terminal.png|nirbing|500x500px]]
[[Berkas:Sbatch terminal display rev2.png|tepi|400x400px]]
|-
!''Tutorial ini mengasumsikan user familiar dengan terminal Linux''
|-
|[[Berkas:EOD Apps Shell full.png|kiri|nirbing|101x101px]]'''''Menggunakan terminal!'''''
* ''User EFIRO klik app '''<code>Aleleon Shell Access</code>'''''
*''atau menu '''<code>Apps > Aleleon Shell Access</code>'''''
|-
!<big><nowiki>---| 0 |---</nowiki></big>
|-
!Apakah bisa menjalankan job?
|-
| Lakukan [https: / wiki.efisonlt.com wiki Menggunakan_ALELEON_Supercomputer_via_Terminal#1_ |User dengan '''Kredit Core Hour''' disarankan cek kuota terlebih dulu:
$ '''sausage'''
*'''''Untuk akun institusi ikuti petunjuk support EFISON.'''''
*Detail limit alokasi komputasi job lihat langkah '''<big>2B</big>'''.
*Bila butuh tambah kuota, lihat '''[[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Core_Hour#Penggunaan_Kredit_Core_Hour top up Kredit Core Hour]]'''
|-
!<big><nowiki>---| 1 |---</nowiki></big>
|-
!Lakukan persiapan:
|-
|'''Siapkan file komputasi yang dibutuhkan:'''
* Upload / download file lihat '''[[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Manajemen_File_di_ALELEON_Supercomputer#Upload_dan_Download_File Upload / Dow][https://wiki.efisonlt.com/wiki/Manajemen_File_di_ALELEON_Supercomputer#Upload_dan_Download_File nload File HOME]]'''
*'''Perhatikan [[https://wiki.efisonlt.com/wiki/OpenMX#DATA.PATH_pada_File_Input nilai DATA.PATH]] pada file input.'''
|-
!<big><nowiki>---| 2A |---</nowiki></big>
|-
|-
|'''0'''
|Buat '''Submit Script''' yaitu 'formulir' untuk menjalankan job komputasi:
|
*Nama file bebas dengan format .sh, contoh '''<code>submit.sh</code>'''
=====Login SSH=====
*''Biasanya submit script berada satu folder dengan file komputasi.''
Tatacara login SSH lihat laman [https://wiki.efisonlt.com/wiki/Menggunakan_ALELEON_Supercomputer_via_Terminal#1_|_Login_SSH '''Login SSH ALELEON Supercomputer'''].
$ '''nano submit.sh'''
''<small>atau vim</small>''
|-
|-
|'''1'''
!
|
=====Menyiapkan File Komputasi=====
Siapkan file yang dibutuhkan untuk komputasi user, rekomendasi dalam satu folder per job:
*File input dan data komputasi.
**User dapat upload / download file ke ALELEON dengan [[Upload File dengan Aplikasi FTP|'''software FTP''']].
*Membuat '''SLURM Submit Script''' yaitu 'formulir' untuk menjalankan job komputasi.
**Nama script bebas dengan format file .sh (bash), contoh ''<code>my_job_submission.sh</code>''
$ mkdir kerjaanskripsi
$ cd kerjaanskripsi
$ nano my_job_submission.sh
''... upload / menyiapkan / edit input dan data komputasi ...''
|-
|-
| rowspan="2" |'''2'''
|Contoh template Submit Script:
|
* Ikuti petunjuk '''NOTES dan alur script''' di dalamnya.
=====Template SLURM Submit Script OpenMX=====
''<small><code>Klik expand / kembangkan</code></small>''
Ikuti panduan template berikut dan petunjuk NOTES di dalamnya.
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
!Template SLURM Submit Script untuk OpenMX
!- Template Submit Script OpenMX -
[[Berkas:GMB CPU icon.png|nirbing|80x80px]]
|-
|'''[[Berkas:GMB warning wololo.png|nirbing|50x50px]] OpenMX dapat dijalankan dengan opsi paralelisasi:'''
* MPI, OpenMP, atau hybid MPI / OMP.
* Detail lihat subbab '''[[https://wiki.efisonlt.com/wiki/OpenMX#Pilihan_MPI_atau_Threading_OpenMP_untuk_Menjalankan_OpenMX Pilihan MPI atau Threading OpenMP di OpenMX]]'''
|-
|-
|<syntaxhighlight lang="bash" line="1">
|<syntaxhighlight lang="bash" line="1">
Baris 146: Baris 173:
</syntaxhighlight>
</syntaxhighlight>
|}
|}
|-
!
|-
|-
|
|
=====Panduan Nilai Maksimal SBATCH untuk OpenMX=====
*''Detail Submit Script lihat '''[<nowiki/>[[Submit Script ALELEON Supercomputer|Subm]][[Submit Script ALELEON Supercomputer|it Script ALELEON Supercomputer]]]'''''  
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
! colspan="5" |Panduan Nilai Maksimal SBATCH ntasks, mem, gpus, time
|-
!Skenario Komputasi
! (CPU)''<sup>1</sup>''
!mem
(RAM)
!gpus
(GPU)
!time
(time limit)
|-
|Fair policy usage untuk akumulasi semua job<sup>''2''</sup>
|128
|128GB
|2
| rowspan="3" |3-00:00:00
atau


72:00:00
*''Untuk SBATCH notifikasi email status jalannya job lihat '''[[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Submit_Script_ALELEON_Supercomputer#SBATCH_untuk_notifikasi_email_SLURM Slurm Jojo]]'''''
*''Detail menjalankan program MPI lihat '''[<nowiki/>[[MPI ALELEON Supercomputer]]]'''''
|-
|-
|OpenMX''<sup>3</sup>''
!<big><nowiki>---| 2B |---</nowiki></big>
|384
|240GB''<sup>2</sup>''
|0
|-
|-
|OpenMX versi CPU di high-mem node*Tambahkan <code>#SBATCH --nodelist=epyc001</code>
!Berapa alokasi komputasi yang bisa digunakan?
|128
|500GB
|0
|-
|-
| colspan="5" |'''''Keterangan:'''''
|SBATCH komputasi (ntasks, mem, time, dll) '''punya limit''' berdasarkan:
# Jumlah CPU = ntasks * cpus-per-task
*Sisa Core Hour user dan '''[<nowiki/>[[Limitasi Fair Usage ALELEON Supercomputer|Fair Usage Limit]]]'''
# Limitasi untuk menjaga kualitas layanan ALELEON Supercomputer.
*Spesifikasi sistem dan software komputasi.
#* User dapat mengajukan permintaan buka limitasi apabila butuh alokasi lebih.
Untuk melihat limit, jalankan perintah berikut:
#*Info detail buka laman [[Limitasi Fair Usage ALELEON Supercomputer|'''Limitasi Fair Usage ALELEON Supercomputer''']]
$ '''slimit-mpi'''
#OpenMX mendukung komputasi paralel MPI. Ketika jumlah ntasks lebih dari 128:
[[Berkas:GMB warning wololo.png|nirbing|50x50px]] '''Note untuk saat ini:'''
#*SLURM otomatis menjalankan job pada multi-node.
* ''Jalankan ketika tidak ada job user yang berjalan atau antri.''
#*Parameter mem adalah alokasi memori RAM per-node.
*''Sementara berlaku untuk akun perseorangan saja.''
#*Info detail buka laman [[MPI ALELEON Supercomputer|'''MPI ALELEON Supercomputer''']].
|-
|-
! colspan="5" |Keterangan tambahan
!<big><nowiki>---| 3 |---</nowiki></big>
|-
|-
| colspan="5" |
|Jalankan job dengan perintah:
*'''Untuk akun perseorangan dengan Kredit Core Hour:'''
  $ '''sbatch ''[nama-submit-script]'''''
**SLURM akan menahan job apabila:
***ntasks * time (jam) lebih besar dari sisa CPU Core Hour user.
''Contoh:''
***gpus * time (jam) lebih besar dari sisa GPU Hour user.
$ sbatch submit.sh
**Cek sisa Kredit Core Hour melalui perintah:
  $ '''sausage'''
*Info SBATCH lebih detail lihat laman [[Submit Script ALELEON Supercomputer|'''Submit Script ALELEON Supercomputer''']]
|}
|-
|-
|'''3'''
!<big><nowiki>---| 4 |---</nowiki></big>
|
=====Menjalankan Job Komputasi=====
Jalankan job dengan perintah sbatch.
$ '''sbatch''' '''''<nama-SLURM-Submit-script>'''''
Contoh menjalankan nama script <code>my_job_submission.sh</code>.
$ sbatch my_job_submission.sh
|-
|-
|'''4A'''
|User dapat melihat status jalannya job dengan perintah:
|User dapat melihat status jalannya job dengan perintah squeue berikut.
*Apabila tidak ada output artinya tidak ada job user yang berjalan / antri pada waktu itu.
  $ '''squeue -ul $USER'''
  $ '''squeue -ul $USER'''
Berikut adalah daftar STATE (ST) dari squeue yang menunjukkan status berjalannya job:
*''Apabila tidak ada di squeue artinya job bersangkutan telah berakhir.''
*''Waktu jalan job tidak bergantung oleh alokasi limit waktu di script.''
*''Job berakhir ketika komputasi selesai atau ada error.''
{| class="wikitable"
{| class="wikitable"
|+Daftar STATE squeue SLURM
|+Kolom ST atau STATE menunjukkan status jalannya job:
|-
!STATE
!STATE
!Kepanjangan
!Penjelasan
!Penjelasan
|-
|-
|R
|<code>'''R (RUN)'''</code>
|RUN
|Job berjalan
|Job berjalan
|-
|-
|PD
|<code>'''PD (PENDING)'''</code>
|PENDING
|Job tertahan, lihat '''[<nowiki/>[[Daftar Job Reason ALELEON Supercomputer|Daftar Job Reason]]]'''
|Job tertahan, lihat keterangan [[Daftar Reason NODELIST ALELEON Supercomputer|'''NODELIST(REASON)''']]
|-
|-
|CG
|<code>'''CG (COMPLETING)'''</code>
|COMPLETING
|Job selesai dan dalam proses clean-up
|Job selesai dan dalam proses clean-up SLURM
|-
|-
|CA
|<code>'''CA (CANCELED)'''</code>
|CANCELED
|Job dibatalkan user
|Job dibatalkan oleh user
|-
|-
|PR
|<code>'''PR (PREEMPETED)'''</code>
|PREEMPETED
|Job dibatalkan admin, alasan dikabarkan via email
|Job dibatalkan oleh admin EFISON, alasan dikabarkan melalui email
|-
|-
|S
|<code>'''S (SUSPENDED)'''</code>
|SUSPENDED
|Job ditahan admin, alasan dikabarkan via email
|Job ditahan oleh admin EFISON
|}
|}
|-
|-
|'''4B'''
! <big><nowiki>---| 5 |---</nowiki></big>
|
|-
=====Menghentikan Job Komputasi=====
|User dapat memantau file output dengan perintah Unix seperti:
Apabila user ingin membatalkan job, gunakan perintah scancel berdasarkan job ID.
*'''<code>ls</code>''', '''<code>cat</code>''', '''<code>more</code>''', '''<code>tail</code>''', dll
*Job ID dapat dilihat melalui perintah squeue pada kolom JOBID.
|-
*User hanya bisa membatalkan job submission milik user sendiri.
!<big><nowiki>---| 6 |---</nowiki></big>
  $ '''scancel <''job-ID-submission-user''>'''
|-
Contoh user membatalkan job submission milik user dengan ID 231.
|Apabila user ingin menghentikan job yang berjalan, jalankan perintah:
  $ scancel 231
  '''$ scancel ''[job-ID]'''''
''Job ID ada pada squeue diatas.''
contoh membatalkan job ID 231:
  $ '''scancel 231'''
|-
!---
|}
|}
===Opsi Menggunakan Web EFIRO (EFIRO Job Composer)===
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
! colspan="2" |Langkah Menjalankan OpenMX di Web EFIRO
! - Langkah Batch Job di EFIRO Job Composer -
[[Berkas:Efirojobcomposer3.png|nirbing|500x500px]]
[[Berkas:Efiro jobcomposer display.png|nirbing|400x400px]]
|-
!<big><nowiki>---| 0 |---</nowiki></big>
|-
!Apakah bisa menjalankan job?
|-
|User dengan '''Kredit Core Hour''' disarankan cek kuota terlebih dulu:
#Buka menu '''<big><code>Apps > Aleleon Shell Access</code></big>'''
#Jalankan:
$ '''sausage'''
*'''''Untuk akun institusi ikuti petunjuk support EFISON.'''''
*Detail limit alokasi komputasi job lihat langkah '''<big>5B</big>'''.
*Bila butuh tambah kuota, lihat '''[[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Core_Hour#Penggunaan_Kredit_Core_Hour top up Kredit Core Hour]]'''
|-
!<big><nowiki>---| 1 |---</nowiki></big>
|-
| Lakukan [https: / wiki.efisonlt.com wiki Menggunakan_ALELEON_Supercomputer_via_Terminal#1_ |'''[[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Menggunakan_ALELEON_Supercomputer_via_EFIRO#Login_Web_EFIRO Login ke web EFIRO]]''' ALELEON Supercomputer.
|-
!<big><nowiki>---| 2 |---</nowiki></big>
|-
|-
|'''0'''
|
|
=====Login Web EFIRO=====
{| class="wikitable"
*[[Koneksi VPN ALELEON Supercomputer|'''User harus terhubung ke jaringan VPN ALELEON Supercomputer''']].
|[[Berkas:EOD Apps Job Composer full.png|nirbing|126x126px]]
*Buka alamat web '''<code><nowiki>http://aleleon.ood</nowiki></code>''' lalu masukkan username dan password user.
| Klik app '''<code><big>Job Composer</big></code>''' di homepage EFIRO.
**Bagi user Linux, buka alamat <code>'''<nowiki>http://10.192.50.11</nowiki>'''</code>
*''atau'' menu '''<big><code>Apps > Job Composer</code></big>'''
|}
|-
|[[Berkas:Jcnewjobmarked.png|nirbing|170x170px]]Pilih menu <big>'''<code>New Job > From Template</code>'''</big>
|-
! <big><nowiki>---| 3 |---</nowiki></big>
|-
!Buat ruang job untuk menjalankan komputasi:
|-
|-
|'''1'''
|
|
=====Membuka Job Composer dan Memilih Template Job=====
*Buka menu '''<code>Jobs</code>''' > '''<code>Jobs Composer</code>''' pada dashboard EFIRO.
*Pilih '''<code>New Job</code>''' > '''<code>From Template</code>'''
[[Berkas:Efirojobcomposermenu.png|nir|jmpl|Menu '''<code>Jobs</code> > <code>Jobs Composer</code>''']][[Berkas:Jcnewjobmarked.png|al=|nir|jmpl|220x220px|Menu '''<code>New Jobs</code>''' > '''<code>From Template</code>''']]
|-
|'''2'''
|[[Berkas:Jcselecttemplate3.png|nirbing|600x600px]]
*PIlih template OpenMX yang diinginkan.
*Isi atau ganti kolom '''<code>Job Name</code>''' sesuai keinginan user.
*Apabila sudah selesai, klik '''<code>Create New Job</code>'''.
{| class="wikitable"
{| class="wikitable"
! colspan="2" |Template OpenMX yang tersedia
|+Pilih template OpenMX yang diinginkan:
|-
|-
!Nama Template
!Nama Template
Baris 288: Baris 295:
|OpenMX 3.9.9
|OpenMX 3.9.9
|Menjalankan OpenMX 3.9.9
|Menjalankan OpenMX 3.9.9
|}
|}Kemudian isi '''Job Name''' dan klik '''<code><big>Create New Job</big></code>'''
|-
|'''3'''
|
=====Menyiapkan File Komputasi=====
[[Berkas:Jcjoboption3.png|nirbing|600x600px]]


Gunakan menu <code>'''Edit Files'''</code> untuk upload file komputasi yang dibutuhkan.
[[Berkas:Jctemplate-2.png|nirbing]]
*Laman Edit Files juga dapat melakukan download / edit / rename / delete file.
*Fitur upload pada Edit Files mempunyai limit kapasitas '''2GB per file'''.
**Gunakan [[Upload File dengan Aplikasi FTP|'''aplikasi FTP''']] untuk upload file tunggal diatas 2GB.
|-
|-
| rowspan="2" |'''4'''
! <big><nowiki>---| 4 |---</nowiki></big>
|
=====Melengkapi Submit Script=====
Submit Script adalah "formulir" untuk menjalankan job komputasi user.
*Lengkapi Submit Script melalui menu '''<code>Open Editor</code>'''.
*Ikuti petunjuk NOTES di dalamnya.
*Jangan lupa klik <code>'''Save'''</code> setiap sekali mengubah script.
[[Berkas:Jceditor3.png|al=|nirbing|500x500px]]
|-
|-
|
!Lakukan persiapan:
=====Panduan Nilai Maksimal SBATCH=====
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
! colspan="5" |Panduan Nilai Maksimal SBATCH ntasks, mem, gpus, time
|-
|-
!Skenario Komputasi
| '''Siapkan file komputasi yang dibutuhkan di ruang job:'''
!(CPU)''<sup>1</sup>''
*''Pastikan ruang job yang dipilih adalah yang akan digunakan.''
!mem
 
(RAM)
*Upload / download / edit file via menu <code>'''<big>Edit Files</big>'''</code>
!gpus
 
(GPU)
*Upload / download file tunggal diatas 2GB gunakan '''[[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Manajemen_File_di_ALELEON_Supercomputer#Upload_/_Download_Ruang_Job_Composer software FTP]]'''
!time
'''Perhatikan [[https://wiki.efisonlt.com/wiki/OpenMX#DATA.PATH_pada_File_Input nilai DATA.PATH]] pada file input.'''
(time limit)
|-
|Fair policy usage untuk akumulasi semua job<sup>''2''</sup>
|128
|128GB
|2
| rowspan="3" |3-00:00:00
atau


72:00:00
[[Berkas:JC job menu.png|nirbing|400x400px]]
|-
|OpenMX''<sup>3</sup>''
|384
|240GB''<sup>2</sup>''
|0
|-
|-
|OpenMX versi CPU di high-mem node*Tambahkan <code>#SBATCH --nodelist=epyc001</code>
!<big><nowiki>---| 5A |---</nowiki></big>
|128
|500GB
|0
|-
|-
| colspan="5" |'''''Keterangan:'''''
|Lengkapi '''Submit Script''' melalui tombol '''<code><big>Open Editor</big></code>'''
# Jumlah CPU = ntasks * cpus-per-task
*Submit script adalah 'formulir' untuk menjalankan job komputasi.
# Limitasi untuk menjaga kualitas layanan ALELEON Supercomputer.
*Ikuti petunjuk '''NOTES dan alur script''' di dalamnya.
#* User dapat mengajukan permintaan buka limitasi apabila butuh alokasi lebih.
*Klik '''<code><big>Save</big></code>''' setiap kali mengubah script.
#*Info detail buka laman [[Limitasi Fair Usage ALELEON Supercomputer|'''Limitasi Fair Usage ALELEON Supercomputer''']]
[[Berkas:Jceditor3.png|al=|nirbing|400x400px]]
#OpenMX mendukung komputasi paralel MPI. Ketika jumlah ntasks lebih dari 128:
#*SLURM otomatis menjalankan job pada multi-node.
#*Parameter mem adalah alokasi memori RAM per-node.
#*Info detail buka laman [[MPI ALELEON Supercomputer|'''MPI ALELEON Supercomputer''']].
|-
|-
! colspan="5" |Keterangan tambahan
|[[Berkas:GMB warning wololo.png|nirbing|50x50px]] '''OpenMX dapat dijalankan dengan opsi paralelisasi:'''
* MPI, OpenMP, atau hybid MPI / OMP.
* Detail lihat subbab '''[[https://wiki.efisonlt.com/wiki/OpenMX#Pilihan_MPI_atau_Threading_OpenMP_untuk_Menjalankan_OpenMX Pilihan MPI atau Threading OpenMP di OpenMX]]'''
|-
|-
| colspan="5" |
!
*'''Untuk akun perseorangan dengan Kredit Core Hour:'''
**SLURM akan menahan job apabila:
***ntasks * time (jam) lebih besar dari sisa CPU Core Hour user.
***gpus * time (jam) lebih besar dari sisa GPU Hour user.
**Cek sisa Kredit Core Hour melalui menu '''<code>Open Terminal</code>''' dan jalankan perintah:
$ '''sausage'''
[[Berkas:Jcjoboption4.png|nirbing|600x600px]]
*Info SBATCH lebih detail lihat laman [[Submit Script ALELEON Supercomputer|'''Submit Script ALELEON Supercomputer''']]
|}
|-
|-
|'''5'''
|
|
=====Menjalankan Job Komputasi=====
*''Detail Submit Script lihat '''[<nowiki/>[[Submit Script ALELEON Supercomputer|Subm]][[Submit Script ALELEON Supercomputer|it Script ALELEON Supercomputer]]]'''''
Jalankan job dengan klik tombol '''<code>Submit</code>'''.


[[Berkas:Jcsubmit2.png|al=|nirbing|600x600px]]
*''Untuk SBATCH notifikasi email status jalannya job lihat '''[[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Submit_Script_ALELEON_Supercomputer#SBATCH_untuk_notifikasi_email_SLURM Slurm Jojo]]'''''
*''Detail menjalankan program MPI lihat '''[<nowiki/>[[MPI ALELEON Supercomputer]]]'''''
|-
!<big><nowiki>---| 5B |---</nowiki></big>
|-
|SBATCH komputasi (ntasks, mem, time, dll) '''punya limit''' berdasarkan:
*Sisa Core Hour user dan '''[<nowiki/>[[Limitasi Fair Usage ALELEON Supercomputer|Fair Usage Limit]]]'''
*Spesifikasi sistem dan software komputasi.
Untuk melihat limit, jalankan perintah berikut:
$ '''slimit-hympi'''
[[Berkas:GMB warning wololo.png|nirbing|50x50px]] '''Note untuk saat ini:'''
*''Jalankan ketika tidak ada job user yang berjalan atau antri.''
*''Sementara berlaku untuk akun perseorangan saja.''
|-
!<big><nowiki>---| 6 |---</nowiki></big>
|-
|Jalankan job dengan klik tombol '''<code><big>Submit</big></code>'''
[[Berkas:JC job runstop.png|al=|nirbing|400x400px]]
*''Waktu jalan job tidak bergantung oleh alokasi limit waktu di script.''
*''Job berakhir ketika komputasi selesai atau ada error.''
{| class="wikitable"
{| class="wikitable"
|+''Penjelasan kolom '''<code>Status</code>,''' pantau dengan refresh halaman job''
|+Kolom Status menunjukkan status jalannya job:
|-
!Status
!Status
!Arti
!Arti
|-
|-
|Not Submitted
|'''Not Submitted'''
|Job belum pernah dijalankan.
|Job belum pernah dijalankan.
|-
|-
|Running
|'''Running'''
|Job berjalan.
|Job berjalan.
|-
|-
|Queue
|'''Queue'''
|Job mengantri dan belum berjalan.
|Job mengantri dan belum berjalan.
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
!Langkah melihat status job ketika queue
|-
|-
|Buka <code>'''Jobs > Active Jobs'''</code> pada dashboard EFIRO.
|'''Completed'''
*Lakukan langkah sesuai gambar dibawah ini
|Job selesai berjalan.
[[Berkas:Efiroqueueedit.png|al=|jmpl|''Halaman Active Jobs. Ubah opsi '''<code>Your jobs</code>''' untuk melihat status job user saja. Klik simbol '''>''' untuk melihat status job pending pada kolom '''Reason'''. Arti reason lihat laman '''[[Daftar Reason NODELIST ALELEON Supercomputer]].'''''|kiri]]
|-
|'''Failed'''
|Job berhenti karena error atau di stop user.
|-
! colspan="2" |'''Melihat alasan job yang queue:'''
|-
| colspan="2" |[[Berkas:Active Jobs detail.png|nir|jmpl|300x300px|''Buka menu '''Apps >''' '''Active Jobs''' di homepage EFIRO. Ubah opsi All jobs ke '''Your Jobs'''. Klik simbol '''>''' untuk melihat status job yang pending pada kolom Reason. Arti reason lihat laman '''[[Daftar Job Reason ALELEON Supercomputer]]''''']]
|}
|}
|-
|-
|Completed
!<big><nowiki>---| 7 |---</nowiki></big>
|Job selesai berjalan.
|-
|Lihat output file komputasi pada kolom '''Folder Contents'''
*Atau dengan membuka menu '''<code><big>Edit Files</big></code>'''
[[Berkas:Jcfoldercontentsedit.png|al=|nir|jmpl|''Kolom '''<code>Folder Contents</code>''''']]
|-
!<big><nowiki>---| 8 |---</nowiki></big>
|-
|Apabila user ingin menghentikan job yang berjalan, klik '''<code><big>Stop</big></code>'''
|-
|-
|Failed
!<big><nowiki>---| 9 |---</nowiki></big>
|Job berhenti di tengah jalan, bisa karena di Stop atau Delete oleh user.
|}
=====Menghentikan Job Komputasi=====
Untuk menghentikan job yang tengah berjalan, klik tombol '''<code>Stop</code>'''.
 
[[Berkas:Stop.png|nirbing|600x600px]]
|-
|-
|'''6A'''
|Untuk menghapus ruang job dan datanya:
|
*Pilih ruang job yang akan dihapus.
=====Melihat Output Komputasi=====
*Perhatikan opsi ini juga '''menghapus data di ruang job tersebut.'''
User dapat melihat output file komputasi pada kolom '''<code>Folder Contents</code>'''
*Klik menu '''<code><big>Delete</big></code>'''
*Atau dengan membuka '''<code>Edit Files</code>'''
[[Berkas:JC delete menu.png|nirbing|400x400px]]
[[Berkas:Jcfoldercontentsedit.png|al=|nir|jmpl|Kolom '''<code>Folder Contents</code>'''.]]
|-
|-
|'''6B'''
!---
|User dapat '''menjalankan ulang ruang job yang sama''' dengan mengklik kembali tombol '''<code>Submit</code>'''.
|}
|}
=='''Notifikasi Status Jalannya Komputasi via email'''==
 
SLURM ALELEON Supercomputer dapat mengirim notifikasi email kepada user dengan nama "Jojo" untuk mengabarkan status berjalannya job komputasi user. Silahkan tambahan SBATCH berikut pada Submit Script apabila user ingin menerima notifikasi email dari SLURM:<syntaxhighlight lang="bash">
== '''''Pilihan MPI atau Threading OpenMP untuk Menjalankan OpenMX''''' ==
#SBATCH --mail-user=<alamat-email-user>  
OpenMX di ALELEON Supercomputer dapat berjalan melalui paralelisasi '''MPI''', '''OpenMP''' (OMP), atau keduanya ('''hybrid MPI/OMP''') untuk menggunakan multi-core CPU dan multi-node. Admin menyerahkan keputusan kepada user untuk memilih metode paralelisasi melalui parameter Submit Script berikut:
#SBATCH --mail-type=BEGIN,END,FAIL
*'''SBATCH ntasks mewakili jumlah task MPI sedangkan SBATCH cpus-per-task mewakili jumlah thread OMP.'''
</syntaxhighlight>SBATCH mail-type mengatur konten email notifikasi SLURM dengan pilihan opsi yang sekiranya berguna untuk user:
'''#SBATCH --ntasks''' ''-> mewakili jumlah task MPI''
*BEGIN -> notifikasi job sudah mulai
'''#SBATCH --cpus-per-task''' ''-> mewakili jumlah thread OpenMP''
*END -> notifikasi job sudah selesai beserta cuplikan 20 baris terakhir dari file SBATCH output dan error.
*'''Apabila ingin MPI saja <<big>Pure MPI></big>,''' isi jumlah SBATCH cpus-per-task dengan 1:
*FAIL -> notifikasi apabila job gagal berjalan atau berhenti tidak sewajarnya.
''# Pure MPI''
*TIME_LIMIT_50 -> job telah berjalan dengan durasi waktu 50% time limit.
'''#SBATCH --ntasks='''''[isi-sesuai-keinginan]''
*TIME_LIMIT_80 -> job telah berjalan dengan durasi waktu 80% time limit.
'''#SBATCH --cpus-per-task=1'''
=='''Pelaporan Kendala dan Support'''==
*'''Apabila ingin <big>Hybrid MPI/OMP</big>,''' isi kedua parameter tersebut:
**'''Total core CPU''' yang digunakan adalah '''ntasks * cpus-per-task'''.
**Contoh menggunakan 2 proses MPI dan 4 thread OMP per MPI sehingga total menggunakan 8 core CPU:
''# Hybrid MPI/OMP, contoh dengan 2 proses MPI dan 4 thread OMP per MPI.''
'''#SBATCH --ntasks=2'''
'''#SBATCH --cpus-per-task=4'''
*'''Apabila ingin OMP saja <<big>Pure OMP</big>>,''' isi jumlah ntasks dengan 1:
''# Pure OMP''
'''#SBATCH --ntasks=1'''
'''#SBATCH --cpus-per-task='''''[isi-sesuai-keinginan]''
''Kembali ke subbab '''[[https://wiki.efisonlt.com/wiki/ORCA#Batch_Job Batch Job]]'''''
 
=='''''Pelaporan Kendala dan Support'''''==
Apabila menjumpai masalah teknis dalam menjalankan komputasi, silahkan lapor dengan klik gambar berikut ini.
Apabila menjumpai masalah teknis dalam menjalankan komputasi, silahkan lapor dengan klik gambar berikut ini.


Revisi terkini sejak 13 Mei 2025 01.56

Logo OpenMX ALELEON tp.png

[OpenMX] adalah software package untuk simulasi material skala nano berdasarkan DFT (Density Functional Theories), norm-conserving pseudopotensials, dan pseudo-atomic localized basis functinons. OpenMX merupakan software tidak berbayar dengan lisensi GNU GPLv3.

Modul OpenMX

Berikut adalah detail versi OpenMX yang tersedia secara global di ALELEON Supercomputer:

  • Hubungi tim admin melalui email support@efisonlt.com untuk permintaan instalasi versi lain.
Modul OpenMX
Versi Nama modul Dukungan hardware
GMB CPU icon.png GMB GPU icon.png Parallel run
OMP1 MPI2 Hybrid3
3.9.9 openmx/3.9.9-GCC11.3-AOCL4.0 V - V V V

Note:

  1. OMP -> komputasi berjalan multi-core CPU melalui API OpenMP.
  2. MPI -> komputasi berjalan multi-core CPU dan multi-node melalui protokol MPI (Message Passing Interface).
  3. Hybrid -> komputasi berjalan multi-core CPU dan multi-node melalui kombinasi OpenMP dan MPI.

DATA.PATH pada File Input

User wajib mendefinisikan DATA.PATH berikut pada file input supaya OpenMX dapat berjalan. Daftar DATA.PATH per versi OpenMX lihat tabel di bawah. 

DATA.PATH        [data-path-OpenMX]
Daftar DATA.PATH OpenMX
Versi DATA.PATH
3.9.9 /comp/openmx/3.9.9-GCC11.3-AOCL4.0/DFT_DATA19

Pilihan Menjalankan Komputasi

Berikut opsi menjalankan OpenMX, pilih sesuai kebutuhan:

Jenis Komputasi Berjalan di
[Batch Job]
  • Menjalankan komputasi siap jalan melalui manajemen Slurm.
    • Job dijalankan oleh Slurm, user menunggu hingga selesai.
  • Koneksi user tidak mempengaruhi jalannya job, contoh:
    • Job tidak akan berhenti ketika koneksi user terputus, atau
    • User keluar (log out) dari ALELEON.
  • Job akan berhenti ketika:
    • Program komputasi selesai berjalan.
    • Program menjumpai error sehingga selesai prematur.
 [Compute node]:
  • Partisi epyc GMB CPU icon.png

Batch Job

Tersedia dua pilihan tampilan yaitu terminal dan web EFIRO melalui app Job Composer. Pilih sesuai keinginan.

(klik expand / kembangkan)

- Langkah Batch Job di Terminal -

Sbatch terminal display rev2.png

Tutorial ini mengasumsikan user familiar dengan terminal Linux
EOD Apps Shell full.png
Menggunakan terminal!
  • User EFIRO klik app Aleleon Shell Access
  • atau menu Apps > Aleleon Shell Access
---| 0 |---
Apakah bisa menjalankan job?
User dengan Kredit Core Hour disarankan cek kuota terlebih dulu: 
$ sausage
  • Untuk akun institusi ikuti petunjuk support EFISON.
  • Detail limit alokasi komputasi job lihat langkah 2B.
  • Bila butuh tambah kuota, lihat [top up Kredit Core Hour]
---| 1 |---
Lakukan persiapan:
Siapkan file komputasi yang dibutuhkan:
---| 2A |---
Buat Submit Script yaitu 'formulir' untuk menjalankan job komputasi:
  • Nama file bebas dengan format .sh, contoh submit.sh
  • Biasanya submit script berada satu folder dengan file komputasi.
$ nano submit.sh
atau vim
Contoh template Submit Script:
  • Ikuti petunjuk NOTES dan alur script di dalamnya.

Klik expand / kembangkan

- Template Submit Script OpenMX -

GMB CPU icon.png

GMB warning wololo.png OpenMX dapat dijalankan dengan opsi paralelisasi: 
#!/bin/bash

# -----------------------------------------------------
# Template SLURM Submit Script
# OpenMX | rev.080124
# 
# NOTES: 
# 1. Isi bagian yang ditandai 4 garing (////).
# 2. Template ini bersifat referensi.
#    User dapat mengubah bagian yang perlu diubah.
# 3. Perhatikan rate CCH = ntasks * cpus-per-task.
# -----------------------------------------------------

# -----------------------------------------------------
# Alokasi komputasi SBATCH, input, dan module
# -----------------------------------------------------

# Alokasi jumlah core thread CPU, mewakili jumlah task MPI
#SBATCH --ntasks=////

# Alokasi jumlah thread OMP per task MPI
#SBATCH --cpus-per-task=////

# Alokasi jumlah memori RAM (satuan GB)
#SBATCH --mem=////GB

# Alokasi limit waktu menjalankan job
# Format HH:MM:SS atau D-HH:MM:SS
#SBATCH --time=////

# Definisi file untuk menampung output terminal program
#SBATCH --output=result-%j.txt

# Definisi file untuk menampung output error log    
#SBATCH --error=error-%j.txt 

# Nama input file OpenMX yang dijalankan
INPUT_FILE='////.dat'

# Memuat modul software OpenMX
# Daftar modul lihat subbab "Modul OpenMX" di atas 
module load openmx////

# ----------------------------------------------------
# Script jalannya program
# ----------------------------------------------------

# Definisi threading OMP 
export OMP_NUM_THREADS=${SLURM_CPUS_PER_TASK}

# Perintah menjakankan OpenMX
mpirun -np ${SLURM_NTASKS} openmx ${INPUT_FILE}
---| 2B |---
Berapa alokasi komputasi yang bisa digunakan?
SBATCH komputasi (ntasks, mem, time, dll) punya limit berdasarkan:
  • Sisa Core Hour user dan [Fair Usage Limit]
  • Spesifikasi sistem dan software komputasi.

Untuk melihat limit, jalankan perintah berikut: 

$ slimit-mpi

GMB warning wololo.png Note untuk saat ini:

  • Jalankan ketika tidak ada job user yang berjalan atau antri.
  • Sementara berlaku untuk akun perseorangan saja.
---| 3 |---
Jalankan job dengan perintah: 
$ sbatch [nama-submit-script]

Contoh:
$ sbatch submit.sh
---| 4 |---
User dapat melihat status jalannya job dengan perintah: 
$ squeue -ul $USER
  • Apabila tidak ada di squeue artinya job bersangkutan telah berakhir.
  • Waktu jalan job tidak bergantung oleh alokasi limit waktu di script.
  • Job berakhir ketika komputasi selesai atau ada error.
Kolom ST atau STATE menunjukkan status jalannya job:
STATE Penjelasan
R (RUN) Job berjalan
PD (PENDING) Job tertahan, lihat [Daftar Job Reason]
CG (COMPLETING) Job selesai dan dalam proses clean-up
CA (CANCELED) Job dibatalkan user
PR (PREEMPETED) Job dibatalkan admin, alasan dikabarkan via email
S (SUSPENDED) Job ditahan admin, alasan dikabarkan via email
---| 5 |---
User dapat memantau file output dengan perintah Unix seperti:
  • ls, cat, more, tail, dll
---| 6 |---
Apabila user ingin menghentikan job yang berjalan, jalankan perintah: 
$ scancel [job-ID]

Job ID ada pada squeue diatas.
contoh membatalkan job ID 231:
$ scancel 231
---
- Langkah Batch Job di EFIRO Job Composer -

Efiro jobcomposer display.png

---| 0 |---
Apakah bisa menjalankan job?
User dengan Kredit Core Hour disarankan cek kuota terlebih dulu:
  1. Buka menu Apps > Aleleon Shell Access
  2. Jalankan:
$ sausage
  • Untuk akun institusi ikuti petunjuk support EFISON.
  • Detail limit alokasi komputasi job lihat langkah 5B.
  • Bila butuh tambah kuota, lihat [top up Kredit Core Hour]
---| 1 |---
[Login ke web EFIRO] ALELEON Supercomputer.
---| 2 |---
EOD Apps Job Composer full.png Klik app Job Composer di homepage EFIRO.
  • atau menu Apps > Job Composer
Jcnewjobmarked.pngPilih menu New Job > From Template
---| 3 |---
Buat ruang job untuk menjalankan komputasi:
Pilih template OpenMX yang diinginkan:
Nama Template Penjelasan
OpenMX 3.9.9 Menjalankan OpenMX 3.9.9
Kemudian isi Job Name dan klik Create New Job

Jctemplate-2.png

---| 4 |---
Lakukan persiapan:
Siapkan file komputasi yang dibutuhkan di ruang job:
  • Pastikan ruang job yang dipilih adalah yang akan digunakan.
  • Upload / download / edit file via menu Edit Files
  • Upload / download file tunggal diatas 2GB gunakan [software FTP]

Perhatikan [nilai DATA.PATH] pada file input.

JC job menu.png

---| 5A |---
Lengkapi Submit Script melalui tombol Open Editor
  • Submit script adalah 'formulir' untuk menjalankan job komputasi.
  • Ikuti petunjuk NOTES dan alur script di dalamnya.
  • Klik Save setiap kali mengubah script.

GMB warning wololo.png OpenMX dapat dijalankan dengan opsi paralelisasi:
---| 5B |---
SBATCH komputasi (ntasks, mem, time, dll) punya limit berdasarkan:
  • Sisa Core Hour user dan [Fair Usage Limit]
  • Spesifikasi sistem dan software komputasi.

Untuk melihat limit, jalankan perintah berikut: 

$ slimit-hympi

GMB warning wololo.png Note untuk saat ini:

  • Jalankan ketika tidak ada job user yang berjalan atau antri.
  • Sementara berlaku untuk akun perseorangan saja.
---| 6 |---
Jalankan job dengan klik tombol Submit

  • Waktu jalan job tidak bergantung oleh alokasi limit waktu di script.
  • Job berakhir ketika komputasi selesai atau ada error.
Kolom Status menunjukkan status jalannya job:
Status Arti
Not Submitted Job belum pernah dijalankan.
Running Job berjalan.
Queue Job mengantri dan belum berjalan.
Completed Job selesai berjalan.
Failed Job berhenti karena error atau di stop user.
Melihat alasan job yang queue:
Buka menu Apps > Active Jobs di homepage EFIRO. Ubah opsi All jobs ke Your Jobs. Klik simbol > untuk melihat status job yang pending pada kolom Reason. Arti reason lihat laman Daftar Job Reason ALELEON Supercomputer
---| 7 |---
Lihat output file komputasi pada kolom Folder Contents
  • Atau dengan membuka menu Edit Files
Kolom Folder Contents
---| 8 |---
Apabila user ingin menghentikan job yang berjalan, klik Stop
---| 9 |---
Untuk menghapus ruang job dan datanya:
  • Pilih ruang job yang akan dihapus.
  • Perhatikan opsi ini juga menghapus data di ruang job tersebut.
  • Klik menu Delete

JC delete menu.png

---

Pilihan MPI atau Threading OpenMP untuk Menjalankan OpenMX

OpenMX di ALELEON Supercomputer dapat berjalan melalui paralelisasi MPI, OpenMP (OMP), atau keduanya (hybrid MPI/OMP) untuk menggunakan multi-core CPU dan multi-node. Admin menyerahkan keputusan kepada user untuk memilih metode paralelisasi melalui parameter Submit Script berikut:

  • SBATCH ntasks mewakili jumlah task MPI sedangkan SBATCH cpus-per-task mewakili jumlah thread OMP.
#SBATCH --ntasks -> mewakili jumlah task MPI
#SBATCH --cpus-per-task -> mewakili jumlah thread OpenMP
  • Apabila ingin MPI saja <Pure MPI>, isi jumlah SBATCH cpus-per-task dengan 1:
# Pure MPI 
#SBATCH --ntasks=[isi-sesuai-keinginan]
#SBATCH --cpus-per-task=1
  • Apabila ingin Hybrid MPI/OMP, isi kedua parameter tersebut:
    • Total core CPU yang digunakan adalah ntasks * cpus-per-task.
    • Contoh menggunakan 2 proses MPI dan 4 thread OMP per MPI sehingga total menggunakan 8 core CPU:
# Hybrid MPI/OMP, contoh dengan 2 proses MPI dan 4 thread OMP per MPI.
#SBATCH --ntasks=2
#SBATCH --cpus-per-task=4
  • Apabila ingin OMP saja <Pure OMP>, isi jumlah ntasks dengan 1:
# Pure OMP 
#SBATCH --ntasks=1
#SBATCH --cpus-per-task=[isi-sesuai-keinginan]

Kembali ke subbab [Batch Job]

Pelaporan Kendala dan Support

Apabila menjumpai masalah teknis dalam menjalankan komputasi, silahkan lapor dengan klik gambar berikut ini.

Wiki-pelaporankendala.jpg

---

Bila terdapat pertanyaan lainnya, silahkan hubungi admin EFISON melalui email: 

support@efisonlt.com
Diperoleh dari "https://wiki.efisonlt.com/index.php?title=OpenMX&oldid=1984"