Anaconda Python (depreciated): Perbedaan antara revisi
WilsonLisan (bicara | kontrib) (overhaul hingga membuat conda env) |
WilsonLisan (bicara | kontrib) kTidak ada ringkasan suntingan |
||
(33 revisi perantara oleh pengguna yang sama tidak ditampilkan) | |||
Baris 1: | Baris 1: | ||
[[Berkas: | {| class="wikitable" | ||
!<nowiki>HULALA WOLOLO DEPRECIATED CONTENT !!</nowiki> | |||
[[Berkas:Wololo stoppp.png|nirbing|300x300px]]Halaman ini dipindah ke laman baru: | |||
== '''[[Komputasi Python]]''' == | |||
|} | |||
[https://www.anaconda.com/ '''Anaconda'''] adalah suite katalog packages Python dan R untuk komputasi ''data science'' dan ''machine learning''. | [https://www.anaconda.com/ '''Anaconda'''] adalah suite katalog packages Python dan R untuk komputasi ''data science'' dan ''machine learning''. | ||
= | [[Berkas:Pythonanaconda.png|al=|nirbing|500x500px]] | ||
== '''Modul Anaconda Python dan NVIDIA CUDA Toolkit''' == | |||
Berikut adalah detail versi Anaconda yang tersedia secara global di ALELEON Supercomputer dimana menggunakan Python 3 sebagai standar. Sementara itu User membutuhkan modul NVIDIA CUDA Toolkit untuk menjalankan Python dengan akselerasi GPU NVIDIA. Detail versi NVIDIA CUDA disertakan dalam tabel berikut. ''(klik expand atau kembangkan'') | |||
== '''Modul Anaconda Python''' == | {| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed" | ||
Berikut adalah detail versi Anaconda yang tersedia secara global di ALELEON Supercomputer dimana menggunakan Python 3 sebagai standar. | ! colspan="7" |Modul Anaconda dan NVIDIA CUDA Toolkit | ||
{| class="wikitable" | |- | ||
| | ! colspan="7" |Modul Anaconda | ||
|- | |||
! rowspan="2" |Versi | ! rowspan="2" |Versi | ||
! rowspan="2" |Nama modul | ! rowspan="2" |Nama modul | ||
Baris 28: | Baris 32: | ||
|Anaconda3/2020.11 | |Anaconda3/2020.11 | ||
|3.8.5 | |3.8.5 | ||
| rowspan=" | | rowspan="4" |V | ||
| rowspan=" | | rowspan="4" |V | ||
| rowspan=" | | rowspan="4" |V''<sup>1</sup>'' | ||
| rowspan=" | | rowspan="4" | V''<sup>2</sup>'' | ||
|- | |- | ||
|Anaconda 3 2021.05 | |Anaconda 3 2021.05 | ||
Baris 39: | Baris 43: | ||
|Anaconda 3 2022.05 | |Anaconda 3 2022.05 | ||
|Anaconda3/2022.05 | |Anaconda3/2022.05 | ||
|3.9.12 | |||
|- | |||
|Anaconda 3 2023.07-2 | |||
|Anaconda3/2023.07-2 | |||
''atau'' Anaconda3 | ''atau'' Anaconda3 | ||
|3. | |3.11.4 | ||
| | |- | ||
! colspan="7" |Modul NVIDIA CUDA Toolkit | |||
|- | |||
|CUDA 11.2 dengan cuDNN 8.1.1 | |||
|cuda/11.2-cuDNN8.1.1 | |||
| colspan="5" rowspan="6" | | |||
|- | |||
|CUDA 11.6 dengan cuDNN 8.3.3 | |||
|cuda/11.6-cuDNN8.3.3 | |||
|- | |- | ||
|CUDA 11.8 dengan cuDNN 8.6.0 | |||
|cuda/11.8-cuDNN8.6.0 | |||
|- | |- | ||
| | |CUDA 12.0 dengan cuDNN 8.7.0 | ||
|cuda/12.0-cuDNN8.7.0 | |||
|- | |- | ||
|CUDA 12.1 dengan cuDNN 8.8.1 | |||
|cuda/12.1-cuDNN8.8.1 | |||
|- | |- | ||
| | |CUDA 12.3 dengan cuDNN 8.9.6 | ||
|cuda/12.3-cuDNN8.9.6 | |||
''atau'' cuda | |||
|} | |} | ||
'''''Keterangan:''''' | |||
# Melalui package Python yang mendukung OpenMP seperti [https://cython.org/ '''Cython'''], [https://numba.pydata.org/ '''Numba'''], [https://pythran.readthedocs.io/en/latest/ '''Pythran'''], [https://www.pypy.org/ '''PyPy'''], dll. | |||
# Melalui [https://mpi4py.readthedocs.io/en/stable/ '''MPI for Python (MPI4PY)'''] | |||
=='''Membuat Conda Environment dan Instalasi Package Python'''== | |||
Sebelum menjalankan komputasi, ALELEON Supercomputer mensyaratkan user membuat '''Conda Environment''' yaitu 'ruang isolasi' untuk instalasi package Python masing-masing user. | |||
{| class="wikitable" | {| class="wikitable" | ||
! colspan="2" | | ! colspan="2" |Langkah Membuat Conda Environment di ALELEON Supercomputer | ||
''*tidak menkonsumsi Kredit Core Hour'' | |||
|- | |- | ||
|'''0''' | |'''0''' | ||
|Instalasi package dilakukan melalui '''terminal'''.*Bagi user yang login ke web EFIRO, buka menu '''<code>Clusters</code> > <code>Aleleon Shell Access</code>'''. | |Instalasi package dilakukan melalui '''terminal'''. | ||
* Bagi user yang login ke web EFIRO, buka menu '''<code>Clusters</code> > <code>Aleleon Shell Access</code>'''. | |||
[[Berkas:Shellaccess.png|nirbing|200x200px]] | [[Berkas:Shellaccess.png|nirbing|200x200px]] | ||
|- | |- | ||
|'''1''' | |'''1''' | ||
|Aktifkan modul Anaconda, | |Aktifkan modul Anaconda, disarankan menggunakan Anaconda terbaru: | ||
$ module load '''Anaconda3''' | $ module load '''Anaconda3''' | ||
Apabila ingin menggunakan versi Anaconda lainnya, lihat '''[[Python#Modul Anaconda|subbab Modul Anaconda]]'''. | Apabila ingin menggunakan versi Anaconda lainnya, lihat '''[[Python#Modul Anaconda|subbab Modul Anaconda]]'''. | ||
|- | |- | ||
|'''2''' | |'''2''' | ||
|Buat Conda Environment secara default di direktori HOME dengan format perintah: | | | ||
$ conda create --name '''''<nama-conda-environment>''''' | === Membuat Conda Environment === | ||
Buat Conda Environment secara default di direktori HOME dengan format perintah: | |||
$ conda create --name '''''<nama-conda-environment>''''' pip | |||
''Contoh:'' | ''Contoh:'' | ||
''$ conda create --name'' ''kerjaanskripsi'' | ''$ conda create --name'' ''kerjaanskripsi pip'' | ||
|- | |- | ||
|''' | |'''3A''' | ||
|Aktifkan Conda Environment dengan format berikut: | | | ||
=== Mengaktifkan Conda Environment dan Instalasi Package Python === | |||
Aktifkan Conda Environment dengan format berikut: | |||
$ source activate $CONDA/'''''<nama-conda-environment''''' | $ source activate $CONDA/'''''<nama-conda-environment''''' | ||
Baris 105: | Baris 112: | ||
Conda Environment aktif ditandai dengan tulisan nama env pada bash terminal seperti ini: | Conda Environment aktif ditandai dengan tulisan nama env pada bash terminal seperti ini: | ||
''(kerjaanskripsi)'' [wololo@login ~]$ | ''(kerjaanskripsi)'' [wololo@login ~]$ | ||
Lakukan instalasi package Python (contoh Tensorflow, PyTorch) yang dibutuhkan dengan '''<code>pip</code>''' | |||
''(kerjaanskripsi)'' $ pip install '''''<nama-package-Python>''''' | |||
|- | |- | ||
|''' | |'''3B''' | ||
| | | | ||
==== Instalasi Package | ==== Instalasi Package Jupyter ==== | ||
Instal package jupyter bagi user yang ingin menggunakan sesi interaktif Jupyter | |||
''(kerjaanskripsi)'' $ '''pip install jupyter''' | |||
''(kerjaanskripsi)'' $ '''pip install jupyterlab''' | |||
|- | |- | ||
| colspan="2" | | | colspan="2" | | ||
==== ''' | === Menonaktifkan Conda Environment === | ||
User dapat kembali | User dapat menonaktifkan Conda Environment yang sedang aktif dengan perintah: | ||
$ conda deactivate | |||
=== '''Mengaktifkan Kembali Conda Environment User''' === | |||
User dapat kembali mengaktifkan Conda Environment yang dibuat dengan langkah 1 dan 3 diatas: | |||
$ module load Anaconda3 | $ module load Anaconda3 | ||
$ source activate $CONDA/'''''<nama-conda-environment>''''' | $ source activate $CONDA/'''''<nama-conda-environment>''''' | ||
Baris 129: | Baris 134: | ||
$ conda-env list | $ conda-env list | ||
=== Menghapus Conda Environment === | |||
User dapat menghapus Conda Environment dengan format perintah: | User dapat menghapus Conda Environment dengan format perintah: | ||
$ conda remove -n '''''<nama-conda-environment>''''' --all | $ conda remove -n '''''<nama-conda-environment>''''' --all | ||
|} | |} | ||
=='''Alternatif Menjalankan Anaconda Python di ALELEON Supercomputer'''== | |||
ALELEON Supercomputer menawarkan user untuk menjalankan Anaconda Python dengan pilihan skema: | |||
{| class="wikitable" | |||
|- | |||
![[Berkas:Efirojobcomposer3.png|pus|nirbing|400x400px]]--- | |||
'''[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Anaconda_Python#Menjalankan_Anaconda_Python_Melalui_Job_Submission Menjalankan Anaconda Python melalui Job Submission]''' | |||
|- | |||
| | |||
*Menjalankan file Python siap jalan melalui scheduler SLURM. | |||
*Untuk menjalankan file ipynb harus dikonversi ke file Python. | |||
*Berjalan di [https://wiki.efisonlt.com/wiki/Spesifikasi_ALELEON_Supercomputer#Spesifikasi_Compute_Node '''Compute Node''']: | |||
**Versi CPU dengan alokasi hingga CPU 128 core dan RAM 500GB. | |||
***Python versi MPI (MPI4PY) dapat berjalan paralel hingga CPU 384 core. | |||
**Versi GPU dengan alokasi hingga CPU 32 core, RAM 120GB, dan 2 GPU. | |||
|- | |||
![[Berkas:Efirojupyterlab.png|nirbing|400x400px]] | |||
'''[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Anaconda_Python#Menjalankan_Anaconda_Python_dengan_Sesi_Interaktif_Jupyter Menjalankan Anaconda Python dengan sesi interaktif Jupyter]''' | |||
|- | |||
| | |||
*Menjalankan Anaconda Python melalui sesi interaktif via Jupyter Notebook / Lab. | |||
*Berjalan di [https://wiki.efisonlt.com/wiki/Spesifikasi_ALELEON_Supercomputer#Spesifikasi_Interactive_Node '''Interactive Node''']: | |||
**Torti dengan spesifikasi CPU 32 core dan RAM 64GB. | |||
**Tilla dengan spesifikasi CPU 32 core, RAM 64GB, dan 1 GPU. | |||
|} | |||
== '''Menjalankan Anaconda Python Melalui Job Submission''' == | |||
User dapat menjalankan komputasi dengan pilihan cara melalui tampilan terminal atau website EFIRO ''(klik expand atau kembangkan)''. | |||
===Opsi Menggunakan terminal (SLURM sbatch)=== | |||
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed" | |||
! colspan="2" | Langkah Menjalankan Anaconda Python di Terminal | |||
[[Berkas:Sbatch Terminal.png|nirbing|500x500px]] | |||
|- | |||
|'''0''' | |||
| | |||
=====Login SSH===== | |||
Tatacara login SSH lihat laman [https://wiki.efisonlt.com/wiki/Menggunakan_ALELEON_Supercomputer_via_Terminal#1_|_Login_SSH '''Login SSH ALELEON Supercomputer''']. | |||
|- | |||
|'''1''' | |||
| | |||
=====Menyiapkan File Komputasi===== | |||
Siapkan file yang dibutuhkan untuk komputasi user, rekomendasi dalam satu folder per job: | |||
*File input dan data komputasi. | |||
**User dapat upload / download file ke ALELEON dengan [[Upload File dengan Aplikasi FTP|'''software FTP''']]. | |||
*Membuat '''SLURM Submit Script''' yaitu 'formulir' untuk menjalankan job komputasi. | |||
**Nama script bebas dengan format file .sh (bash), contoh ''<code>my_job_submission.sh</code>'' | |||
|- | |||
| rowspan="2" |'''2''' | |||
| | |||
=====Template SLURM Submit Script Anaconda Python===== | |||
Ikuti panduan template berikut dan petunjuk NOTES di dalamnya. | |||
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed" | |||
!Template SLURM Submit Script untuk Anaconda Python versi CPU | |||
|- | |||
|<syntaxhighlight lang="bash" line="1"> | |||
#!/bin/bash | |||
# ----------------------------------------------------- | |||
# Template SLURM Submit Script | |||
# Anaconda Python (CPU) | |||
# | |||
# NOTES: | |||
# 1. Isi bagian yang ditandai 4 garing (////). | |||
# 2. Template ini bersifat referensi. | |||
# User dapat mengubah bagian yang perlu diubah. | |||
# 3. Pastikan user sudah membuat Conda Environment. | |||
# ----------------------------------------------------- | |||
# ----------------------------------------------------- | |||
# Alokasi komputasi SBATCH dan file input | |||
# ----------------------------------------------------- | |||
# Alokasi jumlah core thread CPU | |||
#SBATCH --ntasks=//// | |||
# Alokasi jumlah memori RAM (satuan GB) | |||
#SBATCH --mem=////GB | |||
# Alokasi limit waktu menjalankan job | |||
# Format HH:MM:SS atau D-HH:MM:SS | |||
#SBATCH --time=//// | |||
# Definisi file untuk menampung output terminal program | |||
#SBATCH --output=result-%j.txt | |||
# Definisi file untuk menampung output error log | |||
#SBATCH --error=error-%j.txt | |||
# Nama Conda Environment yang digunakan | |||
CONDA_NAME=//// | |||
# Nama program Python yang dijalankan | |||
INPUT_FILE=////.py | |||
# ---------------------------------------------------- | |||
# Script jalannya program | |||
# ---------------------------------------------------- | |||
# Mengaktifkan Conda Environment | |||
module load Anaconda3 | |||
source activate ${CONDA}/${CONDA_NAME} | |||
# Menjalankan file Python | |||
python3 ${INPUT_FILE} | |||
</syntaxhighlight> | |||
|} | |||
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed" | |||
!Template SLURM Submit Script untuk Anaconda Python versi GPU | |||
|- | |||
|<syntaxhighlight lang="bash" line="1"> | |||
#!/bin/bash | |||
# ----------------------------------------------------- | |||
# Template SLURM Submit Script | |||
# Anaconda Python (GPU) | |||
# | |||
# NOTES: | |||
# 1. Isi bagian yang ditandai 4 garing (////). | |||
# 2. Template ini bersifat referensi. | |||
# User dapat mengubah bagian yang perlu diubah. | |||
# 3. Pastikan user sudah membuat Conda Environment. | |||
# ----------------------------------------------------- | |||
# ----------------------------------------------------- | |||
# Alokasi komputasi SBATCH dan file input | |||
# ----------------------------------------------------- | |||
# Menggunakan partisi compute node GPU | |||
#SBATCH --partition=ampere | |||
# Alokasi jumlah core thread CPU | |||
#SBATCH --ntasks=//// | |||
# Alokasi jumlah GPU | |||
#SBATCH --gpus=//// | |||
# Alokasi jumlah memori RAM (satuan GB) | |||
#SBATCH --mem=////GB | |||
# Alokasi limit waktu menjalankan job | |||
# Format HH:MM:SS atau D-HH:MM:SS | |||
#SBATCH --time=//// | |||
# Definisi file untuk menampung output terminal program | |||
#SBATCH --output=result-%j.txt | |||
# Definisi file untuk menampung output error log | |||
#SBATCH --error=error-%j.txt | |||
# Nama Conda Environment yang digunakan | |||
CONDA_NAME=//// | |||
# Nama program Python yang dijalankan | |||
INPUT_FILE=////.py | |||
# ---------------------------------------------------- | |||
# Script jalannya program | |||
# ---------------------------------------------------- | |||
# Memuat modul NVIDIA CUDA default | |||
module load cuda | |||
# Mengaktifkan Conda Environment | |||
module load Anaconda3 | |||
source activate ${CONDA}/${CONDA_NAME} | |||
===[[ | # Menjalankan file Python | ||
python3 ${INPUT_FILE} | |||
</syntaxhighlight> | |||
|} | |||
|- | |||
| | |||
===== Panduan Nilai Maksimal SBATCH untuk Anaconda Python ===== | |||
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed" | |||
! colspan="5" |Panduan Nilai Maksimal SBATCH ntasks, mem, gpus, time | |||
|- | |||
!Skenario Komputasi | |||
!ntasks | |||
(CPU) | |||
!mem | |||
(RAM) | |||
!gpus | |||
(GPU) | |||
!time | |||
(time limit) | |||
|- | |||
|Fair policy usage untuk akumulasi semua job<sup>''1''</sup> | |||
|128 | |||
|128GB | |||
|2 | |||
| rowspan="5" | 3-00:00:00 | |||
atau | |||
72:00:00 | |||
|- | |||
|Python versi CPU | |||
|128 | |||
|240GB | |||
|0 | |||
|- | |||
|Python versi CPU di high-mem node | |||
*Tambahkan <code>#SBATCH --nodelist=epyc001</code> | |||
|128 | |||
|500GB | |||
|0 | |||
|- | |||
|Python versi GPU | |||
|32 | |||
|120GB | |||
| 2 | |||
|- | |||
|Python versi MPI (MPI4PY)''<sup>2</sup>'' | |||
|384 | |||
|240GB''<sup>2</sup>'' | |||
|0 | |||
|- | |||
| colspan="5" | '''''Keterangan:''''' | |||
#Limitasi untuk menjaga kualitas layanan ALELEON Supercomputer. | |||
#*User dapat mengajukan permintaan buka limitasi apabila butuh alokasi lebih. | |||
#*Info detail buka laman [[Limitasi Fair Usage ALELEON Supercomputer|'''Limitasi Fair Usage ALELEON Supercomputer''']] | |||
#MPI4PY mendukung komputasi paralel MPI. Ketika jumlah ntasks lebih dari 128: | |||
#*SLURM otomatis menjalankan job pada multi-node. | |||
#*Parameter mem adalah alokasi memori RAM per-node. | |||
#*Info detail buka laman [[MPI ALELEON Supercomputer|'''MPI ALELEON Supercomputer''']]. | |||
|- | |||
! colspan="5" |Keterangan tambahan | |||
|- | |||
| colspan="5" | | |||
*'''Untuk akun perseorangan dengan Kredit Core Hour:''' | |||
**SLURM akan menahan job apabila: | |||
***ntasks * time (jam) lebih besar dari sisa CPU Core Hour user. | |||
***gpus * time (jam) lebih besar dari sisa GPU Hour user. | |||
**Cek sisa Kredit Core Hour melalui perintah: | |||
$ '''sausage''' | |||
*Info SBATCH lebih detail lihat laman [[Submit Script ALELEON Supercomputer|'''Submit Script ALELEON Supercomputer''']] | |||
|} | |||
|- | |||
|'''3''' | |||
| | |||
=====Menjalankan Job Komputasi===== | |||
Jalankan job dengan perintah sbatch. | |||
$ '''sbatch''' '''''<nama-SLURM-Submit-script>''''' | |||
Contoh menjalankan nama script <code>my_job_submission.sh</code>. | |||
$ sbatch my_job_submission.sh | |||
|- | |||
|'''4A''' | |||
|User dapat melihat status jalannya job dengan perintah squeue berikut. | |||
*Apabila tidak ada output artinya tidak ada job user yang berjalan / antri pada waktu itu. | |||
$ '''squeue -ul $USER''' | |||
Berikut adalah daftar STATE (ST) dari squeue yang menunjukkan status berjalannya job: | |||
{| class="wikitable" | {| class="wikitable" | ||
|+ | |+Daftar STATE squeue SLURM | ||
! | !STATE | ||
!Kepanjangan | |||
!Penjelasan | !Penjelasan | ||
|- | |- | ||
| | |R | ||
| | |RUN | ||
|Job berjalan | |||
|- | |||
|PD | |||
|PENDING | |||
|Job tertahan, lihat keterangan [[Daftar Reason NODELIST ALELEON Supercomputer|'''NODELIST(REASON)''']] | |||
|- | |||
|CG | |||
|COMPLETING | |||
|Job selesai dan dalam proses clean-up SLURM | |||
|- | |||
| CA | |||
|CANCELED | |||
|Job dibatalkan oleh user | |||
|- | |||
|PR | |||
| PREEMPETED | |||
|Job dibatalkan oleh admin EFISON, alasan dikabarkan melalui email | |||
|- | |- | ||
| | |S | ||
| | |SUSPENDED | ||
| Job ditahan oleh admin EFISON | |||
|} | |} | ||
|- | |- | ||
|'''4B''' | |||
| | | | ||
=====Menghentikan Job Komputasi===== | |||
Apabila user ingin membatalkan job, gunakan perintah scancel berdasarkan job ID. | |||
*Job ID dapat dilihat melalui perintah squeue pada kolom JOBID. | |||
*User hanya bisa membatalkan job submission milik user sendiri. | |||
$ '''scancel <''job-ID-submission-user''>''' | |||
Contoh user membatalkan job submission milik user dengan ID 231. | |||
$ scancel 231 | |||
|} | |} | ||
===Opsi Menggunakan Web EFIRO (EFIRO Job Composer)=== | |||
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed" | {| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed" | ||
! | ! colspan="2" |Langkah Menjalankan Anaconda Python di Web EFIRO | ||
[[Berkas:Efirojobcomposer3.png|nirbing|500x500px]] | |||
|- | |||
|'''0''' | |||
| | |||
===== Login Web EFIRO===== | |||
*[[Koneksi VPN ALELEON Supercomputer|'''User harus terhubung ke jaringan VPN ALELEON Supercomputer''']]. | |||
*Buka alamat web '''<code><nowiki>http://aleleon.ood</nowiki></code>''' lalu masukkan username dan password user. | |||
**Bagi user Linux, buka alamat <code>'''<nowiki>http://10.192.50.11</nowiki>'''</code> | |||
|- | |- | ||
|'''1''' | |||
| | | | ||
=====Membuka Job Composer dan Memilih Template Job===== | |||
*Buka menu '''<code>Jobs</code>''' > '''<code>Jobs Composer</code>''' pada dashboard EFIRO. | |||
*Pilih '''<code>New Job</code>''' > '''<code>From Template</code>''' | |||
[[Berkas:Efirojobcomposermenu.png|nir|jmpl|''Menu '''<code>Jobs</code> > <code>Jobs Composer</code>''''']][[Berkas:Jcnewjobmarked.png|al=|nir|jmpl|220x220px|''Menu '''<code>New Jobs</code>''' > '''<code>From Template</code>''''']] | |||
|- | |||
|'''2''' | |||
|[[Berkas:Jcselecttemplate3.png|nirbing|600x600px]] | |||
*PIlih template Anaconda Python yang diinginkan. | |||
*Isi atau ganti kolom '''<code>Job Name</code>''' sesuai keinginan user. | |||
*Apabila sudah selesai, klik '''<code>Create New Job</code>'''. | |||
{| class="wikitable" | |||
! colspan="2" |Template Anaconda Python yang tersedia | |||
|- | |||
!Nama Template | |||
!Penjelasan | |||
|- | |||
|Anaconda Python (CPU) | |||
|Menjalankan Anaconda Python versi CPU | |||
|- | |||
|Anaconda Python (GPU) | |||
|Menjalankan Anaconda Python versi GPU | |||
|} | |} | ||
|- | |||
|'''3''' | |||
| | |||
=====Menyiapkan File Komputasi===== | |||
[[Berkas:Jcjoboption3.png|nirbing|600x600px]] | |||
= | Gunakan menu <code>'''Edit Files'''</code> untuk upload file komputasi yang dibutuhkan. | ||
*Laman Edit Files juga dapat melakukan download / edit / rename / delete file. | |||
*Fitur upload pada Edit Files mempunyai limit kapasitas '''2GB per file'''. | |||
**Gunakan [[Upload File dengan Aplikasi FTP|'''aplikasi FTP''']] untuk upload file tunggal diatas 2GB. | |||
|- | |||
| rowspan="2" |'''4''' | |||
| | |||
=====Melengkapi Submit Script===== | |||
Submit Script adalah "formulir" untuk menjalankan job komputasi user. | |||
*Lengkapi Submit Script melalui menu '''<code>Open Editor</code>'''. | |||
*Ikuti petunjuk NOTES di dalamnya. | |||
*Jangan lupa klik <code>'''Save'''</code> setiap sekali mengubah script. | |||
[[Berkas:Jceditor3.png|al=|nirbing|500x500px]] | |||
|- | |||
| | |||
=====Panduan Nilai Maksimal SBATCH untuk Anaconda Python===== | |||
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed" | |||
! colspan="5" | Panduan Nilai Maksimal SBATCH ntasks, mem, gpus, time | |||
|- | |||
!Skenario Komputasi | |||
!ntasks | |||
(CPU) | |||
!mem | |||
(RAM) | |||
!gpus | |||
(GPU) | |||
!time | |||
(time limit) | |||
|- | |||
|Fair policy usage untuk akumulasi semua job<sup>''1''</sup> | |||
|128 | |||
|128GB | |||
|2 | |||
| rowspan="5" |3-00:00:00 | |||
atau | |||
72:00:00 | |||
|- | |||
|Python versi CPU | |||
|128 | |||
*''' | |240GB | ||
** | |0 | ||
*''' | |- | ||
** | |Python versi CPU di high-mem node | ||
*''' | *Tambahkan <code>#SBATCH --nodelist=epyc001</code> | ||
|128 | |||
* | |500GB | ||
|0 | |||
|- | |||
|Python versi GPU | |||
|32 | |||
|120GB | |||
|2 | |||
|- | |||
|Python versi MPI (MPI4PY)''<sup>2</sup>'' | |||
|384 | |||
|240GB''<sup>2</sup>'' | |||
|0 | |||
|- | |||
| colspan="5" |'''''Keterangan:''''' | |||
#Limitasi untuk menjaga kualitas layanan ALELEON Supercomputer. | |||
#*User dapat mengajukan permintaan buka limitasi apabila butuh alokasi lebih. | |||
#*Info detail buka laman [[Limitasi Fair Usage ALELEON Supercomputer|'''Limitasi Fair Usage ALELEON Supercomputer''']] | |||
#MPI4PY mendukung komputasi paralel MPI. Ketika jumlah ntasks lebih dari 128: | |||
#*SLURM otomatis menjalankan job pada multi-node. | |||
#*Parameter mem adalah alokasi memori RAM per-node. | |||
#*Info detail buka laman [[MPI ALELEON Supercomputer|'''MPI ALELEON Supercomputer''']]. | |||
|- | |||
| colspan="5" | | |||
*'''Untuk akun perseorangan dengan Kredit Core Hour:''' | |||
**SLURM akan menahan job apabila: | |||
***ntasks * time (jam) lebih besar dari sisa CPU Core Hour user. | |||
***gpus * time (jam) lebih besar dari sisa GPU Hour user. | |||
**Cek sisa Kredit Core Hour melalui menu '''<code>Open Terminal</code>''' dan jalankan perintah: | |||
$ '''sausage''' | |||
[[Berkas:Jcjoboption4.png|nirbing|600x600px]] | |||
*Info SBATCH lebih detail lihat laman [[Submit Script ALELEON Supercomputer|'''Submit Script ALELEON Supercomputer''']] | |||
|} | |||
|- | |||
|'''5''' | |||
| | |||
==== Menjalankan Job Komputasi ==== | |||
Jalankan job dengan klik tombol '''<code>Submit</code>'''. | |||
[[Berkas:Jcsubmit2.png|al=|nirbing|600x600px]] | |||
{| class="wikitable" | {| class="wikitable" | ||
! | |+''Penjelasan kolom '''<code>Status</code>,''' pantau dengan refresh halaman job'' | ||
= | ! Status | ||
!Arti | |||
|- | |||
|Not Submitted | |||
| Job belum pernah dijalankan. | |||
|- | |||
|Running | |||
|Job berjalan. | |||
|- | |||
|Queue | |||
|Job mengantri dan belum berjalan. | |||
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed" | |||
!Langkah melihat status job ketika queue | |||
|- | |||
|Buka <code>'''Jobs > Active Jobs'''</code> pada dashboard EFIRO. | |||
*Lakukan langkah sesuai gambar dibawah ini | |||
[[Berkas:Efiroqueueedit.png|al=|jmpl|''Halaman Active Jobs. Ubah opsi '''<code>Your jobs</code>''' untuk melihat status job user saja. Klik simbol '''>''' untuk melihat status job pending pada kolom '''Reason'''. Arti reason lihat laman '''[[Daftar Reason NODELIST ALELEON Supercomputer]].'''''|kiri]] | |||
|} | |||
|- | |||
|Completed | |||
| Job selesai berjalan. | |||
|- | |- | ||
| | |Failed | ||
|''' | |Job berhenti di tengah jalan, bisa karena di Stop atau Delete oleh user. | ||
|} | |||
=====Menghentikan Job Komputasi===== | |||
Untuk menghentikan job yang tengah berjalan, klik tombol '''<code>Stop</code>'''. | |||
[[Berkas:Stop.png|nirbing|600x600px]] | |||
|- | |- | ||
|''' | |'''6A''' | ||
| | | | ||
=====Melihat Output Komputasi===== | |||
User dapat melihat output file komputasi pada kolom '''<code>Folder Contents</code>''' | |||
*Atau dengan membuka '''<code>Edit Files</code>''' | |||
[[Berkas:Jcfoldercontentsedit.png|al=|nir|jmpl|''Kolom '''<code>Folder Contents</code>'''.'']] | |||
|- | |||
|'''6B''' | |||
|User dapat '''menjalankan ulang ruang job yang sama''' dengan mengklik kembali tombol '''<code>Submit</code>'''. | |||
|} | |||
==='''Notifikasi Status Jalannya Komputasi via email'''=== | |||
SLURM ALELEON Supercomputer dapat mengirim notifikasi email kepada user dengan nama "Jojo" untuk mengabarkan status berjalannya job komputasi user. Silahkan tambahan SBATCH berikut pada Submit Script apabila user ingin menerima notifikasi email dari SLURM:<syntaxhighlight lang="bash"> | |||
#SBATCH --mail-user=<alamat-email-user> | |||
#SBATCH --mail-type=BEGIN,END,FAIL | |||
</syntaxhighlight>SBATCH mail-type mengatur konten email notifikasi SLURM dengan pilihan opsi yang sekiranya berguna untuk user: | |||
*BEGIN -> notifikasi job sudah mulai | |||
*END -> notifikasi job sudah selesai beserta cuplikan 20 baris terakhir dari file SBATCH output dan error. | |||
*FAIL -> notifikasi apabila job gagal berjalan atau berhenti tidak sewajarnya. | |||
*TIME_LIMIT_50 -> job telah berjalan dengan durasi waktu 50% time limit. | |||
*TIME_LIMIT_80 -> job telah berjalan dengan durasi waktu 80% time limit. | |||
=='''Menjalankan Anaconda Python dengan Sesi Interaktif Jupyter'''== | |||
Berikut adalah langkah untuk memulai sesi Jupyter dengan Conda Environment yang dibuat user ''(klik expand atau kembangkan)'': | |||
{| class="wikitable" | |||
! colspan="2" |Langkah Memulai Sesi Interaktif Jupyter | |||
[[Berkas:Efirojupyterlab.png|nirbing|400x400px]] | |||
|- | |||
|'''0''' | |||
| | |||
===== Login Web EFIRO===== | |||
*[[Koneksi VPN ALELEON Supercomputer|'''User harus terhubung ke jaringan VPN ALELEON Supercomputer''']]. | |||
*Buka alamat web '''<code><nowiki>http://aleleon.ood</nowiki></code>''' lalu masukkan username dan password user. | |||
**Bagi user Linux, buka alamat <code>'''<nowiki>http://10.192.50.11</nowiki>'''</code> | |||
|- | |- | ||
|'''1''' | |'''1''' | ||
|Buka menu '''<code>Interactive Apps</code>''' | |Pastikan Conda Environment yang akan dipakai sudah terinstal package Jupyter. | ||
* Lihat subbab [https://wiki.efisonlt.com/wiki/Anaconda_Python#Mengaktifkan_Conda_Environment_dan_Instalasi_Package_Python '''Mengaktifkan Conda Environment dan Instalasi Package Python'''] di atas. | |||
|- | |||
|'''2''' | |||
|Buka menu '''<code>Interactive Apps</code>''' | |||
* Silahkan pilih Jupyter Notebook atau Lab sesuai referensi pribadi user. | |||
[[Berkas:Efirojupyternotebooklab.png|nirbing|238x238px]] | [[Berkas:Efirojupyternotebooklab.png|nirbing|238x238px]] | ||
|- | |- | ||
|''' | |'''3''' | ||
| | | | ||
==== Mengisi Formulir Sesi Interaktif Jupyter ==== | |||
Isi formulir untuk memulai sesi Jupyter dengan panduan berikut: | |||
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed" | {| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed" | ||
!Panduan Formulir Menggunakan | !Panduan Formulir Menggunakan Torti (Interactive Node CPU) | ||
|- | |- | ||
| | | | ||
*'''Partition''' | *'''Partition''' -> '''torti''' | ||
*'''Number of CPU Cores''' -> Min: '''1''', maks: '''32''' | |||
*'''Number of CPU Cores''' | *'''Number of GPUs''' -> ''kosongkan'' | ||
*'''Number of hours''' ''(Durasi sesi interaktif)'' -> Min: '''1''', maks: '''72''' | |||
*'''Anaconda Selection''' -> ''Pilih versi terbaru'' | |||
*'''Number of GPUs''' | |||
*'''Number of hours''' | |||
*'''Anaconda Selection''' | |||
*'''Conda Environment Directory''' | *'''Conda Environment Directory''' | ||
** | **Alamat direktori Conda Environment user, isi dengan format: | ||
<code>$CONDA/ | '''''<code>$CONDA/<nama-conda-environment></code>''''' | ||
*'''Software Modules''' | *'''Software Modules''' -> ''kosongkan'' | ||
*'''Environment Setup''' | *'''Environment Setup''' -> ''kosongkan'' | ||
*'''Email Address''' | *'''Email Address''' | ||
**Sistem | **Sistem mengirim notifikasi ke email user ketika sesi Jupyter siap diakses. | ||
**Apabila | **Apabila butuh, ''isi dengan email user'' | ||
|} | |} | ||
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed" | {| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed" | ||
!Panduan Formulir Menggunakan | !Panduan Formulir Menggunakan Tilla (Interactive Node GPU) | ||
|- | |- | ||
| | | | ||
*'''Partition''' | *'''Partition''' -> '''tilla''' | ||
*'''Number of CPU Cores''' -> Min: '''1''', maks: '''32''' | |||
*'''Number of CPU Cores''' | *'''Number of GPUs''' -> '''1''' | ||
*'''Number of hours''' ''(Durasi sesi interaktif)'' -> Min: '''1''', maks: '''72''' | |||
*'''Anaconda Selection''' -> ''Pilih versi terbaru'' | |||
*'''Conda Environment Directory''' | |||
*'''Number of GPUs''' | **Alamat direktori Conda Environment user, isi dengan format: | ||
*'''Number of hours''' | |||
*'''Anaconda Selection''' | |||
*'''Conda Environment Directory''' | |||
** | |||
'''''<code>$CONDA/<nama-conda-environment></code>''''' | '''''<code>$CONDA/<nama-conda-environment></code>''''' | ||
*'''Software Modules''' | *'''Software Modules''' | ||
** | **Masukkan nama modul NVIDIA CUDA. Terdapat dua alternatif: | ||
*** | ***Menggunakan modul CUDA versi terbaru: '''<code>cuda</code>''' | ||
*** | ***Memilih modul CUDA lainnya. lihat '''[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Anaconda_Python#Modul_Anaconda_Python_dan_NVIDIA_CUDA_Toolkit Daftar Modul NVIDIA CUDA Toolkit]'''. | ||
*'''Environment Setup''' | *'''Environment Setup''' -> ''kosongkan'' | ||
*'''Email Address''' | *'''Email Address''' | ||
**Sistem | **Sistem mengirim notifikasi ke email user ketika sesi Jupyter siap diakses. | ||
**Apabila | **Apabila butuh, ''isi dengan email user'' | ||
|} | |} | ||
{| class="wikitable" | |||
!Perhatikan sisa Kredit Core Hour user! | |||
|- | |- | ||
| | |Bagi akun perseorangan, sesi Jupyter tidak akan berjalan apabila: | ||
*Number of CPU cores * Number of Hour lebih besar dari sisa CPU Core Hour user. | |||
*Number of GPUs * Number of Hour lebih besar dari sisa GPU Hour user. | |||
Cek sisa Kredit Core Hour user dengan langkah: | |||
* Buka '''<code>Clusters</code>''' > '''<code>Aleleon Shell Access</code>''' pada dasboard EFIRO. | |||
* Jalankan perintah: | |||
$ '''sausage''' | |||
[[Berkas:Shellaccess.png|nirbing|200x200px]] | |||
| | |} | ||
|- | |- | ||
| | |'''4''' | ||
| | |||
==== Memulai Sesi Interaktif Jupyter ==== | |||
Apabila formulir sudah terisi, klik tombol '''<code>Launch</code>''' untuk memulai sesi Jupyter. | |||
*User akan diarahkan ke halaman '''<code>My Interactive Sessions</code>'''. | |||
*Tunggu hingga sesi Jupyter siap diakses. | |||
[[Berkas:Jupyternotebookqueue.png|nir|jmpl|''Status sesi Jupyter mengantri menunggu alokasi hardware'']] | |||
|- | |- | ||
| | |'''5''' | ||
| | |Apabila status menunjukkan '''Running''' atau kolom berwarna hijau, klik <code>'''Connect to Jupyter'''</code>. | ||
* ''Sistem mulai menghitung Core Hour saat status sesi Jupyter menunjukkan running.'' | |||
[[Berkas:Newjupyter120124.png|nir|jmpl|''Sesi Jupyter siap diakses.'']] | |||
|- | |- | ||
| | |'''6''' | ||
| | |Pilih Notebook Python 3 untuk memulai sesi notebook Python 3 baik di Jupyter Notebook dan Lab.[[Berkas:Jupyternotebookkernelupdated.png|al=|nir|jmpl|200x200px|''Gunakan Notebook Python 3 untuk menjalankan kernel Conda Environment user di Jupyter Notebook'']][[Berkas:Rjupyterlab.png|nir|jmpl|225x225px|''Gunakan Notebook Python 3 untuk menjalankan kernel Conda Environment user di Jupyter Lab'']] | ||
|- | |- | ||
| | |'''7A''' | ||
| | | | ||
==== Mengakses Kembali Sesi Interaktif Jupyter yang Berjalan ==== | |||
User dapat mengunjungi sesi Jupyter yang sedang berjalan di '''<code>My Interactive Sessions</code>''' | |||
[[Berkas:Interactivesession.png|nirbing|500x500px]] | |||
|- | |- | ||
| | |'''7B''' | ||
| | |||
==== Menghentikan Sesi Interaktif Jupyter ==== | |||
User dapat menghentikan sesi Jupyter yang sedang berjalan dengan klik tombol '''<code>Delete</code>'''[[Berkas:Newjupyter120124.png|nir|jmpl|''Klik tombol '''<code>Cancel</code>''' untuk menghentikan sesi Jupyter yang sedang berjalan'']] | |||
|} | |||
== '''Pelaporan Kendala dan Support'''== | |||
Apabila menjumpai masalah teknis dalam menjalankan komputasi, silahkan lapor dengan klik gambar berikut ini. | |||
[[Berkas:Wiki-pelaporankendala.jpg|1000x1000px|link=https://efisonlt.com/aleleonbugreport]] | |||
--- | |||
Bila terdapat pertanyaan lainnya, silahkan hubungi admin EFISON melalui email: | |||
'''support@efisonlt.com''' | |||
__TANPADAFTARISI__ |
Revisi terkini sejak 15 Mei 2024 10.33
HULALA WOLOLO DEPRECIATED CONTENT !!
Halaman ini dipindah ke laman baru: Komputasi Python |
---|
Anaconda adalah suite katalog packages Python dan R untuk komputasi data science dan machine learning.
Modul Anaconda Python dan NVIDIA CUDA Toolkit
Berikut adalah detail versi Anaconda yang tersedia secara global di ALELEON Supercomputer dimana menggunakan Python 3 sebagai standar. Sementara itu User membutuhkan modul NVIDIA CUDA Toolkit untuk menjalankan Python dengan akselerasi GPU NVIDIA. Detail versi NVIDIA CUDA disertakan dalam tabel berikut. (klik expand atau kembangkan)
Modul Anaconda dan NVIDIA CUDA Toolkit | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
Modul Anaconda | ||||||
Versi | Nama modul | Versi Python
default |
Dukungan hardware | |||
CPU | GPU | OMP
Threading |
MPI
multi-node | |||
Anaconda 3 2020.11 | Anaconda3/2020.11 | 3.8.5 | V | V | V1 | V2 |
Anaconda 3 2021.05 | Anaconda3/2021.05 | 3.8.8 | ||||
Anaconda 3 2022.05 | Anaconda3/2022.05 | 3.9.12 | ||||
Anaconda 3 2023.07-2 | Anaconda3/2023.07-2
atau Anaconda3 |
3.11.4 | ||||
Modul NVIDIA CUDA Toolkit | ||||||
CUDA 11.2 dengan cuDNN 8.1.1 | cuda/11.2-cuDNN8.1.1 | |||||
CUDA 11.6 dengan cuDNN 8.3.3 | cuda/11.6-cuDNN8.3.3 | |||||
CUDA 11.8 dengan cuDNN 8.6.0 | cuda/11.8-cuDNN8.6.0 | |||||
CUDA 12.0 dengan cuDNN 8.7.0 | cuda/12.0-cuDNN8.7.0 | |||||
CUDA 12.1 dengan cuDNN 8.8.1 | cuda/12.1-cuDNN8.8.1 | |||||
CUDA 12.3 dengan cuDNN 8.9.6 | cuda/12.3-cuDNN8.9.6
atau cuda |
Keterangan:
- Melalui package Python yang mendukung OpenMP seperti Cython, Numba, Pythran, PyPy, dll.
- Melalui MPI for Python (MPI4PY)
Membuat Conda Environment dan Instalasi Package Python
Sebelum menjalankan komputasi, ALELEON Supercomputer mensyaratkan user membuat Conda Environment yaitu 'ruang isolasi' untuk instalasi package Python masing-masing user.
Langkah Membuat Conda Environment di ALELEON Supercomputer
*tidak menkonsumsi Kredit Core Hour | |
---|---|
0 | Instalasi package dilakukan melalui terminal.
|
1 | Aktifkan modul Anaconda, disarankan menggunakan Anaconda terbaru:
$ module load Anaconda3 Apabila ingin menggunakan versi Anaconda lainnya, lihat subbab Modul Anaconda. |
2 |
Membuat Conda EnvironmentBuat Conda Environment secara default di direktori HOME dengan format perintah: $ conda create --name <nama-conda-environment> pip Contoh: $ conda create --name kerjaanskripsi pip |
3A |
Mengaktifkan Conda Environment dan Instalasi Package PythonAktifkan Conda Environment dengan format berikut: $ source activate $CONDA/<nama-conda-environment Contoh: $ source activate $CONDA/kerjaanskripsi Conda Environment aktif ditandai dengan tulisan nama env pada bash terminal seperti ini: (kerjaanskripsi) [wololo@login ~]$ Lakukan instalasi package Python (contoh Tensorflow, PyTorch) yang dibutuhkan dengan (kerjaanskripsi) $ pip install <nama-package-Python> |
3B |
Instalasi Package JupyterInstal package jupyter bagi user yang ingin menggunakan sesi interaktif Jupyter (kerjaanskripsi) $ pip install jupyter (kerjaanskripsi) $ pip install jupyterlab |
Menonaktifkan Conda EnvironmentUser dapat menonaktifkan Conda Environment yang sedang aktif dengan perintah: $ conda deactivate Mengaktifkan Kembali Conda Environment UserUser dapat kembali mengaktifkan Conda Environment yang dibuat dengan langkah 1 dan 3 diatas: $ module load Anaconda3 $ source activate $CONDA/<nama-conda-environment> User dapat melihat daftar nama Conda Environment yang sebelumnya dibuat dengan perintah $ conda-env list Menghapus Conda EnvironmentUser dapat menghapus Conda Environment dengan format perintah: $ conda remove -n <nama-conda-environment> --all |
Alternatif Menjalankan Anaconda Python di ALELEON Supercomputer
ALELEON Supercomputer menawarkan user untuk menjalankan Anaconda Python dengan pilihan skema:
--- |
---|
|
|
Menjalankan Anaconda Python Melalui Job Submission
User dapat menjalankan komputasi dengan pilihan cara melalui tampilan terminal atau website EFIRO (klik expand atau kembangkan).
Opsi Menggunakan terminal (SLURM sbatch)
Langkah Menjalankan Anaconda Python di Terminal | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
0 |
Login SSHTatacara login SSH lihat laman Login SSH ALELEON Supercomputer. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 |
Menyiapkan File KomputasiSiapkan file yang dibutuhkan untuk komputasi user, rekomendasi dalam satu folder per job:
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 |
Template SLURM Submit Script Anaconda PythonIkuti panduan template berikut dan petunjuk NOTES di dalamnya.
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Panduan Nilai Maksimal SBATCH untuk Anaconda Python
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 |
Menjalankan Job KomputasiJalankan job dengan perintah sbatch. $ sbatch <nama-SLURM-Submit-script> Contoh menjalankan nama script $ sbatch my_job_submission.sh | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4A | User dapat melihat status jalannya job dengan perintah squeue berikut.
$ squeue -ul $USER Berikut adalah daftar STATE (ST) dari squeue yang menunjukkan status berjalannya job:
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4B |
Menghentikan Job KomputasiApabila user ingin membatalkan job, gunakan perintah scancel berdasarkan job ID.
$ scancel <job-ID-submission-user> Contoh user membatalkan job submission milik user dengan ID 231. $ scancel 231 |
Opsi Menggunakan Web EFIRO (EFIRO Job Composer)
Langkah Menjalankan Anaconda Python di Web EFIRO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
0 |
Login Web EFIRO
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 |
Membuka Job Composer dan Memilih Template Job
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 |
Menyiapkan File KomputasiGunakan menu
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4 |
Melengkapi Submit ScriptSubmit Script adalah "formulir" untuk menjalankan job komputasi user.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Panduan Nilai Maksimal SBATCH untuk Anaconda Python
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 |
Menjalankan Job KomputasiJalankan job dengan klik tombol
Menghentikan Job KomputasiUntuk menghentikan job yang tengah berjalan, klik tombol | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
6A |
Melihat Output KomputasiUser dapat melihat output file komputasi pada kolom
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
6B | User dapat menjalankan ulang ruang job yang sama dengan mengklik kembali tombol Submit .
|
Notifikasi Status Jalannya Komputasi via email
SLURM ALELEON Supercomputer dapat mengirim notifikasi email kepada user dengan nama "Jojo" untuk mengabarkan status berjalannya job komputasi user. Silahkan tambahan SBATCH berikut pada Submit Script apabila user ingin menerima notifikasi email dari SLURM:
#SBATCH --mail-user=<alamat-email-user>
#SBATCH --mail-type=BEGIN,END,FAIL
SBATCH mail-type mengatur konten email notifikasi SLURM dengan pilihan opsi yang sekiranya berguna untuk user:
- BEGIN -> notifikasi job sudah mulai
- END -> notifikasi job sudah selesai beserta cuplikan 20 baris terakhir dari file SBATCH output dan error.
- FAIL -> notifikasi apabila job gagal berjalan atau berhenti tidak sewajarnya.
- TIME_LIMIT_50 -> job telah berjalan dengan durasi waktu 50% time limit.
- TIME_LIMIT_80 -> job telah berjalan dengan durasi waktu 80% time limit.
Menjalankan Anaconda Python dengan Sesi Interaktif Jupyter
Berikut adalah langkah untuk memulai sesi Jupyter dengan Conda Environment yang dibuat user (klik expand atau kembangkan):
Langkah Memulai Sesi Interaktif Jupyter | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
0 |
Login Web EFIRO
| ||||||
1 | Pastikan Conda Environment yang akan dipakai sudah terinstal package Jupyter.
| ||||||
2 | Buka menu Interactive Apps
| ||||||
3 |
Mengisi Formulir Sesi Interaktif JupyterIsi formulir untuk memulai sesi Jupyter dengan panduan berikut:
| ||||||
4 |
Memulai Sesi Interaktif JupyterApabila formulir sudah terisi, klik tombol
| ||||||
5 | Apabila status menunjukkan Running atau kolom berwarna hijau, klik Connect to Jupyter .
| ||||||
6 | Pilih Notebook Python 3 untuk memulai sesi notebook Python 3 baik di Jupyter Notebook dan Lab. | ||||||
7A |
Mengakses Kembali Sesi Interaktif Jupyter yang BerjalanUser dapat mengunjungi sesi Jupyter yang sedang berjalan di | ||||||
7B |
Menghentikan Sesi Interaktif JupyterUser dapat menghentikan sesi Jupyter yang sedang berjalan dengan klik tombolDelete
|
Pelaporan Kendala dan Support
Apabila menjumpai masalah teknis dalam menjalankan komputasi, silahkan lapor dengan klik gambar berikut ini.
---
Bila terdapat pertanyaan lainnya, silahkan hubungi admin EFISON melalui email:
support@efisonlt.com