Komputasi Python dengan Conda Environment (Mandiri): Perbedaan antara revisi

Revisi terkini sejak 4 Juli 2025 02.48

Halaman ini menjelaskan menjalankan komputasi / aplikasi Python dengan conda environment (conda env) di ALELEON Supercomputer yang dibuat secara mandiri oleh user termasuk instalasi package di dalamnya.

Laman ini merupakan bagian laman [Komputasi Python]

0. Spesifikasi

Tutorial ini mengasumsikan user dapat melakukan atau mau mencoba pembuatan environment - instalasi package Python.

Spesifikasi

Tutorial ini memandu membuat conda environment dengan site-packages yang terisolasi di dalamnya.
Pembuatan conda env dan instalasi package mengkonsumsi storage HOME user.
- Pantau konsumsi storage HOME dengan perintah $ ncdu $HOME

Keterangan simbol perintah terminal
`$`	Perintah ketika conda env tidak aktif
`_(env)$`	Perintah ketika conda env aktif

1. Langkah Menjalankan Komputasi

Subbab	Langkah
[ 2 ]	Buat conda env untuk menampung instalasi package.
[ 3 ]	Mengaktifkan conda env dan melakukan instalasi package di dalamnya.
[ 4 ]	Pengecekan bagi yang menginstal package Python versi CUDA.
[ 5 ]	Opsional, manajemen conda env yang sekiranya berguna.
[ 6 ]	Menjalankan komputasi dengan pilihan: [ 6.1 ] batch job [ 6.2 ] sesi Jupyter Notebook / Lab
[ 7 ]	Support apabila menemui masalah.

2. Membuat Conda Environment

Tersedia pilihan Python Package Manager (PPM) berikut untuk membuat conda env. Pilih sesuai preferensi user:

Anaconda: PPM Python paling banyak digunakan dan saat ini menjadi standar industri.
Mamba: PPM Python alternatif Anaconda versi komunitas.

- Langkah Membuat conda env -

Menggunakan terminal!

User EFIRO klik app Aleleon Shell Access
atau menu Apps > Aleleon Shell Access

-/ 1 /-

Pilih dan aktifkan modul PPM untuk membuat conda env:

Ingat atau catat modul PPM yang dipakai.
Kedepannya digunakan untuk mengaktifkan conda env ini.

$ module load [nama-modul-anaconda-atau-mamba]

- Nama modul Anaconda3 -
Versi	Nama Modul	Versi Py default
2024-02-1	`Anaconda3/2024.02-1`	3.11.7
2023.07-2	`Anaconda3/2023.07-2`	3.11.4
2022.05	`Anaconda3/2022.05`	3.9.12
2021.05	`Anaconda3/2021.05`	3.8.8
2020.11	`Anaconda3/2020.11`	3.8.5
- Nama modul Mamba -
23.11.0-0	`Mamba/23.11.0-0`	3.10.13

Saran sebelum langkah 2 ...

Pilih nama conda env yang mengandung unsur nama modul:

Untuk mengingat modul yang digunakan.
Contoh user memilih modul Anaconda3/2024-02-1
- Gunakan nama conda env seperti A2024-skripsi

-/ 2 /-

Buat conda env dengan opsi:

2A - Conda env kosong dengan Python versi tertentu, apabila:

Hendak melakukan instalasi salah satu package berikut:

*Package Python dengan kebutuhan versi Python spesifik*
Package	Versi Python
TensorFlow	Lihat [TensorFlow Tested Build Configurations]
PyTorch	3.9 - 3.12
AutoGluon	3.9 - 3.12

- Anaconda
$ conda create -n [nama-conda-env] python=[versi]

- Mamba
$ mamba create -n [nama-conda-env] python=[versi]

Contoh dengan Python 3.10 
$ conda create -n skripsi python=3.10

2B - Conda env kosong dengan Python versi 3.12.

Rekomendasi admin untuk versi Python terstabil saat ini.

- Anaconda
$ conda create -n [nama-conda-env] python=3.12

- Mamba
$ mamba create -n [nama-conda-env] python=3.12

2C - Conda env dengan file "resep" konfigurasi yml

File yml disediakan user sendiri.

- Anaconda
$ conda create -f [nama-file-yml].yml

- Mamba
$ mamba create -f [nama-file-yml].yml

---

3. Aktivasi Conda Env dan Instalasi Package

Ada baiknya user melengkapi instalasi package sebelum menjalankan komputasi karena:

Batch job -> supaya script Python berjalan tanpa error missing package.
Sesi Jupyter -> untuk efisiensi penggunaan karena terkadang ada package yang membutuhkan waktu lama untuk instalasi.

Langkah berikut berjalan di login node dan tidak mengkonsumsi Core Hour.

- Mengaktifkan dan Instalasi Package Conda Env -
Menggunakan terminal! User EFIRO klik app `Aleleon Shell Access` atau menu `Apps > Aleleon Shell Access`
`-/ 1 /-`
Muat modul PPM yang digunakan untuk membuat conda env: $ module load [nama-modul-anaconda-atau-mamba]
`-/ 2 /-`
Aktifkan conda env dengan perintah `source`: $ source activate [nama-conda-env] - Apabila lupa nama conda env, cari dengan: $ conda env list
`-/ 3 /-`
Lakukan instalasi package Python yang dibutuhkan: Lihat laman [Daftar Instalasi Package Python]
`-/ 4 /-`
Untuk user yang hendak menggunakan sesi Jupyter
Instal package: _(env)$ pip install jupyter jupyterlab
`-/ 5 /-`
Apabila melakukan instalasi package versi CUDA: Lihat subbab [ 4 ]
`-/ 6 /-`
Apabila hendak menonaktfkan conda env: _(env)$ conda deactivate

4. Instalasi Package Python versi CUDA?

Perhatikan hal berikut apabila user menginstal package Python versi CUDA dan hendak menggunakan compute / interactive node GPU:

Package membutuhkan jenis dan versi library NVIDIA sesuai seperti CUDA, cuDNN untuk dapat berjalan di GPU NVIDIA.
Umumnya (walau tidak semua) package Python CUDA saat ini juga menginstal package NVIDIA yang dibutuhkan.
Berikut metode mengecek dan melengkapi library NVIDIA yang dibutuhkan package:

- Melanjutkan langkah 5 di atas -
`-/ 5 /-`
Cek ketersediaan library CUDA di conda env: - Apabila instal package dengan pip _(env)$ pip list \| awk /cuda/ - Apabila instal package dengan conda _(env)$ conda list \| awk /cuda/
Ada output
Conda env siap digunakan. User tidak perlu memuat modul CUDA.
Tidak ada output
User harus memuat modul CUDA ketika menjalankan job: Perhatikan versi CUDA yang dibutuhkan package. Langkah ada pada tutorial menjalankan komputasi.

5. (Opsional) Manajemen Conda Env

Berikut adalah daftar manajemen conda env yang sekiranya berguna:

(klik expand / kembangkan)

5.1. Menghapus Cache Conda dan Package

Pembuatan conda env dan instalasi package Python juga mengeluarkan file cache yang apabila dibiarkan akan menumpuk dan menghabiskan ruang storage HOME. User dapat berkala membersihkan cache ini.

- Menghapus cache conda dan package -
`-/ 1 /-`
Muat modul PPM yang digunakan untuk membuat conda env: $ module load [nama-modul-anaconda-atau-mamba]
`-/ 2 /-`
Pilih opsi:
- Menghapus index dan cache package conda. - Tidak mempengaruhi conda env dan package - di dalamnya. $ conda clean --all - Menghapus semua cache pip $ pip cache purge

5.2. Menghapus Conda Environment

Apabila merasa tidak dibutuhkan, user dapat menghapus conda environment dimana juga meluangkan storage HOME.

- Menghapus conda environment -
`-/ 1 /-`
Muat modul PPM yang digunakan untuk membuat conda env: $ module load [nama-modul-anaconda-atau-mamba]
`-/ 2 /-`
Hapus conda env dengan: $ *conda remove -n [nama-conda-env]* --all**

5.3. Manajemen Conda Environment Lainnya

Berikut manajemen conda yang sekiranya berguna:

- Manajemen conda environment lainnya -

- Mengganti nama conda env
$ conda rename -n [nama-conda-env-saat-ini] [nama-conda-env-baru]

- Menduplikat conda env yang ada
$ conda create -n [nama-conda-duplikat] --clone [nama-conda-env-yang-ada]

- Membuat file konfigurasi yml dari conda env yang aktif
_(env)$ conda env create -f [nama-file-yml].yml

6. Pilihan Menjalankan Komputasi

Berikut opsi menjalankan komputasi Python dengan conda env, pilih sesuai kebutuhan:

[ 6.1 - Batch Job ]
- Menjalankan script Python siap jalan tanpa interaksi user di [Compute node].
  - Perhatikan file .ipynb harus dikonversi ke file .py.
  - Job dijalankan oleh manajemen Slurm, user menunggu hingga selesai.
- Batch job akan berhenti ketika:
  - Program komputasi selesai berjalan.
  - Program komputasi menyentuh limit waktu yang ditentukan user.
  - Program menjumpai error sehingga selesai prematur.
- Koneksi user tidak mempengaruhi jalannya batch job:
  - Job tidak akan berhenti ketika koneksi user terputus, atau
  - user keluar (log out) dari ALELEON.
[ 6.2 - Sesi Jupyter ]
- Menjalankan sesi interaktif Jupyter Lab atau Notebook di [interactive node].
- Sesi Jupyter akan berhenti ketika:
  - Waktu sesi habis.
  - Sesi dihentikan secara manual oleh user.
  - Sesi menjumpai error sehingga selesai prematur.
- Koneksi user tidak mempengaruhi jalannya sesi Jupyter, contoh:
  - Sesi tidak akan berhenti ketika koneksi user terputus, atau
  - user keluar (log out) dari ALELEON.
- Ketika user keluar dari sesi Jupyter saat cell berjalan dan kembali masuk:
  - Bisa jadi cell tsb. tidak menampilkan proses jalannya komputasi.
  - Lihat cell berikutnya apakah belum / sedang / sudah selesai berjalan.

---

6.1. Batch Job

Menjalankan script Python siap jalan tanpa interaksi user di [Compute node].

Perhatikan file .ipynb harus dikonversi ke file .py.
Job dijalankan oleh manajemen Slurm, user menunggu hingga selesai.

Tersedia pilihan tampilan yang dapat dipilih sesuai preferensi user:

(klik expand / kembangkan)

- Langkah Batch Job di Terminal -

Tutorial ini mengasumsikan user familiar dengan terminal Linux

Menggunakan terminal!

User EFIRO klik app Aleleon Shell Access
atau menu Apps > Aleleon Shell Access

-/ 0 /-

Apakah bisa menjalankan job?

User dengan Kredit Core Hour disarankan cek kuota terlebih dulu:

$ sausage

Detail limit alokasi komputasi job lihat langkah 2B.
Bila butuh tambah kuota, lihat [top up Kredit Core Hour].

-/ 1 /-

Lakukan persiapan:

1A - Pastikan package lengkap pada conda env yang akan digunakan:

Package tidak lengkap akan menyebabkan job gagal berjalan.

1B - Siapkan file komputasi yang dibutuhkan:

Upload / download file lihat [Upload / Dow nload File HOME]

1C - Memastikan batch job memuat conda env dengan benar:

1 - Nonaktifkan conda env di terminal apabila aktif:
(env)$ conda deactivate
 
2 - Nonaktifkan modul Package Python:
$ ml unload Anaconda Mamba

Apabila ada pesan ini, abaikan:
 the module ... cannot be unloaded because it was not loaded

-/ 2A /-

Buat Submit Script yaitu 'formulir' untuk menjalankan job komputasi:

Nama file bebas dengan format .sh, contoh submit.sh
Biasanya submit script berada satu folder dengan file komputasi.

$ nano submit.sh
atau vim

Contoh template Submit Script:

Ikuti petunjuk NOTES dan alur script di dalamnya.

Klik expand / kembangkan

- Template submit script Conda Environment versi CPU -

#!/bin/bash

# -----------------------------------------------------
# Template SLURM Submit Script
# Python dengan Conda Environment (CPU) | rev.210125
#
# NOTES:
# 1. Isi bagian yang ditandai 4 garing (////).
# 2. Template ini bersifat referensi.
#    User dapat mengubah bagian yang perlu diubah.
# 3. Pastikan user sudah melengkapi conda environment.
# -----------------------------------------------------

# -----------------------------------------------------
# Alokasi komputasi SBATCH dan file input
# -----------------------------------------------------

# Alokasi jumlah core thread CPU
#SBATCH --ntasks=////

# Alokasi jumlah memori RAM (satuan GB)
#SBATCH --mem=////GB

# Alokasi limit waktu menjalankan job
# Format HH:MM:SS atau D-HH:MM:SS
#SBATCH --time=////

# Definisi file untuk menampung output terminal program
#SBATCH --output=result-%j.txt

# Definisi file untuk menampung output error log
#SBATCH --error=error-%j.txt

# Input nama modul package manager yang digunakan untuk membuat
# conda env user. Daftar nama:
# Anaconda3/2020.11   || Anaconda3/2021.05   || Anaconda3/2022.05 ||
# Anaconda3/2023.07-2 || Anaconda3/2024.02-1 || Mamba/23.11.0-0   ||
PM="////"

# Nama conda environment yang digunakan
CONDA_NAME="////"

# ----------------------------------------------------
# Script jalannya program
# ----------------------------------------------------

# Memuat modul
module load ${PM}

# Mengaktifkan Conda Environment
source activate ${CONDA_NAME}

# Tuliskan perintah menjalankan komputasi Python user
# contoh -> python3 [nama-file-python]
////

- Template submit script conda environment versi GPU -

Apakah perlu memuat modul CUDA [ Subbab 4 ]?

Apabila butuh, isi nama modul CUDA pada script sebagai berikut:

...
module load ${PM}
module load [Nama-modul-CUDA]
...

- Daftar modul CUDA ALELEON -
Versi CUDA	Nama modul CUDA
11.2	`cuda/11.2-cuDNN8.1.1`
11.6	`cuda/11.6-cuDNN8.3.3`
11.8	`cuda/11.8-cuDNN8.6.0`
12.0	`cuda/12.0-cuDNN8.7.0`
12.1	`cuda/12.1-cuDNN8.8.1`
12.3	`cuda/12.3-cuDNN8.9.6`
12.4	`cuda/12.4-cuDNN9.2.1`
12.5	`cuda/12.5-cuDNN9.2.1`
Permintaan instalasi CUDA versi lain: Hubungi tim admin di support@efisonlt.com
---

#!/bin/bash

# -----------------------------------------------------
# Template SLURM Submit Script
# Python dengan Conda Environment (GPU) | rev.210125
#
# NOTES:
# 1. Isi bagian yang ditandai 4 garing (////).
# 2. Template ini bersifat referensi.
#    User dapat mengubah bagian yang perlu diubah.
# 3. Pastikan user sudah melengkapi conda environment.
# -----------------------------------------------------

# -----------------------------------------------------
# Alokasi komputasi SBATCH dan file input
# -----------------------------------------------------

# Partisi compute node GPU
#SBATCH --partition=ampere

# Alokasi jumlah core thread CPU
#SBATCH --ntasks=////

# Alokasi jumlah GPU
#SBATCH --gpus=////

# Alokasi jumlah memori RAM (satuan GB)
#SBATCH --mem=////GB

# Alokasi limit waktu menjalankan job
# Format HH:MM:SS atau D-HH:MM:SS
#SBATCH --time=////

# Definisi file untuk menampung output terminal program
#SBATCH --output=result-%j.txt

# Definisi file untuk menampung output error log
#SBATCH --error=error-%j.txt

# Input nama modul package manager yang digunakan untuk membuat
# conda env user. Daftar nama:
# Anaconda3/2020.11   || Anaconda3/2021.05   || Anaconda3/2022.05 ||
# Anaconda3/2023.07-2 || Anaconda3/2024.02-1 || Mamba/23.11.0-0   ||
PM="////"

# Nama conda environment yang digunakan
CONDA_NAME="////"

# ----------------------------------------------------
# Script jalannya program
# ----------------------------------------------------

# Memuat modul
module load ${PM} 

# Mengaktifkan Conda Environment
source activate ${CONDA_NAME}

# Tuliskan perintah menjalankan komputasi Python user
# contoh -> python3 [nama-file-python]
////

Detail Submit Script lihat [Submit Script ALELEON Supercomputer]

Untuk SBATCH notifikasi email status jalannya job lihat [Slurm Jojo]

-/ 2B /-

SBATCH komputasi (ntasks, mem, time, dll) punya limit berdasarkan:

Sisa Core Hour user dan [Fair Usage Limit]
Spesifikasi sistem dan software komputasi.

Untuk melihat limit, jalankan perintah berikut:

$ slimit-python

Note untuk saat ini:

Jalankan ketika tidak ada job user yang berjalan atau antri.
Sementara berlaku untuk akun perseorangan saja.

-/ 3 /-

Jalankan job dengan perintah:

$ sbatch [nama-submit-script]

Contoh:
$ sbatch submit.sh

-/ 4 /-

User dapat melihat status jalannya job dengan perintah:

$ squeue -ul $USER

Apabila tidak ada di squeue artinya job bersangkutan telah berakhir.
Job berakhir ketika:
- Komputasi selesai atau ada error sehingga selesai prematur.
- Job menyentuh walltime yang didefinisikan user di SBATCH time.

Kolom ST atau STATE menunjukkan status jalannya job:
STATE	Penjelasan
`R (RUN)`	Job berjalan
`PD (PENDING)`	Job tertahan, lihat [Daftar Job Reason]
`CG (COMPLETING)`	Job selesai dan dalam proses clean-up
`CA (CANCELED)`	Job dibatalkan user
`PR (PREEMPETED)`	Job dibatalkan admin, alasan dikabarkan via email
`S (SUSPENDED)`	Job ditahan admin, alasan dikabarkan via email

-/ 5 /-

User dapat memantau file output dengan perintah Unix seperti:

ls, cat, more, tail, dll

-/ 6 /-

Apabila user ingin menghentikan job yang berjalan, jalankan perintah:

$ scancel [job-ID]

Job ID ada pada squeue diatas.
contoh membatalkan job ID 231:
$ scancel 231

---

- Langkah Batch Job di web EFIRO -

-/ 0 /-

Apakah bisa menjalankan job?

User dengan Kredit Core Hour disarankan cek kuota terlebih dulu:

Buka menu Apps > Aleleon Shell Access
Jalankan:

$ sausage

Detail limit alokasi komputasi job lihat langkah 5B.
Bila butuh tambah kuota, lihat [top up Kredit Core Hour].

-/ 1 /-

[Login ke web EFIRO] ALELEON Supercomputer.

-/ 2 /-

	Klik app `Job Composer` di homepage EFIRO. atau menu `Apps > Job Composer`

Pilih menu New Job > From Template

-/ 3 /-

Buat ruang job untuk menjalankan komputasi:

Pilih template Anaconda Python yang diinginkan:
Nama Template	Penjelasan
Conda Environment Python (CPU)	Menjalankan conda env pada CPU
Conda Environment Python (GPU)	Menjalankan conda env pada GPU

Kemudian Isi Job Name dan klik Create New Job

-/ 4 /-

Lakukan persiapan:

4A - Pastikan package lengkap pada conda env yang akan digunakan:

Package tidak lengkap akan menyebabkan job gagal berjalan.
Akses terminal apabila butuh via menu Open Terminal

4B - Siapkan file komputasi yang dibutuhkan di ruang job:

Pastikan ruang job yang dipilih adalah yang akan digunakan.

Upload / download / edit file via menu Edit Files

Upload / download file tunggal diatas 2GB gunakan [software FTP]

-/ 5A /-

Lengkapi Submit Script melalui tombol Open Editor

Submit script adalah 'formulir' untuk menjalankan job komputasi.
Ikuti petunjuk NOTES dan alur script di dalamnya.
Klik Save setiap kali mengubah script.

Bagi yang memilih template GPU:

Apakah perlu memuat modul CUDA [ Subbab 4 ]?
Apabila butuh, isi nama modul CUDA pada script sebagai berikut:

...
module load ${PM}
module load [Nama-modul-CUDA]
...

- Daftar modul CUDA ALELEON -
Versi CUDA	Nama modul CUDA
11.2	`cuda/11.2-cuDNN8.1.1`
11.6	`cuda/11.6-cuDNN8.3.3`
11.8	`cuda/11.8-cuDNN8.6.0`
12.0	`cuda/12.0-cuDNN8.7.0`
12.1	`cuda/12.1-cuDNN8.8.1`
12.3	`cuda/12.3-cuDNN8.9.6`
12.4	`cuda/12.4-cuDNN9.2.1`
12.5	`cuda/12.5-cuDNN9.2.1`
Permintaan instalasi CUDA versi lain: Hubungi tim admin di support@efisonlt.com
---

Detail Submit Script lihat [Submit Script ALELEON Supercomputer]

Untuk SBATCH notifikasi email status jalannya job lihat [Slurm Jojo]

-/ 5B /-

SBATCH komputasi (ntasks, mem, time, dll) punya limit berdasarkan:

Sisa Core Hour user dan [Fair Usage Limit]
Spesifikasi sistem dan software komputasi.

Untuk melihat limit, jalankan perintah berikut:

$ slimit-python

Note untuk saat ini:

Jalankan ketika tidak ada job user yang berjalan atau antri.
Sementara berlaku untuk akun perseorangan saja.

-/ 6 /-

Jalankan job dengan klik tombol Submit

Job berakhir (Status completed) ketika:
- Komputasi selesai atau ada error sehingga selesai prematur.
- Job menyentuh walltime yang didefinisikan user di SBATCH time.

Kolom Status menunjukkan status jalannya job:
Status	Arti
Not Submitted	Job belum pernah dijalankan.
Running	Job berjalan.
Queue	Job mengantri dan belum berjalan.
Completed	Job selesai berjalan.
Failed	Job berhenti karena error atau di stop user.
Melihat alasan job yang queue:
Buka menu `Apps > Active Jobs` Ubah opsi `All Jobs` ke `Your Jobs`. Klik simbol `>` pada job status pending dan lihat kolom Reason. Arti reason lihat laman [Daftar Job Reason ALELEON]

-/ 7 /-

Lihat output file komputasi pada kolom Folder Contents

Atau dengan membuka menu Edit Files

Kolom Folder Contents

-/ 8 /-

Apabila user ingin menghentikan job yang berjalan, klik Stop

-/ 9 /-

Untuk menghapus ruang job dan datanya:

Pilih ruang job yang akan dihapus.
Perhatikan opsi ini juga menghapus data di ruang job tersebut.
Klik menu Delete

---

6.2. Sesi Jupyter

Menjalankan sesi interaktif Jupyter Lab atau Notebook di [interactive node].

(klik expand / kembangkan)

- Langkah Sesi Jupyter -

-/ 1 /-

[Login ke web EFIRO] ALELEON Supercomputer.

-/ 2 /-

Lakukan persiapan sebelum sesi Jupyter:

Untuk efisiensi sesi terkait batasan waktu dan konsumsi Core Hour:

Lengkapi instalasi package pada conda env yang akan dipakai.
- Pastikan package jupyter dan jupyterlab telah terinstal.
Upload file besar lihat [Upload / Download File HOME]
- Direktori standar sesi Jupyter adalah $HOME user.

-/ 3 /-

	Klik app `Jupyter` di homepage EFIRO. atau menu `Apps > Jupyter`

-/ 4 /-

Isi formulir untuk memulai sesi Jupyter dengan panduan berikut:

Choose Jupyter version

Pilih sesuai preferensi user, Jupyter Lab atau Notebook

Partition

Pilih sesuai kebutuhan:

torti -> interactive node CPU
tilla -> interactive node GPU

Number of CPU thread(s)

Alokasi core CPU, range 2 - 32

Amount of memory/RAM (GB)

Alokasi RAM dalam satuan GB, range 1 - 64

Number of GPUs (apabila pilih partition tilla)

Jumlah GPU, isi angka 1

Number of hours

Waktu maksimal sesi Jupyter, range 1 - 72

Apakah bisa menjalankan sesi Jupyter?

Form CPU, GPU, dan hours punya limit berdasarkan:

Sisa Core Hour user dan [Fair Usage Limit]

Untuk melihat limit:

Buka menu Apps > Aleleon Shell Access
Jalankan perintah:

$ sausage

Ketentuan sesi Jupyter dapat berjalan:

sisa CCH > number of CPU threads X number of hours
sisa GH > number of GPU X number of hours

Choose how to launch Jupyter

Pilih Anaconda/Mamba

Choose Anaconda/Mamba version

Pilih versi yang digunakan untuk membuat conda env user.

Conda/Mamba environment directory

Isi nama conda env user, contoh: skripsi

Software Modules

Memuat modul software diluar conda env user , isi apabila ada.

Bagi user yang memilih partition tilla:

Apakah perlu memuat modul CUDA [ Subbab 4 ]?
Apabila butuh, isi form ini dengan nama modul CUDA.

- Daftar modul CUDA ALELEON -
Versi CUDA	Nama modul CUDA
11.2	`cuda/11.2-cuDNN8.1.1`
11.6	`cuda/11.6-cuDNN8.3.3`
11.8	`cuda/11.8-cuDNN8.6.0`
12.0	`cuda/12.0-cuDNN8.7.0`
12.1	`cuda/12.1-cuDNN8.8.1`
12.3	`cuda/12.3-cuDNN8.9.6`
12.4	`cuda/12.4-cuDNN9.2.1`
12.5	`cuda/12.5-cuDNN9.2.1`
Permintaan instalasi CUDA versi lain: Hubungi tim admin di support@efisonlt.com
---

Environment setup

Memuat environment variable, isi apabila ada.

Additional Jupyter arguments

Memuat argumen tambahan Jupyter, isi apabila ada.

Email address

Notifikasi email untuk status mulai dan selesainya Jupyter.

Isi apabila berkenan.

-/ 5 /-

Klik tombol Launch untuk memulai sesi Jupyter:

User akan diarahkan ke halaman My Interactive Sessions
Tunggu hingga sesi Jupyter siap diakses.

-/ 6 /-

Apabila status Running, klik tombol Connect to Jupyter

Sistem mulai menghitung Core Hour!
Sesi akan terus berjalan selama waktu sesi masih ada.
Untuk menghentikan sesi yang running, klik tombol Cancel

-/ 7 /-

Gunakan kernel Python 3 (ipykernel) untuk sesi Jupyter.

-/ 8 /-

Sesi Jupyter tidak terputus ketika:

Koneksi user terputus saat sesi Jupyter.
User keluar / log out dari sesi Jupyter dan web EFIRO.

User dapat mengunjungi sesi Jupyter yang sedang berjalan pada:

Menu My Interactive Sessions
Kolom Active interactive sessions di homepage EFIRO.

Ketika user keluar saat ada cell berjalan dan kembali masuk:

Bisa jadi cell tersebut tidak menampilkan proses jalannya komputasi.
Lihat cell berikutnya apakah belum / sedang / selesai berjalan.

---

7. Pelaporan Kendala dan Support

Apabila menjumpai masalah teknis dalam menjalankan komputasi, silahkan lapor dengan klik gambar berikut ini.

Bila terdapat pertanyaan lainnya, silahkan hubungi admin EFISON melalui email:

support@efisonlt.com

Kontributor

EFISON turut mengucapakan terima kasih spesial kepada:

[Sadasa Aacademy] untuk pengujian semua tutorial di laman ini.

Article tools

Perkakas pribadi

Navigasi

Perkakas

Komputasi Python dengan Conda Environment (Mandiri): Perbedaan antara revisi

Revisi terkini sejak 4 Juli 2025 02.48

Daftar isi

0. Spesifikasi

Spesifikasi

1. Langkah Menjalankan Komputasi

2. Membuat Conda Environment

3. Aktivasi Conda Env dan Instalasi Package

4. Instalasi Package Python versi CUDA?

5. (Opsional) Manajemen Conda Env

5.1. Menghapus Cache Conda dan Package

5.2. Menghapus Conda Environment

5.3. Manajemen Conda Environment Lainnya

6. Pilihan Menjalankan Komputasi

6.1. Batch Job

6.2. Sesi Jupyter

7. Pelaporan Kendala dan Support

Kontributor

@@ Baris 1: / Baris 1: @@
-[[Berkas:Logo Python - Anaconda - Mamba ALELEON.png|400x400px]]
+[[Berkas:Logo Python Anaconda Mamba ALELEON tp.png|400x400px]]
-Halaman ini menjelaskan menjalankan komputasi Python dengan '''conda environment''' di ALELEON Supercomputer.
+Halaman ini menjelaskan menjalankan komputasi / aplikasi Python dengan conda environment '''<big>(conda env)</big>''' di ALELEON Supercomputer yang '''<big>dibuat secara mandiri oleh user</big>''' termasuk instalasi package di dalamnya.
 {| class="wikitable"
-!''Laman ini merupakan bagian laman ->'' [[Komputasi Python]]
+!''Laman ini merupakan bagian laman'' [<nowiki/>[[Komputasi Python]]]
 |}
-== '''Langkah Menjalankan Komputasi''' ==
+== '''''0. Spesifikasi''''' ==
-Terdapat dua langkah utama:
+Tutorial ini mengasumsikan user dapat melakukan atau mau mencoba pembuatan environment - instalasi package Python.
-# Membuat conda environment dan instal package yang diperlukan di dalamnya.
+=== Spesifikasi ===
-# Menjalankan komputasi dengan conda env tersebut.
+* Tutorial ini memandu membuat conda environment dengan '''site-packages yang terisolasi di dalamnya'''.
+* Pembuatan conda env dan instalasi package '''mengkonsumsi storage HOME user.'''
+** Pantau konsumsi storage HOME dengan perintah <code>$ '''ncdu $HOME'''</code>
-== '''Membangun Conda Environment''' ==
-ALELEON Supercomputer menyediakan pilihan package manager Python untuk membuat conda environment. Pilih sesuai preferensi user:
 {| class="wikitable"
+|+Keterangan simbol perintah terminal
 |-
-![[Berkas:Anaconda transparent logo.png|nirbing|130x130px]]
+!<code>'''<big>$</big>'''</code>
-![[Berkas:Mamba transparent logo.png|nirbing|100x100px]]
+|Perintah ketika conda env tidak aktif
 |-
-|
+!'''<code><big><sub>(env)</sub>$</big></code>'''
-*PM Python paling banyak digunakan.
+|Perintah ketika conda env aktif
-*Saat ini menjadi standar industri.
-|
-*Alternatif Anaconda, dibuat dengan C++.
-*Dikembangkan oleh komunitas.
-*Dalam beberapa kasus lebih ringan dan cepat.
 |}
-=== Membuat dan Manajemen Conda Environment ===
+== '''''1. Langkah Menjalankan Komputasi''''' ==
 {| class="wikitable"
-!
+!Subbab
+!Langkah
+|-
+!'''<big>[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Komputasi_Python_dengan_Conda_Environment_(Mandiri)#2._Membuat_Conda_Environment <nowiki>[ 2 ]</nowiki>]</big>'''
+|Buat conda env untuk menampung instalasi package.
+|-
+!'''<big>[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Komputasi_Python_dengan_Conda_Environment_(Mandiri)#3._Aktivasi_Conda_Env_dan_Instalasi_Package <nowiki>[ 3 ]</nowiki>]</big>'''
+|Mengaktifkan conda env dan melakukan instalasi package di dalamnya.
 |-
-|[[Berkas:Icon apps terminal cropped.png|kiri|nirbing|80x80px]]Menggunakan terminal!
+!<big>[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Komputasi_Python_dengan_Conda_Environment_(Mandiri)#4._Instalasi_Package_Python_versi_CUDA? <nowiki>[ 4 ]</nowiki>]</big>
-* User web EFIRO buka app '''<code>Aleleon Shell Access</code>'''.
+|Pengecekan bagi yang menginstal package Python versi CUDA.
 |-
-!1
+!<big>[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Komputasi_Python_dengan_Conda_Environment_(Mandiri)#5._(Opsional)_Manajemen_Conda_Env <nowiki>[ 5 ]</nowiki>]</big>
+|''Opsional, manajemen conda env yang sekiranya berguna.''
 |-
-|Pilih menggunakan Anaconda atau Mamba.
+!'''<big>[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Komputasi_Python_dengan_Conda_Environment_(Mandiri)#6._Pilihan_Menjalankan_Komputasi <nowiki>[ 6 ]</nowiki>]</big>'''
-''<small><code>(klik expand / kembangkan)</code></small>''
+|Menjalankan komputasi dengan pilihan:
-{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
-! ---- Opsi Anaconda
+* '''<big>[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Komputasi_Python_dengan_Conda_Environment_(Mandiri)#6.1._Batch_Job <nowiki>[ 6.1 ]</nowiki>]</big>''' batch job
-[[Berkas:Anaconda transparent logo.png|nirbing|130x130px]]
+* '''<big>[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Komputasi_Python_dengan_Conda_Environment_(Mandiri)#6.2._Sesi_Jupyter <nowiki>[ 6.2 ]</nowiki>]</big>''' sesi Jupyter Notebook / Lab
+|-
+!<big>[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Komputasi_Python_dengan_Conda_Environment_(Mandiri)#7._Pelaporan_Kendala_dan_Support <nowiki>[ 7 ]</nowiki>]</big>
+|Support apabila menemui masalah.
+|}
+== '''''2. Membuat Conda Environment''''' ==
+Tersedia pilihan '''Python Package Manager (PPM)''' berikut untuk membuat conda env. Pilih sesuai preferensi user:
+* '''Anaconda:''' PPM Python paling banyak digunakan dan saat ini menjadi standar industri.
+* '''Mamba:''' PPM Python alternatif Anaconda versi komunitas.
+{| class="wikitable"
+!- Langkah Membuat conda env -
+|-
+|[[Berkas:EOD Apps Shell full.png|kiri|nirbing|101x101px]]'''''Menggunakan terminal!'''''
+* ''User EFIRO klik app '''<code>Aleleon Shell Access</code>'''''
+* ''atau menu '''<code>Apps > Aleleon Shell Access</code>'''''
 |-
-!1
+!<big><code>-/ 1 /-</code></big>
 |-
-|Pilih dan aktifkan modul Anaconda untuk membuat conda env:
+|Pilih dan aktifkan modul PPM untuk membuat conda env:
-<code>$ '''module load ''[nama-modul-anaconda]'''''</code>
+* ''Ingat atau catat modul PPM yang dipakai.''
+* ''Kedepannya digunakan untuk mengaktifkan conda env ini.''
+ $ '''module load ''[nama-modul-anaconda-atau-mamba]'''''
 {| class="wikitable"
-|+Daftar nama modul Anaconda 3
+! colspan="3" |- Nama modul Anaconda3 -
+[[Berkas:Anaconda transparent logo.png|nirbing|100x100px]]
+|-
 !Versi
 !Nama Modul
@@ Baris 72: / Baris 100: @@
 |<code>'''Anaconda3/2020.11'''</code>
 |''3.8.5''
+|-
+! colspan="3" |- Nama modul Mamba -
+[[Berkas:Mamba transparent logo.png|nirbing|90x90px]]
+|-
+|23.11.0-0
+|<code>'''Mamba/23.11.0-0'''</code>
+|''3.10.13''
 |}
 |-
-! 2
+!Saran sebelum langkah 2 ...
+|-
+|''Pilih nama conda env yang mengandung unsur nama modul:''
+* ''Untuk mengingat modul yang digunakan.''
+* ''Contoh user memilih modul Anaconda3/2024-02-1''
+** ''Gunakan nama conda env seperti <code>'''A2024-skripsi'''</code>''
+|-
+! <big><code>-/ 2 /-</code></big>
+|-
+!Buat conda env dengan opsi:
+|-
+|'''<big>2A</big> -''' Conda env kosong dengan Python '''versi tertentu''', apabila:
+* Hendak melakukan instalasi salah satu package berikut:
+{| class="wikitable"
+|+''Package Python dengan kebutuhan versi Python spesifik''
+!Package
+!Versi Python
+|-
+|TensorFlow
+|Lihat '''[[https://www.tensorflow.org/install/source#tested_build_configurations TensorFlow Tested Build Configurations]]'''
 |-
-| '''Ingat atau catat''' modul Anaconda yang dipakai.
+|PyTorch
-*Kedepannya digunakan untuk mengaktifkan conda env ini.
+|3.9 - 3.12
 |-
-! 3
+|AutoGluon
+|3.9 - 3.12
+|}
+ ''- Anaconda''
+ $ '''conda create -n ''[nama-conda-env]'' python=''[versi]'''''
+ ''- Mamba''
+ $ '''mamba create -n ''[nama-conda-env]'' python=''[versi]'''''
+ <small>''Contoh dengan Python 3.10''</small>
+ <small>$ conda create -n '''skripsi python=3.10'''</small>
 |-
-|Buat conda env di direktori HOME:
+!
-<code>$ '''conda create -n ''[nama-conda-env]'''''</code>
+|-
+|'''<big>2B</big> -''' Conda env kosong dengan Python '''versi 3.12.'''
+* Rekomendasi admin untuk versi Python terstabil saat ini.
-<small>''Contoh nama 'skripsi' ->'' <code>$ conda create -n '''skripsi'''</code></small>
+ ''- Anaconda''
+ $ '''conda create -n ''[nama-conda-env]'' python=3.12'''
+ ''- Mamba''
+ $ '''mamba create -n ''[nama-conda-env]'' python=3.12'''
+|-
+!
 |-
-!4
+|'''<big>2C</big> -''' Conda env dengan '''file "resep" konfigurasi yml'''
+* File yml disediakan user sendiri.
+ ''- Anaconda''
+ $ '''conda create -f ''[nama-file-yml]''.yml'''
+ ''- Mamba''
+ $ '''mamba create -f ''[nama-file-yml]''.yml'''
 |-
-|Aktifkan conda env dengan perintah source:
+!---
-<code>$ '''source activate ''[nama-conda-env]'''''</code>
+|}
+== '''''3. Aktivasi Conda Env dan Instalasi Package''''' ==
+[[Berkas:GMB warning wololo.png|nirbing|40x40px]] Ada baiknya user melengkapi instalasi package '''sebelum menjalankan komputasi''' karena:
-<small>''Contoh nama 'skripsi' ->'' <code>$ source activate '''skripsi'''</code></small>
+# Batch job -> supaya script Python berjalan tanpa error ''missing package''.
+# Sesi Jupyter -> untuk efisiensi penggunaan karena terkadang ada package yang membutuhkan waktu lama untuk instalasi.
+Langkah berikut berjalan di login node dan '''tidak mengkonsumsi Core Hour.'''
+{| class="wikitable"
+!- Mengaktifkan dan Instalasi Package Conda Env -
 |-
-!''Menonaktifkan conda env:''
+|[[Berkas:EOD Apps Shell full.png|kiri|nirbing|101x101px]]'''''Menggunakan terminal!'''''
+* ''User EFIRO klik app '''<code>Aleleon Shell Access</code>'''''
+* ''atau menu '''<code>Apps > Aleleon Shell Access</code>'''''
 |-
-|<code><small>(env-user)$</small> '''conda deactivate'''</code>
+!<big><code>-/ 1 /-</code></big>
 |-
-!''Mengaktifkan kembali conda env:''
+|Muat modul PPM yang digunakan untuk membuat conda env:
+ $ '''module load ''[nama-modul-anaconda-atau-mamba]'''''
 |-
-|Lakukan '''<code>langkah 1 dan 4</code>'''. Apabila lupa nama env:
+!<big><code>-/ 2 /-</code></big>
-<code>$ '''conda env list'''</code>
 |-
-!''Manajemen lainnya:''
+|Aktifkan conda env dengan perintah '''<big><code>source</code></big>''':
+ $ '''source activate ''[nama-conda-env]'''''
+ ''- Apabila lupa nama conda env, cari dengan:''
+ $ '''conda env list'''
 |-
-|Manajemen lain seperti rename, delete, clone, export, dll lihat:
+!<big><code>-/ 3 /-</code></big>
-*'''[[https://docs.conda.io/projects/conda/en/latest/user-guide/tasks/manage-environments.html Conda Managing environments]]'''
+|-
+|Lakukan instalasi package Python yang dibutuhkan:
+* Lihat laman '''<big>[<nowiki/>[[Daftar Instalasi Package Python|Dafta]]</big><big>[[Daftar Instalasi Package Python|r Instalasi Package Python]]]</big>'''
+|-
+!<big><code>-/ 4 /-</code></big>
+|-
+!Untuk user yang hendak menggunakan sesi Jupyter
+[[Berkas:EOD Apps Jupyter icon.png|nirbing|100x100px]]
+|-
+|Instal package:
+ <sub>(env)</sub>$ '''pip install jupyter jupyterlab'''
+|-
+!<big><code>-/ 5 /-</code></big>
+|-
+|'''Apabila melakukan instalasi package versi CUDA:'''
+* Lihat subbab '''<big>[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Komputasi_Python_dengan_Conda_Environment_(Mandiri)#4._Instalasi_Package_Python_versi_CUDA? <nowiki>[ 4 ]</nowiki>]</big>'''
+|-
+!<big><code>-/ 6 /-</code></big>
+|-
+|Apabila hendak menonaktfkan conda env:
+ <sub>(env)</sub>$ '''conda deactivate'''
+|}
+== '''''4. Instalasi Package Python versi CUDA?''''' ==
+Perhatikan hal berikut apabila user menginstal '''package Python versi CUDA''' dan hendak menggunakan '''compute / interactive node GPU''':
+# Package membutuhkan jenis dan versi library NVIDIA sesuai seperti '''CUDA, cuDNN''' untuk dapat berjalan di GPU NVIDIA.
+# '''''Umumnya (walau tidak semua)''''' package Python CUDA saat ini juga menginstal package NVIDIA yang dibutuhkan.
+# Berikut metode mengecek dan melengkapi library NVIDIA yang dibutuhkan package:
+{| class="wikitable"
+!- Melanjutkan langkah 5 di atas  -
+|-
+!<big><code>-/ 5 /-</code></big>
+|-
+|Cek ketersediaan library CUDA di conda env:
+ - Apabila instal package dengan pip
+ <sub>(env)</sub>$ '''pip list | awk /cuda/'''
+ - Apabila instal package dengan conda
+ <sub>(env)</sub>$ '''conda list | awk /cuda/'''
+|-
+!''Ada output''
+|-
+|Conda env siap digunakan.
+* User '''tidak perlu memuat modul CUDA.'''
+|-
+!''Tidak ada output''
+|-
+|User '''harus memuat modul CUDA''' ketika menjalankan job:
+* Perhatikan versi CUDA '''yang dibutuhkan''' package.
+* Langkah ada pada tutorial menjalankan komputasi.
+|}
+== '''''5. <small>(Opsional)</small> Manajemen Conda Env''''' ==
+Berikut adalah daftar manajemen conda env yang sekiranya berguna:
+''<small><code>(klik expand / kembangkan)</code></small>''
+=== 5.1. Menghapus Cache Conda dan Package ===
+Pembuatan conda env dan instalasi package Python juga mengeluarkan file cache yang apabila dibiarkan akan menumpuk dan menghabiskan ruang storage HOME. User dapat berkala membersihkan cache ini.
+{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
+!- Menghapus cache conda dan package -
+|-
+!<big><code>-/ 1 /-</code></big>
+|-
+|Muat modul PPM yang digunakan untuk membuat conda env:
+ $ '''module load ''[nama-modul-anaconda-atau-mamba]'''''
+|-
+!<big><code>-/ 2 /-</code></big>
+|-
+!Pilih opsi:
+|-
+|
+ ''- Menghapus index dan cache package conda.''
+ ''- Tidak mempengaruhi conda env dan package
+ ''- di dalamnya.''
+ $ '''conda clean --all'''
+ ''- Menghapus semua cache pip''
+ $ '''pip cache purge'''
 |}
+=== 5.2. Menghapus Conda Environment ===
+Apabila merasa tidak dibutuhkan, user dapat menghapus conda environment dimana juga meluangkan storage HOME.
 {| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
-!---- Opsi Mamba
+!- Menghapus conda environment -
-[[Berkas:Mamba transparent logo.png|nirbing|100x100px]]
 |-
-!1
+!<big><code>-/ 1 /-</code></big>
 |-
-|Pilih dan aktifkan modul Mamba untuk membuat conda env:
+|Muat modul PPM yang digunakan untuk membuat conda env:
-<code>$ '''module load ''[nama-modul-mamba]'''''</code>
+ $ '''module load ''[nama-modul-anaconda-atau-mamba]'''''
-{| class="wikitable"
+|-
-|+Daftar nama modul Mamba
+!<big><code>-/ 2 /-</code></big>
-!Versi
+|-
-! Nama Modul
+|Hapus conda env dengan:
-!Versi Py default
+ $ '''conda remove -n ''[nama-conda-env]'' --all'''
+|}
+=== 5.3. Manajemen Conda Environment Lainnya ===
+Berikut manajemen conda yang sekiranya berguna:
+{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
+!- Manajemen conda environment lainnya -
 |-
-|23.11.0-0
+|
-|<code>'''Mamba/23.11.0-0'''</code>
+ ''- Mengganti nama conda env''
-|''3.10.13''
+ $ '''conda rename -n ''[nama-conda-env-saat-ini] [nama-conda-env-baru]'''''
+ ''- Menduplikat conda env yang ada''
+ $ '''conda create -n ''[nama-conda-duplikat]'' --clone ''[nama-conda-env-yang-ada]'''''
+ ''- Membuat file konfigurasi yml dari '''conda env yang aktif'''''
+ <sub>(env)</sub>$ '''conda env create -f ''[nama-file-yml]''.yml'''
 |}
+== '''''6. Pilihan Menjalankan Komputasi''''' ==
+Berikut opsi menjalankan komputasi Python dengan conda env, pilih sesuai kebutuhan:
+* '''<big>[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Komputasi_Python_dengan_Conda_Environment_(Mandiri)#6.1._Batch_Job <nowiki>[ 6.1 - Batch Job ]</nowiki>]</big>'''
+** '''Menjalankan script Python siap jalan tanpa interaksi user di [<nowiki/>[[Spesifikasi ALELEON Supercomputer#Spesifikasi%20Compute%20Node|Compute node]]].'''
+*** [[Berkas:GMB warning wololo.png|nirbing|40x40px]] ''Perhatikan '''file <code>.ipynb</code>''' harus dikonversi ke '''file <code>.py</code>'''.''
+*** ''Job dijalankan oleh manajemen Slurm, user menunggu hingga selesai.''
+** '''Batch job akan berhenti ketika:'''
+*** ''Program komputasi selesai berjalan.''
+***''Program komputasi menyentuh limit waktu yang ditentukan user.''
+***''Program menjumpai error sehingga selesai prematur.''
+** '''Koneksi user tidak mempengaruhi jalannya batch job:'''
+***''Job tidak akan berhenti ketika koneksi user terputus, atau''
+***''user keluar (log out) dari ALELEON.''
+* '''<big>[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Komputasi_Python_dengan_Conda_Environment_(Mandiri)#6.2._Sesi_Jupyter <nowiki>[ 6.2 - Sesi Jupyter ]</nowiki>]</big>'''
+** '''Menjalankan sesi interaktif Jupyter Lab atau Notebook di [<nowiki/>[[Spesifikasi ALELEON Supercomputer#Spesifikasi%20Interactive%20Node|interactive node]]].'''
+** '''Sesi Jupyter akan berhenti ketika:'''
+***''Waktu sesi habis.''
+***''Sesi dihentikan secara manual oleh user.''
+***''Sesi menjumpai error sehingga selesai prematur.''
+** '''Koneksi user tidak mempengaruhi jalannya sesi Jupyter, contoh:'''
+***''Sesi tidak akan berhenti ketika koneksi user terputus, atau''
+***''user keluar (log out) dari ALELEON.''
+**'''Ketika user keluar dari sesi Jupyter saat cell berjalan dan kembali masuk:'''
+***''Bisa jadi cell tsb. tidak menampilkan proses jalannya komputasi.''
+***''Lihat cell berikutnya apakah belum / sedang / sudah selesai berjalan.''
+---
+=== 6.1. Batch Job ===
+Menjalankan script Python siap jalan tanpa interaksi user di '''[<nowiki/>[[Spesifikasi ALELEON Supercomputer#Spesifikasi%20Compute%20Node|Compute node]]]'''.
+* [[Berkas:GMB warning wololo.png|nirbing|40x40px]] ''Perhatikan '''file <code>.ipynb</code>''' harus dikonversi ke '''file <code>.py</code>'''.''
+* ''Job dijalankan oleh manajemen Slurm, user menunggu hingga selesai.''
+'''Tersedia pilihan tampilan yang dapat dipilih sesuai preferensi user:'''
+''<small><code>(klik expand / kembangkan)</code></small>''
+{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
+!- Langkah Batch Job di Terminal -
+[[Berkas:Sbatch terminal display rev2.png|tepi|400x400px]]
 |-
-!2
+!''Tutorial ini mengasumsikan user familiar dengan terminal Linux''
 |-
-|'''Ingat atau catat''' modul Mamba yang dipakai.
+|[[Berkas:EOD Apps Shell full.png|kiri|nirbing|101x101px]]'''''Menggunakan terminal!'''''
-*Kedepannya digunakan untuk mengaktifkan conda env ini.
+* ''User EFIRO klik app '''<code>Aleleon Shell Access</code>'''''
+* ''atau menu '''<code>Apps > Aleleon Shell Access</code>'''''
 |-
-! 3
+!<big><code>-/ 0 /-</code></big>
 |-
-|Buat conda env di direktori HOME:
+!Apakah bisa menjalankan job?
-<code>$ '''mamba create -n ''[nama-conda-env]'''''</code>
+|-
+|User dengan '''Kredit Core Hour''' disarankan cek kuota terlebih dulu:
+ $ '''sausage'''
-<small>''Contoh nama 'skripsi' ->'' <code>$ mamba create -n '''skripsi'''</code></small>
+* Detail limit alokasi komputasi job lihat langkah '''<big>2B</big>'''.
+* Bila butuh tambah kuota, lihat '''[[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Core_Hour#Penggunaan_Kredit_Core_Hour top up Kredit Core Hour]].'''
 |-
-!4
+!<big><code>-/ 1 /-</code></big>
 |-
-|Aktifkan conda env dengan perintah source:
+!Lakukan persiapan:
-<code>$ '''source activate ''[nama-conda-env]'''''</code>
+|-
+|'''<big>1A</big> -''' '''Pastikan package lengkap pada conda env yang akan digunakan:'''
+* Package tidak lengkap akan menyebabkan job gagal berjalan.
+'''<big>1B</big> -''' '''Siapkan file komputasi yang dibutuhkan:'''
+* Upload / download file lihat '''[[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Manajemen_File_di_ALELEON_Supercomputer#Upload_dan_Download_File Upload / Dow][https://wiki.efisonlt.com/wiki/Manajemen_File_di_ALELEON_Supercomputer#Upload_dan_Download_File nload File HOME]]'''
+'''<big>1C</big> -[[Berkas:GMB warning wololo.png|nirbing|50x50px]] Memastikan batch job memuat conda env dengan benar:'''
+- Nonaktifkan conda env di terminal apabila aktif:
+ <small>(env)</small>$ '''conda deactivate'''
+- Nonaktifkan modul Package Python:
+ $ '''ml unload Anaconda Mamba'''
+ <small>Apabila ada pesan ini, abaikan:
+  '''''the module ... cannot be unloaded because it was not loaded'''''</small>
+|-
+!<big><code>-/ 2A /-</code></big>
+|-
+|Buat '''Submit Script''' yaitu 'formulir' untuk menjalankan job komputasi:
+*Nama file bebas dengan format .sh, contoh '''<code>submit.sh</code>'''
+*''Biasanya submit script berada satu folder dengan file komputasi.''
+ $ '''nano submit.sh'''
+ ''<small>atau vim</small>''
+|-
+!
+|-
+|Contoh template Submit Script:
+*Ikuti petunjuk '''NOTES dan alur script''' di dalamnya.
+''<small><code>Klik expand / kembangkan</code></small>''
+{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
+!- Template submit script Conda Environment versi CPU -
+[[Berkas:GMB CPU icon.png|nirbing|80x80px]]
+|-
+|<syntaxhighlight lang="bash" line="1">
+#!/bin/bash
-<small>''Contoh nama 'skripsi' ->'' <code>$ source activate '''skripsi'''</code></small>
+# -----------------------------------------------------
+# Template SLURM Submit Script
+# Python dengan Conda Environment (CPU) | rev.210125
+#
+# NOTES:
+# 1. Isi bagian yang ditandai 4 garing (////).
+# 2. Template ini bersifat referensi.
+#    User dapat mengubah bagian yang perlu diubah.
+# 3. Pastikan user sudah melengkapi conda environment.
+# -----------------------------------------------------
+# -----------------------------------------------------
+# Alokasi komputasi SBATCH dan file input
+# -----------------------------------------------------
+# Alokasi jumlah core thread CPU
+#SBATCH --ntasks=////
+# Alokasi jumlah memori RAM (satuan GB)
+#SBATCH --mem=////GB
+# Alokasi limit waktu menjalankan job
+# Format HH:MM:SS atau D-HH:MM:SS
+#SBATCH --time=////
+# Definisi file untuk menampung output terminal program
+#SBATCH --output=result-%j.txt
+# Definisi file untuk menampung output error log
+#SBATCH --error=error-%j.txt
+# Input nama modul package manager yang digunakan untuk membuat
+# conda env user. Daftar nama:
+# Anaconda3/2020.11   || Anaconda3/2021.05   || Anaconda3/2022.05 ||
+# Anaconda3/2023.07-2 || Anaconda3/2024.02-1 || Mamba/23.11.0-0   ||
+PM="////"
+# Nama conda environment yang digunakan
+CONDA_NAME="////"
+# ----------------------------------------------------
+# Script jalannya program
+# ----------------------------------------------------
+# Memuat modul
+module load ${PM}
+# Mengaktifkan Conda Environment
+source activate ${CONDA_NAME}
+# Tuliskan perintah menjalankan komputasi Python user
+# contoh -> python3 [nama-file-python]
+////
+</syntaxhighlight>
+|}
+|-
+|
+{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
+!- Template submit script conda environment versi GPU -
+[[Berkas:GMB GPU icon.png|nirbing|100x100px]]
+|-
+|[[Berkas:GMB warning wololo.png|nirbing|40x40px]]'''Apakah perlu memuat modul CUDA <big>[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Komputasi_Python_dengan_Conda_Environment_(Mandiri)#4._Instalasi_Package_Python_versi_CUDA? <nowiki>[ Subbab 4 ]</nowiki>]</big>?'''
+*'''''Apabila butuh''''', isi nama modul CUDA pada script sebagai berikut:
+ ...
+ module load ${PM}
+ '''''module load [Nama-modul-CUDA]'''''
+ ...
+{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
+|-
+! colspan="2" |- Daftar modul CUDA ALELEON -
 |-
-!''Menonaktifkan conda env:''
+!Versi CUDA
+!Nama modul CUDA
 |-
-|<code><small>(env-user)$</small> '''conda deactivate'''</code>
+|11.2
+|<code>cuda/11.2-cuDNN8.1.1</code>
 |-
-!''Mengaktifkan kembali conda env:''
+|11.6
+|<code>cuda/11.6-cuDNN8.3.3</code>
 |-
-| Lakukan '''<code>langkah 1 dan 4</code>'''. Apabila lupa nama env:
+|11.8
-<code>$ '''conda env list'''</code>
+|<code>cuda/11.8-cuDNN8.6.0</code>
 |-
-!''Manajemen lainnya:''
+|12.0
+|<code>cuda/12.0-cuDNN8.7.0</code>
 |-
-|Manajemen lain seperti rename, delete, clone, export, dll lihat:
+|12.1
-*'''[[https://docs.conda.io/projects/conda/en/latest/user-guide/tasks/manage-environments.html Conda Managing environments]]'''
+|<code>cuda/12.1-cuDNN8.8.1</code>
+|-
+|12.3
+|<code>cuda/12.3-cuDNN8.9.6</code>
+|-
+|12.4
+|<code>cuda/12.4-cuDNN9.2.1</code>
+|-
+|12.5
+|<code>cuda/12.5-cuDNN9.2.1</code>
+|-
+| colspan="2" |Permintaan instalasi CUDA versi lain:
+* Hubungi tim admin di '''''support@efisonlt.com'''''
+|-
+! colspan="2" |---
 |}
+|-
+|<syntaxhighlight lang="bash" line="1">
+#!/bin/bash
+# -----------------------------------------------------
+# Template SLURM Submit Script
+# Python dengan Conda Environment (GPU) | rev.210125
+#
+# NOTES:
+# 1. Isi bagian yang ditandai 4 garing (////).
+# 2. Template ini bersifat referensi.
+#    User dapat mengubah bagian yang perlu diubah.
+# 3. Pastikan user sudah melengkapi conda environment.
+# -----------------------------------------------------
+# -----------------------------------------------------
+# Alokasi komputasi SBATCH dan file input
+# -----------------------------------------------------
+# Partisi compute node GPU
+#SBATCH --partition=ampere
+# Alokasi jumlah core thread CPU
+#SBATCH --ntasks=////
+# Alokasi jumlah GPU
+#SBATCH --gpus=////
+# Alokasi jumlah memori RAM (satuan GB)
+#SBATCH --mem=////GB
+# Alokasi limit waktu menjalankan job
+# Format HH:MM:SS atau D-HH:MM:SS
+#SBATCH --time=////
+# Definisi file untuk menampung output terminal program
+#SBATCH --output=result-%j.txt
+# Definisi file untuk menampung output error log
+#SBATCH --error=error-%j.txt
+# Input nama modul package manager yang digunakan untuk membuat
+# conda env user. Daftar nama:
+# Anaconda3/2020.11   || Anaconda3/2021.05   || Anaconda3/2022.05 ||
+# Anaconda3/2023.07-2 || Anaconda3/2024.02-1 || Mamba/23.11.0-0   ||
+PM="////"
+# Nama conda environment yang digunakan
+CONDA_NAME="////"
+# ----------------------------------------------------
+# Script jalannya program
+# ----------------------------------------------------
+# Memuat modul
+module load ${PM}
+# Mengaktifkan Conda Environment
+source activate ${CONDA_NAME}
+# Tuliskan perintah menjalankan komputasi Python user
+# contoh -> python3 [nama-file-python]
+////
+</syntaxhighlight>
 |}
+|-
+!
+|-
+|
+*''Detail Submit Script lihat '''[<nowiki/>[[Submit Script ALELEON Supercomputer|Subm]]<small><nowiki/></small>[[Submit Script ALELEON Supercomputer|it Script ALELEON Supercomputer]]]'''''
+*''Untuk SBATCH notifikasi email status jalannya job lihat '''[[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Submit_Script_ALELEON_Supercomputer#SBATCH_untuk_notifikasi_email_SLURM Slurm Jojo]]'''''
+|-
+!<big><code>-/ 2B /-</code></big>
+|-
+|SBATCH komputasi (ntasks, mem, time, dll) '''punya limit''' berdasarkan:
+*Sisa Core Hour user dan '''[<nowiki/>[[Limitasi Fair Usage ALELEON Supercomputer|Fair Usage Limit]]]'''
+*Spesifikasi sistem dan software komputasi.
+Untuk melihat limit, jalankan perintah berikut:
+ $ '''slimit-python'''
+[[Berkas:GMB warning wololo.png|nirbing|40x40px]] '''Note untuk saat ini:'''
+*''Jalankan ketika tidak ada job user yang berjalan atau antri.''
+*''Sementara berlaku untuk akun perseorangan saja.''
+|-
+!<big><code>-/ 3 /-</code></big>
+|-
+|Jalankan job dengan perintah:
+ $ '''sbatch ''[nama-submit-script]'''''
+ ''Contoh:''
+ $ sbatch submit.sh
+|-
+!<big><code>-/ 4 /-</code></big>
+|-
+|User dapat melihat status jalannya job dengan perintah:
+ $ '''squeue -ul $USER'''
+* ''Apabila tidak ada di squeue artinya job bersangkutan telah berakhir.''
+* ''Job berakhir ketika:''
+** ''Komputasi selesai atau ada error sehingga selesai prematur.''
+** ''Job menyentuh walltime yang didefinisikan user di SBATCH time.''
-=== Instalasi Package di Conda Environment ===
 {| class="wikitable"
-!
+|+Kolom ST atau STATE menunjukkan status jalannya job:
+|-
+!STATE
+!Penjelasan
+|-
+|<code>'''R (RUN)'''</code>
+|Job berjalan
+|-
+|<code>'''PD (PENDING)'''</code>
+|Job tertahan, lihat '''[<nowiki/>[[Daftar Job Reason ALELEON Supercomputer|Daftar Job Reason]]]'''
+|-
+|<code>'''CG (COMPLETING)'''</code>
+|Job selesai dan dalam proses clean-up
+|-
+|<code>'''CA (CANCELED)'''</code>
+|Job dibatalkan user
+|-
+|<code>'''PR (PREEMPETED)'''</code>
+|Job dibatalkan admin, alasan dikabarkan via email
+|-
+|<code>'''S (SUSPENDED)'''</code>
+|Job ditahan admin, alasan dikabarkan via email
+|}
 |-
-|[[Berkas:Icon apps terminal cropped.png|kiri|nirbing|80x80px]]Menggunakan terminal!
+!<big><code>-/ 5 /-</code></big>
-*User web EFIRO buka app '''<code>Aleleon Shell Access</code>'''.
 |-
-!1
+|User dapat memantau file output dengan perintah Unix seperti:
+* '''<code>ls</code>''', '''<code>cat</code>''', '''<code>more</code>''', '''<code>tail</code>''', dll
 |-
-| '''Aktifkan conda env''' yang akan dipakai untuk instalasi package ini.
+!<big><code>-/ 6 /-</code></big>
 |-
-!2
+|Apabila user ingin menghentikan job yang berjalan, jalankan perintah:
+ '''$ scancel ''[job-ID]'''''
+ ''Job ID ada pada squeue diatas.''
+ contoh membatalkan job ID 231:
+ $ '''scancel 231'''
 |-
-|Pilih tutorial instalasi sesuai kebutuhan:
+!---
-''<small><code>(klik expand / kembangkan)</code></small>''
+|}
 {| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
-! colspan="2" |Instalasi Package Secara Umum dengan pip / conda
+!- Langkah Batch Job di web EFIRO -
+[[Berkas:Efiro jobcomposer display.png|nirbing|400x400px]]
+|-
+!<big><code>-/ 0 /-</code></big>
 |-
-| colspan="2" |User dapat melakukan instalasi package lainnya dengan pip atau conda
+!Apakah bisa menjalankan job?
 |-
-! rowspan="2" |pip
+|User dengan '''Kredit Core Hour''' disarankan cek kuota terlebih dulu:
-| Contoh umum:
-<code><small>(env-user)$</small> '''pip install ''[nama-package]'''''</code>
+# Buka menu '''<big><code>Apps > Aleleon Shell Access</code></big>'''
+# Jalankan:
+ $ '''sausage'''
+* Detail limit alokasi komputasi job lihat langkah '''<big>5B</big>'''.
+* Bila butuh tambah kuota, lihat '''[[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Core_Hour#Penggunaan_Kredit_Core_Hour top up Kredit Core Hour]].'''
 |-
-|Daftar package dan tutorial instal '''pip''' lihat web:
+!<big><code>-/ 1 /-</code></big>
-*'''[[https://pypi.org/ PyPI The Python Package Index]]'''.
 |-
-! colspan="2" |
+| [https: / wiki.efisonlt.com wiki Menggunakan_ALELEON_Supercomputer_via_EFIRO#1_ |'''[[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Menggunakan_ALELEON_Supercomputer_via_EFIRO#Login_Web_EFIRO Login ke web EFIRO]]''' ALELEON Supercomputer.
 |-
-! rowspan="2" |conda
+!<big><code>-/ 2 /-</code></big>
-|Contoh umum:
-<code><small>(env-user)$</small> '''conda install conda-forge::''[nama-package]'''''</code>
 |-
-|Daftar package dan tutorial instal conda lihat web:
+|
-*'''[[https://conda-forge.org/packages/ Packages in Conda Forge]]'''.
+{| class="wikitable"
+|[[Berkas:EOD Apps Job Composer full.png|nirbing|126x126px]]
+|Klik app '''<code><big>Job Composer</big></code>'''  di homepage EFIRO.
+* ''atau'' menu '''<big><code>Apps > Job Composer</code></big>'''
 |}
+|-
+|[[Berkas:Jcnewjobmarked.png|nirbing|170x170px]]Pilih menu <big>'''<code>New Job > From Template</code>'''</big>
+|-
+!<big><code>-/ 3 /-</code></big>
+|-
+!Buat ruang job untuk menjalankan komputasi:
+|-
+|
+{| class="wikitable"
+|+Pilih template Anaconda Python yang diinginkan:
+|-
+!Nama Template
+!Penjelasan
+|-
+|Conda Environment Python (CPU)
+|Menjalankan conda env pada CPU
+|-
+|Conda Environment Python (GPU)
+|Menjalankan conda env pada GPU
+|}Kemudian Isi '''Job Name''' dan klik '''<code><big>Create New Job</big></code>'''
+[[Berkas:Jctemplate-2.png|nirbing]]
+|-
+!<big><code>-/ 4 /-</code></big>
+|-
+!Lakukan persiapan:
+|-
+|'''<big>4A</big> -''' '''Pastikan package lengkap pada conda env yang akan digunakan:'''
+* Package tidak lengkap akan menyebabkan job gagal berjalan.
+* Akses terminal apabila butuh via menu '''<code><big>Open Terminal</big></code>'''
+'''<big>4B</big> -''' '''Siapkan file komputasi yang dibutuhkan di ruang job:'''
+* ''Pastikan ruang job yang dipilih adalah yang akan digunakan.''
+*Upload / download / edit file via menu <code>'''<big>Edit Files</big>'''</code>
+*Upload / download file tunggal diatas 2GB gunakan '''[[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Manajemen_File_di_ALELEON_Supercomputer#Upload_/_Download_Ruang_Job_Composer software FTP]]'''
+[[Berkas:JC job menu.png|nirbing|500x500px]]
+|-
+!<big><code>-/ 5A /-</code></big>
+|-
+|Lengkapi '''Submit Script''' melalui tombol '''<code><big>Open Editor</big></code>'''
+*Submit script adalah 'formulir' untuk menjalankan job komputasi.
+* Ikuti petunjuk '''NOTES dan alur script''' di dalamnya.
+*Klik '''<code><big>Save</big></code>''' setiap kali mengubah script.
+[[Berkas:Jceditor3.png|al=|nirbing|400x400px]]
+|-
+!
+|-
+|[[Berkas:GMB warning wololo.png|nirbing|40x40px]] '''Bagi yang memilih template GPU:'''
+* Apakah perlu memuat modul CUDA '''<big>[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Komputasi_Python_dengan_Conda_Environment_(Mandiri)#4._Instalasi_Package_Python_versi_CUDA? <nowiki>[ Subbab 4 ]</nowiki>]</big>?'''
+*'''''Apabila butuh''''', isi nama modul CUDA pada script sebagai berikut:
+ ...
+ module load ${PM}
+ '''''module load [Nama-modul-CUDA]'''''
+ ...
 {| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
-! colspan="2" |Instalasi Package TensorFlow
 |-
-| colspan="2" |Tersedia dua versi TensorFlow, pilih sesuai kebutuhan:
+! colspan="2" |- Daftar modul CUDA ALELEON -
-* Versi CPU - berjalan di CPU.
+|-
-*Versi GPU - berjalan dengan akselerasi GPU NVIDIA dan lib. CUDA.
+!Versi CUDA
+!Nama modul CUDA
+|-
+|11.2
+|<code>cuda/11.2-cuDNN8.1.1</code>
+|-
+|11.6
+|<code>cuda/11.6-cuDNN8.3.3</code>
+|-
+|11.8
+|<code>cuda/11.8-cuDNN8.6.0</code>
+|-
+|12.0
+|<code>cuda/12.0-cuDNN8.7.0</code>
+|-
+|12.1
+|<code>cuda/12.1-cuDNN8.8.1</code>
 |-
-!Versi
+|12.3
-!Perintah pip
+|<code>cuda/12.3-cuDNN8.9.6</code>
+|-
+|12.4
+|<code>cuda/12.4-cuDNN9.2.1</code>
+|-
+|12.5
+|<code>cuda/12.5-cuDNN9.2.1</code>
+|-
+| colspan="2" |Permintaan instalasi CUDA versi lain:
+* Hubungi tim admin di '''''support@efisonlt.com'''''
+|-
+! colspan="2" |---
+|}
+|-
+!
+|-
+|
+*''Detail Submit Script lihat '''[<nowiki/>[[Submit Script ALELEON Supercomputer|Subm]]<small><nowiki/></small>[[Submit Script ALELEON Supercomputer|it Script ALELEON Supercomputer]]]'''''
+*''Untuk SBATCH notifikasi email status jalannya job lihat '''[[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Submit_Script_ALELEON_Supercomputer#SBATCH_untuk_notifikasi_email_SLURM Slurm Jojo]]'''''
+|-
+!<big><code>-/ 5B /-</code></big>
+|-
+|SBATCH komputasi (ntasks, mem, time, dll) '''punya limit''' berdasarkan:
+*Sisa Core Hour user dan '''[<nowiki/>[[Limitasi Fair Usage ALELEON Supercomputer|Fair Usage Limit]]]'''
+*Spesifikasi sistem dan software komputasi.
+Untuk melihat limit, jalankan perintah berikut:
+ $ '''slimit-python'''
+[[Berkas:GMB warning wololo.png|nirbing|40x40px]] '''Note untuk saat ini:'''
+*''Jalankan ketika tidak ada job user yang berjalan atau antri.''
+*''Sementara berlaku untuk akun perseorangan saja.''
+|-
+!<big><code>-/ 6 /-</code></big>
+|-
+|Jalankan job dengan klik tombol '''<code><big>Submit</big></code>'''
+[[Berkas:JC job runstop.png|al=|nirbing|400x400px]]
+*''Job berakhir '''(Status completed)''' ketika:''
+** ''Komputasi selesai atau ada error sehingga selesai prematur.''
+** ''Job menyentuh walltime yang didefinisikan user di SBATCH time.''
+{| class="wikitable"
+|+Kolom Status menunjukkan status jalannya job:
+|-
+!Status
+!Arti
+|-
+|'''Not Submitted'''
+|Job belum pernah dijalankan.
+|-
+|'''Running'''
+|Job berjalan.
+|-
+| '''Queue'''
+|Job mengantri dan belum berjalan.
+|-
+|'''Completed'''
+| Job selesai berjalan.
+|-
+|'''Failed'''
+|Job berhenti karena error atau di stop user.
+|-
+! colspan="2" |'''Melihat alasan job yang queue:'''
+|-
+| colspan="2" |[[Berkas:Active Jobs detail.png|nirbing|400x400px]]
+* Buka menu '''<big><code>Apps > Active Jobs</code></big>'''
+* Ubah opsi '''<big><code>All Jobs</code></big>''' ke <big><code>'''Your Jobs'''</code></big>.
+* Klik simbol '''<code><big>></big></code>''' pada job status pending dan lihat kolom '''Reason'''.
+* Arti reason lihat laman '''[[Daftar Job Reason ALELEON Supercomputer|[Daftar Job Reason ALELEON]]]'''
+|}
+|-
+!<big><code>-/ 7 /-</code></big>
+|-
+|Lihat output file komputasi pada kolom '''Folder Contents'''
+*Atau dengan membuka menu '''<code><big>Edit Files</big></code>'''
+[[Berkas:Jcfoldercontentsedit.png|al=|nir|jmpl|''Kolom '''<code>Folder Contents</code>''''']]
+|-
+!<big><code>-/ 8 /-</code></big>
+|-
+|Apabila user ingin menghentikan job yang berjalan, klik '''<code><big>Stop</big></code>'''
+|-
+!<big><code>-/ 9 /-</code></big>
 |-
-|CPU
+|Untuk menghapus ruang job dan datanya:
-| <code><small>(env-user)$</small> '''python3 -m pip install tensorflow'''</code>
+*Pilih ruang job yang akan dihapus.
+*Perhatikan opsi ini juga '''menghapus data di ruang job tersebut.'''
+*Klik menu '''<code><big>Delete</big></code>'''
+[[Berkas:JC delete menu.png|nirbing|400x400px]]
 |-
-|GPU
+!---
-|<code><small>(env-user)$</small> '''python3 -m pip install 'tensorflow[and-cuda]''''</code>
 |}
+=== 6.2. Sesi Jupyter ===
+Menjalankan sesi interaktif Jupyter Lab atau Notebook di '''[<nowiki/>[[Spesifikasi ALELEON Supercomputer#Spesifikasi%20Interactive%20Node|interactive node]]].'''
+''<small><code>(klik expand / kembangkan)</code></small>''
 {| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
-! colspan="2" |Instalasi Package PyTorch
+!- Langkah Sesi Jupyter -
+[[Berkas:Efiro jupyter display.png|400x400px]]
 |-
-| colspan="2" |Tersedia dua versi PyTorch, pilih sesuai kebutuhan:
+!<big><code>-/ 1 /-</code></big>
-*Versi CPU - berjalan di CPU.
-*Versi GPU - berjalan dengan akselerasi GPU NVIDIA dan lib. CUDA.
 |-
-!Versi
+| '''[https: / wiki.efisonlt.com wiki Menggunakan_ALELEON_Supercomputer_via_EFIRO#1_ |'''[[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Menggunakan_ALELEON_Supercomputer_via_EFIRO#Login_Web_EFIRO Login ke web EFIRO]]''' ALELEON Supercomputer.
-!Perintah pip
+|-
+!<big><code>-/ 2 /-</code></big>
 |-
-|CPU
+!Lakukan persiapan sebelum sesi Jupyter:
-|<code><small>(env-user)$</small> '''pip3 install torch torchvision torchaudio --index-url <nowiki>https://download.pytorch.org/whl/cpu</nowiki>'''</code>
 |-
-| GPU - CUDA 11.8
+|'''Untuk efisiensi sesi terkait batasan waktu dan konsumsi Core Hour:'''
-|<code><small>(env-user)$</small> '''pip3 install torch torchvision torchaudio --index-url <nowiki>https://download.pytorch.org/whl/cu118</nowiki>'''</code>
+* Lengkapi instalasi package pada conda env yang akan dipakai.
+** [[Berkas:GMB warning wololo.png|nirbing|50x50px]] ''Pastikan package jupyter dan jupyterlab telah terinstal.''
+* Upload file besar lihat '''[[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Manajemen_File_di_ALELEON_Supercomputer Upload / Download File HOME]]'''
+** Direktori standar sesi Jupyter adalah $HOME user.
 |-
-|GPU - CUDA 12.1
+!<big><code>-/ 3 /-</code></big>
-|<code><small>(env-user)$</small> '''pip3 install torch torchvision torchaudio --index-url <nowiki>https://download.pytorch.org/whl/cu121</nowiki>'''</code>
 |-
-|GPU - CUDA 12.4
+|
-|<code><small>(env-user)$</small> '''pip3 install torch torchvision torchaudio'''</code>
+{| class="wikitable"
+|[[Berkas:New Pinnedapps jupyter.png|nirbing|116x116px]]
+|Klik app '''<code><big>Jupyter</big></code>'''  di homepage EFIRO.
+* ''atau'' menu '''<big><code>Apps > Jupyter</code></big>'''
 |}
+|-
+!<big><code>-/ 4 /-</code></big>
+|-
+|Isi formulir untuk memulai sesi Jupyter dengan panduan berikut:
+{| class="wikitable"
+!<code>''<big>Choose Jupyter version</big>''</code>
+|-
+|Pilih sesuai preferensi user, <code>Jupyter Lab</code> atau <code>Notebook</code>
+|-
+!
+|-
+!''<code><big>Partition</big></code>''
+|-
+|Pilih sesuai kebutuhan:
+*<code>'''torti'''</code> -> interactive node CPU [[Berkas:GMB CPU icon.png|nirbing|60x60px]]
+*<code>'''tilla'''</code> -> interactive node GPU [[Berkas:GMB GPU icon.png|nirbing|90x90px]]
+|-
+!
+|-
+!<code>''<big>Number of CPU thread(s)</big>''</code>
+|-
+|Alokasi core CPU, range <code><big>'''2 - 32'''</big></code>
+|-
+!
+|-
+!<code>''<big>Amount of memory/RAM (GB)</big>''</code>
+|-
+|Alokasi RAM dalam satuan GB, range <code><big>'''1 - 64'''</big></code>
+|-
+!
+|-
+!''<code><big>Number of GPUs</big></code> (apabila pilih partition tilla)''
+|-
+|Jumlah GPU, isi angka <code><big>'''1'''</big></code>
+|-
+!
+|-
+!''<code><big>Number of hours</big></code>''
+|-
+|Waktu maksimal sesi Jupyter, range <code><big>'''1 - 72'''</big></code>
+|-
+![[Berkas:GMB warning wololo.png|nirbing|50x50px]] Apakah bisa menjalankan sesi Jupyter?
+|-
+|Form CPU, GPU, dan hours '''punya limit''' berdasarkan:
+*Sisa Core Hour user dan '''[<nowiki/>[[Limitasi Fair Usage ALELEON Supercomputer|Fair Usage Limit]]]'''
+Untuk melihat limit:
+* Buka menu '''<code><big>Apps > Aleleon Shell Access</big></code>'''
+* Jalankan perintah:
+ $ '''sausage'''
+* Ketentuan sesi Jupyter dapat berjalan:
+ sisa CCH > number of CPU threads X number of hours
+ sisa GH > number of GPU X number of hours
+|-
+!
+|-
+!''<code><big>Choose how to launch Jupyter</big></code>''
+|-
+|Pilih <code>'''Anaconda/Mamba'''</code>
+|-
+!
+|-
+!''<code><big>Choose Anaconda/Mamba version</big></code>''
+|-
+|Pilih versi yang digunakan untuk membuat conda env user.
+|-
+!
+|-
+!''<code><big>Conda/Mamba environment directory</big></code>''
+|-
+|Isi nama conda env user, contoh: <code>skripsi</code>
+|-
+!
+|-
+!''<code><big>Software Modules</big></code>''
+|-
+|Memuat modul software diluar conda env user , ''isi apabila ada''.
+|-
+|[[Berkas:GMB warning wololo.png|nirbing|40x40px]] Bagi user yang memilih '''partition tilla''':
+* Apakah perlu memuat modul CUDA '''<big>[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Komputasi_Python_dengan_Conda_Environment_(Mandiri)#4._Instalasi_Package_Python_versi_CUDA? <nowiki>[ Subbab 4 ]</nowiki>]</big>?'''
+* '''''Apabila butuh''''', isi form ini dengan nama modul CUDA.
 {| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
-!Instalasi Package Jupyter untuk user Mamba
 |-
-|Conda env dari Mamba perlu instalasi package Jupyter untuk menggunakan sesi Jupyter:
+! colspan="2" |- Daftar modul CUDA ALELEON -
- <small>(env-user)$</small> '''mamba install -c conda-forge jupyterlab'''
+|-
- <small>(env-user)$</small> '''mamba install -c conda-forge jupyter'''
+!Versi CUDA
+!Nama modul CUDA
+|-
+|11.2
+|<code>cuda/11.2-cuDNN8.1.1</code>
+|-
+|11.6
+|<code>cuda/11.6-cuDNN8.3.3</code>
+|-
+|11.8
+|<code>cuda/11.8-cuDNN8.6.0</code>
+|-
+|12.0
+|<code>cuda/12.0-cuDNN8.7.0</code>
+|-
+|12.1
+|<code>cuda/12.1-cuDNN8.8.1</code>
+|-
+|12.3
+|<code>cuda/12.3-cuDNN8.9.6</code>
+|-
+|12.4
+|<code>cuda/12.4-cuDNN9.2.1</code>
+|-
+|12.5
+|<code>cuda/12.5-cuDNN9.2.1</code>
+|-
+| colspan="2" |Permintaan instalasi CUDA versi lain:
+* Hubungi tim admin di '''''support@efisonlt.com'''''
+|-
+! colspan="2" |---
 |}
+|-
+!
+|-
+!''<code><big>Environment setup</big></code>''
+|-
+|Memuat environment variable, ''isi apabila ada''.
+|-
+!
+|-
+!''<code><big>Additional Jupyter arguments</big></code>''
+|-
+|Memuat argumen tambahan Jupyter, ''isi apabila ada''.
+|-
+!
+|-
+!''<code><big>Email address</big></code>''
+|-
+|Notifikasi email untuk status mulai dan selesainya Jupyter.
+*''Isi apabila berkenan.''
 |}
-== '''Metode Menjalankan Komputasi''' ==
+*
-User dapat memilih metode menjalankan komputasi sesuai keinginan: ''<small>(klik expand / kembangkan)</small>''
+|-
+!<big><code>-/ 5 /-</code></big>
+|-
+|Klik tombol '''<code><big>Launch</big></code>''' untuk memulai sesi Jupyter:
+*User akan diarahkan ke halaman '''<code><big>My Interactive Sessions</big></code>'''
+*Tunggu hingga sesi Jupyter siap diakses.
+[[Berkas:Jupyternotebookqueue.png|nirbing|500x500px]]
+|-
+!<big><code>-/ 6 /-</code></big>
+|-
+|Apabila status '''Running''', klik tombol '''<code><big>Connect to Jupyter</big></code>'''
+*[[Berkas:GMB warning wololo.png|nirbing|50x50px]] Sistem mulai menghitung Core Hour!
+*Sesi akan terus berjalan selama '''waktu sesi masih ada'''.
+*Untuk menghentikan sesi yang running, klik tombol '''<code><big>Cancel</big></code>'''
+[[Berkas:Newjupyter120124.png|nirbing|500x500px]]
+|-
+!<big><code>-/ 7 /-</code></big>
+|-
+|Gunakan kernel '''Python 3 (ipykernel)''' untuk sesi Jupyter.
+|-
+!<big><code>-/ 8 /-</code></big>
+|-
+|'''Sesi Jupyter tidak terputus ketika:'''
+* Koneksi user terputus saat sesi Jupyter.
+* User keluar / log out dari sesi Jupyter dan web EFIRO.
+'''User dapat mengunjungi sesi Jupyter yang sedang berjalan pada:'''
+*Menu '''<code><big>My Interactive Sessions</big></code>'''
+*Kolom '''<code><big>Active interactive sessions</big></code>''' di homepage EFIRO.
+[[Berkas:GMB warning wololo.png|nirbing|50x50px]] '''Ketika user keluar saat ada cell berjalan dan kembali masuk:'''
-* '''Job submission Slurm'''
+* Bisa jadi cell tersebut tidak menampilkan proses jalannya komputasi.
-** ''Menjalankan komputasi di [https://wiki.efisonlt.com/wiki/Spesifikasi_ALELEON_Supercomputer#Spesifikasi_Compute_Node compute node] melalui manajemen Slurm kemudian user menunggu hingga selesai.''
+* Lihat cell berikutnya apakah belum / sedang / selesai berjalan.
-** ''Hanya untuk file Python (.py) siap jalan, file ipynb harus diubah ke py.''
+|-
-* '''Sesi Interaktif Slurm'''
+!---
-** ''coming soon!''
+|}
-* '''Sesi Interaktif Jupyter'''
+=='''''7. Pelaporan Kendala dan Support'''''==
-** ''Menggunakan [https://wiki.efisonlt.com/wiki/Spesifikasi_ALELEON_Supercomputer#Spesifikasi_Interactive_Node interactive node] secara langsung melalui IDE Jupyter Lab atau Notebook.''
-=== Job Submission Slurm ===
-Terdapat dua pilihan tampilan yaitu dengan terminal dan web EFIRO.
-=== Sesi Interaktif Jupyter ===
-=='''Pelaporan Kendala dan Support'''==
 Apabila menjumpai masalah teknis dalam menjalankan komputasi, silahkan lapor dengan klik gambar berikut ini.
@@ Baris 264: / Baris 1.075: @@
 Bila terdapat pertanyaan lainnya, silahkan hubungi admin EFISON melalui email:
   '''support@efisonlt.com'''
+== '''''Kontributor''''' ==
+EFISON turut mengucapakan terima kasih spesial kepada:
+# '''[[https://sadasa.id/ Sadasa Aacademy]]''' untuk pengujian semua tutorial di laman ini.