Tutorial Menggunakan ALELEON Supercomputer: Perbedaan antara revisi

Dari ALELEON by EFISON
(→‎3A. Tutorial Menjalankan Software Komputasi: tes penulisan tabel dan menambah tabel cara menjalankan komputasi)
(membuat section Job Composer dan Interactive Apps)
Baris 12: Baris 12:
[[Berkas:Efiromenubar2.png|al=|900x900px]]
[[Berkas:Efiromenubar2.png|al=|900x900px]]
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
!Isi dari Dashboard EFIRO
!PENJELASAN MENU DI DASHBOARD EFIRO
|-
|-
|
|
Baris 18: Baris 18:
* Halaman untuk membuat dan menjalankan komputasi di Compute Node ALELEON Supercomp'''<nowiki/>'''uter.
* Halaman untuk membuat dan menjalankan komputasi di Compute Node ALELEON Supercomp'''<nowiki/>'''uter.
* Job Composer berisikan serangkaian template, formulir, dan script untuk menjalank'''<nowiki/>'''an software komputasi. '''<nowiki/><nowiki/>'''
* Job Composer berisikan serangkaian template, formulir, dan script untuk menjalank'''<nowiki/>'''an software komputasi. '''<nowiki/><nowiki/>'''
[[Berkas:Efirojobcomposer3.png|al=|jmpl|Halaman Job Composer|kiri]]
[[Berkas:Efirojobcomposer3.png|al=|jmpl|'''Halaman Job Composer'''|kiri]]
|-
|-
|
|
=== Jobs > '''Active Jobs'''===
=== Jobs > '''Active Jobs'''===
* Menampilkan status dan antrian job komputasi semua user yang sedang berjalan.
* Menampilkan status dan antrian job komputasi semua user yang sedang berjalan.
[[Berkas:Efiroqueueedit.png|al=|jmpl|Halaman Active Jobs|kiri]]
[[Berkas:Efiroqueueedit.png|al=|jmpl|'''Halaman Active Jobs'''|kiri]]
|-
|-
|
|
=== Clusters > '''Aleleon Shell Access'''===
=== Clusters > '''Aleleon Shell Access'''===
* Halaman terminal Linux (shell) ALELEON Supercomputer.
* Halaman terminal Linux (shell) ALELEON Supercomputer.
* Untuk kegiatan yang membutuhkan terminal seperti compiling, membuat environment, dll.
* Untuk kegiatan yang membutuhkan terminal seperti compiling, membuat environment (user Python, R, GROMACS), dll.
[[Berkas:Efiroshell.png|kiri|jmpl|200x200px|Terminal ALELEON Supercomputer]]
[[Berkas:Efiroshell.png|kiri|jmpl|200x200px|'''Terminal ALELEON Supercomputer''']]
|-
|-
|
|
Baris 37: Baris 37:
* User dapat melakukan manajemen file seperti upload, download, copy, rename, delete, dll.
* User dapat melakukan manajemen file seperti upload, download, copy, rename, delete, dll.


[[Berkas:Efiroftp3.png|al=|jmpl|Halaman Home Directory dan menu manajemen file|kiri]]
[[Berkas:Efiroftp3.png|al=|jmpl|'''Halaman Home Directory dan menu manajemen file'''|kiri]]
|}
|}


== '''3. Menjalankan Komputasi di ALELEON Supercomputer''' ==
== '''3. Menggunakan ALELEON Supercomputer''' ==
Terdapat dua metode untuk menjalankan software komputasi di ALELEON Supercomputer:  
Terdapat dua metode untuk menjalankan software komputasi di ALELEON Supercomputer:  
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
!Metode Menjalankan Komputasi di ALELEON Supercomputer
|-
|
=== Job Composer ===
[[Berkas:Efirojobcomposermenu.png|nirbing|300x300px]][[Berkas:Efirojobcomposer3.png|nir|jmpl|Halaman Job Composer.]]---
* Bekerja dengan model '''''job submission'':''' software komputasi dijalankan oleh sistem berdasarkan serangkaian formulir dan script yang didefinisikan user.
* Job Composer menjalankan software komputasi pada '''Compute Node''' - bagian server utama dan terkencang untuk menjalankan komputasi user.
* Job Composer digunakan untuk menjalankan komputasi skala apapun dari kecil hingga besar.
* Langkah menggunakan Job Composer dirangkum pada semua tutorial penggunaan software komputasi ALELEON Supercomputer,
|-
|
=== Interactive Apps ===
[[Berkas:Inapps.png|nirbing]][[Berkas:Jupyterefiro.png|nir|jmpl|Contoh salah satu interactive apps di ALELEON Supercomputer yaitu Jupyter Notebook.]]---


* Aplikasi yang dapat dijalankan secara '''interaktif''' (langsung) oleh user.
* Job Composer  
* Semua software Interactive Apps berjalan pada '''Interactive Node''' - bagian server untuk menjalankan semua interactive apps
* Interactive Apps  
* Interactive Node mempunyai spesifikasi hardware terbatas sehingga lebih cocok digunakan untuk komputasi skala kecil atau pengujian jalannya software / script. Gunakan Job Composer untuk melakukan komputasi skala besar.
* Untuk saat ini, aplikasi pada Interactive Apps hanya dapat ditambahkan oleh admin EFISON. Kedepannya akan diimplementasikan model sandbox supaya user dapat menambah aplikasi interaktif sendiri.
|}


=='''Melakukan Komputasi via Job Composer'''==
=='''Job Composer'''==
 
[[Berkas:Efirojobcomposermenu.png|nirbing|300x300px]]
* Software yang dijalankan via Job Composer akan menggunakan Compute Node ALELEON Supercomputer - bagian  
[[Berkas:Efirojobcomposer2.png|nir|jmpl|'''Halaman Job Composer''']]
* Silahkan pilih berdasarkan software yang akan user jalankan.
* Cara utama menjalankan komputasi di ALELEON Supercomputer. Bekerja dengan model '''''job submission'':''' software komputasi dijalankan oleh sistem berdasarkan serangkaian template, formulir, dan script yang didefinisikan user.
* Job Composer menjalankan software pada '''Compute Node''' - bagian server utama dan terkencang.
* Silahkan temukan tutorial software yang digunakan user:
{| class="wikitable sortable mw-collapsible mw-collapsed"
{| class="wikitable sortable mw-collapsible mw-collapsed"
|+SOFTWARE SAINTIFIK
|+TUTORIAL MENJALANKAN SOFTWARE KOMPUTASI DI JOB COMPOSER
!Nama Software
!Nama Software
|-
|-
|
|
=== R [[Berkas:R.png|nirbing|100x100px]] ===
=== [[R]] [[Berkas:R.png|nirbing|100x100px]]===
|-
|-
|
|
=== GROMACS [[Berkas:GROMACS.png|nirbing|200x200px]] ===
=== [[GROMACS]] [[Berkas:GROMACS.png|nirbing|200x200px]]===
|-
|-
|
|
=== NWChem [[Berkas:Nwhem.png|nirbing|200x200px]] ===
=== [[NWChem]] [[Berkas:Nwhem.png|nirbing|200x200px]]===
|-
|-
|
|
=== Quantum ESPRESSO [[Berkas:Quantum ogo ok.png|nirbing|250x250px]] ===
=== [[Quantum ESPRESSO]] [[Berkas:Quantum ogo ok.png|nirbing|250x250px]]===
|-
|-
|
|
=== GAMESS [[Berkas:GAMESS.png|nirbing|200x200px]] ===
=== [[GAMESS]] [[Berkas:GAMESS.png|nirbing|200x200px]]===
|-
|-
|
|
=== NAMD [[Berkas:NAMDsof.png|nirbing|250x250px]] ===
=== [[NAMD]] [[Berkas:NAMDsof.png|nirbing|250x250px]]===
|-
|-
|
|
=== ORCA [[Berkas:Orca logo.png|nirbing|100x100px]] ===
=== [[ORCA]] [[Berkas:Orca logo.png|nirbing|100x100px]]===
|-
|-
|
|
=== TensorFlow [[Berkas:TF.png|nirbing|200x200px]] ===
=== TensorFlow [[Berkas:TF.png|nirbing|200x200px]]===
|-
|-
|
|
=== PHASE/0 [[Berkas:Phase-logo4.png|nirbing|100x100px]] ===
=== [[PHASE/0]] [[Berkas:Phase-logo4.png|nirbing|100x100px]]===
|-
|-
|
|
=== COMCOT ===
=== [[COMCOT]] ===
|}
|}
{{DEFAULTSORT:tutorial}}
{{DEFAULTSORT:tutorial}}
__TANPADAFTARISI__
__TANPADAFTARISI__
== '''Interactive Apps''' ==
[[Berkas:Inapps.png|nirbing]][[Berkas:Jupyterefiro.png|nir|jmpl|'''Contoh salah satu interactive apps: Jupyter Notebook.''']]
* Aplikasi yang dapat dijalankan secara '''interaktif''' (langsung) oleh user.
* Semua software Interactive Apps berjalan pada '''Interactive Node''' - bagian server untuk menjalankan semua interactive apps
* Interactive Node mempunyai '''spesifikasi hardware terbatas''' sehingga lebih cocok digunakan untuk komputasi skala kecil atau pengujian jalannya software / script. Gunakan '''Job Composer''' untuk melakukan komputasi skala besar.
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
|+DAFTAR INTERACTIVE APPS DAN TUTORIAL PENGGUNAAN
!Nama Interactive Apps
|-
|
=== Jupyter Notebook [[Berkas:Jupyter logo icon.png|nirbing|200x200px]] ===
|}

Revisi per 24 Februari 2022 03.51

User menggunakan ALELEON Supercomputer melalui EFIRO OnDemand atau disingkat EFIRO - konsol tampilan grafis (GUI) untuk mengakses ALELEON Supercomputer melalui web browser.

1. Koneksi VPN dan Login EFIRO

  • Setelah terhubung ke VPN, user mengakses EFIRO melalui alamat berikut, diikuti dengan memasukkan username dan password akun user.
http://efisonlt.ood

2. Dashboard EFIRO

Setelah login, user masuk ke dalam dashboard EFIRO yang menjadi central hub untuk menggunakan ALELEON Supercomputer.

PENJELASAN MENU DI DASHBOARD EFIRO

Jobs > Job Composer

  • Halaman untuk membuat dan menjalankan komputasi di Compute Node ALELEON Supercomputer.
  • Job Composer berisikan serangkaian template, formulir, dan script untuk menjalankan software komputasi.
Halaman Job Composer

Jobs > Active Jobs

  • Menampilkan status dan antrian job komputasi semua user yang sedang berjalan.
Halaman Active Jobs

Clusters > Aleleon Shell Access

  • Halaman terminal Linux (shell) ALELEON Supercomputer.
  • Untuk kegiatan yang membutuhkan terminal seperti compiling, membuat environment (user Python, R, GROMACS), dll.
Terminal ALELEON Supercomputer

Files > Home Directory

  • Menampilkan isi direktori HOME user.
  • User dapat melakukan manajemen file seperti upload, download, copy, rename, delete, dll.
Halaman Home Directory dan menu manajemen file

3. Menggunakan ALELEON Supercomputer

Terdapat dua metode untuk menjalankan software komputasi di ALELEON Supercomputer:

  • Job Composer
  • Interactive Apps

Job Composer

Efirojobcomposermenu.png

Halaman Job Composer
  • Cara utama menjalankan komputasi di ALELEON Supercomputer. Bekerja dengan model job submission: software komputasi dijalankan oleh sistem berdasarkan serangkaian template, formulir, dan script yang didefinisikan user.
  • Job Composer menjalankan software pada Compute Node - bagian server utama dan terkencang.
  • Silahkan temukan tutorial software yang digunakan user:
TUTORIAL MENJALANKAN SOFTWARE KOMPUTASI DI JOB COMPOSER
Nama Software

R R.png

GROMACS GROMACS.png

NWChem Nwhem.png

Quantum ESPRESSO Quantum ogo ok.png

GAMESS GAMESS.png

NAMD NAMDsof.png

ORCA Orca logo.png

TensorFlow TF.png

PHASE/0 Phase-logo4.png

COMCOT


Interactive Apps

Inapps.png

Contoh salah satu interactive apps: Jupyter Notebook.
  • Aplikasi yang dapat dijalankan secara interaktif (langsung) oleh user.
  • Semua software Interactive Apps berjalan pada Interactive Node - bagian server untuk menjalankan semua interactive apps
  • Interactive Node mempunyai spesifikasi hardware terbatas sehingga lebih cocok digunakan untuk komputasi skala kecil atau pengujian jalannya software / script. Gunakan Job Composer untuk melakukan komputasi skala besar.
DAFTAR INTERACTIVE APPS DAN TUTORIAL PENGGUNAAN
Nama Interactive Apps

Jupyter Notebook Berkas:Jupyter logo icon.png

Diperoleh dari "https://wiki.efisonlt.com/index.php?title=Tutorial_Menggunakan_ALELEON_Supercomputer&oldid=649"