Quantum ESPRESSO

Dari ALELEON by EFISON

Quantum ogo ok.png

Quantum ESPRESSO adalah framework suite untuk kalkulasi electronic-structure dan modeling material berdasarkan density-functional theory (DFT), plane waves, dan pseudopotentials.

Versi yang Tersedia

Versi Dukungan MPI Dukungan Hardware
6.7 Pure MPI CPU, multi-node
6.8 Pure MPI CPU, multi-node

Menjalankan Quantum ESPRESSO di Job Composer

User menjalankan Quantum ESPRESSO pada Job Composer EFIRO yang dapat dibuka melalui menu Jobs > Jobs Composer

Efirojobcomposermenu.png

Memilih template Quantum ESPRESSO

Template Quantum ESPRESSO yang tersedia
Nama Template Penjelasan
Quantum ESPRESSO 6.7 Template standar QE versi 6.7
Quantum ESPRESSO 6.8 Template standar QE versi 6.8

Template Quantum ESPRESSO adalah set environment untuk menjalankan software Quantum ESPRESSO.

  • Klik New Jobs > From Template.
  • Pilih template Quantum ESPRESSO yang dibutuhkan.
  • isi Job Name sesuai keinginan user kemudian klik Create New Job.

---

Mempersiapkan file input Quantum ESPRESSO

Jcjoboption3.png

  • User dapat melakukan upload, editing, dan rename file input Quantum ESPRESSO melalui menu Edit Files.
  • Taruh input file pada direktori yang sama dengan file slurm-qe.sh.

Melengkapi Submit Script Template

  • Melalui menu Open Editor, user perlu melengkapi Submit Script supaya program Quantum ESPRESSO dapat berjalan:
    • Parameter SBATCH.
    • Nama file input Quantum ESPRESSO.
  • Jangan lupa Save setiap sekali mengubah script.

Save.png

---

Panduan lengkap mengisi Submit Script

SLURM Script ALELEON Supercomputer

Note: Submit Script pada dasarnya adalah SLURM Script karena ALELEON Supercomputer menggunakan manajemen SLURM untuk menjalankan job di Compute Node.

Fitur MPI pada Quantum ESPRESSO

Quantum ESPRESSO menggunakan MPI (Message Passing Interface) sehingga memberi kebebasan user untuk:

MPI ALELEON Supercomputer
  • MPI Satu Node vs Multi Node
    • User dapat menjalankan Quantum ESPRESSO hanya dengan 1 node (maksimal 128 core thread CPU)
    • Atau menggunakan multi-node alias lebih dari 128 core thread CPU.

Menjalankan Job

Semua file untuk menjalankan program dan Submit Script sudah siap? Jalankan job dengan menekan tombol Submit.

  • Perhatikan status jalannya job pada kolom Status.
Status Arti
Not Submitted Job belum pernah dijalankan.
Running Job berjalan.
Queue Job mengantri dan belum berjalan.
Completed Job selesai berjalan.
Failed Job berhenti di tengah jalan,

Bisa karena di Stop atau Delete oleh user.

  • User dapat memantau perubahan kolom Status dengan me-refresh halaman Job.
  • Apabila user ingin menghentikan job yang sedang berjalan, klik tombol Stop yang berada di sebelah tombol Submit.

Melihat hasil job yang selesai

Apabila job sudah selesai (status Completed), user dapat melihat hasil output job melalui bagian Folder Contents atau membuka halaman Edit Pages.

Kolom Folder Contents melihat isi dari ruang direktori job. User dapat melihat semua file output yang keluar di kolom ini.
atau dengan membuka menu Edit Files. Melalui halaman ini user juga dapat melakukan revisi file input misalnya apabila hasil output tidak sesuai yang diharapkan.

Submit ulang job

User dapat menjalankan ulang ruang job yang sama (misalkan ketika ada koreksi file input atau Submit Script) dengan mengklik kembali tombol Submit.