Quantum ESPRESSO

Software Quantum ESPRESSO

Quantum ESPRESSO adalah framework suite untuk kalkulasi electronic-structure dan modeling material berdasarkan density-functional theory, plane waves, dan pseudopotentials.

Versi yang Tersedia

Versi	Nama Modul	Dukungan MPI	Dukungan Hardware	Partisi
6.7	qe	Pure MPI	CPU, parallel multi-node	epyc

SLURM Submission Script

User harus menggunakan manajemen SLURM untuk menjalankan komputasi Quantum ESPRESSO di Compute Node. User dapat menjalankan Quantum ESPRESSO dengan satu node atau paralel (lebih dari satu node) untuk performa lebih kencang.

Satu Node CPU

Contoh berikut untuk menjalankan Quantum ESPRESSO pada satu node CPU.

#!/bin/bash

#SBATCH --ntasks=64               # Contoh menggunakan 64 core CPU
#SBATCH --mem=128GB               # Contoh menggunakan RAM 128GB
#SBATCH --time=10:00:00           # Contoh menetapkan walltime maks 10 jam
#SBATCH --output=result-%j.out    # Output terminal program
#SBATCH --error=result-%j.err     # Output verbose program

# Memuat modul Quantum ESPRESSO
module load qe

# RUN COMMAND
# mpirun wajib menggunakan flag protokol UCX

mpirun -np $SLURM_NTASKS --mca pml ucx --mca osc ucx pw.x -input <file_input>

Multi Node CPU

Contoh berikut untuk menjalankan Quantum ESPRESSO pada lebih dari satu node CPU.

#!/bin/bash

#SBATCH --nodes=2                # Contoh menggunakan 2 node ...
#SBATCH --ntasks-per-node=128    # dengan 128 core per node.
                                 # Maka dari itu total menggunakan 256 core CPU
#SBATCH --mem=128GB              # Contoh menggunakan RAM 128GB per node
#SBATCH --time=10:00:00          # Contoh menggunakan walltime maks 10 jam
#SBATCH --output=result-%j.out   # Output terminal program
#SBATCH --error=result-%j.err    # Output verbose program

# Memuat modul Quantum ESPRESSO
module load qe

# RUN COMMAND
# mpirun wajib menggunakan flag protokol UCX
# $SLURM_NTASKS menangkap total proses MPI (nodes * ntasks-per-node)

mpirun -np $SLURM_NTASKS --mca pml ucx --mca osc ucx pw.x -input <file_input>

Pelajari Lebih Lanjut

User dapat melihat laman SLURM Script untuk Komputasi Paralel MPI untuk memahami lebih lanjut tentang berbagai contoh SLURM script diatas,