Quantum ESPRESSO: Perbedaan antara revisi

Dari ALELEON by EFISON
(Tutorial QE versi EFIRO)
(→‎Versi yang Tersedia: menghapus kolom partisi)
Baris 7: Baris 7:
!Dukungan MPI
!Dukungan MPI
!Dukungan Hardware
!Dukungan Hardware
!Partisi
|-
|-
|6.7
|6.7
|Pure MPI
|Pure MPI
|CPU, multi-node
|CPU, multi-node
|epyc
|-
|-
|6.8
|6.8
|Pure MPI
|Pure MPI
|CPU, multi-node
|CPU, multi-node
|epyc
|}
|}



Revisi per 21 Februari 2022 03.26

Software Quantum ESPRESSO

Quantum ESPRESSO adalah framework suite untuk kalkulasi electronic-structure dan modeling material berdasarkan density-functional theory, plane waves, dan pseudopotentials.

Versi yang Tersedia

Versi Dukungan MPI Dukungan Hardware
6.7 Pure MPI CPU, multi-node
6.8 Pure MPI CPU, multi-node

Menjalankan Quantum ESPRESSO

User menjalankan Quantum ESPRESSO pada Job Composer EFIRO yang dapat dibuka melalui menu Jobs > Jobs Composer

Efirojobcomposermenu.png

1. Memilih template Quantum ESPRESSO

  • Klik New Jobs > From Template.
  • Pilih template Quantum ESPRESSO yang dibutuhkan.
  • isi Job Name sesuai keinginan user kemudian klik Create New Job.

---

Template Quantum ESPRESSO yang tersedia
Nama Template Penjelasan
Quantum ESPRESSO 6.7 Template standar QE versi 6.7
Quantum ESPRESSO 6.8 Template standar QE versi 6.8

---

2. Mempersiapkan file input Quantum ESPRESSO

Jcjoboption3.png

  • User dapat melakukan upload, editing, dan rename file input melalui menu Edit Files.
  • Taruh input file pada direktori yang sama dengan file slurm-qe.sh.

---

3A. Melengkapi Submit Script Template

Submit Script adalah set perintah untuk menjalankan program user ke Compute Node melalui manajemen SLURM. User perlu melengkapi script template supaya program Quantum ESPRESSO dapat berjalan melalui menu Open Editor.

  • User dapat memahami script dan mengikuti instruksi melalui penjelasan di deretan comment script template.
  • Panduan lengkap untuk mengisi Submit Script dengan benar pada ALELEON Supercomputer:

SLURM Script ALELEON Supercomputer

---

3B. Menjalankan Quantum ESPRESSO Multi-Node (>128 core thread CPU)

Quantum ESPRESSO menggunakan MPI (Message Passing Interface) sehingga dapat berjalan multi-node atau lebih dari 128 core thread CPU. User dapat mempelajari teknis menjalankan MPI multi-node pada:

MPI ALELEON Supercomputer

---

4. Menjalankan Job

Semua file untuk menjalankan program dan Submit Script sudah siap? Jalankan job dengan menekan tombol Submit.

Perhatikan kolom Status pada job tersebut. User dapat memantau perubahan kolom Status dengan me-refresh halaman Job. Berikut adalah daftar Status yang terjadi:

Status jalannya Job
Status Arti
Not Submitted Job belum pernah dijalankan
Running Job berjalan
Queue Job mengantri dan belum berjalan
Completed Job selesai berjalan
Failed Job berhenti di tengah berjalan.

Bisa karena di Stop atau Delete oleh user.

Apabila user ingin menghentikan job yang sedang berjalan, klik tombol Stop yang berada di sebelah tombol Submit.

---

5. Melihat hasil job yang selesai

Apabila job sudah selesai (status Completed), user dapat melihat hasil output job melalui bagian Folder Contents atau membuka halaman Edit Pages.

---

6. Submit ulang job

User dapat menjalankan ulang job pada ruang job yang sama (misalkan ketika ada error dan mau dijalankan ulang setelah koreksi file input) dengan mengklik kembali tombol Submit.