Quantum ESPRESSO: Perbedaan antara revisi
WilsonLisan (bicara | kontrib) (→Versi yang Tersedia: menghapus kolom partisi) |
WilsonLisan (bicara | kontrib) (mempersingkat penjelasan) |
||
Baris 47: | Baris 47: | ||
--- | --- | ||
===3A. Melengkapi Submit Script Template=== | ===3A. Melengkapi Submit Script Template=== | ||
[[Berkas:Jceditor3.png|al=|nirbing|500x500px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Jceditor3.png]] | |||
* Melalui menu '''Open Editor''', user perlu melengkapi Submit Script supaya program Quantum ESPRESSO dapat berjalan: | |||
** Parameter SBATCH. | |||
** Nama file input Quantum ESPRESSO. | |||
* Panduan umum lengkap dalam mengisi Submit Script khususnya parameter SBATCH: | |||
[[Berkas: | [[Berkas:Wiki-14.jpg|1000x1000px|link=SLURM Script ALELEON Supercomputer |alt=SLURM Script ALELEON Supercomputer ]] | ||
[[Berkas:Jcsaveedit.png|nirbing|450x450px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Jcsaveedit.png|al=]] | [[Berkas:Jcsaveedit.png|nirbing|450x450px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Jcsaveedit.png|al=]] | ||
--- | --- | ||
Baris 70: | Baris 72: | ||
[[Berkas:Jcsubmit2.png|al=|nirbing|600x600px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Jcsubmit2.png]] | [[Berkas:Jcsubmit2.png|al=|nirbing|600x600px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Jcsubmit2.png]] | ||
Perhatikan kolom '''Status''' | * Perhatikan status jalannya job pada kolom '''Status.''' | ||
{| class="wikitable" | {| class="wikitable" | ||
!Status | !Status | ||
!Arti | !Arti | ||
|- | |- | ||
|Not Submitted | |Not Submitted | ||
|Job belum pernah dijalankan | |Job belum pernah dijalankan. | ||
|- | |- | ||
|Running | |Running | ||
|Job berjalan | |Job berjalan. | ||
|- | |- | ||
|Queue | |Queue | ||
|Job mengantri dan belum berjalan | |Job mengantri dan belum berjalan. | ||
|- | |- | ||
|Completed | |Completed | ||
|Job selesai berjalan | |Job selesai berjalan. | ||
|- | |- | ||
|Failed | |Failed | ||
|Job berhenti di tengah | |Job berhenti di tengah jalan, | ||
Bisa karena di Stop atau Delete oleh user. | Bisa karena di Stop atau Delete oleh user. | ||
|}Apabila user ingin menghentikan job yang sedang berjalan, klik tombol '''Stop''' yang berada di sebelah tombol Submit. | |} | ||
* User dapat memantau perubahan kolom Status dengan me-refresh halaman Job. | |||
* Apabila user ingin menghentikan job yang sedang berjalan, klik tombol '''Stop''' yang berada di sebelah tombol Submit. | |||
--- | --- | ||
Baris 101: | Baris 106: | ||
--- | --- | ||
===6. Submit ulang job=== | ===6. Submit ulang job=== | ||
User dapat '''menjalankan ulang | User dapat '''menjalankan ulang ruang job yang sama''' (misalkan ketika ada koreksi file input atau Submit Script) dengan mengklik kembali tombol Submit. |
Revisi per 21 Februari 2022 04.08
Software Quantum ESPRESSO
Quantum ESPRESSO adalah framework suite untuk kalkulasi electronic-structure dan modeling material berdasarkan density-functional theory, plane waves, dan pseudopotentials.
Versi yang Tersedia
Versi | Dukungan MPI | Dukungan Hardware |
---|---|---|
6.7 | Pure MPI | CPU, multi-node |
6.8 | Pure MPI | CPU, multi-node |
Menjalankan Quantum ESPRESSO
User menjalankan Quantum ESPRESSO pada Job Composer EFIRO yang dapat dibuka melalui menu Jobs > Jobs Composer
1. Memilih template Quantum ESPRESSO
- Klik New Jobs > From Template.
- Pilih template Quantum ESPRESSO yang dibutuhkan.
- isi Job Name sesuai keinginan user kemudian klik Create New Job.
---
Nama Template | Penjelasan |
---|---|
Quantum ESPRESSO 6.7 | Template standar QE versi 6.7 |
Quantum ESPRESSO 6.8 | Template standar QE versi 6.8 |
---
2. Mempersiapkan file input Quantum ESPRESSO
- User dapat melakukan upload, editing, dan rename file input melalui menu Edit Files.
- Taruh input file pada direktori yang sama dengan file slurm-qe.sh.
---
3A. Melengkapi Submit Script Template
- Melalui menu Open Editor, user perlu melengkapi Submit Script supaya program Quantum ESPRESSO dapat berjalan:
- Parameter SBATCH.
- Nama file input Quantum ESPRESSO.
- Panduan umum lengkap dalam mengisi Submit Script khususnya parameter SBATCH:
---
3B. Menjalankan Quantum ESPRESSO Multi-Node (>128 core thread CPU)
Quantum ESPRESSO menggunakan MPI (Message Passing Interface) sehingga dapat berjalan multi-node atau lebih dari 128 core thread CPU. User dapat mempelajari teknis menjalankan MPI multi-node pada:
MPI ALELEON Supercomputer |
---|
---
4. Menjalankan Job
Semua file untuk menjalankan program dan Submit Script sudah siap? Jalankan job dengan menekan tombol Submit.
- Perhatikan status jalannya job pada kolom Status.
Status | Arti |
---|---|
Not Submitted | Job belum pernah dijalankan. |
Running | Job berjalan. |
Queue | Job mengantri dan belum berjalan. |
Completed | Job selesai berjalan. |
Failed | Job berhenti di tengah jalan,
Bisa karena di Stop atau Delete oleh user. |
- User dapat memantau perubahan kolom Status dengan me-refresh halaman Job.
- Apabila user ingin menghentikan job yang sedang berjalan, klik tombol Stop yang berada di sebelah tombol Submit.
---
5. Melihat hasil job yang selesai
Apabila job sudah selesai (status Completed), user dapat melihat hasil output job melalui bagian Folder Contents atau membuka halaman Edit Pages.
---
6. Submit ulang job
User dapat menjalankan ulang ruang job yang sama (misalkan ketika ada koreksi file input atau Submit Script) dengan mengklik kembali tombol Submit.