Quantum ESPRESSO: Perbedaan antara revisi
Dari ALELEON by EFISON
WilsonLisan (bicara | kontrib) (→3B. MPI pada Quantum ESPRESSO: penjelasan MPI yang lebih singkat) |
WilsonLisan (bicara | kontrib) (mengubah separator dan penomoran step) |
||
| Baris 24: | Baris 24: | ||
--- | --- | ||
=== 1. Memilih template Quantum ESPRESSO=== | === 1. Memilih template Quantum ESPRESSO=== | ||
| Baris 47: | Baris 46: | ||
|} | |} | ||
--- | --- | ||
===2. Mempersiapkan file input Quantum ESPRESSO=== | ===2. Mempersiapkan file input Quantum ESPRESSO=== | ||
[[Berkas:Jcjoboption3.png|nirbing|600x600px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Jcjoboption3.png]] | [[Berkas:Jcjoboption3.png|nirbing|600x600px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Jcjoboption3.png]] | ||
| Baris 54: | Baris 51: | ||
*Taruh input file pada direktori yang sama dengan file '''slurm-qe.sh.''' | *Taruh input file pada direktori yang sama dengan file '''slurm-qe.sh.''' | ||
--- | --- | ||
===3. Melengkapi Submit Script Template=== | |||
=== | |||
[[Berkas:Jceditor3.png|al=|nirbing|500x500px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Jceditor3.png]] | [[Berkas:Jceditor3.png|al=|nirbing|500x500px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Jceditor3.png]] | ||
| Baris 69: | Baris 64: | ||
--- | --- | ||
=== | ===4. MPI pada Quantum ESPRESSO=== | ||
Quantum ESPRESSO menggunakan MPI (Message Passing Interface) sehingga memberi kebebasan user untuk: | Quantum ESPRESSO menggunakan MPI (Message Passing Interface) sehingga memberi kebebasan user untuk: | ||
{| class="wikitable" | {| class="wikitable" | ||
| Baris 80: | Baris 75: | ||
|} | |} | ||
--- | --- | ||
===5. Menjalankan Job=== | |||
=== | |||
Semua file untuk menjalankan program dan Submit Script sudah siap? Jalankan job dengan menekan tombol '''Submit'''. | Semua file untuk menjalankan program dan Submit Script sudah siap? Jalankan job dengan menekan tombol '''Submit'''. | ||
| Baris 113: | Baris 106: | ||
* Apabila user ingin menghentikan job yang sedang berjalan, klik tombol '''Stop''' yang berada di sebelah tombol Submit. | * Apabila user ingin menghentikan job yang sedang berjalan, klik tombol '''Stop''' yang berada di sebelah tombol Submit. | ||
--- | --- | ||
===6. Melihat hasil job yang selesai=== | |||
=== | |||
Apabila job sudah selesai (status Completed), user dapat melihat hasil output job melalui bagian '''Folder Contents''' atau membuka halaman '''Edit Pages.''' | Apabila job sudah selesai (status Completed), user dapat melihat hasil output job melalui bagian '''Folder Contents''' atau membuka halaman '''Edit Pages.''' | ||
| Baris 121: | Baris 112: | ||
--- | --- | ||
===7. Submit ulang job=== | |||
=== | |||
User dapat '''menjalankan ulang ruang job yang sama''' (misalkan ketika ada koreksi file input atau Submit Script) dengan mengklik kembali tombol Submit. | User dapat '''menjalankan ulang ruang job yang sama''' (misalkan ketika ada koreksi file input atau Submit Script) dengan mengklik kembali tombol Submit. | ||
Revisi per 21 Februari 2022 11.06
Quantum ESPRESSO adalah framework suite untuk kalkulasi electronic-structure dan modeling material berdasarkan density-functional theory, plane waves, dan pseudopotentials.
Versi yang Tersedia
| Versi | Dukungan MPI | Dukungan Hardware |
|---|---|---|
| 6.7 | Pure MPI | CPU, multi-node |
| 6.8 | Pure MPI | CPU, multi-node |
Menjalankan Quantum ESPRESSO
User menjalankan Quantum ESPRESSO pada Job Composer EFIRO yang dapat dibuka melalui menu Jobs > Jobs Composer
---
1. Memilih template Quantum ESPRESSO
- Klik New Jobs > From Template.
- Pilih template Quantum ESPRESSO yang dibutuhkan.
- isi Job Name sesuai keinginan user kemudian klik Create New Job.
---
| Nama Template | Penjelasan |
|---|---|
| Quantum ESPRESSO 6.7 | Template standar QE versi 6.7 |
| Quantum ESPRESSO 6.8 | Template standar QE versi 6.8 |
---
2. Mempersiapkan file input Quantum ESPRESSO
- User dapat melakukan upload, editing, dan rename file input Quantum ESPRESSO melalui menu Edit Files.
- Taruh input file pada direktori yang sama dengan file slurm-qe.sh.
---
3. Melengkapi Submit Script Template
- Melalui menu Open Editor, user perlu melengkapi Submit Script supaya program Quantum ESPRESSO dapat berjalan:
- Parameter SBATCH.
- Nama file input Quantum ESPRESSO.
- Panduan umum lengkap dalam mengisi Submit Script dan parameter SBATCH:
---
4. MPI pada Quantum ESPRESSO
Quantum ESPRESSO menggunakan MPI (Message Passing Interface) sehingga memberi kebebasan user untuk:
| MPI ALELEON Supercomputer |
|---|
|
---
5. Menjalankan Job
Semua file untuk menjalankan program dan Submit Script sudah siap? Jalankan job dengan menekan tombol Submit.
- Perhatikan status jalannya job pada kolom Status.
| Status | Arti |
|---|---|
| Not Submitted | Job belum pernah dijalankan. |
| Running | Job berjalan. |
| Queue | Job mengantri dan belum berjalan. |
| Completed | Job selesai berjalan. |
| Failed | Job berhenti di tengah jalan,
Bisa karena di Stop atau Delete oleh user. |
- User dapat memantau perubahan kolom Status dengan me-refresh halaman Job.
- Apabila user ingin menghentikan job yang sedang berjalan, klik tombol Stop yang berada di sebelah tombol Submit.
---
6. Melihat hasil job yang selesai
Apabila job sudah selesai (status Completed), user dapat melihat hasil output job melalui bagian Folder Contents atau membuka halaman Edit Pages.
---
7. Submit ulang job
User dapat menjalankan ulang ruang job yang sama (misalkan ketika ada koreksi file input atau Submit Script) dengan mengklik kembali tombol Submit.
