Spesifikasi ALELEON Supercomputer: Perbedaan antara revisi

Dari ALELEON by EFISON
(→‎Spesifikasi Sistem Operasi: mengubah judul spek OS ke spek software)
(→‎Spesifikasi Software Sistem: update menyesuaikan maintenance 120124)
 
(16 revisi perantara oleh pengguna yang sama tidak ditampilkan)
Baris 1: Baris 1:
32GB8ALELEON Supercomputer saat ini menggunakan '''HPC ALELEON Mk.III''' - superkomputer ''custom'' EFISON generasi ketiga '''yang akan beroperasi pada November 2022''' untuk menjalankan arsitektur EFIRO.
ALELEON Supercomputer saat ini menggunakan '''HPC ALELEON Mk.III''' - superkomputer ''custom'' EFISON generasi ketiga menyesuaikan arsitektur EFIRO.


== '''Spesifikasi Hardware''' ==
== '''Spesifikasi Compute Node''' ==
Terdapat 3 jenis node:
Compute Node menjalankan komputasi user via job submission SLURM (sbatch terminal atau Job Composer EFIRO).
 
* '''Login Node:''' tempat user login ke ALELEON Supercomputer. Tidak untuk menjalankan komputasi berat
* '''Compute Node:''' Node untuk menjalankan job komputasi user via SLURM dari Login Node.
* '''Interactive Node:''' Node untuk menjalankan sesi interaktif via EFIRO seperti ALELEON Desktop atau Jupyter Lab.
 
=== Spesifikasi Login Node Utama ''(Coming Soon)'' ===
{| class="wikitable"
{| class="wikitable"
|Nodes
! colspan="2" |Spesifikasi Compute Node CPU
|1
|-
|Prosesor
|AMD EPYC 7313P, 16 v-core, 3.0Ghz
|-
|RAM
|64GB
|-
|Interkoneksi
|Mellanox RoCE 25Gbps
|}


=== Spesifikasi Login Node GPU dan backup ===
=== Partisi epyc ===
{| class="wikitable"
|Nodes
|1
|-
|Prosesor
|AMD Ryzen 3300X, 4 core / 8 thread, 4.3Ghz
|-
|RAM
|64GB
|-
|GPU
|NVIDIA T400 4GB
|-
|-
|Interkoneksi
|Mellanox RoCE 25Gbps
|}
=== Spesifikasi Compute Node CPU (Partisi epyc) ===
{| class="wikitable"
|Nodes
|Nodes
|3:
|3


* epyc01 -> high memory
* epyc001 -> high memory
* epyc[02-03] -> normal
* epyc[002-003] -> normal
|-
|-
|Prosesor per node
|CPU per node
|1x AMD EPYC 7702P, 64 core / 128 thread, 2.0Ghz  
|1x AMD EPYC 7702P, 64 core / 128 thread, 2.0Ghz  
|-
|-
|RAM per node
|RAM per node
|
|
* high memory -> 512GB
* high memory -> 500GB efektif
* normal -> 256GB
* normal -> 240GB efektif
|-
|-
|Interkoneksi
|Interkoneksi
|Mellanox RoCE 100Gbps
|Mellanox RoCE 100Gbps
|}
|-
! colspan="2" |Spesifikasi Compute Node GPU


=== Spesifikasi Compute Node GPU (Partisi gpu_ampere) ===
=== Partisi ampere ===
{| class="wikitable"
|-
|Nodes
|Nodes
|1
|1
|-
|-
|Prosesor
|CPU
|AMD Threadripper 3955WX, 16 core / 32 thread, 3.9Ghz  
|1x AMD Threadripper 3955WX, 16 core / 32 thread, 3.9Ghz
|-
|-
|RAM
|RAM
Baris 73: Baris 39:
|-
|-
|GPU
|GPU
|3x NVIDIA RTX 3090 24GB
|2x NVIDIA RTX 3090 24GB NVLink
|-
|-
|Interkoneksi
|Interkoneksi
|Mellanox RoCE 100Gbps
|Mellanox RoCE 25Gbps
|}
|}


=== Spesifikasi Interactive Node CPU (Partisi torti) ===
== '''Spesifikasi Interactive Node''' ==
Interactive Node menjalankan sesi interaktif pada web service EFIRO seperti Jupyter dan ALELEON Virtual Desktop.
{| class="wikitable"
{| class="wikitable"
! colspan="2" |Spesifikasi Interactive Node CPU
=== Partisi torti ===
|-
|Nodes
|Nodes
|8
|2
|-
|-
|Prosesor per node
|CPU per node
|AMD Threadripper 3990X, 16 v-core, 2.9Ghz
|AMD Threadripper 3990X, 32 v-core, 2.9Ghz
|-
|-
|RAM per node
|RAM per node
|32GB
|64GB
|-
|-
|Interkoneksi
! colspan="2" |Spesifikasi Interactive Node GPU
|Ethernet 10GbE
|}


=== Spesifikasi Interactive Node GPU (Partisi tilla) ===
=== Partisi tilla ===
{| class="wikitable"
|-
|Nodes
|Nodes
|1
|2
|-
|-
|Prosesor
|CPU per node
|AMD Ryzen 5600X, 6 core / 12 thread, 3.7Ghz
|AMD Threadripper 3990X, 32 v-core, 2.9Ghz
|-
|-
|RAM
|RAM per node
|64GB
|64GB
|-
|-
|GPU
|GPU per node
|1x NVIDIA RTX 3090 24GB
|1x NVIDIA RTX 3090 24GB
|-
|Interkoneksi
|Ethernet 10GbE
|}
|}


=== Spesifikasi Storage ===
== '''Spesifikasi Storage''' ==
Sistem melakukan checkpoint snapshot storage per 24 jam.
 
* '''User dapat melayangkan permintaan ke email support untuk recovery data apabila tidak sengaja menghapus data.'''
 
{| class="wikitable"
{| class="wikitable"
|Filesystem
! colspan="2" |Spesifikasi Stoarge Node
|NFS
|-
|-
|HOME and work
|Jenis storage
|20TB
|Block-storage, protokol NFS
+ ''64TB (coming soon)''
|-
|HOME and workdir
|HDD SAS 83TiB efektif
|-
|-
|SCRATCH caching
|SCRATCH caching
|1TB NVMe 4.0
|SSD 1TB NVMe 4.0
|-
|-
|Interkoneksi
|Interkoneksi
Baris 129: Baris 100:
{{DISPLAYTITLE:Spesifikasi ALELEON Supercomputer}}
{{DISPLAYTITLE:Spesifikasi ALELEON Supercomputer}}
__TOC__
__TOC__
== '''Spesifikasi Software''' ==
 
== '''Spesifikasi Software Sistem''' ==


* '''Sistem Operasi'''
* '''Sistem Operasi'''
** Linux CentOS 7.9 dengan kernel 5.4.100-1el7.elrepo.x86_64
** Rocky Linux 8 (Red-hat based) dengan kernel 5.4.266-1.el8.elrepo.x86_64
** ''Rocky Linux 8.5 (coming soon)''
* '''Autentikasi Login'''
* '''Autentikasi Login'''
** OpenVPN dan PAM
** OpenVPN dan PAM
* '''GCC default OS'''
*'''Manajemen Job (job scheduler)'''
** GNU RHEL 10.2.0
** SLURM 23.11.1-1 dengan protokol PMIX, UCX, CUDA, dan auto load-balancing menyesuaikan spesifikasi ALELEON Supercomputer.
* '''Manajemen Job'''  
*'''[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Menggunakan_ALELEON_Supercomputer_via_EFIRO EFIRO Web Service] untuk login web dengan tampilan grafis (GUI)'''
** SLURM 20.11.5 dengan protokol PMIX, UCX, CUDA, dan auto load-balancing menyesuaikan arsitektur AMD Zen2.
**Berbasiskan '''Open OnDemand 3.0''' dengan modifikasi oleh tim engineering EFISON menyesuaikan arsitektur dan fitur ALELEON Supercomputer
* '''Modul instalasi dan software untuk user'''
***''MIT License, maintained by Ohio Supercomputing Center (OSC), a member of the Ohio Technology Consortium, the technology and information division of the Ohio Department of High Education.''
** EasyBuild 4.4.2
* '''Manajemen modul software (Module Environment)'''
** Lmod 8.1.18
** Lmod 8.7.32
* '''Profiler'''
*'''Manajemen instalasi software (Package Manager)'''
** AMD μProf
**EasyBuild 4.8.0
* '''Katalog lengkap software compilers, libs, framework:'''  
**Anaconda
** '''[[Katalog Software ALELEON Supercomputer]]'''
**Spack 0.19.1
__PAKSADAFTARISI__
*'''Manajemen compiling otomatis'''
**GNU Make 4.2.1
**CMake 3.26.3
* '''Manajemen container'''
** Singularity 3.10
* '''Profiler sistem'''
** CPU -> AMD μProf
* '''Library I/O sistem'''
** HDF5 1.14.1
** NetCDF 4.9.2
* '''Katalog lengkap software compiler, library, dan framework untuk penggunaan global'''  
** Lihat laman '''[[Katalog Software ALELEON Supercomputer]]'''
__TANPADAFTARISI__

Revisi terkini sejak 18 Januari 2024 06.40

ALELEON Supercomputer saat ini menggunakan HPC ALELEON Mk.III - superkomputer custom EFISON generasi ketiga menyesuaikan arsitektur EFIRO.

Spesifikasi Compute Node

Compute Node menjalankan komputasi user via job submission SLURM (sbatch terminal atau Job Composer EFIRO).

Spesifikasi Compute Node CPU

Partisi epyc

Nodes 3
  • epyc001 -> high memory
  • epyc[002-003] -> normal
CPU per node 1x AMD EPYC 7702P, 64 core / 128 thread, 2.0Ghz
RAM per node
  • high memory -> 500GB efektif
  • normal -> 240GB efektif
Interkoneksi Mellanox RoCE 100Gbps
Spesifikasi Compute Node GPU

Partisi ampere

Nodes 1
CPU 1x AMD Threadripper 3955WX, 16 core / 32 thread, 3.9Ghz
RAM 128GB
GPU 2x NVIDIA RTX 3090 24GB NVLink
Interkoneksi Mellanox RoCE 25Gbps

Spesifikasi Interactive Node

Interactive Node menjalankan sesi interaktif pada web service EFIRO seperti Jupyter dan ALELEON Virtual Desktop.

Spesifikasi Interactive Node CPU

Partisi torti

Nodes 2
CPU per node AMD Threadripper 3990X, 32 v-core, 2.9Ghz
RAM per node 64GB
Spesifikasi Interactive Node GPU

Partisi tilla

Nodes 2
CPU per node AMD Threadripper 3990X, 32 v-core, 2.9Ghz
RAM per node 64GB
GPU per node 1x NVIDIA RTX 3090 24GB

Spesifikasi Storage

Sistem melakukan checkpoint snapshot storage per 24 jam.

  • User dapat melayangkan permintaan ke email support untuk recovery data apabila tidak sengaja menghapus data.
Spesifikasi Stoarge Node
Jenis storage Block-storage, protokol NFS
HOME and workdir HDD SAS 83TiB efektif
SCRATCH caching SSD 1TB NVMe 4.0
Interkoneksi Mellanox RoCE 100Gbps

Spesifikasi Software Sistem

  • Sistem Operasi
    • Rocky Linux 8 (Red-hat based) dengan kernel 5.4.266-1.el8.elrepo.x86_64
  • Autentikasi Login
    • OpenVPN dan PAM
  • Manajemen Job (job scheduler)
    • SLURM 23.11.1-1 dengan protokol PMIX, UCX, CUDA, dan auto load-balancing menyesuaikan spesifikasi ALELEON Supercomputer.
  • EFIRO Web Service untuk login web dengan tampilan grafis (GUI)
    • Berbasiskan Open OnDemand 3.0 dengan modifikasi oleh tim engineering EFISON menyesuaikan arsitektur dan fitur ALELEON Supercomputer
      • MIT License, maintained by Ohio Supercomputing Center (OSC), a member of the Ohio Technology Consortium, the technology and information division of the Ohio Department of High Education.
  • Manajemen modul software (Module Environment)
    • Lmod 8.7.32
  • Manajemen instalasi software (Package Manager)
    • EasyBuild 4.8.0
    • Anaconda
    • Spack 0.19.1
  • Manajemen compiling otomatis
    • GNU Make 4.2.1
    • CMake 3.26.3
  • Manajemen container
    • Singularity 3.10
  • Profiler sistem
    • CPU -> AMD μProf
  • Library I/O sistem
    • HDF5 1.14.1
    • NetCDF 4.9.2
  • Katalog lengkap software compiler, library, dan framework untuk penggunaan global
Diperoleh dari "https://wiki.efisonlt.com/index.php?title=Spesifikasi_ALELEON_Supercomputer&oldid=1384"