Tutorial Menggunakan ALELEON Supercomputer

Dari ALELEON by EFISON

Revisi sejak 5 Maret 2022 05.27 oleh WilsonLisan (bicara | kontrib) (meletakkan informasi kredit core hour sebelum job composer)

User menggunakan ALELEON Supercomputer melalui EFIRO OnDemand atau disingkat EFIRO - konsol tampilan grafis (GUI) untuk mengakses ALELEON Supercomputer melalui web browser.

1. Koneksi VPN dan Login EFIRO

  • Setelah terhubung ke VPN, user mengakses EFIRO melalui alamat berikut, diikuti dengan memasukkan username dan password akun user.
http://efisonlt.ood

2. Dashboard EFIRO

Setelah login, user masuk ke dalam dashboard EFIRO yang menjadi central hub untuk menggunakan ALELEON Supercomputer.

PENJELASAN MENU DI DASHBOARD EFIRO

Jobs > Job Composer

  • Halaman untuk membuat dan menjalankan komputasi di Compute Node ALELEON Supercomputer.
  • Job Composer berisikan serangkaian template, formulir, dan script untuk menjalankan software komputasi.
  • User dapat melihat semua job yang pernah dijalankan beserta hasilnya pada halaman Job Composer ini.
Halaman Job Composer

Jobs > Active Jobs

  • Menampilkan status dan antrian job komputasi semua user yang sedang berjalan.
Halaman Active Jobs

Interactive Apps

  • Menampilkan daftar software yang bisa diakses secara interaktif (langsung) oleh user.

My Interactive Sessions

  • Menampilkan daftar sesi interaktif user yang sedang aktif dan sudah selesai.

Clusters > Aleleon Shell Access

  • Halaman terminal Linux (shell) ALELEON Supercomputer.
  • Untuk kegiatan yang membutuhkan terminal seperti compiling, membuat environment (user Python, R, GROMACS), dll.
Terminal ALELEON Supercomputer

Files > Home Directory

  • Menampilkan isi direktori HOME user.
  • User dapat melakukan manajemen file seperti upload, download, copy, rename, delete, dll.
Halaman Home Directory dan menu manajemen file

3. Menggunakan ALELEON Supercomputer

Terdapat dua metode untuk menjalankan software komputasi di ALELEON Supercomputer:

  • Job Composer
  • Interactive Apps

3A. Kredit Core Hour dan sausage

User memerlukan kredit Core Hour untuk menggunakan Job Composer dan Interactive Apps di mana adalah kuota Core Hour untuk menggunakan CPU dan GPU di ALELEON Supercomputer.

  • Kuota pada kredit Core Hour akan berkurang sesuai dengan resources CPU / GPU yang dialokasikan user saat menjalankan job di Job Composer atau menggunakan interactive apps.

User dapat mengecek kuota pada kredit Core Hour dengan menjalankan perintah sausage:

  • Buka ALELEON Shell Access melalui dashboard EFIRO Clusters > ALELEON Shell Access.

Shellaccess.png

  • Jalankan perintah "sausage".
Perintah sausage memperlihatkan penggunaan kredit CCH dan GH user

3B. Job Composer

Halaman Job Composer. Diakses melalui menu Jobs > Job Composer di dashboard EFIRO.
  • Cara utama menjalankan komputasi di ALELEON Supercomputer. Bekerja dengan model job submission: software komputasi dijalankan oleh sistem berdasarkan serangkaian template, formulir, dan script yang didefinisikan user.
  • Job Composer menjalankan software pada Compute Node - bagian server utama dan terkencang.
  • Silahkan temukan tutorial software yang digunakan user:
TUTORIAL MENJALANKAN SOFTWARE KOMPUTASI DI JOB COMPOSER

R R.png

via Job Composer

GROMACS GROMACS.png

NWChem Nwhem.png

Quantum ESPRESSO Quantum ogo ok.png

GAMESS GAMESS.png

NAMD NAMDsof.png

ORCA Orca logo.png

TensorFlow TF.png

via Job Composer

PHASE/0 Phase-logo4.png

COMCOT


3C. Interactive Apps

Contoh salah satu interactive apps: Jupyter Notebook, diakses melalui menu Interactive Apps di dashboard EFIRO.
  • Aplikasi yang dapat dijalankan secara interaktif (langsung) oleh user.
  • Semua software Interactive Apps berjalan pada Interactive Node - bagian server untuk menjalankan semua interactive apps
  • Interactive Node mempunyai spesifikasi hardware terbatas sehingga lebih cocok digunakan untuk komputasi skala kecil atau pengujian jalannya software / script. Gunakan Job Composer untuk melakukan komputasi skala besar.
DAFTAR INTERACTIVE APPS DAN TUTORIAL PENGGUNAAN

Jupyter Notebook Jupyter logo icon.png

(coming soon)

Aleleon Desktop

(coming soon)

TensorFlow TF.png

via Jupyter Notebook. (coming soon)

R R.png

via Jupyter Notebook. (coming soon)