Menggunakan ALELEON Supercomputer via EFIRO: Perbedaan antara revisi

Revisi per 19 Oktober 2023 10.54

Halaman ini menjelaskan tutorial EFIRO: layanan web service untuk menggunakan ALELEON Supercomputer.

1 | Login Web EFIRO

Sebelum login, user harus terhubung ke jaringan VPN ALELEON Supercomputer. Apabila sudah terhubung ke VPN ALELEON, lakukan tahap berikut:

Buka alamat web http://aleleon.ood kemudian masukkan username dan password user.
- Bagi user Linux, buka alamat http://10.192.50.11

2 | Halaman Dashboard EFIRO

Setelah login, user masuk ke halaman dashboard EFIRO yang berada di Login Node. Berikut adalah daftar menu beserta penjelasannya:

Daftar Menu Dashboard EFIRO
`Files > Home Directory` Menampilkan isi direktori HOME user. User dapat melakukan manajemen file seperti upload, download, copy, rename, delete, dll. Halaman Home Directory dan menu manajemen file
`Jobs > Job Composer` Halaman untuk menjalankan komputasi di Compute Node ALELEON Supercomputer. Lihat subbab Menjalankan Komputasi ke Compute Node via Job Composer. Halaman Job Composer
`Jobs > Active Jobs` Menampilkan status dan antrian job komputasi semua user yang sedang berjalan. Halaman Active Jobs. Terdapat dua opsi yaitu `All Jobs`* untuk melihat antrian semua job dan `Your jobs` untuk melihat status job user saja.*
`Interactive Apps` Menampilkan daftar sesi interaktif untuk menjalankan komputasi seperti sesi Jupyter atau virtual desktop. `My Interactive Sessions` Menampilkan daftar sesi interaktif user yang sedang aktif dan sudah selesai.
`Clusters > Aleleon Shell Access` Halaman terminal Linux (shell) ALELEON Supercomputer. Untuk kegiatan yang membutuhkan terminal. Terminal ALELEON Supercomputer

3 | Menjalankan Komputasi ke Compute Node via Job Composer

User menjalankan job komputasi ke Compute Node melalui halaman Job Composer dimana memvisualisasikan penggunaan program manajemen atau scheduler SLURM.

Tutorial Spesifik per Software Komputasi

User dapat melihat tutorial menjalankan komputasi masing-masing software komputasi di laman Daftar Software Komputasi dan Tutorial Penggunaan:

Tutorial Umum

Berikut adalah tutorial umum menggunakan halaman Job Composer (klik Expand atau Kembangkan):

Langkah Umum Menggunakan Job Composer

1

Buka menu dashboard EFIRO Jobs > Jobs Composer

2

Pilih New Jobs > From Template

3

Pilih template software komputasi yang diinginkan. Isi atau ganti Job Name sesuai keinginan user, kemudian klik Create New Job.

4

Gunakan menu Edit Files untuk upload file yang dibutuhkan.

Laman Edit Files juga dapat melakukan view / download / edit / rename / delete file.
Fitur upload pada laman Edit Files mempunyai batasan ukuran upload 2GB per file.
- Gunakan aplikasi FTP apabila user hendak mengupload file tunggal diatas 2GB.

5

Melalui Open Editor, lengkapi Submit Script dengan mengganti bagian yang di tandai 4 garis miring (////).

Submit Script adalah 'formulir' untuk menjalankan job komputasi user.

Jangan lupa klik Save setiap sekali mengubah script.
Template ini bersifat referensi, user dapat mengubah bagian yang sekiranya perlu diubah.
Info Submit Script lebih detail lihat laman Submit Script ALELEON Supercomputer

6

Jalankan job dengan klik tombol Submit.

Berikut penjelasan kolom Status, pantau dengan refresh halaman job:

Status	Arti
Not Submitted	Job belum pernah dijalankan.
Running	Job berjalan.
Queue	Job mengantri dan belum berjalan. Untuk melihat detail status antrian: Buka `Jobs > Active Jobs` pada dashboard EFIRO. Ubah opsi ke `Your Jobs` sesuai gambar dibawah ini. Klik simbol > untuk melihat detail job submission. Lihat isi kolom Reason. Arti Reason lihat laman Daftar Reason NODELIST ALELEON Supercomputer. Halaman Active Jobs. Ubah opsi `Your jobs`* untuk melihat status job user saja. Klik simbol > untuk melihat detail job submission.*
Completed	Job selesai berjalan.
Failed	Job berhenti di tengah jalan, bisa karena di Stop atau Delete oleh user.

Apabila ingin menghentikan job yang tengah berjalan, klik tombol Stop.

7A

Hasil output job dapat dilihat pada kolom Folder Contents atau membuka halaman Edit Files.

User dapat melihat semua file output yang keluar di kolom Folder Contents.

atau dengan membuka menu Edit Files.

7B User dapat menjalankan ulang ruang job yang sama dengan mengklik kembali tombol Submit.

4A | Sesi Interaktif ALELEON Desktop

ALELEON Desktop adalah sesi interaktif virtual desktop yang berjalan di Interactive Node AELEON Supercomputer. Berikut adalalah langkah memulai sesi ALELEON Desktop (klik Expand atau Kembangkan):

Langkah Menjalankan Sesi Interaktif ALELEON Desktop
1	Buka menu dashboard EFIRO `Interactive Apps` > `ALELEON Desktop`
2	User mengisi formulir untuk memulai sesi ALELEON Desktop: Partition pilih salah satu sesuai keinginan user: `Torti`: sistem CPU `Tilla`: sistem GPU dengan RTX 3090 Number of CPU Cores Alokasi jumlah core CPU yang akan digunakan, isi sesuai keinginan user Minimal: 1 Maksimal: 32 Number of GPUs Kosongkan apabila memilih Partition Torti Isi 1 apabila memilih Partition Tilla Number of hours Durasi sesi ALELEON Desktop dalam satuan jam, isi sesuai keinginan user Minimal: 1 Maksimal: 72 Apabila sudah selesai, klik `Launch`. User akan diarahkan ke halaman `My Interactive Sessions`. Tunggu hingga sesi ALELEON Desktop user siap diakses.
3A	Apabila status sudah menunjukkan Running, klik `Launch Aleleon Desktop`. Perlu diperhatikan bahwa sistem mulai menghitung Kredit Core Hour saat status ALELEON Desktop menunjukkan Running. User dapat mengatur kualitas gambar ALELEON Desktop melalui slider `Compression` dan `Image Quality`. ALELEON Desktop menunjukkan status Running. Menghentikan Sesi ALELEON Desktop User dapat menghentikan sesi ALELEON Desktop yang sedang berjalan dengan klik tombol `Delete`.
3B	User dapat kembali mengunjungi halaman sesi `My Interactive Sessions` melalui menu di dasboard EFIRO.

4B | Sesi Interaktif Jupyter (Notebook dan Lab)

EFIRO menyediakan sesi interaktif Jupyter yang merupakan platform IDE berbasis web untuk Python dan bahasa pemrograman lainnya. Tersedia Jupyter versi Notebook dan Lab.

ALELEON Supercomputer menyediakan tutorial spesifik mengakses sesi interaktif Jupyter untuk komputasi:

Python
R

5 | Support dan Laporan Kendala Penggunaan

Apabila terdapat masalah teknis dalam menggunakan ALELEON Supercomputer, silahkan lapor dengan klik gambar berikut ini.

@@ Baris 1: / Baris 1: @@
-Halaman ini menjelaskan tutorial EFIRO: layanan web service berbasis '''grafis (GUI)''' untuk menggunakan ALELEON Supercomputer.
+Halaman ini menjelaskan tutorial EFIRO: layanan web service untuk menggunakan ALELEON Supercomputer.
 == '''1  | Login Web EFIRO''' ==
-Sebelum login, [[Koneksi VPN ALELEON Supercomputer|'''user harus terhubung ke jaringan VPN ALELEON Supercomputer''']] untuk dapat melakukan login ke ALELEON Supercomputer.
+Sebelum login, [[Koneksi VPN ALELEON Supercomputer|'''user harus terhubung ke jaringan VPN ALELEON Supercomputer''']]. Apabila sudah terhubung ke VPN ALELEON, lakukan tahap berikut:
-Apabila sudah terhubung ke VPN ALELEON, lakukan tahap berikut:
 * Buka alamat web '''<code>http://aleleon.ood</code>''' kemudian masukkan username dan password user.
@@ Baris 10: / Baris 8: @@
 == '''2 | Halaman Dashboard EFIRO''' ==
-Setelah login, user masuk ke halaman dashboard EFIRO yang berada di '''Login Node'''. Berikut adalah daftar menu beserta penjelasannya ''(klik Expand atau Kembangkan)'':
+[[Berkas:Efiromenubarbig3.png|1085x1085px]]
-{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
-!
+Setelah login, user masuk ke halaman dashboard EFIRO yang berada di '''Login Node'''. Berikut adalah daftar menu beserta penjelasannya:
-=== Daftar Menu Dashboard EFIRO ===
+{| class="wikitable"
+!Daftar Menu Dashboard EFIRO
 |-
-|[[Berkas:Efiromenubarbig3.png|1085x1085px]]
+|'''<code>Files > Home Directory</code>'''
-'''Files > Home Directory'''
 *Menampilkan isi direktori HOME user.
 *User dapat melakukan manajemen file seperti upload, download, copy, rename, delete, dll.
 [[Berkas:Efiroftp3.png|al=|jmpl|''Halaman Home Directory dan menu manajemen file''|kiri]]
 |-
-|'''Jobs > Job Composer'''
+|'''<code>Jobs > Job Composer</code>'''
-*Halaman untuk membuat sesi job submission dan menjalankan komputasi di Compute Node ALELEON Supercomputer.
+*Halaman untuk menjalankan komputasi di Compute Node ALELEON Supercomputer.
-*Job Composer berisikan serangkaian template, formulir, dan script untuk menjalankan software komputasi.
+*Lihat subbab [https://wiki.efisonlt.com/wiki/Menggunakan_ALELEON_Supercomputer_via_EFIRO#3_|_Menjalankan_Komputasi_ke_Compute_Node_via_Job_Composer '''Menjalankan Komputasi ke Compute Node via Job Composer'''].
-*User dapat melihat semua job yang pernah dijalankan beserta hasilnya pada halaman Job Composer ini.
 [[Berkas:Efirojobcomposer3.png|al=|jmpl|''Halaman Job Composer''|kiri]]
 |-
-|'''Jobs > Active Jobs'''
+|'''<code>Jobs > Active Jobs</code>'''
 *Menampilkan status dan antrian job komputasi semua user yang sedang berjalan.
-*Terdapat dua opsi yaitu '''<code>All Jobs</code>''' untuk melihat antrian semua job dan '''<code>Your jobs</code>''' untuk melihat status job user saja.
+[[Berkas:Efiroqueueedit.png|al=|jmpl|''Halaman Active Jobs. Terdapat dua opsi yaitu '''<code>All Jobs</code>''' untuk melihat antrian semua job dan '''<code>Your jobs</code>''' untuk melihat status job user saja.''|kiri]]
-[[Berkas:Efiroqueueedit.png|al=|jmpl|''Halaman Active Jobs''|kiri]]
 |-
-|'''Interactive Apps'''
+|'''<code>Interactive Apps</code>'''
-*Menampilkan daftar software yang bisa diakses secara interaktif (langsung) oleh user.
+*Menampilkan daftar sesi interaktif untuk menjalankan komputasi seperti sesi Jupyter atau virtual desktop.
-'''My Interactive Sessions'''
+'''<code>My Interactive Sessions</code>'''
 *Menampilkan daftar sesi interaktif user yang sedang aktif dan sudah selesai.
 |-
-|'''Clusters > Aleleon Shell Access'''
+|'''<code>Clusters > Aleleon Shell Access</code>'''
 *Halaman terminal Linux (shell) ALELEON Supercomputer. Untuk kegiatan yang membutuhkan terminal.
 [[Berkas:Efiroshell.png|kiri|jmpl|200x200px|''Terminal ALELEON Supercomputer'']]
@@ Baris 46: / Baris 41: @@
 [[Berkas:Slurmm.png|al=|600x600px]]
-User menggunakan halaman '''<code>Jobs</code> > <code>Job Composer</code>''' untuk menjalankan komputasi di Compute Node yang merupakan bagian server utama menjalankan job komputasi user.
+User menjalankan job komputasi ke Compute Node melalui halaman '''<code>Job Composer</code>''' dimana memvisualisasikan penggunaan program manajemen atau scheduler '''SLURM.'''
+=== Tutorial Spesifik per Software Komputasi ===
+User dapat melihat tutorial menjalankan komputasi masing-masing software komputasi di laman [[Daftar Software Komputasi dan Tutorial Penggunaan|'''Daftar Software Komputasi dan Tutorial Penggunaan''']]:
+[[Berkas:Wiki-15.jpg|1000x1000px |link=Daftar Software Komputasi dan Tutorial Penggunaan |alt=Daftar Software Komputasi dan Tutorial Penggunaan]]
-Berikut adalah langkah mengggunakan Job Composer ''(klik Expand atau Kembangkan)'':
+=== Tutorial Umum ===
+Berikut adalah tutorial umum menggunakan halaman Job Composer ''(klik Expand atau Kembangkan)'':
 {| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
-! colspan="2" |
+! colspan="2" |Langkah Umum Menggunakan Job Composer
-=== Langkah Menggunakan Job Composer untuk Job Submission ===
 |-
 |'''1'''
@@ Baris 61: / Baris 61: @@
 [[Berkas:Jcnewjobmarked.png|al=|nirbing|180x180px]]
 |-
-|'''3A'''
+|'''3'''
-|'''Berikutnya user memilih template software komputasi yang diinginkan:'''
+|[[Berkas:Jcselecttemplate3.png|al=|nir|jmpl|Pilih template software komputasi yang diinginkan. Isi atau ganti <code>'''Job Name'''</code> sesuai keinginan user, kemudian klik <code>'''Create New Job'''</code>.|400x400px]]
-* Pilih template job yang diinginkan.
-* Isi '''<code>Job Name</code>''' sesuai keinginan user, kemudian klik '''<code>Create New Job</code>'''.
-[[Berkas:Jcselecttemplate3.png|al=|nir|jmpl|''Isi atau ganti <code>'''Job Name'''</code> sesuai keinginan user, kemudian klik <code>'''Create New Job'''</code>.'']]
-{| class="wikitable"
-|'''''Note:'''''
-* ''Template job dibuat oleh admin EFISON serta disesuaikan dengan nama software komputasi dan versinya. User dapat meminta bantuan admin untuk pembuatan template melalui email '''support@efisonlt.com'''.''
-|}
-|-
-|'''3B'''
-|'''''User dapat melihat daftar lengkap template dan tutorial penggunaan software komputasi ALELEON Supercomputer pada:'''''
-[[Berkas:Wiki-15.jpg|1000x1000px |link=Daftar Software Komputasi dan Tutorial Penggunaan |alt=Daftar Software Komputasi dan Tutorial Penggunaan]]
 |-
 |'''4'''
-|'''Setelah itu user menyiapkan keperluan untuk menjalankan job seperti upload file input, dll:'''
+|[[Berkas:Jcjoboption3.png|nirbing|600x600px]]
+Gunakan menu '''<code>Edit Files</code>''' untuk upload file yang dibutuhkan'''.'''
-[[Berkas:Jcjoboption.png|600x600px]]
+*Laman Edit Files juga dapat melakukan view / download / edit / rename / delete file.
+*''Fitur upload pada laman Edit Files '''mempunyai batasan ukuran upload 2GB per file'''.''
-Terdapat tiga opsi untuk mempersiapkan job:
+**''Gunakan [[Upload File dengan Aplikasi FTP|'''aplikasi FTP''']] apabila user hendak mengupload file tunggal diatas 2GB.''
-*'''<code>Edit Files</code>''': Manajemen file melakukan upload / download / editing file untuk menjalankan job komputasi user.
-**''Fitur upload pada laman Edit Files '''mempunyai batasan ukuran upload 2GB per file'''. Gunakan [[Upload File dengan Aplikasi FTP|'''aplikasi FTP''']] apabila user hendak mengupload file tunggal diatas 2GB.''
-*'''<code>Job Options</code>''': Mengganti nama job komputasi
-*'''<code>Open Terminal</code>''': Membuka terminal pada direktori job tersebut, ketika user membutuhkan perintah terminal untuk menyiapkan komputasi user.
 |-
-|'''5A'''
+|'''5'''
-|'''User melengkapi Submit Script''' yaitu script bash yang berisikan alokasi kebutuhan komputasi (CPU, RAM, walltime, output, dll) dan alur jalannya program komputasi user.
+|[[Berkas:Jceditor3.png|al=|nirbing|300x300px]]
+Melalui '''<code>Open Editor</code>''', lengkapi Submit Script dengan mengganti bagian yang di tandai 4 garis miring (////).
-[[Berkas:Jceditor3.png|al=|nirbing|300x300px]]
+* Submit Script adalah 'formulir' untuk menjalankan job komputasi user.
-Melalui '''<code>Open Editor</code>''', lengkapi Submit Script supaya job dapat berjalan dengan benar.
+*''Jangan lupa klik <code>'''Save'''</code> setiap sekali mengubah script.''
-*Template menyediakan penjelasan tentang apa dan mana bagian yang harus dilengkapi, seperti mengisi bagian yang ditandai 4 garis miring (////).
+*Template ini bersifat referensi, user dapat mengubah bagian yang sekiranya perlu diubah.
-*'''''Jangan lupa klik''''' '''<code>Save</code> ''setiap sekali mengubah script.'''''
+*Info Submit Script lebih detail lihat laman [[Submit Script ALELEON Supercomputer|'''Submit Script ALELEON Supercomputer''']]
 |-
-|'''5B'''
+|'''6'''
-|'''''Pengenalan dasar Submit Script dan aturan menentukan alokasi kebutuhan komputasi di ALELEON Supercomputer:'''''
+|Jalankan job dengan klik tombol '''<code>Submit</code>'''.
+[[Berkas:Jcsubmit2.png|al=|nirbing|600x600px]]
-[[Berkas:Wiki-14edit.jpg|al=SLURM Script ALELEON Supercomputer|1000x1000px |link=Submit Script ALELEON Supercomputer ]]
+Berikut penjelasan kolom '''<code>Status</code>,''' pantau dengan refresh halaman job''':'''
-|-
-| rowspan="2" |'''6A'''
-|
-Apabila Submit Script sudah diedit sesuai kebutuhan, '''jalankan job dengan klik tombol''' '''<code>Submit</code>'''.
-[[Berkas:Jcsubmit2.png|al=|nirbing|600x600px]]
-|-
-|Berikut penjelasan kolom '''<code>Status</code>,''' pantau dengan refresh halaman job''':'''
 {| class="wikitable"
 !Status
@@ Baris 119: / Baris 97: @@
 |-
 |Queue
-|Job mengantri dan belum berjalan.
+|Job mengantri dan belum berjalan. Untuk melihat detail status antrian:
+* Buka <code>'''Jobs > Active Jobs'''</code> pada dashboard EFIRO.
+* Ubah opsi ke <code>'''Your Jobs'''</code> sesuai gambar dibawah ini.
+* Klik simbol '''>''' untuk melihat detail job submission.
+* Lihat isi kolom '''Reason'''.
+** Arti Reason lihat laman '''[[Daftar Reason NODELIST ALELEON Supercomputer]].'''
+[[Berkas:Efiroqueueedit.png|al=|jmpl|''Halaman Active Jobs. Ubah opsi '''<code>Your jobs</code>''' untuk melihat status job user saja. Klik simbol '''>''' untuk melihat detail job submission.''|kiri]]
 |-
 |Completed
@@ Baris 125: / Baris 111: @@
 |-
 |Failed
-|Job berhenti di tengah jalan, Bisa karena di Stop atau Delete oleh user.
+|Job berhenti di tengah jalan, bisa karena di Stop atau Delete oleh user.
 |}
-|-
+Apabila ingin menghentikan job yang tengah berjalan, klik tombol '''<code>Stop</code>'''.
-|'''6B'''
-|
-Untuk menghentikan job yang tengah berjalan, klik tombol '''<code>Stop</code>.'''
 [[Berkas:Stop.png|nirbing|600x600px]]
 |-
 |'''7A'''
-|
+|Hasil output job dapat dilihat pada kolom '''<code>Folder Contents</code>''' atau membuka halaman '''<code>Edit Files</code>.'''[[Berkas:Jcfoldercontentsedit.png|al=|nir|jmpl|User dapat melihat semua file output yang keluar di kolom '''<code>Folder Contents</code>'''.]][[Berkas:Jcjoboption3.png|nir|jmpl|atau dengan membuka menu '''<code>Edit Files</code>'''.]]
-Hasil output job yang selesai dapat dilihat pada kolom '''<code>Folder Contents</code>''' atau membuka halaman '''<code>Edit Pages</code>.'''[[Berkas:Jcfoldercontentsedit.png|al=|nir|jmpl|''User dapat melihat semua file output yang keluar di kolom'' '''<code>Folder Contents</code>'''''.'']][[Berkas:Jcjoboption3.png|nir|jmpl|''atau dengan membuka menu'' '''<code>Edit Files</code>'''''.'']]
 |-
 |'''7B'''
-|
+|User dapat '''menjalankan ulang ruang job yang sama''' dengan mengklik kembali tombol '''<code>Submit</code>'''.
-User dapat '''menjalankan ulang ruang job yang sama''' (misalkan ketika ada koreksi file input atau Submit Script) dengan mengklik kembali tombol '''<code>Submit</code>'''.
 |}
 == '''4A | Sesi Interaktif ALELEON Desktop''' ==

Article tools

Perkakas pribadi

Navigasi

Perkakas