Daftar Software Komputasi dan Tutorial Penggunaan

Dari ALELEON by EFISON

Halaman ini merangkum semua daftar software komputasi pada ALELEON Supercomputer dan tutorial penggunaannya.

Pendahuluan; mengecek sisa Kredit Core Hour
1 Sebelum melakukan komputasi, user disarankan mengecek kuota Kredit Core Hour karena dibutuhkan untuk menjalankan komputasi di ALELEON Supercomputer.
Mengecek kuota Kredit Core Hour
1 Buka terminal melalui dashboard EFIRO Clusters > ALELEON Shell Access
2 Jalankan perintah sausage
Perintah sausage memperlihatkan sisa kredit CCH dan GH user
2 Kuota kredit Core Hour akan berkurang sesuai dengan resources CPU / GPU yang dialokasikan user saat menjalankan komputasi di ALELEON Supercomputer melalui Job Composer dan Interactive Apps dibawah ini.

Job Composer dan Interactive Apps

Terdapat dua metode untuk menjalankan komputasi di ALELEON Supercomputer yaitu Job Composer dan Interactive Apps.

Metode Job Composer
Halaman Job Composer. Diakses melalui menu Jobs > Job Composer di dashboard EFIRO.
  • Cara utama untuk menjalankan semua software komputasi di ALELEON Supercomputer.
  • Job Composer menjalankan software pada Compute Node - bagian server komputasi ALELEON Supercomputer terkencang untuk menjalankan berbagai level komputasi dari kecil hingga besar.
  • Job Composer bekerja dengan model job submission: software komputasi dijalankan oleh sistem berdasarkan serangkaian template, formulir, dan script yang didefinisikan user.
Metode Interactive Apps
Contoh salah satu interactive apps: Jupyter Notebook, diakses melalui menu Interactive Apps di dashboard EFIRO.
  • Interactive Apps adalah aplikasi yang dapat dijalankan secara interaktif (langsung) oleh user.
  • Interactive Apps berjalan pada Interactive Node - bagian server komputasi ALELEON Supercomputer untuk menjalankan semua Interactive Apps.
  • Hanya software tertentu yang dapat berjalan pada Interactive Apps.
  • Interactive Node mempunyai spesifikasi hardware terbatas sehingga lebih cocok digunakan untuk komputasi skala kecil atau pengujian jalannya software / script. Gunakan Job Composer untuk melakukan komputasi skala besar.

Daftar Software Komputasi dan Tutorial

SOFTWARE KOMPUTASI DAN MULTIMEDIA
Software

Komputasi

Dukungan

Penggunaan

COMCOT Job Composer
GAMESS Job Composer
GROMACS Job Composer
NAMD Job Composer
NWChem Job Composer
ORCA Job Composer
PHASE/0 Job Composer
Quantum ESPRESSO Job Composer
R
Python1

via Anaconda

CP2K Job Composer
Blender (coming soon)
  • Job Composer
  • Interactive Apps:
    • ALELEON Desktop
SPECFEM3D (coming soon)

Job Composer

Note:

  1. Python mengacu interpreter dan library komputasi seperti TensorFlow, Scikit, PyTorch, Keras, Pandas, dll