COMCOT: Perbedaan antara revisi

Dari ALELEON by EFISON
(formatting)
Baris 25: Baris 25:
| -
| -
|}
|}
 
=='''Pilihan Menjalankan Komputasi'''==
== '''Menjalankan COMCOT''' ==
User dapat memilih metode menjalankan komputasi sesuai keinginan:
User dapat menjalankan komputasi dengan pilihan cara melalui terminal atau website EFIRO ''(klik expand atau kembangkan)''.
*'''Job submission terminal'''
 
**''Berjalan di [[Spesifikasi ALELEON Supercomputer#Spesifikasi%20Compute%20Node|compute node]] melalui manajemen Slurm.''
=== Opsi Menggunakan terminal (SLURM sbatch) ===
*'''Job submission web EFIRO'''
**''Berjalan di [[Spesifikasi ALELEON Supercomputer#Spesifikasi%20Compute%20Node|compute node]] melalui manajemen Slurm via web EFIRO.''
=== Job Submission Terminal ===
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
! colspan="2" |Langkah Menjalankan COMCOT di Terminal
!Langkah Job Submission Terminal
[[Berkas:Sbatch Terminal.png|nirbing|500x500px]]
[[Berkas:Sbatch Terminal.png|tepi|400x400px]]
|-
!1
|-
|-
|'''0'''
| Lakukan [https: / wiki.efisonlt.com wiki Menggunakan_ALELEON_Supercomputer_via_Terminal#1_ |'''[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Menggunakan_ALELEON_Supercomputer_via_Terminal#Login_SSH Login SSH]''' ke ALELEON Supercomputer.
|
|-
Lakukan [https://wiki.efisonlt.com/wiki/Menggunakan_ALELEON_Supercomputer_via_Terminal#1_|_Login_SSH '''login SSH ke ALELEON Supercomputer'''].
!2
|-
|-
|'''1'''
|Siapkan file komputasi yang dibutuhkan.
|
Siapkan file yang dibutuhkan untuk komputasi user
*User dapat upload / download file dengan [[Upload File dengan Aplikasi FTP|'''software FTP''']].
*User dapat upload / download file dengan [[Upload File dengan Aplikasi FTP|'''software FTP''']].
|-
|-
| rowspan="2" |'''2'''
!3A
|
|-
Buat '''Slurm Submit Script''' yaitu "formulir" untuk menjalankan komputasi.
|Buat '''Submit Script''' yaitu 'formulir' untuk menjalankan job komputasi.
 
* Nama file bebas dengan format .sh, contoh '''<code>submit.sh</code>'''
* Format file .sh (bash), nama bebas. Contoh: <code>my_job_submission.sh</code>
|-
* Berikut contoh template untuk COMCOT, ikuti petunjuk NOTES di dalamnya:
!
 
|-
|Contoh template Submit Script, ikuti petunjuk NOTES didalamnya.
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
!Template Submit Script untuk COMCOT
!Template Submit Script COMCOT
|-
|-
|<syntaxhighlight lang="bash" line="1">
|<syntaxhighlight lang="bash" line="1">
Baris 97: Baris 100:
comcot
comcot
</syntaxhighlight>
</syntaxhighlight>
|}
|}  
|-
|-
|
!
 
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
! colspan="5" |Panduan Nilai Maksimal SBATCH ntasks, mem, gpus, time
|-
|-
!Skenario Komputasi
|*''Info script lebih detail lihat [[Submit Script ALELEON Supercomputer|'''Submit Script ALELEON Supercomputer''']].''
!ntasks
*''Untuk SBATCH notifikasi email status jalannya job lihat [https://wiki.efisonlt.com/wiki/Submit_Script_ALELEON_Supercomputer#SBATCH_untuk_notifikasi_email_SLURM '''Slurm Jojo'''].''
(CPU)
!mem
(RAM)
!gpus
(GPU)
!time
(time limit)
|-
|-
|Fair policy usage<sup>''1''</sup>
! 3B
|128
|128GB
|2
| rowspan="3" |3-00:00:00
atau
 
72:00:00
|-
|-
| COMCOT
|'''SBATCH komputasi (ntasks, mem, time, dll) mempunyai limit''' berdasarkan:*Sisa Core Hour user dan [[Limitasi Fair Usage ALELEON Supercomputer|'''Fair Usage Limit''']].
|128
* Spesifikasi sistem dan software komputasi.
| 240GB
Untuk melihat limit, jalankan perintah berikut:
|0
'''$ slimit-ser'''
|-
|-
|COMCOT di high-mem node, tambahkan:
!4
<code>#SBATCH --nodelist=epyc001</code>
|128
|500GB
|0
|-
|-
| colspan="5" |'''''Keterangan:'''''
|Jalankan job komputasi dengan perintah:
#Limitasi untuk menjaga kualitas layanan ALELEON Supercomputer.
$ '''sbatch ''[nama-submit-script]'''''
#*Berlaku untuk akumulasi semua job user yang berjalan.
#*Dapat mengajukan permintaan buka limitasi apabila butuh alokasi lebih.
''Contoh:''
#*Info detail buka laman [[Limitasi Fair Usage ALELEON Supercomputer|'''Limitasi Fair Usage ALELEON Supercomputer''']].
$ sbatch submit.sh
|-
|-
! colspan="5" |Keterangan tambahan
!5
|-
|-
| colspan="5" |
|User dapat melihat status jalannya job dengan perintah:
* '''Untuk akun perseorangan dengan Kredit Core Hour:'''
'''<code>$ squeue -ul $USER</code>'''
**SLURM akan menahan job apabila:
***ntasks * time (jam) lebih besar dari sisa CPU Core Hour user.
***gpus * time (jam) lebih besar dari sisa GPU Hour user.
**Cek sisa Kredit Core Hour melalui perintah '''<code>sausage</code>'''


*Info SBATCH lebih detail lihat laman [[Submit Script ALELEON Supercomputer|'''Submit Script ALELEON Supercomputer''']]
Kolom ST atau STATE menunjukkan status jalannya job.
|}
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
! colspan="2" |Daftar ST (STATE)
|-
|-
|'''3'''
!STATE
|
Jalankan job dengan perintah sbatch:
$ '''sbatch''' '''''<nama-SLURM-Submit-script>'''''
Contoh menjalankan script <code>my_job_submission.sh</code>
$ sbatch ''my_job_submission.sh''
|-
|'''4A'''
|User dapat melihat status jalannya job dengan perintah squeue:
$ '''squeue -ul $USER'''
*Apabila tidak ada output artinya tidak ada job user yang sedang berjalan / antri.
 
* Berikut adalah daftar STATE (ST) yang menunjukkan status jalannya job:
 
{| class="wikitable"
|+Daftar STATE squeue Slurm
! colspan="2" |STATE  
!Penjelasan
!Penjelasan
|-
|-
| R  
|R (RUN)
|RUN
|Job berjalan
|Job berjalan
|-
|-
|PD  
|PD (PENDING)
|PENDING
|Job tertahan, lihat [[Daftar Reason NODELIST ALELEON Supercomputer|'''NODELIST(REASON)''']]
|Job tertahan, lihat keterangan [[Daftar Reason NODELIST ALELEON Supercomputer|'''NODELIST(REASON)''']]
|-
|-
|CG  
|CG (COMPLETING)
|COMPLETING
|Job selesai dan dalam proses clean-up
|Job selesai dan dalam proses clean-up
|-
|-
|CA  
|CA (CANCELED)
|CANCELED
|Job dibatalkan user
|Job dibatalkan oleh user
|-
|-
|PR  
|PR (PREEMPETED)
|PREEMPETED
| Job dibatalkan admin, alasan dikabarkan via email
|Job dibatalkan oleh admin EFISON.
 
* alasan dikabarkan melalui email ke user.
|-
|-
|S  
|S (SUSPENDED)
|SUSPENDED
|Job ditahan admin, alasan dikabarkan via email
|Job ditahan oleh admin EFISON
|}
|}
|-
|-
|'''4B'''
!
|
|-
Apabila user ingin membatalkan job, gunakan perintah scancel:
| Apabila user ingin menghentikan job yang berjalan, jalankan perintah:
  $ '''scancel <''job-ID-submission-user''>'''
  '''$ scancel ''[job-ID]'''''
*Job ID dapat dilihat melalui perintah squeue pada kolom JOBID.
*User hanya bisa memb231atalkan job submission milik user sendiri.
''Job ID ada pada squeue diatas.''
*Contoh user membatalkan job submission ID 231:
contoh membatalkan job ID 231:
  $ scancel ''231''
  $ scancel 231
|}
|}
=== Opsi Menggunakan Web EFIRO (EFIRO Job Composer) ===
=== Job Submission Web EFIRO ===
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
! colspan="2" |Langkah Menjalankan COMCOT di Web EFIRO
!Langkah Job Submission Web EFIRO
[[Berkas:Efirojobcomposer3.png|nirbing|500x500px]]
[[Berkas:Efirojobcomposer3.png|nirbing|400x400px]]  
|-
|-
|'''0'''
!1
|
|-
=====Login Web EFIRO=====
| [https: / wiki.efisonlt.com wiki Menggunakan_ALELEON_Supercomputer_via_EFIRO#1_ |'''[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Menggunakan_ALELEON_Supercomputer_via_EFIRO#Login_Web_EFIRO Login ke web EFIRO]''' ALELEON Supercomputer.
*[[Koneksi VPN ALELEON Supercomputer|'''User harus terhubung ke jaringan VPN ALELEON Supercomputer''']].
|-
*Buka alamat web '''<code><nowiki>http://aleleon.ood</nowiki></code>'''  lalu masukkan username dan password user.
!2
**Bagi user Linux, buka alamat <code>'''<nowiki>http://10.192.50.11</nowiki>'''</code>
|-
|-
|'''1'''
|Buka pinned apps '''Job Composer''' [[Berkas:New Pinnedapps jc.png|nirbing|128x128px]] di homepage EFIRO.
|
Pilih menu '''<code>New Job</code>''' -> '''<code>From Template</code>'''
==== Membuka Job Composer dan Memilih Template Job ====


* Buka menu '''<code>Jobs</code>''' > '''<code>Jobs Composer</code>''' pada dashboard EFIRO.
[[Berkas:Jcnewjobmarked.png|nirbing|180x180px]]
*Pilih '''<code>New Job</code>''' > '''<code>From Template</code>'''
[[Berkas:Efirojobcomposermenu.png|nir|jmpl|''Menu '''<code>Jobs</code> > <code>Jobs Composer</code>''''']][[Berkas:Jcnewjobmarked.png|al=|nir|jmpl|220x220px|''Menu '''<code>New Jobs</code>''' > '''<code>From Template</code>''''']]
|-
|-
|'''2'''
!3
|[[Berkas:Jcselecttemplate3.png|nirbing|600x600px]]
|-
*PIlih template COMCOT yang diinginkan.
|{| class="wikitable"
*Isi atau ganti kolom '''<code>Job Name</code>''' sesuai keinginan user.
! colspan="2" |Pilih template COMCOT yang diinginkan
*Apabila sudah selesai, klik '''<code>Create New Job</code>'''.
{| class="wikitable"
! colspan="2" |Template COMCOT yang tersedia
|-
|-
!Nama Template
!Nama Template
Baris 240: Baris 188:
|COMCOT 1.7 (CPU)
|COMCOT 1.7 (CPU)
|Menjalankan COMCOT 1.7 versi CPU
|Menjalankan COMCOT 1.7 versi CPU
|}
|}Kemudian Isi '''<code>Job Name</code>''' dan klik '''<code>Create New Job</code>'''
 
[[Berkas:Jctemplate-2.png|nirbing]]
|-
|-
|'''3'''
!4
|
=====Menyiapkan File Komputasi=====
[[Berkas:Jcjoboption3.png|nirbing|600x600px]]
 
Gunakan menu <code>'''Edit Files'''</code> untuk upload file komputasi yang dibutuhkan.
*Laman Edit Files juga dapat melakukan download / edit / rename / delete file.
*Fitur upload pada Edit Files mempunyai limit kapasitas '''2GB per file'''.
** Gunakan [[Upload File dengan Aplikasi FTP|'''aplikasi FTP''']] untuk upload file tunggal diatas 2GB.
|-
|-
| rowspan="2" |'''4'''
|Siapkan file komputasi yang dibutuhkan.
|
[[Berkas:Jcjoboption.png|nirbing|400x400px]]
===== Melengkapi Submit Script=====
* Upload file melalui menu '''<code>Edit Files</code>'''
Submit Script adalah "formulir" untuk menjalankan job komputasi user.
**Untuk upload file tunggal diatas 2GB gunakan [[Upload File dengan Aplikasi FTP|'''software FTP''']].
*Lengkapi Submit Script melalui menu '''<code>Open Editor</code>'''.
*Ikuti petunjuk NOTES di dalamnya.
*Jangan lupa klik <code>'''Save'''</code> setiap sekali mengubah script.
[[Berkas:Jceditor3.png|al=|nirbing|500x500px]]
|-
|-
|
!5A
=====Panduan Nilai Maksimal SBATCH=====
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
! colspan="5" |Panduan Nilai Maksimal SBATCH ntasks, mem, gpus, time
|-
|-
!Skenario Komputasi
|Lengkapi '''Submit Script''' melalui tombol '''<code>Open Editor</code>'''.
!ntasks
[[Berkas:Jceditor3.png|al=|nirbing|400x400px]]
(CPU)
*Submit script adalah 'formulir' untuk menjalankan job komputasi.
!mem
*Ikuti petunjuk NOTES didalamnya
(RAM)
*Klik '''<code>Save</code>''' setiap kali mengubah script.
!gpus
(GPU)
!time
(time limit)
|-
|-
|Fair policy usage untuk akumulasi semua job<sup>''1''</sup>
!
|128
|128GB
|2
| rowspan="3" |3-00:00:00
atau
 
72:00:00
|-
|-
|COMCOT
|
|128
*''Info script lebih detail lihat [[Submit Script ALELEON Supercomputer|'''Submit Script ALELEON Supercomputer''']].''
|240GB
*''Untuk SBATCH notifikasi email status jalannya job lihat [https://wiki.efisonlt.com/wiki/Submit_Script_ALELEON_Supercomputer#SBATCH_untuk_notifikasi_email_SLURM '''Slurm Jojo'''].''
|0
|-
|-
|COMCOT di high-mem node
!5B
*Tambahkan <code>#SBATCH --nodelist=epyc001</code>
|128
| 500GB
|0
|-
|-
| colspan="5" |'''''Keterangan:'''''
|'''SBATCH komputasi (ntasks, mem, time, dll) mempunyai limit''' berdasarkan:
#Limitasi untuk menjaga kualitas layanan ALELEON Supercomputer.
*Sisa Core Hour user dan [[Limitasi Fair Usage ALELEON Supercomputer|'''Fair Usage Limit''']].
#*User dapat mengajukan permintaan buka limitasi apabila butuh alokasi lebih.
*Spesifikasi sistem dan software komputasi.
#*Info detail buka laman [[Limitasi Fair Usage ALELEON Supercomputer|'''Limitasi Fair Usage ALELEON Supercomputer''']].
Untuk melihat limit, jalankan perintah berikut pada terminal:
'''$ slimit-ser'''
|-
|-
! colspan="5" |Keterangan tambahan
!6
|-
|-
| colspan="5" |
|Jalankan job dengan klik tombol '''<code>Submit</code>'''.
*'''Untuk akun perseorangan dengan Kredit Core Hour:'''
[[Berkas:Jcsubmit2.png|al=|nirbing|400x400px]]
**SLURM akan menahan job apabila:
* Pantau kolom status yang menjelaskan status jalannya job.
***ntasks * time (jam) lebih besar dari sisa CPU Core Hour user.
*Apabila ingin membatalkan job yang berjalan, klik '''<code>Stop</code>'''.
***gpus * time (jam) lebih besar dari sisa GPU Hour user.
*Job completed dapat dijalankan kembali dengan '''<code>Submit</code>'''.
**Cek sisa Kredit Core Hour melalui menu '''<code>Open Terminal</code>''' dan jalankan perintah:
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
$ '''sausage'''
! colspan="2" |Daftar status job
[[Berkas:Jcjoboption4.png|nirbing|600x600px]]
*Info SBATCH lebih detail lihat laman [[Submit Script ALELEON Supercomputer|'''Submit Script ALELEON Supercomputer''']]
|}
|-
|-
|'''5'''
|
=====Menjalankan Job Komputasi=====
Jalankan job dengan klik tombol '''<code>Submit</code>'''.
[[Berkas:Jcsubmit2.png|al=|nirbing|600x600px]]
{| class="wikitable"
|+''Penjelasan kolom '''<code>Status</code>,''' pantau dengan refresh halaman job''
!Status
!Status
!Arti
!Arti
Baris 333: Baris 242:
|Queue
|Queue
|Job mengantri dan belum berjalan.
|Job mengantri dan belum berjalan.
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
!Langkah melihat status job ketika queue
|-
|-
|Buka <code>'''Jobs > Active Jobs'''</code> pada dashboard EFIRO.
| Completed
*Lakukan langkah sesuai gambar dibawah ini
[[Berkas:Efiroqueueedit.png|al=|jmpl|''Halaman Active Jobs. Ubah opsi '''<code>Your jobs</code>''' untuk melihat status job user saja. Klik simbol '''>''' untuk melihat status  job pending pada kolom '''Reason'''. Arti reason lihat laman '''[[Daftar Reason NODELIST ALELEON Supercomputer]].'''''|kiri]]
|}
|-
|Completed
|Job selesai berjalan.
|Job selesai berjalan.
|-
|-
|Failed
|Failed
|Job berhenti di tengah jalan, bisa karena di Stop atau Delete oleh user.
|Job berhenti di tengah jalan, antara error atau di stop user
|}
|-
=====Menghentikan Job Komputasi=====
| colspan="2" |'''Untuk melihat alasan queue:'''
Untuk menghentikan job yang tengah berjalan, klik tombol '''<code>Stop</code>'''.
#Buka app '''<code>Active Jobs</code>''' [[Berkas:Pinnedapps activejobs.png|nirbing|127x127px]]di homepage EFIRO.
 
#[[Berkas:Efiroqueueedit.png|nir|jmpl|''Ubah opsi '''<code>Your jobs</code>''' untuk melihat status job user saja. Klik simbol '''>''' untuk melihat status  job pending pada kolom '''Reason'''. Arti reason lihat laman '''[[Daftar Reason NODELIST ALELEON Supercomputer]].''''']]
[[Berkas:Stop.png|nirbing|600x600px]]
|}
|-
!7
|-
|-
|'''6A'''
|Lihat output file komputasi pada kolom '''<code>Folder Contents</code>'''
|
*Atau dengan membuka '''<code>Edit Files</code>'''  
=====Melihat Output Komputasi=====
User dapat melihat output file komputasi pada kolom '''<code>Folder Contents</code>'''
*Atau dengan membuka '''<code>Edit Files</code>'''
[[Berkas:Jcfoldercontentsedit.png|al=|nir|jmpl|''Kolom '''<code>Folder Contents</code>'''.'']]
[[Berkas:Jcfoldercontentsedit.png|al=|nir|jmpl|''Kolom '''<code>Folder Contents</code>'''.'']]
|-
|'''6B'''
|User dapat '''menjalankan ulang ruang job yang sama''' dengan mengklik kembali tombol '''<code>Submit</code>'''.
|}
|}
== '''Notifikasi Status Jalannya Komputasi via email''' ==
SLURM ALELEON Supercomputer dapat mengirim notifikasi email kepada user dengan nama "Jojo" untuk mengabarkan status berjalannya job komputasi user. Silahkan tambahan SBATCH berikut pada Submit Script apabila user ingin menerima notifikasi email dari SLURM:<syntaxhighlight lang="bash">
#SBATCH --mail-user=<alamat-email-user>
#SBATCH --mail-type=BEGIN,END,FAIL
</syntaxhighlight>SBATCH mail-type mengatur konten email notifikasi SLURM dengan pilihan opsi yang sekiranya berguna untuk user:
*BEGIN -> notifikasi job sudah mulai
*END -> notifikasi job sudah selesai beserta cuplikan 20 baris terakhir dari file SBATCH output dan error.
*FAIL -> notifikasi apabila job gagal berjalan atau berhenti tidak sewajarnya.
*TIME_LIMIT_50 -> job telah berjalan dengan durasi waktu 50% time limit.
*TIME_LIMIT_80 -> job telah berjalan dengan durasi waktu 80% time limit.
== '''Pelaporan Kendala dan Support''' ==
== '''Pelaporan Kendala dan Support''' ==
Apabila menjumpai masalah teknis dalam menjalankan komputasi, silahkan lapor dengan klik gambar berikut ini.
Apabila menjumpai masalah teknis dalam menjalankan komputasi, silahkan lapor dengan klik gambar berikut ini.

Revisi per 14 Juni 2024 01.48

COMCOT (Cornell Multi-grid Coupled Tsunami Grid) adalah software pemodelan tsunami yang menggunakan metode Shallow Water Equations.

Modul COMCOT

Berikut adalah detail versi COMCOT yang tersedia secara global di ALELEON Supercomputer:

Versi Nama modul Modul

DEFAULT

Dukungan hardware
CPU GPU OMP

Threading

MPI

multi-node

1.7 comcot/1.7cpu V V - - -

Pilihan Menjalankan Komputasi

User dapat memilih metode menjalankan komputasi sesuai keinginan:

  • Job submission terminal
  • Job submission web EFIRO
    • Berjalan di compute node melalui manajemen Slurm via web EFIRO.

Job Submission Terminal

Langkah Job Submission Terminal

Sbatch Terminal.png

1
Login SSH ke ALELEON Supercomputer.
2
Siapkan file komputasi yang dibutuhkan.
3A
Buat Submit Script yaitu 'formulir' untuk menjalankan job komputasi.
  • Nama file bebas dengan format .sh, contoh submit.sh
Contoh template Submit Script, ikuti petunjuk NOTES didalamnya.
Template Submit Script COMCOT
#!/bin/bash

# -----------------------------------------------------
# Template SLURM Submit Script
# COMCOT | rev.080124
# 
# NOTES: 
# 1. Isi bagian yang ditandai 4 garing (////).
# 2. Template ini bersifat referensi.
#    User dapat mengubah bagian yang perlu diubah.
# -----------------------------------------------------

# -----------------------------------------------------
# Alokasi komputasi SBATCH, input, dan module
# -----------------------------------------------------

# Alokasi jumlah core thread CPU
#SBATCH --ntasks=////

# Alokasi jumlah memori RAM (satuan GB)
#SBATCH --mem=////GB

# Alokasi limit waktu menjalankan job
# Format HH:MM:SS atau D-HH:MM:SS
#SBATCH --time=////

# Definisi file untuk menampung output terminal program
#SBATCH --output=result-%j.txt

# Definisi file untuk menampung output error log    
#SBATCH --error=error-%j.txt 

# Memuat modul software COMCOT
# Daftar modul lihat subbab "Modul COMCOT" di atas 
module load comcot////

# ----------------------------------------------------
# Script jalannya program
# ----------------------------------------------------

# Perintah menjakankan COMCOT
comcot
*Info script lebih detail lihat Submit Script ALELEON Supercomputer.
  • Untuk SBATCH notifikasi email status jalannya job lihat Slurm Jojo.
3B
SBATCH komputasi (ntasks, mem, time, dll) mempunyai limit berdasarkan:*Sisa Core Hour user dan Fair Usage Limit.
  • Spesifikasi sistem dan software komputasi.

Untuk melihat limit, jalankan perintah berikut:

$ slimit-ser
4
Jalankan job komputasi dengan perintah:
$ sbatch [nama-submit-script]

Contoh:
$ sbatch submit.sh
5
User dapat melihat status jalannya job dengan perintah:

$ squeue -ul $USER

Kolom ST atau STATE menunjukkan status jalannya job.

Daftar ST (STATE)
STATE Penjelasan
R (RUN) Job berjalan
PD (PENDING) Job tertahan, lihat NODELIST(REASON)
CG (COMPLETING) Job selesai dan dalam proses clean-up
CA (CANCELED) Job dibatalkan user
PR (PREEMPETED) Job dibatalkan admin, alasan dikabarkan via email
S (SUSPENDED) Job ditahan admin, alasan dikabarkan via email
Apabila user ingin menghentikan job yang berjalan, jalankan perintah:
$ scancel [job-ID]

Job ID ada pada squeue diatas.
contoh membatalkan job ID 231:
$ scancel 231

Job Submission Web EFIRO

Langkah Job Submission Web EFIRO

Efirojobcomposer3.png

1
Login ke web EFIRO ALELEON Supercomputer.
2
Buka pinned apps Job Composer New Pinnedapps jc.png di homepage EFIRO.

Pilih menu New Job -> From Template

Jcnewjobmarked.png

3
class="wikitable" Pilih template COMCOT yang diinginkan
Nama Template Penjelasan
COMCOT 1.7 (CPU) Menjalankan COMCOT 1.7 versi CPU

Kemudian Isi Job Name dan klik Create New Job

Jctemplate-2.png |- !4 |- |Siapkan file komputasi yang dibutuhkan. Jcjoboption.png

  • Upload file melalui menu Edit Files

|- !5A |- |Lengkapi Submit Script melalui tombol Open Editor.

  • Submit script adalah 'formulir' untuk menjalankan job komputasi.
  • Ikuti petunjuk NOTES didalamnya
  • Klik Save setiap kali mengubah script.

|- ! |- |

|- !5B |- |SBATCH komputasi (ntasks, mem, time, dll) mempunyai limit berdasarkan:

  • Sisa Core Hour user dan Fair Usage Limit.
  • Spesifikasi sistem dan software komputasi.

Untuk melihat limit, jalankan perintah berikut pada terminal:

$ slimit-ser 

|- !6 |- |Jalankan job dengan klik tombol Submit.

  • Pantau kolom status yang menjelaskan status jalannya job.
  • Apabila ingin membatalkan job yang berjalan, klik Stop.
  • Job completed dapat dijalankan kembali dengan Submit.
Daftar status job
Status Arti
Not Submitted Job belum pernah dijalankan.
Running Job berjalan.
Queue Job mengantri dan belum berjalan.
Completed Job selesai berjalan.
Failed Job berhenti di tengah jalan, antara error atau di stop user
Untuk melihat alasan queue:
  1. Buka app Active Jobs Pinnedapps activejobs.pngdi homepage EFIRO.
  2. Ubah opsi Your jobs untuk melihat status job user saja. Klik simbol > untuk melihat status job pending pada kolom Reason. Arti reason lihat laman Daftar Reason NODELIST ALELEON Supercomputer.

|- !7 |- |Lihat output file komputasi pada kolom Folder Contents

  • Atau dengan membuka Edit Files
Kolom Folder Contents.

|}

Pelaporan Kendala dan Support

Apabila menjumpai masalah teknis dalam menjalankan komputasi, silahkan lapor dengan klik gambar berikut ini.

Wiki-pelaporankendala.jpg

---

Bila terdapat pertanyaan lainnya, silahkan hubungi admin EFISON melalui email:

support@efisonlt.com