Daftar Software Komputasi dan Tutorial Penggunaan: Perbedaan antara revisi

Dari ALELEON by EFISON
Tidak ada ringkasan suntingan
(mengganti nama header tabel)
 
(34 revisi perantara oleh pengguna yang sama tidak ditampilkan)
Baris 1: Baris 1:
Halaman ini merangkum daftar software komputasi pada ALELEON Supercomputer dan tutorial penggunaannya.  
Halaman ini merangkum semua daftar software komputasi pada ALELEON Supercomputer dan tutorial penggunaannya.  
* Dilengkapi dengan kompabilitas menjalankan software tersebut pada Job Composer atau Interactive Apps.
{| class="wikitable sortable mw-collapsible"
 
! rowspan="2" |Software Komputasi dan Tutorial
{| class="wikitable sortable"
! colspan="2" |Cara menjalankan job komputasi
!Daftar Software dan tutorial penggunaan
|-
|-
|[[Berkas:R.png|nirbing|100x100px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:R.png]]
!Job submission Slurm
 
!Sesi Interactive EFIRO
===R ===
{| class="wikitable"
|-
|-
|
|'''[[COMCOT]]'''
===[[R menggunakan Job Composer|Job Composer]]===
|V
| -
|-
|-
|
|'''[[GAMESS]]'''
===[[R menggunakan Jupyter Notebook|Interactive Apps: Jupyter Notebook]]===
|V
|}
| -
|-
|-
|
|'''[[GROMACS]]'''
=== MPI (Template Umum) '''''(coming soon)''''' ===
|V
 
| -
* Tutorial menjalankan program MPI secara umum di Job Composer.
* Mencakup Pure MPI dan Hybrid MPI.
{| class="wikitable"
|-
|
=== Job Composer ===
|}
|-
|-
|[[Berkas:Python logo.png|nirbing|110x110px]]
|'''[[NAMD]]'''
 
|V
=== Python (Template Umum) ''(coming soon)'' ===
| -
 
* Tutorial menjalankan program Python secara umum.
 
{| class="wikitable"
|-
|-
|
|'''[[NWChem]]'''
=== Job Composer ===
|V
| -
|-
|-
|
|'''[[ORCA]]'''
=== Interactive Apps: Jupyter Notebook ===
|V
|}
| -
|-
|-
|
|'''[[PHASE/0]]'''
=== Default Job ''(coming soon)'' ===
|V
 
| -
* Tutorial mengenal template default job pada Job Composer.
* Untuk menjalankan program apapun di Compute Node CPU.
{| class="wikitable"
|-
|-
|
|'''[[Quantum ESPRESSO]]'''
=== Job Composer ===
|V
|}
| -
|-
|-
|[[Berkas:GROMACS.png|nirbing|200x200px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:GROMACS.png]]
|'''[[R]]'''
 
|Untuk file '''.R''' siap jalan.
==='''GROMACS'''===
'''''Tidak support file .ipynb.'''''
{| class="wikitable"
|Jupyter Notebook / Lab
|-
|-
|
|'''[[Komputasi Python|Python''<sup>1</sup>'']]'''
=== [[GROMACS|Job Composer]] ===
|Untuk file '''.py''' siap jalan.
|}
'''''Tidak support file .ipynb'''''.
|Jupyter Notebook / Lab
|-
|-
|[[Berkas:Nwhem.png|nirbing|200x200px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Nwhem.png]]
|'''[[CP2K]]'''
 
|V
===NWChem ===
| -
{| class="wikitable"
|-
|-
|
|'''[[FLACS-CFD]]'''
=== [[NWChem|Job Composer]] ===
|V
|}
|ALELEON Desktop
|-
|-
|[[Berkas:Quantum ogo ok.png|nirbing|250x250px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Quantum_ogo_ok.png]]
|'''[[LAMMPS]]'''
 
|V
===Quantum ESPRESSO ===
| -
{| class="wikitable"
|-
|-
|
|[[DFTB+|'''DFTB+''']]
=== [[Quantum ESPRESSO|Job Composer]] ===
|V
|}
| -
|-
|-
|[[Berkas:GAMESS.png|nirbing|200x200px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:GAMESS.png]]
|'''[[OpenMX]]'''
 
|V
===GAMESS ===
| -
{| class="wikitable"
|-
|-
|
|'''[[AmberTools]]'''
=== [[GAMESS|Job Composer]] ===
|V
| -
|}
|}
|-
|[[Berkas:NAMDsof.png|nirbing|250x250px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:NAMDsof.png]]
===NAMD ===
{| class="wikitable"
{| class="wikitable"
|-
|'''Note:'''
|
# ''Python mengacu interpreter dan library komputasi seperti TensorFlow, Scikit, PyTorch, Keras, Pandas, dll. User melakukan instalasi mandiri untuk package tersebut.''
=== [[NAMD|Job Composer]] ===
|}
|-
|[[Berkas:Orca logo.png|nirbing|120x120px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Orca_logo.png|al=]]
 
===ORCA ===
{| class="wikitable"
|-
|
=== [[ORCA|Job Composer]] ===
|}
|-
|[[Berkas:TF.png|nirbing|200x200px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:TF.png]]
 
===TensorFlow ''(coming soon)''===
{| class="wikitable"
|-
|
=== Job Composer ===
|-
|
=== Interactive Apps: Jupyter Notebook ===
|}
|-
|[[Berkas:Phase-logo4.png|nirbing|100x100px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Phase-logo4.png]]
 
===PHASE/0 ===
{| class="wikitable"
|-
|
=== [[PHASE/0|Job Composer]] ===
|}
|-
|
===COMCOT===
{| class="wikitable"
|-
|
=== [[COMCOT|Job Composer]] ===
|}
|-
|
=== ALELEON Desktop ''(coming soon)'' ===
 
* Menjalankan sesi VDI (Virtual Desktop Interface) berbasiskan OS CentOS
 
{| class="wikitable"
|
=== Interactive Apps: ALELEON Desktop ===
|}
|}
|}
__TANPADAFTARISI__

Revisi terkini sejak 28 Juli 2024 03.38

Halaman ini merangkum semua daftar software komputasi pada ALELEON Supercomputer dan tutorial penggunaannya.

Software Komputasi dan Tutorial Cara menjalankan job komputasi
Job submission Slurm Sesi Interactive EFIRO
COMCOT V -
GAMESS V -
GROMACS V -
NAMD V -
NWChem V -
ORCA V -
PHASE/0 V -
Quantum ESPRESSO V -
R Untuk file .R siap jalan.

Tidak support file .ipynb.

Jupyter Notebook / Lab
Python1 Untuk file .py siap jalan.

Tidak support file .ipynb.

Jupyter Notebook / Lab
CP2K V -
FLACS-CFD V ALELEON Desktop
LAMMPS V -
DFTB+ V -
OpenMX V -
AmberTools V -
Note:
  1. Python mengacu interpreter dan library komputasi seperti TensorFlow, Scikit, PyTorch, Keras, Pandas, dll. User melakukan instalasi mandiri untuk package tersebut.
Diperoleh dari "https://wiki.efisonlt.com/index.php?title=Daftar_Software_Komputasi_dan_Tutorial_Penggunaan&oldid=1703"