|
|
| (31 revisi perantara oleh pengguna yang sama tidak ditampilkan) |
| Baris 1: |
Baris 1: |
| Halaman ini merangkum semua daftar software komputasi pada ALELEON Supercomputer dan tutorial penggunaannya. | | Halaman ini merangkum semua daftar software komputasi pada ALELEON Supercomputer dan tutorial penggunaannya. |
| | | {| class="wikitable" |
| == '''Kredit Core Hour''' ==
| | ! colspan="2" |Software Komputasi dan Tutorial |
| Sebelum melakukan komputasi, user disarankan mengecek kuota [[Core Hour|'''Kredit Core Hour''']] karena dibutuhkan untuk menjalankan komputasi di ALELEON Supercomputer.
| |
| | |
| * Buka terminal melalui '''dashboard EFIRO Clusters > ALELEON Shell Access'''
| |
| [[Berkas:Shellaccess.png|nirbing|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Shellaccess.png|al=|200x200px]]
| |
| * Jalankan perintah <code>sausage</code>[[Berkas:Sausage.png|nir|jmpl|'''Perintah sausage memperlihatkan sisa kredit CCH dan GH user'''|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Sausage.png]]
| |
| | |
| Kuota pada kredit Core Hour akan berkurang sesuai dengan resources CPU / GPU yang dialokasikan user saat menjalankan komputasi di ALELEON Supercomputer.
| |
| | |
| == '''Job Composer dan Interactive Apps''' ==
| |
| Terdapat dua metode untuk menjalankan komputasi di ALELEON Supercomputer yaitu Job Composer dan Interactive Apps.
| |
| {| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed" | |
| !Menjalankan Komputasi via Job Composer | |
| |- | | |- |
| |[[Berkas:Efirojobcomposer2.png|nir|jmpl|'''Halaman Job Composer. Diakses melalui menu Jobs > Job Composer di dashboard EFIRO.'''|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Efirojobcomposer2.png]] | | !'''<big><nowiki/></big>''' |
| *Cara utama untuk menjalankan '''semua software komputasi''' di ALELEON Supercomputer.
| | |'''<big>[<nowiki/>[[COMCOT]]]</big>''' |
| *Job Composer menjalankan software pada '''[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Spesifikasi_ALELEON_Supercomputer#Spesifikasi_Hardware:_Compute_Node Compute Node]''' - bagian server komputasi ALELEON Supercomputer terkencang untuk menjalankan berbagai level komputasi dari kecil hingga besar.
| | |- |
| *Job Composer bekerja dengan model '''''job submission'':''' software komputasi dijalankan oleh sistem berdasarkan serangkaian template, formulir, dan script yang didefinisikan user.
| | ![[Berkas:Logo GAMESS ALELEON tp.png|nirbing|150x150px]] |
| |} | | |'''<big>[<nowiki/>[[GAMESS]]]</big>''' |
| {| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
| | |- |
| !Menjalankan Komputasi via Interactive Apps
| | ![[Berkas:Logo GROMACS ALELEON tp.png|nirbing|200x200px]]'''<big>]</big>''' |
| | |'''<big>[<nowiki/>[[GROMACS]]]</big>''' |
| | |- |
| | ![[Berkas:Logo NAMD ALELEON tp.png|nirbing|200x200px]] |
| | |'''<big>[<nowiki/>[[NAMD]]]</big>''' |
| | |- |
| | ![[Berkas:Logo NWChem ALELEON tp.png|nirbing|200x200px]] |
| | |'''<big>[<nowiki/>[[NWChem]]]</big>''' |
| |- | | |- |
| |[[Berkas:Jupyterefiro.png|nir|jmpl|'''Contoh salah satu interactive apps: Jupyter Notebook, diakses melalui menu Interactive Apps di dashboard EFIRO.'''|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Jupyterefiro.png]]
| | ![[Berkas:Logo ORCA ALELEON tp.png|nirbing|120x120px]] |
| *'''Interactive Apps''' adalah aplikasi yang dapat dijalankan secara '''interaktif''' (langsung) oleh user.
| | |'''<big>[<nowiki/>[[ORCA]]]</big>''' |
| *Interactive Apps berjalan pada '''[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Spesifikasi_ALELEON_Supercomputer#Spesifikasi_Hardware:_Interactive_Node Interactive Node]''' - bagian server komputasi ALELEON Supercomputer untuk menjalankan semua Interactive Apps.
| |
| *Interactive Node mempunyai '''spesifikasi hardware terbatas''' sehingga lebih cocok digunakan untuk komputasi skala kecil atau pengujian jalannya software / script. Gunakan '''Job Composer''' untuk melakukan komputasi skala besar.
| |
| |}
| |
| | |
| =='''Software Komputasi dan Tutorial'''==
| |
| {| class="wikitable sortable mw-collapsible"
| |
| !Software
| |
| Komputasi
| |
| !Dukungan
| |
| Penggunaan
| |
| |- | | |- |
| |'''COMCOT''' | | ![[Berkas:Logo PHASE ALELEON tp.png|nirbing|113x113px]] |
| |'''[[COMCOT|Job Composer]]''' | | |'''<big>[<nowiki/>[[PHASE/0]]]</big>''' |
| |- | | |- |
| |'''GAMESS''' | | ![[Berkas:Logo QE ALELEON tp.png|nirbing|200x200px]] |
| |'''[[GAMESS|Job Composer]]''' | | |'''<big>[<nowiki/>[[Quantum ESPRESSO]]]</big>''' |
| |- | | |- |
| |'''GROMACS''' | | ![[Berkas:Logo R ALELEON tp.png|nirbing|120x120px]] |
| |'''[[GROMACS|Job Composer]]''' | | |'''<big>[<nowiki/>[[R]]]</big>''' |
| |- | | |- |
| |'''NAMD''' | | ![[Berkas:Logo Python ALELEON tp.png|nirbing|135x135px]] |
| |'''[[NAMD|Job Composer]]''' | | |'''<big>[<nowiki/>[[Komputasi Python|Python''<sup>1</sup>'']]]</big>''' |
| |- | | |- |
| |'''NWChem''' | | ![[Berkas:Logo CP2K ALELEON tp.png|nirbing|120x120px]] |
| |'''[[NWChem|Job Composer]]''' | | |'''<big>[<nowiki/>[[CP2K]]]</big>''' |
| |- | | |- |
| |'''ORCA''' | | ![[Berkas:Logo FLACS ALELEON tp.png|nirbing|117x117px]] |
| |'''[[ORCA|Job Composer]]''' | | |'''<big>[<nowiki/>[[FLACS-CFD]]]</big>''' |
| |- | | |- |
| |'''PHASE/0''' | | ![[Berkas:Logo LAMMPS ALELEON tp.png|nirbing|180x180px]] |
| |'''[[PHASE/0|Job Composer]]''' | | |'''<big>[<nowiki/>[[LAMMPS]]]</big>''' |
| |- | | |- |
| |'''R'''
| | ![[Berkas:Logo DFTB ALELEON tp.png|nirbing|109x109px]] |
| |
| | |<big>['''[[DFTB+]]''']</big> |
| *'''[[R menggunakan Job Composer|Job Composer]]'''
| |
| *'''Interactive Apps:'''
| |
| ** '''[[R menggunakan Jupyter Notebook|Jupyter Notebook]]'''
| |
| |- | | |- |
| |'''Komputasi Python''' | | ![[Berkas:Logo OpenMX ALELEON tp.png|nirbing|108x108px]] |
| Mencakup:
| | |'''<big>[<nowiki/>[[OpenMX]]]</big>''' |
| | | |} |
| * TensorFlow
| | {| class="wikitable" |
| * PyTorch
| | |'''Note:''' |
| * Keras
| | # ''Python mengacu interpreter dan package seperti TensorFlow, Scikit, PyTorch, Keras, Pandas, dll..'' |
| * dll
| |
| | | |
| *'''[[TensorFlow menggunakan Job Composer|Job Composer]]'''
| |
| *'''Interactive Apps:'''
| |
| ** '''[[TensorFlow menggunakan Jupyter Notebook|Jupyter Notebook]]'''
| |
| |} | | |} |
| __TANPADAFTARISI__
| |
|
| |
| == '''Interactive Apps''' ==
| |
| ''(coming soon)''
| |
]
