Daftar Software Komputasi dan Tutorial Penggunaan: Perbedaan antara revisi

Dari ALELEON by EFISON
(new format)
(→‎Daftar Software Komputasi dan Tutorial: menambah nama EFIRO di sesi interactive)
(23 revisi perantara oleh pengguna yang sama tidak ditampilkan)
Baris 1: Baris 1:
Halaman ini merangkum daftar software komputasi pada ALELEON Supercomputer dan tutorial penggunaannya.
Halaman ini merangkum semua daftar software komputasi pada ALELEON Supercomputer dan tutorial penggunaannya.  
* Dilengkapi dengan kompabilitas menjalankan software tersebut pada Job Composer atau Interactive Apps.


{| class="wikitable sortable"
== '''Mengecek Kredit Core Hour bagi Akun Perseorangan''' ==
!Daftar Software dan tutorial penggunaan
User dengan akun perseorangan mempunyai kuota komputasi bernama [[Core Hour|'''Kredit Core Hour''']]. User disarankan untuk selalu mengecek sisa Kredit Core Hour sebelum melakukan komputasi dengan langkah berikut:
|-
|[[Berkas:R.png|nirbing|100x100px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:R.png]]
 
===R ===
{| class="wikitable"
|-
|
===[[R menggunakan Job Composer|Job Composer]]===
|-
|
===[[R menggunakan Jupyter Notebook|Interactive Apps: Jupyter Notebook]]===
|}
|-
|
=== MPI (Template Umum) '''''(coming soon)''''' ===
 
* Tutorial menjalankan program MPI secara umum di Job Composer.
* Mencakup Pure MPI dan Hybrid MPI.
{| class="wikitable"
{| class="wikitable"
|1
|Buka terminal (bagi pengguna EFIRO, buka menu '''<code>Clusters</code> > <code>Aleleon Shell Access</code>'''
|-
|-
|
|2
=== Job Composer ===
|Jalankan perintah 'sausage'.
$ '''sausage'''
|}
|}
|-
|[[Berkas:Python logo.png|nirbing|110x110px]]
=== Python (Template Umum) ''(coming soon)'' ===
* Tutorial menjalankan program Python secara umum.
{| class="wikitable"
|-
|
=== Job Composer ===
|-
|
=== Interactive Apps: Jupyter Notebook ===
|}
|-
|
=== Default Job ''(coming soon)'' ===
* Tutorial mengenal template default job pada Job Composer.
* Untuk menjalankan program apapun di Compute Node CPU.
{| class="wikitable"
|-
|
=== Job Composer ===
|}
|-
|[[Berkas:GROMACS.png|nirbing|200x200px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:GROMACS.png]]
==='''GROMACS'''===
{| class="wikitable"
|-
|
=== [[GROMACS|Job Composer]] ===
|}
|-
|[[Berkas:Nwhem.png|nirbing|200x200px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Nwhem.png]]


===NWChem ===
=='''Daftar Software Komputasi dan Tutorial'''==
{| class="wikitable"
{| class="wikitable sortable mw-collapsible"
! rowspan="2" |Software Komputasi dan Tutorial
! colspan="2" |Dukungan Penggunaan
|-
|-
|
!SLURM sbatch / Job Composer
=== [[NWChem|Job Composer]] ===
!Sesi Interactive EFIRO
|}
|-
|-
|[[Berkas:Quantum ogo ok.png|nirbing|250x250px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Quantum_ogo_ok.png]]
|'''[[COMCOT]]'''
 
|V
===Quantum ESPRESSO ===
|X
{| class="wikitable"
|-
|-
|
|'''[[GAMESS]]'''
=== [[Quantum ESPRESSO|Job Composer]] ===
|V
|}
|X
|-
|-
|[[Berkas:GAMESS.png|nirbing|200x200px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:GAMESS.png]]
|'''[[GROMACS]]'''
 
|V
===GAMESS ===
|X
{| class="wikitable"
|-
|-
|
|'''[[NAMD]]'''
=== [[GAMESS|Job Composer]] ===
|V
|}
|X
|-
|-
|[[Berkas:NAMDsof.png|nirbing|250x250px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:NAMDsof.png]]
|'''[[NWChem]]'''
 
|V
===NAMD ===
|X
{| class="wikitable"
|-
|-
|
|'''[[ORCA]]'''
=== [[NAMD|Job Composer]] ===
|V
|}
|X
|-
|-
|[[Berkas:Orca logo.png|nirbing|120x120px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Orca_logo.png|al=]]
|'''[[PHASE/0]]'''
 
|V
===ORCA ===
|X
{| class="wikitable"
|-
|-
|
|'''[[Quantum ESPRESSO]]'''
=== [[ORCA|Job Composer]] ===
|V
|}
|X
|-
|-
|[[Berkas:TF.png|nirbing|200x200px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:TF.png]]
|'''R'''
 
|Untuk program .R siap jalan.
===TensorFlow ''(coming soon)''===
'''''Tidak support file .ipynb.'''''
{| class="wikitable"
|Jupyter Lab
|-
|-
|
|'''Python<small><sup>''1''</sup></small>''' '''''via Anaconda'''''
=== Job Composer ===
|Untuk program '''.py''' siap jalan.
'''''Tidak support file .ipynb'''''.
|Jupyter Lab
|-
|-
|
|'''[[CP2K]]'''
=== Interactive Apps: Jupyter Notebook ===
|V
|}
|X
|-
|-
|[[Berkas:Phase-logo4.png|nirbing|100x100px|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Phase-logo4.png]]
|'''Blender'''
 
|V
===PHASE/0 ===
|ALELEON Desktop
{| class="wikitable"
|-
|-
|
|'''[[SPECFEM3D]]'''
=== [[PHASE/0|Job Composer]] ===
|V
|}
|X
|-
|-
|
|'''FLACS'''
===COMCOT===
|V
{| class="wikitable"
|ALELEON Desktop
|-
|
=== [[COMCOT|Job Composer]] ===
|}
|}
|-
'''Note:'''
|
=== ALELEON Desktop ===
 
* Menjalankan sesi VDI (Virtual Desktop Interface) berbasiskan OS CentOS


{| class="wikitable"
# Python mengacu interpreter dan library komputasi seperti TensorFlow, Scikit, PyTorch, Keras, Pandas, dll
|
=== Interactive Apps: ALELEON Desktop ===
|}
|}
__TANPADAFTARISI__

Revisi per 24 November 2022 05.04

Halaman ini merangkum semua daftar software komputasi pada ALELEON Supercomputer dan tutorial penggunaannya.

Mengecek Kredit Core Hour bagi Akun Perseorangan

User dengan akun perseorangan mempunyai kuota komputasi bernama Kredit Core Hour. User disarankan untuk selalu mengecek sisa Kredit Core Hour sebelum melakukan komputasi dengan langkah berikut:

1 Buka terminal (bagi pengguna EFIRO, buka menu Clusters > Aleleon Shell Access
2 Jalankan perintah 'sausage'. 
$ sausage

Daftar Software Komputasi dan Tutorial

Software Komputasi dan Tutorial Dukungan Penggunaan
SLURM sbatch / Job Composer Sesi Interactive EFIRO
COMCOT V X
GAMESS V X
GROMACS V X
NAMD V X
NWChem V X
ORCA V X
PHASE/0 V X
Quantum ESPRESSO V X
R Untuk program .R siap jalan.

Tidak support file .ipynb.

Jupyter Lab
Python1 via Anaconda Untuk program .py siap jalan.

Tidak support file .ipynb.

Jupyter Lab
CP2K V X
Blender V ALELEON Desktop
SPECFEM3D V X
FLACS V ALELEON Desktop

Note:

  1. Python mengacu interpreter dan library komputasi seperti TensorFlow, Scikit, PyTorch, Keras, Pandas, dll
Diperoleh dari "https://wiki.efisonlt.com/index.php?title=Daftar_Software_Komputasi_dan_Tutorial_Penggunaan&oldid=919"