R

R adalah bahasa interpreter yang didesain untuk mengerjakan komputasi statistika. Pada perkembangannya, bahasa R digunakan untuk pengolahan data di bidang data science. Software R didukung oleh The R Foundation for Statistical Computing.

Wololo w00t!

Halaman ini masih sedang dalam proses penulisan dan belum final!

Modul R

Berikut adalah detail versi R yang tersedia secara global di ALELEON Supercomputer:

Modul R

Versi	Nama modul	Modul DEFAULT	Dukungan hardware
			CPU	GPU	OMP Threading	MPI multi-node
4.1.0 "Camp Pontanezen"	R/4.1.0-GCC10-MKL	-	V	-	-	V melalui RMPI
4.1.2 "Bird Hippie"	R/4.1.2-GCC10-MKL	V	V	-	-

Alternatif Menjalankan R di ALELEON Supercomputer

ALELEON Supercomputer menawarkan user untuk menjalankan R dengan skema job submission melalui scheduler atau interaktif melalui sesi Jupyter Notebook / Lab dengan detail penjelasan berikut:

Menjalankan R melalui Job Submission Menjalankan file R siap jalan melalui scheduler dan script dengan skema EFIRO Job Composer (tampilan GUI via EFIRO) atau SLURM sbatch via Terminal. Berjalan di Compute Node CPU Partisi epyc.

Menjalankan R dengan sesi interaktif Jupyter Menjalankan R melalui sesi interaktif via Jupyter Notebook atau Lab. Berjalan di Interactive Node Partisi Torti.

Instalasi Library Package R

Instalasi library R pada ALELEON Supercomputer dapat dilakukan dengan alternatif cara:

1. Melayangkan permintaan instalasi package ke admin melalui email support@efisonlt.com; atau
2. Melakukan instalasi mandiri dengan langkah berikut:

Panduan instalasi mandiri Package R

0A	Instalasi package dilakukan melalui terminal.
0B	Bagi user EFIRO, buka terminal melalui dashboard EFIRO menu Clusters > Aleleon Shell Access.
1	Aktifkan R dengan memuat modul versi R yang akan digunakan. Versi Perintah Terminal 4.1.0 $ module load R/4.1.0-GCC10-MKL 4.1.2 $ module load R Perlu diperhatikan bahwa package R yang diinstal di versi 4.1.2 misalnya tidak dapat digunakan oleh R versi lainnya dan sebaliknya.
2	Jalankan R dan lakukan instalasi package dengan format perintah standar: $ R > install.packages('nama-package-yang-akan-diinstal') Package akan terinstal di direktori HOME user.
X	Bagi user yang pertama kali melakukan instalasi package R: Akan terdapat peringatan bahwa user tidak dapat melakukan instalasi package R di direktori global /work (di mana benar karena hanya user root yang dapat melakukannya), jawab yes. Warning in install.packages("benchmarkme") : 'lib = "/comp/R/4.1.2-GCC10-MKL/lib64/R/library"' is not writable Would you like to use a personal library instead? (yes/No/cancel) yes R akan meminta izin untuk menginstal package R di direktori HOME user dan membuat folder bernama R. Jawab yes. Would you like to create a personal library ‘~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1’ to install packages into? (yes/No/cancel) yes

Kontributor

EFISON mengucapkan terima kasih kepada para kontributor untuk pengujian R di ALELEON Supercomputer yang kemudian menjadi dasar penulisan tutorial di halaman ini:

• Tim Sadasa Academy.