|
|
| (64 revisi perantara oleh pengguna yang sama tidak ditampilkan) |
| Baris 1: |
Baris 1: |
| Halaman ini merangkum urutan tutorial penggunaan dan semua informasi teknis untuk menggunakan ALELEON Supercomputer.
| | == '''Opsi Menggunakan ALELEON Supercomputer''' == |
| | ALELEON Supercomputer memberikan dua opsi penggunaan yaitu: |
| | |
| | * Tampilan terminal |
| | * Tampilan grafis (GUI) via web service EFIRO dengan fitur eksklusif sesi interaktif Jupyter (untuk user yang menjalankan komputasi Python, AI, Deep Learning, R, dll) dan virtual desktop. |
| | ''User bisa mengakses keduanya dalam waktu bersamaan.'' |
| {| class="wikitable" | | {| class="wikitable" |
| !Tutorial ALELEON Supercomputer | | |+Silahkan pilih cara menggunakan ALELEON Supercomputer sesuai preferensi user: |
| | ! |
| | === [[Menggunakan ALELEON Supercomputer via Terminal|MENGGUNAKAN ALELEON Supercomputer via TERMINAL]] === |
| | [[Berkas:Efiroshell.png|nirbing]] |
| | |
| | ''100% terminal dan tradisional'' |
| |- | | |- |
| |[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Tutorial_Menggunakan_ALELEON_Supercomputer#1_-_Koneksi_VPN_dan_Login_EFIRO '''Login''']
| | ! |
| |-
| | === [[Menggunakan ALELEON Supercomputer via EFIRO|MENGGUNAKAN ALELEON Supercomputer via web service EFIRO]] === |
| |[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Tutorial_Menggunakan_ALELEON_Supercomputer#2_-_Selamat_Datang_di_Dashboard_EFIRO '''Dashboard EFIRO''']
| | [[Berkas:Efirodashboardshort2.png|900x900px]] |
| |- | | |
| |[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Tutorial_Menggunakan_ALELEON_Supercomputer#3_-_Job_Composer:_Menjalankan_Komputasi_.28Job_Submission.29 '''Menjalankan komputasi via Job Composer EFIRO''']
| | ''Tampilan grafis + sesi interaktif'' |
| * [[SLURM Script ALELEON Supercomputer|'''Panduan mengisi SLURM Script untuk menjalankan job''']]
| |
| * [[Optimasi Performa ALELEON Supercomputer|'''Panduan optimasi performa dalam menggunakan ALELEON Supercomputer''']]
| |
| |} | | |} |
| | {{DEFAULTSORT:tutorial}} |
|
| |
|
| == '''Mengenalkan EFIRO OnDemand''' == | | == '''Support dan Laporan Kendala Penggunaan''' == |
| User menggunakan ALELEON Supercomputer melalui EFIRO OnDemand atau disingkat '''EFIRO -''' konsol tampilan grafis (GUI) untuk mengakses ALELEON Supercomputer melalui web browser.
| | Apabila menjumpai masalah teknis ketika menggunakan ALELEON Supercomputer, silahkan lapor dengan klik gambar berikut ini: |
| | |
| [[Berkas:Efirodashboardshort.png|al=|700x700px]]
| |
| | |
| ---
| |
| | |
| === ''Doing the old way?'' Login SSH dan Terminal Linux ===
| |
| ALELEON Supercomputer '''tetap membuka akses login SSH''' untuk user yang memilih tampilan terminal Linux EFISON menyediakan [[Menggunakan ALELEON Supercomputer via Terminal|'''tutorial terpisah untuk menggunakan ALELEON Supercomputer melalui terminal''']].
| |
| | |
| == '''1 - Koneksi VPN dan Login EFIRO''' ==
| |
| Langkah pertama untuk mengakses ALELEON Supercomputer adalah [[Koneksi VPN ALELEON Supercomputer|'''menghubungkan perangkat user ke koneksi VPN ALELEON Supercomputer''']] demi keamanan jaringan dan data user.
| |
|
| |
|
| Setelah terhubung ke VPN, user dapat mengakses EFIRO melalui alamat:
| | [[Berkas:Wiki-pelaporankendala.jpg|1000x1000px|link=https://efisonlt.com/aleleonbugreport]] |
| '''http://efisonlt.ood'''
| |
| Kemudian masukkan '''username dan password user''' '''ALELEON Supercomputer'''.
| |
|
| |
|
| == '''2 - Selamat Datang di Dashboard EFIRO''' ==
| | Apabila butuh support lainnya, hubungi admin melalui email: |
| Setelah login, user masuk ke dalam dashboard EFIRO yang menjadi ''central hub'' bagi user untuk menggunakan ALELEON Supercomputer.
| | '''support@efisonlt.com''' |
|
| |
|
| [[Berkas:Efiromenubarbig.png|al=|800x800px]]
| | == '''Info Cepat''' == |
| | | Berikut adalah ''shortcut'' untuk info teknis lainnya: |
| * Halaman '''Files > Home Directory''' menampilkan isi direktori HOME user. User dapat melakukan manajemen file melalui deretan menu di bagian atas halaman seperti upload, download, copy, rename, delete, dll.
| |
| | |
| [[Berkas:Efiroftp3.png|al=|nirbing|600x600px]]
| |
| ----
| |
| | |
| * Halaman '''Jobs > Active Jobs''' menampilkan daftar job komputasi beserta statusnya yang sedang berjalan di ALELEON Supercomputer.
| |
| | |
| [[Berkas:Efiroqueueedit.png|al=|nirbing|600x600px]]
| |
| ----
| |
| | |
| * Halaman '''Clusters > Aleleon Shell Access''' menampilkan terminal Linux (shell) ALELEON Supercomputer.
| |
| [[Berkas:Efiroshell.png|al=|nirbing|400x400px]]
| |
| | |
| =='''3 - Job Composer: Menjalankan Komputasi (''Job Submission'')'''==
| |
| [[Berkas:Efirojobcomposer2.png|al=|nirbing|600x600px]]
| |
| | |
| Halaman Jobs > '''Job Composer''' adalah tempat bagi user untuk membuat dan menjalankan komputasi (disebut sebagai '''<nowiki/>'job'''') di Compute Node ALELEON Supercomputer.
| |
| {| class="wikitable" | | {| class="wikitable" |
| ! colspan="2" |Langkah Menggunakan Job Composer
| |
| |- | | |- |
| |1
| | ! |
| |[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Tutorial_Menggunakan_ALELEON_Supercomputer#1._Membuat_job_baru_dan_memilih_template_job '''Membuat job baru dan memilih template job''']
| |
| |-
| |
| |2
| |
| |[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Tutorial_Menggunakan_ALELEON_Supercomputer#2._Mempersiapkan_file_program_yang_akan_dijalankan '''Mempersiapkan file program yang akan dijalankan''']
| |
| |-
| |
| |3
| |
| |[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Tutorial_Menggunakan_ALELEON_Supercomputer#3._Mengisi_.28SLURM.29_Submit_Script '''Mengisi Submit Script''']
| |
| * [[SLURM Script ALELEON Supercomputer|'''Panduan mengisi Submit Script''']]
| |
| |-
| |
| |4
| |
| |[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Tutorial_Menggunakan_ALELEON_Supercomputer#4._Submit_job_dan_memantau_jalannya_job '''Submit Job dan memantau jalannya job''']
| |
| |}
| |
| ----
| |
| ----
| |
|
| |
|
| === 1. Membuat job baru dan memilih template job ===
| |
| User membuat job baru melalui menu '''New Job.'''
| |
|
| |
|
| [[Berkas:Jcnewjob.png|al=|nirbing|200x200px]] | | [[Berkas:Wiki-15.jpg|1000x1000px |link=Daftar Software Komputasi dan Tutorial Penggunaan |alt=Daftar Software Komputasi dan Tutorial Penggunaan]] |
|
| |
|
| Pilihan New Job yang direkomendasikan:
| | Memuat info daftar software komputasi beserta tutorial penggunannya dan template submit script |
|
| |
|
| * '''From Default Template'''
| | |- |
| ** Template job default yang dapat digunakan untuk menjalankan job apapun di mana user menulis sendiri perintah jalannya program.
| | ! |
| * '''From Template'''
| |
| ** Tersedia template yang dibuat oleh EFISON untuk menjalankan job software komputasi tertentu seperti GROMACS, QE, NAMD, R, dll dan skenario tertentu seperti MPI, Hybrid MPI/OMP. BLAS, dll.
| |
| ** User juga dapat membuat template job sendiri.
| |
| ** User dapat menyampaikan permintaan kepada admin EFISON untuk pembuatan template tertentu.
| |
|
| |
|
| ---
| |
|
| |
|
| ==== Opsi From Template ====
| | [[Berkas:Banner Katalog 1 4 2.jpg|1000x1000px |link=Katalog Software ALELEON Supercomputer |alt=Katalog Software ALELEON Supercomputer ]] |
| Apabila user memilih opsi '''From Template,''' langkah berikutnya adalah memilih template yang akan digunakan dan isi kolom '''Job Name''' untuk kerapian manajemen job user''',''' setelah itu klik '''Create New Job'''.
| |
| [[Berkas:Jcselecttemplate2.png|al=|nirbing|600x600px]] | |
| ----
| |
| ----
| |
|
| |
|
| === 2. Mempersiapkan file program yang akan dijalankan ===
| | Memuat info lengkap katalog software ALELEON Supercomputer: |
| Berikutnya user mempersiapkan file yang dibutuhkan untuk menjalankan program tersebut seperti file input, config, binary program. Tersedia dua opsi:
| | |- |
| | ! |
|
| |
|
| [[Berkas:Jcjoboption.png|al=|nirbing|600x600px]]
| |
|
| |
|
| *'''Edit Files'''
| | [[Berkas:Wiki-14edit.jpg|al=SLURM Script ALELEON Supercomputer|1000x1000px |link=Submit Script ALELEON Supercomputer ]] |
| ** Membuka halaman manajemen file untuk ruang job yang dipilih.
| |
| ** User dapat melakukan manajemen file seperti upload, download, editing file script, rename, dll.[[Berkas:Jcfilemanagement.png|al=|nirbing|600x600px]]
| |
| * '''Open Terminal'''
| |
| ** Membuka ruang job melalui terminal
| |
| ** Dapat melakukan kebutuhan yang membutuhkan terminal seperti compiling.
| |
| ----
| |
| ----
| |
|
| |
|
| === 3. Mengisi (SLURM) Submit Script ===
| | Memuat detail info Submit Script untuk melakukan job submission di ALELEON Supercomputer: |
| Langkah berikutnya adalah mengisi Submit Script (terletak di kanan bawah halaman Jobs). Submit Script adalah bash script yang '''memerintahkan program manajemen superkomputer untuk menjalankan job komputasi user ke Compute Node.''' ALELEON Supercomputer menggunakan manajemen [https://slurm.schedmd.com/documentation.html '''SLURM'''] sehingga Submit Script ini disebut sebagai '''SLURM Script'''.
| | |- |
| | | ! |
| [[Berkas:Jcsubmits.png|al=|nirbing|400x400px|tepi]]
| |
| | |
| User dapat menulis atau mengubah Submit Script yang telah disediakan melalui menu '''Open Editor'''.
| |
| | |
| [[Berkas:Jceditor.png|al=|nirbing|500x500px]]
| |
|
| |
|
| ---
| |
|
| |
|
| ==== Mengisi SLURM Script ==== | | [[Berkas:Wiki-13.jpg|1000x1000px |link=MPI ALELEON Supercomputer |alt=MPI ALELEON Supercomputer]] |
| Admin EFISON merangkum panduan lengkap untuk memahami dan mengedit SLURM Script pada laman berikut:
| |
|
| |
|
| [[Berkas:Wiki-14.jpg|1000x1000px|link=SLURM Script ALELEON Supercomputer |alt=SLURM Script ALELEON Supercomputer ]]
| | Memuat info menjalankan program paralel MPI di ALELEON Supercomputer: |
| | |
| ---
| |
| | |
| ==== Jangan Lupa Save Setelah Mengedit Submit Script! ====
| |
| [[Berkas:Jcsaveedit.png|nirbing|400x400px]]
| |
| ----
| |
| ----
| |
| | |
| === 4. Submit job dan memantau jalannya job ===
| |
| Semua file untuk menjalankan program dan Submit Script sudah siap? Jalankan job tersebut dengan menekan tombol '''Submit'''.
| |
| | |
| [[Berkas:Jcsubmit.png|nirbing|700x700px|al=]]
| |
| | |
| Perhatikan kolom '''Status''' pada job tersebut. User dapat memantau perubahan kolom Status dengan me-refresh halaman Job. Berikut adalah daftar Status yang terjadi:
| |
| {| class="wikitable"
| |
| |+Status jalannya Job
| |
| !Status
| |
| !Arti
| |
| |-
| |
| |Not Submitted
| |
| |Job belum pernah dijalankan
| |
| |-
| |
| |Running
| |
| |Job berjalan
| |
| |-
| |
| |Queue
| |
| |Job mengantri dan belum berjalan
| |
| |-
| |
| |Completed
| |
| |Job selesai berjalan
| |
| |-
| |
| |Failed
| |
| |Job berhenti di tengah berjalan.
| |
| Bisa karena di Stop atau Delete oleh user atau server tiba-tiba mati.
| |
| |} | | |} |
| Apabila user ingin menghentikan job yang sedang berjalan, klik tombol '''Stop''' yang berada di sebelah tombol Submit.
| |
|
| |
| ---
| |
|
| |
| ==== Melihat Hasil Job yang Selesai ====
| |
| Apabila job sudah selesai berjalan, user dapat melihat hasil file yang dihasilkan melalui '''Edit Pages''' atau melihat secara cepat pada kolom '''Folder Contents'''.
| |
|
| |
| [[Berkas:Jcfoldercontentsedit.png|al=|nirbing|399x399px]]
| |
|
| |
| ---
| |
|
| |
| ==== Submit Ulang Job ====
| |
| User dapat menjalankan ulang job yang sudah selesai dengan mengklik kembali tombol Submit.
| |
|
| |
| {{DEFAULTSORT:tutorial}}
| |
| __TANPADAFTARISI__
| |
