Tutorial Menggunakan ALELEON Supercomputer: Perbedaan antara revisi

Dari ALELEON by EFISON
(paraphrasing)
 
(63 revisi perantara oleh pengguna yang sama tidak ditampilkan)
Baris 1: Baris 1:
Halaman ini merangkum urutan tutorial penggunaan dan semua informasi teknis untuk menggunakan ALELEON Supercomputer.
Halaman ini menjelaskan tutorial dan info teknis untuk menggunakan ALELEON Supercomputer.  
== '''Mengenalkan EFIRO OnDemand''' ==
User menggunakan ALELEON Supercomputer melalui EFIRO OnDemand atau disingkat '''EFIRO -''' konsol tampilan grafis (GUI) untuk mengakses ALELEON Supercomputer melalui web browser.  


[[Berkas:Efirodashboardshort.png|al=|700x700px]]
== '''1 | Terhubung ke Jaringan VPN ALELEON Supercomputer''' ==
Kebijakan keamanan ALELEON Supercomputer mewajibkan user untuk login melalui koneksi VPN yang dibuat oleh EFISON.


---
* Langkah membuat dan terhubung ke VPN ALELEON Supercomputer dijelaskan pada laman [[Koneksi VPN ALELEON Supercomputer|'''Koneksi VPN ALELEON Supercomputer''']].


=== ''Doing the old way?'' Login SSH dan Terminal Linux ===
=='''2 | Opsi Menggunakan ALELEON Supercomputer'''==
ALELEON Supercomputer '''tetap membuka akses login SSH''' untuk user yang memilih tampilan terminal Linux EFISON menyediakan [[Menggunakan ALELEON Supercomputer via Terminal|'''tutorial terpisah untuk menggunakan ALELEON Supercomputer melalui terminal''']].
ALELEON Supercomputer memberikan dua opsi login dan penggunaan yaitu:


== '''1 - Koneksi VPN dan Login EFIRO''' ==
* Penggunaan via terminal dan login SSH.
Langkah pertama untuk mengakses ALELEON Supercomputer adalah [[Koneksi VPN ALELEON Supercomputer|'''menghubungkan perangkat user ke koneksi VPN ALELEON Supercomputer''']] demi keamanan jaringan dan data user.
* Penggunaan tampilan grafis via web service EFIRO'''.'''
{| class="wikitable"
|+Silahkan pilih cara menggunakan ALELEON Supercomputer sesuai preferensi user:
!
=== [[Menggunakan ALELEON Supercomputer via Terminal|MENGGUNAKAN ALELEON Supercomputer via TERMINAL]] ===
[[Berkas:Efiroshell.png|nirbing]]


Setelah terhubung ke VPN, user dapat mengakses EFIRO melalui alamat:
''100% tradisional: CLI dan Linux all the way!''
'''http://efisonlt.ood'''
|-
Kemudian masukkan '''username dan password user''' '''ALELEON Supercomputer'''.
!
=== [[Menggunakan ALELEON Supercomputer via EFIRO|MENGGUNAKAN ALELEON Supercomputer via web service EFIRO]] ===
[[Berkas:Efirodashboardshort2.png|900x900px]]


== '''2 - Selamat Datang di Dashboard EFIRO''' ==
''Dengan fitur eksklusif: Job composer, sesi interaktif Jupyter Notebook / Lab, dan virtual desktop ALELEON Desktop.''
Setelah login, user masuk ke dalam dashboard EFIRO yang menjadi ''central hub'' bagi user untuk menggunakan ALELEON Supercomputer. 
|}
{{DEFAULTSORT:tutorial}}


[[Berkas:Efiromenubarbig.png|al=|800x800px]]
== '''3 | Support dan Laporan Kendala Penggunaan''' ==
Apabila membutuhkan layanan support dan menjumpai masalah teknis dalam menggunakan ALELEON Supercomputer, silahkan lapor dengan klik gambar berikut ini.


* Halaman '''Files > Home Directory''' menampilkan isi direktori HOME user. User dapat melakukan manajemen file melalui deretan menu di bagian atas halaman seperti upload, download, copy, rename, delete, dll.
[[Berkas:Wiki-pelaporankendala.jpg|1000x1000px|link=https://efisonlt.com/aleleonbugreport]]


[[Berkas:Efiroftp3.png|al=|nirbing|600x600px]]
== '''Info Cepat''' ==
----
Berikut adalah ''shortcut'' untuk info teknis lainnya yang esensial dalam menggunakan ALELEON Supercomputer:
{| class="wikitable"
|-
|
=== Daftar Software Komputasi dan Tutorial Penggunaan ===
[[Berkas:Wiki-15.jpg|1000x1000px |link=Daftar Software Komputasi dan Tutorial Penggunaan |alt=Daftar Software Komputasi dan Tutorial Penggunaan]]


* Halaman '''Jobs > Active Jobs''' menampilkan daftar job komputasi beserta statusnya yang sedang berjalan di ALELEON Supercomputer.
Memuat info daftar software komputasi beserta tutorial penggunannya:


[[Berkas:Efiroqueueedit.png|al=|nirbing|600x600px]]
* Daftar modul software yang terinstal.
----
* Template SLURM Submit Script.
* Info teknis lainnya yang perlu diperhatikan.
|-
|
=== Katalog Software ALELEON Supercomputer ===
[[Berkas:Banner Katalog 1 4 2.jpg|1000x1000px |link=Katalog Software ALELEON Supercomputer |alt=Katalog Software ALELEON Supercomputer ]]


* Halaman '''Clusters > Aleleon Shell Access''' menampilkan terminal Linux (shell) ALELEON Supercomputer.
Memuat info lengkap katalog software ALELEON Supercomputer:  
[[Berkas:Efiroshell.png|al=|nirbing|400x400px]]


=='''3 - Job Composer: Menjalankan Komputasi (''Job Submission'')'''==
* Daftar software yang terinstal secara global atau dapat digunakan oleh semua user di ALELEON Supercomputer.
[[Berkas:Efirojobcomposer2.png|al=|nirbing|600x600px]]  
* Daftar software komputasi beserta tutorial penggunannya, mencakup template untuk SLURM Submit Script.
|-
|
=== Submit Script ALELEON Supercomputer ===
[[Berkas:Wiki-14edit.jpg|al=SLURM Script ALELEON Supercomputer|1000x1000px |link=Submit Script ALELEON Supercomputer ]]


Halaman Jobs > '''Job Composer''' adalah tempat bagi user untuk membuat dan menjalankan komputasi (disebut sebagai '''<nowiki/>'job'''') di Compute Node ALELEON Supercomputer. 
Memuat info SLURM Submit Script untuk melakukan job submission di ALELEON Supercomputer:
----
----


=== 1. Membuat job baru dan memilih template job ===
* Memahami dan membuat SLURM Submit Script.
User membuat job baru melalui menu '''New Job.'''
* Aturan menentukan alokasi komputasi di ALELEON Supercomputer.
 
|-
[[Berkas:Jcnewjob.png|al=|nirbing|200x200px]]
|
 
=== Menjalankan Program MPI di ALELEON Supercomputer ===
Pilihan New Job yang direkomendasikan:
[[Berkas:Wiki-13.jpg|1000x1000px |link=MPI ALELEON Supercomputer |alt=MPI ALELEON Supercomputer]]


* '''From Default Template'''
Memuat info bagaimana menjalankan program paralel MPI di ALELEON Supercomputer:
** Template job default yang dapat digunakan untuk menjalankan job apapun di mana user menulis sendiri perintah jalannya program.
* '''From Template'''
** Tersedia template yang dibuat oleh EFISON untuk menjalankan job software komputasi tertentu seperti GROMACS, QE, NAMD, R, dll dan skenario tertentu seperti MPI, Hybrid MPI/OMP. BLAS, dll.
** User juga dapat membuat template job sendiri.
** User dapat menyampaikan permintaan kepada admin EFISON untuk pembuatan template tertentu.


---
* Memahami bagaimana arsitektur CPU AMD Zen2 menjalankan program MPI.
 
* Menjalankan program MPI pada ALELEON Supercomputer.
==== Opsi From Template ====
Apabila user memilih opsi '''From Template,''' langkah berikutnya adalah memilih template yang akan digunakan dan isi kolom '''Job Name''' untuk kerapian manajemen job user''',''' setelah itu klik '''Create New Job'''.
[[Berkas:Jcselecttemplate2.png|al=|nirbing|600x600px]]
----
----
 
=== 2. Mempersiapkan file program yang akan dijalankan ===
Berikutnya user mempersiapkan file yang dibutuhkan untuk menjalankan program tersebut seperti file input, config, binary program. Tersedia dua opsi: 
 
[[Berkas:Jcjoboption.png|al=|nirbing|600x600px]] 
 
*'''Edit Files'''
** Membuka halaman manajemen file untuk ruang job yang dipilih.
** User dapat melakukan manajemen file seperti upload, download, editing file script, rename, dll.[[Berkas:Jcfilemanagement.png|al=|nirbing|600x600px]]
* '''Open Terminal'''
** Membuka ruang job melalui terminal
** Dapat melakukan kebutuhan yang membutuhkan terminal seperti compiling.
----
----
 
=== 3. Mengisi (SLURM) Submit Script ===
Langkah berikutnya adalah mengisi '''Submit Script''' (terletak di kanan bawah halaman Jobs). Submit Script adalah bash script yang '''memerintahkan program manajemen superkomputer untuk menjalankan job komputasi user ke Compute Node.''' ALELEON Supercomputer menggunakan manajemen [https://slurm.schedmd.com/documentation.html '''SLURM'''] sehingga Submit Script ini disebut sebagai '''SLURM Script'''.
 
[[Berkas:Jcsubmits.png|al=|nirbing|400x400px]]
 
User dapat menulis atau mengubah Submit Script yang telah disediakan melalui menu '''Open Editor'''.
 
[[Berkas:Jceditor.png|al=|nirbing|500x500px]]
 
Admin EFISON memberikan instruksi pada template script untuk memandu menulis script atau mengisi parameter yang diperlukan.
 
---
 
==== Mengedit SLURM Script ====
Admin EFISON merangkum panduan lengkap untuk memahami dan mengedit SLURM Script pada laman berikut: 
 
[[Berkas:Wiki-14.jpg|1000x1000px|link=SLURM Script ALELEON Supercomputer |alt=SLURM Script ALELEON Supercomputer ]]
 
---
 
==== Jangan Lupa Save Setelah Mengedit Submit Script! ====
[[Berkas:Jcsaveedit.png|nirbing|400x400px]]
----
----
 
=== 4. Submit job dan memantau jalannya job ===
Semua file untuk menjalankan program dan Submit Script sudah siap? Jalankan job tersebut dengan menekan tombol '''Submit'''.
 
[[Berkas:Jcsubmit.png|nirbing|700x700px|al=]]
 
Perhatikan kolom '''Status''' pada job tersebut. User dapat memantau perubahan kolom Status dengan me-refresh halaman Job. Berikut adalah daftar Status yang terjadi:
{| class="wikitable"
|+Status jalannya Job
!Status
!Arti
|-
|Not Submitted
|Job belum pernah dijalankan
|-
|Running
|Job berjalan
|-
|Queue
|Job mengantri dan belum berjalan
|-
|Completed
|Job selesai berjalan
|-
|Failed
|Job berhenti di tengah berjalan.
Bisa karena di Stop atau Delete oleh user atau server tiba-tiba mati.
|}
|}
Apabila user ingin menghentikan job yang sedang berjalan, klik tombol '''Stop''' yang berada di sebelah tombol Submit.
---
==== Melihat Hasil Job yang Selesai ====
Apabila job sudah selesai berjalan, user dapat melihat hasil file yang dihasilkan melalui '''Edit Pages''' atau melihat secara cepat pada kolom '''Folder Contents'''.
[[Berkas:Jcfoldercontentsedit.png|nir|jmpl|399x399px|'''User dapat melihat isi folder dari ruang job yang aktif pada Folder Contents.''']]
---


==== Submit Ulang Job ====
__PAKSADAFTARISI__
User dapat menjalankan ulang job yang sudah selesai dengan mengklik kembali tombol Submit.

Revisi terkini sejak 17 Oktober 2023 10.25

Halaman ini menjelaskan tutorial dan info teknis untuk menggunakan ALELEON Supercomputer.

1 | Terhubung ke Jaringan VPN ALELEON Supercomputer

Kebijakan keamanan ALELEON Supercomputer mewajibkan user untuk login melalui koneksi VPN yang dibuat oleh EFISON.

2 | Opsi Menggunakan ALELEON Supercomputer

ALELEON Supercomputer memberikan dua opsi login dan penggunaan yaitu:

  • Penggunaan via terminal dan login SSH.
  • Penggunaan tampilan grafis via web service EFIRO.
Silahkan pilih cara menggunakan ALELEON Supercomputer sesuai preferensi user:

MENGGUNAKAN ALELEON Supercomputer via TERMINAL

Efiroshell.png

100% tradisional: CLI dan Linux all the way!

MENGGUNAKAN ALELEON Supercomputer via web service EFIRO

Efirodashboardshort2.png

Dengan fitur eksklusif: Job composer, sesi interaktif Jupyter Notebook / Lab, dan virtual desktop ALELEON Desktop.


3 | Support dan Laporan Kendala Penggunaan

Apabila membutuhkan layanan support dan menjumpai masalah teknis dalam menggunakan ALELEON Supercomputer, silahkan lapor dengan klik gambar berikut ini.

Wiki-pelaporankendala.jpg

Info Cepat

Berikut adalah shortcut untuk info teknis lainnya yang esensial dalam menggunakan ALELEON Supercomputer:

Daftar Software Komputasi dan Tutorial Penggunaan

Daftar Software Komputasi dan Tutorial Penggunaan

Memuat info daftar software komputasi beserta tutorial penggunannya:

  • Daftar modul software yang terinstal.
  • Template SLURM Submit Script.
  • Info teknis lainnya yang perlu diperhatikan.

Katalog Software ALELEON Supercomputer

Katalog Software ALELEON Supercomputer

Memuat info lengkap katalog software ALELEON Supercomputer:

  • Daftar software yang terinstal secara global atau dapat digunakan oleh semua user di ALELEON Supercomputer.
  • Daftar software komputasi beserta tutorial penggunannya, mencakup template untuk SLURM Submit Script.

Submit Script ALELEON Supercomputer

SLURM Script ALELEON Supercomputer

Memuat info SLURM Submit Script untuk melakukan job submission di ALELEON Supercomputer:

  • Memahami dan membuat SLURM Submit Script.
  • Aturan menentukan alokasi komputasi di ALELEON Supercomputer.

Menjalankan Program MPI di ALELEON Supercomputer

MPI ALELEON Supercomputer

Memuat info bagaimana menjalankan program paralel MPI di ALELEON Supercomputer:

  • Memahami bagaimana arsitektur CPU AMD Zen2 menjalankan program MPI.
  • Menjalankan program MPI pada ALELEON Supercomputer.


Diperoleh dari "https://wiki.efisonlt.com/index.php?title=Tutorial_Menggunakan_ALELEON_Supercomputer&oldid=1207"