|
|
| (57 revisi perantara oleh pengguna yang sama tidak ditampilkan) |
| Baris 1: |
Baris 1: |
| Halaman ini merangkum urutan tutorial penggunaan dan semua informasi teknis untuk menggunakan ALELEON Supercomputer. | | Halaman ini menjelaskan tutorial dan info teknis untuk menggunakan ALELEON Supercomputer. |
| {| class="wikitable"
| |
| !Tutorial ALELEON Supercomputer
| |
| |-
| |
| |[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Tutorial_Menggunakan_ALELEON_Supercomputer#1_-_Koneksi_VPN_dan_Login_EFIRO '''Login''']
| |
| |-
| |
| |[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Tutorial_Menggunakan_ALELEON_Supercomputer#2_-_Selamat_Datang_di_Dashboard_EFIRO '''Dashboard EFIRO''']
| |
| |-
| |
| |[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Tutorial_Menggunakan_ALELEON_Supercomputer#3_-_Job_Composer:_Menjalankan_Komputasi_.28Job_Submission.29 '''Menjalankan komputasi via Job Composer EFIRO''']
| |
| * [[SLURM Script ALELEON Supercomputer|'''Panduan mengisi SLURM Script untuk menjalankan job''']]
| |
| * [[Optimasi Performa ALELEON Supercomputer|'''Panduan optimasi performa dalam menggunakan ALELEON Supercomputer''']]
| |
| |}
| |
|
| |
|
| == '''Mengenalkan EFIRO OnDemand''' == | | == '''1 | Terhubung ke Jaringan VPN ALELEON Supercomputer''' == |
| User menggunakan ALELEON Supercomputer melalui EFIRO OnDemand atau disingkat '''EFIRO -''' konsol tampilan grafis (GUI) untuk mengakses ALELEON Supercomputer melalui web browser.
| | Kebijakan keamanan ALELEON Supercomputer mewajibkan user untuk login melalui koneksi VPN yang dibuat oleh EFISON. |
|
| |
|
| [[Berkas:Efirodashboardshort.png|al=|700x700px]] | | * Langkah membuat dan terhubung ke VPN ALELEON Supercomputer dijelaskan pada laman [[Koneksi VPN ALELEON Supercomputer|'''Koneksi VPN ALELEON Supercomputer''']]. |
|
| |
|
| ---
| | =='''2 | Opsi Menggunakan ALELEON Supercomputer'''== |
| | ALELEON Supercomputer memberikan dua opsi login dan penggunaan yaitu: |
|
| |
|
| === ''Doing the old way?'' Login SSH dan Terminal Linux ===
| | * Penggunaan via terminal dan login SSH. |
| ALELEON Supercomputer '''tetap membuka akses login SSH''' untuk user yang memilih tampilan terminal Linux EFISON menyediakan [[Menggunakan ALELEON Supercomputer via Terminal|'''tutorial terpisah untuk menggunakan ALELEON Supercomputer melalui terminal''']]. | | * Penggunaan tampilan grafis via web service EFIRO'''.''' |
| | {| class="wikitable" |
| | |+Silahkan pilih cara menggunakan ALELEON Supercomputer sesuai preferensi user: |
| | ! |
| | === [[Menggunakan ALELEON Supercomputer via Terminal|MENGGUNAKAN ALELEON Supercomputer via TERMINAL]] === |
| | [[Berkas:Efiroshell.png|nirbing]] |
|
| |
|
| == '''1 - Koneksi VPN dan Login EFIRO''' ==
| | ''100% tradisional: CLI dan Linux all the way!'' |
| Langkah pertama untuk mengakses ALELEON Supercomputer adalah [[Koneksi VPN ALELEON Supercomputer|'''menghubungkan perangkat user ke koneksi VPN ALELEON Supercomputer''']] demi keamanan jaringan dan data user.
| | |- |
| | ! |
| | === [[Menggunakan ALELEON Supercomputer via EFIRO|MENGGUNAKAN ALELEON Supercomputer via web service EFIRO]] === |
| | [[Berkas:Efirodashboardshort2.png|900x900px]] |
|
| |
|
| Setelah terhubung ke VPN, user dapat mengakses EFIRO melalui alamat:
| | ''Dengan fitur eksklusif: Job composer, sesi interaktif Jupyter Notebook / Lab, dan virtual desktop ALELEON Desktop.'' |
| '''http://efisonlt.ood'''
| | |} |
| Kemudian masukkan '''username dan password user''' '''ALELEON Supercomputer'''.
| | {{DEFAULTSORT:tutorial}} |
| | |
| == '''2 - Selamat Datang di Dashboard EFIRO''' ==
| |
| Setelah login, user masuk ke dalam dashboard EFIRO yang menjadi ''central hub'' bagi user untuk menggunakan ALELEON Supercomputer.
| |
| | |
| [[Berkas:Efiromenubarbig.png|al=|800x800px]]
| |
| | |
| * Halaman '''Files > Home Directory''' menampilkan isi direktori HOME user. User dapat melakukan manajemen file melalui deretan menu di bagian atas halaman seperti upload, download, copy, rename, delete, dll.
| |
| | |
| [[Berkas:Efiroftp3.png|al=|nirbing|600x600px]]
| |
| ----
| |
| | |
| * Halaman '''Jobs > Active Jobs''' menampilkan daftar job komputasi beserta statusnya yang sedang berjalan di ALELEON Supercomputer.
| |
| | |
| [[Berkas:Efiroqueueedit.png|al=|nirbing|600x600px]]
| |
| ----
| |
|
| |
|
| * Halaman '''Clusters > Aleleon Shell Access''' menampilkan terminal Linux (shell) ALELEON Supercomputer.
| | == '''3 | Support dan Laporan Kendala Penggunaan''' == |
| [[Berkas:Efiroshell.png|al=|nirbing|400x400px]]
| | Apabila membutuhkan layanan support dan menjumpai masalah teknis dalam menggunakan ALELEON Supercomputer, silahkan lapor dengan klik gambar berikut ini. |
|
| |
|
| =='''3 - Job Composer: Menjalankan Komputasi (''Job Submission'')'''==
| | [[Berkas:Wiki-pelaporankendala.jpg|1000x1000px|link=https://efisonlt.com/aleleonbugreport]] |
| [[Berkas:Efirojobcomposer2.png|al=|nirbing|600x600px]] | |
|
| |
|
| Halaman Jobs > '''Job Composer''' adalah tempat bagi user untuk membuat dan menjalankan komputasi (disebut sebagai '''<nowiki/>'job'''') di Compute Node ALELEON Supercomputer.
| | == '''Info Cepat''' == |
| | Berikut adalah ''shortcut'' untuk info teknis lainnya yang esensial dalam menggunakan ALELEON Supercomputer: |
| {| class="wikitable" | | {| class="wikitable" |
| ! colspan="2" |Langkah Menggunakan Job Composer
| |
| |-
| |
| |1
| |
| |[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Tutorial_Menggunakan_ALELEON_Supercomputer#1._Membuat_job_baru_dan_memilih_template_job '''Membuat job baru dan memilih template job''']
| |
| |-
| |
| |2
| |
| |[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Tutorial_Menggunakan_ALELEON_Supercomputer#2._Mempersiapkan_file_program_yang_akan_dijalankan '''Mempersiapkan file program yang akan dijalankan''']
| |
| |-
| |
| |3
| |
| |[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Tutorial_Menggunakan_ALELEON_Supercomputer#3._Mengisi_.28SLURM.29_Submit_Script '''Mengisi Submit Script''']
| |
| * [[SLURM Script ALELEON Supercomputer|'''Panduan mengisi Submit Script''']]
| |
| |- | | |- |
| |4 | | | |
| |[https://wiki.efisonlt.com/wiki/Tutorial_Menggunakan_ALELEON_Supercomputer#4._Submit_job_dan_memantau_jalannya_job '''Submit Job dan memantau jalannya job''']
| | === Daftar Software Komputasi dan Tutorial Penggunaan === |
| |}
| | [[Berkas:Wiki-15.jpg|1000x1000px |link=Daftar Software Komputasi dan Tutorial Penggunaan |alt=Daftar Software Komputasi dan Tutorial Penggunaan]] |
| ----
| |
| ----
| |
|
| |
|
| === 1. Membuat job baru dan memilih template job ===
| | Memuat info daftar software komputasi beserta tutorial penggunannya: |
| User membuat job baru melalui menu '''New Job.'''
| |
|
| |
|
| [[Berkas:Jcnewjob.png|al=|nirbing|200x200px]] | | * Daftar modul software yang terinstal. |
| | * Template SLURM Submit Script. |
| | * Info teknis lainnya yang perlu diperhatikan. |
| | |- |
| | | |
| | === Katalog Software ALELEON Supercomputer === |
| | [[Berkas:Banner Katalog 1 4 2.jpg|1000x1000px |link=Katalog Software ALELEON Supercomputer |alt=Katalog Software ALELEON Supercomputer ]] |
|
| |
|
| Pilihan New Job yang direkomendasikan:
| | Memuat info lengkap katalog software ALELEON Supercomputer: |
|
| |
|
| * '''From Default Template''' | | * Daftar software yang terinstal secara global atau dapat digunakan oleh semua user di ALELEON Supercomputer. |
| ** Template job default yang dapat digunakan untuk menjalankan job apapun di mana user menulis sendiri perintah jalannya program.
| | * Daftar software komputasi beserta tutorial penggunannya, mencakup template untuk SLURM Submit Script. |
| * '''From Template''' | | |- |
| ** Tersedia template yang dibuat oleh EFISON untuk menjalankan job software komputasi tertentu seperti GROMACS, QE, NAMD, R, dll dan skenario tertentu seperti MPI, Hybrid MPI/OMP. BLAS, dll.
| | | |
| ** User juga dapat membuat template job sendiri.
| | === Submit Script ALELEON Supercomputer === |
| ** User dapat menyampaikan permintaan kepada admin EFISON untuk pembuatan template tertentu.
| | [[Berkas:Wiki-14edit.jpg|al=SLURM Script ALELEON Supercomputer|1000x1000px |link=Submit Script ALELEON Supercomputer ]] |
|
| |
|
| ---
| | Memuat info SLURM Submit Script untuk melakukan job submission di ALELEON Supercomputer: |
|
| |
|
| ==== Opsi From Template ==== | | * Memahami dan membuat SLURM Submit Script. |
| Apabila user memilih opsi '''From Template,''' langkah berikutnya adalah memilih template yang akan digunakan dan isi kolom '''Job Name''' untuk kerapian manajemen job user''',''' setelah itu klik '''Create New Job'''.
| | * Aturan menentukan alokasi komputasi di ALELEON Supercomputer. |
| [[Berkas:Jcselecttemplate2.png|al=|nirbing|600x600px]] | | |- |
| ----
| | | |
| ----
| | === Menjalankan Program MPI di ALELEON Supercomputer === |
| | [[Berkas:Wiki-13.jpg|1000x1000px |link=MPI ALELEON Supercomputer |alt=MPI ALELEON Supercomputer]] |
|
| |
|
| === 2. Mempersiapkan file program yang akan dijalankan ===
| | Memuat info bagaimana menjalankan program paralel MPI di ALELEON Supercomputer: |
| Berikutnya user mempersiapkan file yang dibutuhkan untuk menjalankan program tersebut seperti file input, config, binary program. Tersedia dua opsi:
| |
|
| |
|
| [[Berkas:Jcjoboption.png|al=|nirbing|600x600px]]
| | * Memahami bagaimana arsitektur CPU AMD Zen2 menjalankan program MPI. |
| | | * Menjalankan program MPI pada ALELEON Supercomputer. |
| *'''Edit Files''' | |
| ** Membuka halaman manajemen file untuk ruang job yang dipilih.
| |
| ** User dapat melakukan manajemen file seperti upload, download, editing file script, rename, dll. | |
| [[Berkas:Jcfilemanagement.png|al=|nirbing|600x600px]]
| |
| *'''Open Terminal'''
| |
| ** Membuka ruang job melalui terminal
| |
| ** Dapat melakukan kebutuhan yang membutuhkan terminal seperti compiling.
| |
| ----
| |
| ----
| |
| | |
| === 3. Mengisi (SLURM) Submit Script ===
| |
| Langkah berikutnya adalah mengisi Submit Script (terletak di kanan bawah halaman Jobs). Submit Script adalah bash script yang '''memerintahkan program manajemen superkomputer untuk menjalankan job komputasi user ke Compute Node.''' ALELEON Supercomputer menggunakan manajemen [https://slurm.schedmd.com/documentation.html '''SLURM'''] sehingga Submit Script ini disebut sebagai '''SLURM Script'''.
| |
| | |
| [[Berkas:Jcsubmits.png|al=|nirbing|400x400px|tepi]]
| |
| | |
| User dapat menulis atau mengubah Submit Script yang telah disediakan melalui menu '''Open Editor'''.
| |
| | |
| [[Berkas:Jceditor.png|al=|nirbing|500x500px]]
| |
| | |
| ---
| |
| | |
| ==== Mengisi SLURM Script ====
| |
| Admin EFISON merangkum panduan lengkap untuk memahami dan mengedit SLURM Script pada laman berikut:
| |
| | |
| [[Berkas:Wiki-14.jpg|1000x1000px|link=SLURM Script ALELEON Supercomputer |alt=SLURM Script ALELEON Supercomputer ]]
| |
| | |
| ---
| |
| | |
| ==== Jangan Lupa Save Setelah Mengedit Submit Script! ====
| |
| [[Berkas:Jcsaveedit.png|nirbing|400x400px]]
| |
| ----
| |
| ----
| |
| | |
| === 4. Submit job dan memantau jalannya job ===
| |
| Semua file untuk menjalankan program dan Submit Script sudah siap? Jalankan job tersebut dengan menekan tombol '''Submit'''.
| |
| | |
| [[Berkas:Jcsubmit.png|nirbing|700x700px|al=]]
| |
| | |
| Perhatikan kolom '''Status''' pada job tersebut. User dapat memantau perubahan kolom Status dengan me-refresh halaman Job. Berikut adalah daftar Status yang terjadi:
| |
| {| class="wikitable"
| |
| |+Status jalannya Job
| |
| !Status
| |
| !Arti
| |
| |-
| |
| |Not Submitted
| |
| |Job belum pernah dijalankan
| |
| |-
| |
| |Running
| |
| |Job berjalan
| |
| |-
| |
| |Queue
| |
| |Job mengantri dan belum berjalan
| |
| |-
| |
| |Completed
| |
| |Job selesai berjalan
| |
| |-
| |
| |Failed
| |
| |Job berhenti di tengah berjalan.
| |
| Bisa karena di Stop atau Delete oleh user atau server tiba-tiba mati.
| |
| |} | | |} |
| Apabila user ingin menghentikan job yang sedang berjalan, klik tombol '''Stop''' yang berada di sebelah tombol Submit.
| |
|
| |
|
| ---
| | __PAKSADAFTARISI__ |
| | |
| ==== Melihat Hasil Job yang Selesai ====
| |
| Apabila job sudah selesai berjalan, user dapat melihat hasil file yang dihasilkan melalui '''Edit Pages''' atau melihat secara cepat pada kolom '''Folder Contents'''.
| |
| | |
| [[Berkas:Jcfoldercontentsedit.png|al=|nirbing|399x399px]]
| |
| | |
| ---
| |
| | |
| ==== Submit Ulang Job ====
| |
| User dapat menjalankan ulang job yang sudah selesai dengan mengklik kembali tombol Submit.
| |
| | |
| {{DEFAULTSORT:tutorial}}
| |
| __TANPADAFTARISI__
| |
