Tutorial Menggunakan ALELEON Supercomputer: Perbedaan antara revisi

Dari ALELEON by EFISON
(mematikan daftar isi karena terlihat tedious ._.)
(paraphrasing)
 
(35 revisi perantara oleh pengguna yang sama tidak ditampilkan)
Baris 1: Baris 1:
[[Berkas:Efirodashboardshort.png|al=|700x700px]]
Halaman ini menjelaskan tutorial dan info teknis untuk menggunakan ALELEON Supercomputer.  


User menggunakan ALELEON Supercomputer melalui EFIRO OnDemand atau disingkat '''EFIRO -''' konsol tampilan grafis (GUI) untuk mengakses ALELEON Supercomputer melalui web browser.
== '''1 | Terhubung ke Jaringan VPN ALELEON Supercomputer''' ==
=='''1. Koneksi VPN dan Login EFIRO'''==
Kebijakan keamanan ALELEON Supercomputer mewajibkan user untuk login melalui koneksi VPN yang dibuat oleh EFISON.
* Sebelum mengakses ALELEON Supercomputer, user harus [[Koneksi VPN ALELEON Supercomputer|'''terhubung ke koneksi VPN EFISON''']] demi keamanan jaringan dan data user.


* Setelah terhubung ke VPN, user mengakses EFIRO melalui alamat berikut, diikuti dengan memasukkan '''username dan password''' akun user.
* Langkah membuat dan terhubung ke VPN ALELEON Supercomputer dijelaskan pada laman [[Koneksi VPN ALELEON Supercomputer|'''Koneksi VPN ALELEON Supercomputer''']].
'''http://efisonlt.ood'''
== '''2. Dashboard EFIRO''' ==
Setelah login, user masuk ke dalam dashboard EFIRO yang menjadi ''central hub'' untuk menggunakan ALELEON Supercomputer.  


[[Berkas:Efiromenubarbig3.png|al=|900x900px]]
=='''2 | Opsi Menggunakan ALELEON Supercomputer'''==
{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
ALELEON Supercomputer memberikan dua opsi login dan penggunaan yaitu:  
!PENJELASAN MENU DI DASHBOARD EFIRO
|-
|
=== Jobs > '''Job Composer'''===
* Halaman untuk membuat dan menjalankan komputasi di Compute Node ALELEON Supercomp'''<nowiki/>'''uter.
* Job Composer berisikan serangkaian template, formulir, dan script untuk menjalank'''<nowiki/>'''an software komputasi.'''<nowiki/><nowiki/>'''
* User dapat melihat semua job yang pernah dijalankan beserta hasilnya pada halaman'''<nowiki/>''' Job Composer ini.
[[Berkas:Efirojobcomposer3.png|al=|jmpl|'''Halaman Job Composer'''|kiri]]
|-
|
=== Jobs > '''Active Jobs'''===
* Menampilkan status dan antrian job komputasi semua user yang sedang berjalan.
[[Berkas:Efiroqueueedit.png|al=|jmpl|'''Halaman Active Jobs'''|kiri]]
|-
|
=== Interactive Apps ===
 
* Menampilkan daftar software yang bisa diakses secara interaktif (langsung) oleh user.


=== My Interactive Sessions ===
* Penggunaan via terminal dan login SSH.
* Penggunaan tampilan grafis via web service EFIRO'''.'''
{| class="wikitable"
|+Silahkan pilih cara menggunakan ALELEON Supercomputer sesuai preferensi user:
!
=== [[Menggunakan ALELEON Supercomputer via Terminal|MENGGUNAKAN ALELEON Supercomputer via TERMINAL]] ===
[[Berkas:Efiroshell.png|nirbing]]


* Menampilkan daftar sesi interaktif user yang sedang aktif dan sudah selesai.
''100% tradisional: CLI dan Linux all the way!''
|-
|
=== Clusters > '''Aleleon Shell Access'''===
* Halaman terminal Linux (shell) ALELEON Supercomputer.
* Untuk kegiatan yang membutuhkan terminal seperti compiling, membuat environment (user Python, R, GROMACS), dll.
[[Berkas:Efiroshell.png|kiri|jmpl|200x200px|'''Terminal ALELEON Supercomputer''']]
|-
|-
|
!
=== Files > '''Home Directory''' ===
=== [[Menggunakan ALELEON Supercomputer via EFIRO|MENGGUNAKAN ALELEON Supercomputer via web service EFIRO]] ===
[[Berkas:Efirodashboardshort2.png|900x900px]]


* Menampilkan isi direktori HOME user.
''Dengan fitur eksklusif: Job composer, sesi interaktif Jupyter Notebook / Lab, dan virtual desktop ALELEON Desktop.''
* User dapat melakukan manajemen file seperti upload, download, copy, rename, delete, dll.
 
[[Berkas:Efiroftp3.png|al=|jmpl|'''Halaman Home Directory dan menu manajemen file'''|kiri]]
|}
|}
{{DEFAULTSORT:tutorial}}


== '''3. Menggunakan ALELEON Supercomputer''' ==
== '''3 | Support dan Laporan Kendala Penggunaan''' ==
Terdapat dua metode untuk menjalankan software komputasi di ALELEON Supercomputer:
Apabila membutuhkan layanan support dan menjumpai masalah teknis dalam menggunakan ALELEON Supercomputer, silahkan lapor dengan klik gambar berikut ini.


* '''Job Composer'''
[[Berkas:Wiki-pelaporankendala.jpg|1000x1000px|link=https://efisonlt.com/aleleonbugreport]]
* '''Interactive Apps'''


== '''3A. [[Core Hour|Kredit Core Hour]] dan ''sausage''''' ==
== '''Info Cepat''' ==
User memerlukan kredit Core Hour untuk menggunakan Job Composer dan Interactive Apps di mana adalah kuota [[Core Hour|'''Core Hour''']] untuk menggunakan CPU dan GPU di ALELEON Supercomputer.  
Berikut adalah ''shortcut'' untuk info teknis lainnya yang esensial dalam menggunakan ALELEON Supercomputer:
{| class="wikitable"
|-
|
=== Daftar Software Komputasi dan Tutorial Penggunaan ===
[[Berkas:Wiki-15.jpg|1000x1000px |link=Daftar Software Komputasi dan Tutorial Penggunaan |alt=Daftar Software Komputasi dan Tutorial Penggunaan]]


* Kuota pada kredit Core Hour akan berkurang sesuai dengan resources CPU / GPU yang dialokasikan user saat menjalankan job di Job Composer atau menggunakan interactive apps.
Memuat info daftar software komputasi beserta tutorial penggunannya:


User dapat mengecek kuota pada kredit Core Hour dengan menjalankan perintah sausage:  
* Daftar modul software yang terinstal.
* Template SLURM Submit Script.
* Info teknis lainnya yang perlu diperhatikan.
|-
|
=== Katalog Software ALELEON Supercomputer ===
[[Berkas:Banner Katalog 1 4 2.jpg|1000x1000px |link=Katalog Software ALELEON Supercomputer |alt=Katalog Software ALELEON Supercomputer ]]


* Buka ALELEON Shell Access melalui dashboard EFIRO Clusters > ALELEON Shell Access.
Memuat info lengkap katalog software ALELEON Supercomputer:


[[Berkas:Shellaccess.png|nirbing|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Shellaccess.png]]
* Daftar software yang terinstal secara global atau dapat digunakan oleh semua user di ALELEON Supercomputer.
* Daftar software komputasi beserta tutorial penggunannya, mencakup template untuk SLURM Submit Script.
|-
|
=== Submit Script ALELEON Supercomputer ===
[[Berkas:Wiki-14edit.jpg|al=SLURM Script ALELEON Supercomputer|1000x1000px |link=Submit Script ALELEON Supercomputer ]]


* Jalankan perintah "'''sausage'''".
Memuat info SLURM Submit Script untuk melakukan job submission di ALELEON Supercomputer:


[[Berkas:Sausage.png|nir|jmpl|'''Perintah sausage memperlihatkan penggunaan kredit CCH dan GH user'''|pra=https://wiki.efisonlt.com/wiki/Berkas:Sausage.png]]
* Memahami dan membuat SLURM Submit Script.
=='''3B. Job Composer'''==
* Aturan menentukan alokasi komputasi di ALELEON Supercomputer.
[[Berkas:Efirojobcomposer2.png|nir|jmpl|'''Halaman Job Composer. Diakses melalui menu Jobs > Job Composer di dashboard EFIRO.''']]
* Cara utama menjalankan komputasi di ALELEON Supercomputer. Bekerja dengan model '''''job submission'':''' software komputasi dijalankan oleh sistem berdasarkan serangkaian template, formulir, dan script yang didefinisikan user.
* Job Composer menjalankan software pada '''Compute Node''' - bagian server utama dan terkencang.
* Silahkan temukan tutorial software yang digunakan user:
{| class="wikitable sortable mw-collapsible mw-collapsed"
!TUTORIAL MENJALANKAN SOFTWARE KOMPUTASI DI JOB COMPOSER
|-
|
=== [[R]] [[Berkas:R.png|nirbing|100x100px]]===
via Job Composer
|-
|
=== [[GROMACS]] [[Berkas:GROMACS.png|nirbing|200x200px]]===
|-
|-
|
|
=== [[NWChem]] [[Berkas:Nwhem.png|nirbing|200x200px]]===
=== Menjalankan Program MPI di ALELEON Supercomputer ===
|-
[[Berkas:Wiki-13.jpg|1000x1000px |link=MPI ALELEON Supercomputer |alt=MPI ALELEON Supercomputer]]
|
=== [[Quantum ESPRESSO]] [[Berkas:Quantum ogo ok.png|nirbing|250x250px]]===
|-
|
=== [[GAMESS]] [[Berkas:GAMESS.png|nirbing|200x200px]]===
|-
|
=== [[NAMD]] [[Berkas:NAMDsof.png|nirbing|250x250px]]===
|-
|
=== [[ORCA]] [[Berkas:Orca logo.png|nirbing|100x100px]]===
|-
|
=== TensorFlow [[Berkas:TF.png|nirbing|200x200px]]===
via Job Composer
|-
|
=== [[PHASE/0]] [[Berkas:Phase-logo4.png|nirbing|100x100px]]===
|-
|
=== [[COMCOT]] ===
|}
{{DEFAULTSORT:tutorial}}
== '''3C. Interactive Apps''' ==
[[Berkas:Jupyterefiro.png|nir|jmpl|'''Contoh salah satu interactive apps: Jupyter Notebook, diakses melalui menu Interactive Apps di dashboard EFIRO.''']]


* Aplikasi yang dapat dijalankan secara '''interaktif''' (langsung) oleh user.
Memuat info bagaimana menjalankan program paralel MPI di ALELEON Supercomputer:
* Semua software Interactive Apps berjalan pada '''Interactive Node''' - bagian server untuk menjalankan semua interactive apps
* Interactive Node mempunyai '''spesifikasi hardware terbatas''' sehingga lebih cocok digunakan untuk komputasi skala kecil atau pengujian jalannya software / script. Gunakan '''Job Composer''' untuk melakukan komputasi skala besar.


{| class="wikitable mw-collapsible mw-collapsed"
* Memahami bagaimana arsitektur CPU AMD Zen2 menjalankan program MPI.
!DAFTAR INTERACTIVE APPS DAN TUTORIAL PENGGUNAAN
* Menjalankan program MPI pada ALELEON Supercomputer.
|-
|
=== Jupyter Notebook [[Berkas:Jupyter logo icon.png|nirbing|200x200px]] ===
''(coming soon)''
|-
|
=== Aleleon Desktop ===
''(coming soon)''
|-
|
=== TensorFlow [[Berkas:TF.png|nirbing|200x200px]] ===
via Jupyter Notebook. ''(coming soon)''
|-
|
=== R [[Berkas:R.png|nirbing|100x100px]] ===
via Jupyter Notebook. ''(coming soon)''
|}
|}
__TANPADAFTARISI__
 
__PAKSADAFTARISI__

Revisi terkini sejak 17 Oktober 2023 10.25

Halaman ini menjelaskan tutorial dan info teknis untuk menggunakan ALELEON Supercomputer.

1 | Terhubung ke Jaringan VPN ALELEON Supercomputer

Kebijakan keamanan ALELEON Supercomputer mewajibkan user untuk login melalui koneksi VPN yang dibuat oleh EFISON.

2 | Opsi Menggunakan ALELEON Supercomputer

ALELEON Supercomputer memberikan dua opsi login dan penggunaan yaitu:

  • Penggunaan via terminal dan login SSH.
  • Penggunaan tampilan grafis via web service EFIRO.
Silahkan pilih cara menggunakan ALELEON Supercomputer sesuai preferensi user:

MENGGUNAKAN ALELEON Supercomputer via TERMINAL

Efiroshell.png

100% tradisional: CLI dan Linux all the way!

MENGGUNAKAN ALELEON Supercomputer via web service EFIRO

Efirodashboardshort2.png

Dengan fitur eksklusif: Job composer, sesi interaktif Jupyter Notebook / Lab, dan virtual desktop ALELEON Desktop.


3 | Support dan Laporan Kendala Penggunaan

Apabila membutuhkan layanan support dan menjumpai masalah teknis dalam menggunakan ALELEON Supercomputer, silahkan lapor dengan klik gambar berikut ini.

Wiki-pelaporankendala.jpg

Info Cepat

Berikut adalah shortcut untuk info teknis lainnya yang esensial dalam menggunakan ALELEON Supercomputer:

Daftar Software Komputasi dan Tutorial Penggunaan

Daftar Software Komputasi dan Tutorial Penggunaan

Memuat info daftar software komputasi beserta tutorial penggunannya:

  • Daftar modul software yang terinstal.
  • Template SLURM Submit Script.
  • Info teknis lainnya yang perlu diperhatikan.

Katalog Software ALELEON Supercomputer

Katalog Software ALELEON Supercomputer

Memuat info lengkap katalog software ALELEON Supercomputer:

  • Daftar software yang terinstal secara global atau dapat digunakan oleh semua user di ALELEON Supercomputer.
  • Daftar software komputasi beserta tutorial penggunannya, mencakup template untuk SLURM Submit Script.

Submit Script ALELEON Supercomputer

SLURM Script ALELEON Supercomputer

Memuat info SLURM Submit Script untuk melakukan job submission di ALELEON Supercomputer:

  • Memahami dan membuat SLURM Submit Script.
  • Aturan menentukan alokasi komputasi di ALELEON Supercomputer.

Menjalankan Program MPI di ALELEON Supercomputer

MPI ALELEON Supercomputer

Memuat info bagaimana menjalankan program paralel MPI di ALELEON Supercomputer:

  • Memahami bagaimana arsitektur CPU AMD Zen2 menjalankan program MPI.
  • Menjalankan program MPI pada ALELEON Supercomputer.


Diperoleh dari "https://wiki.efisonlt.com/index.php?title=Tutorial_Menggunakan_ALELEON_Supercomputer&oldid=1207"